Heatmap: Cluster_97 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
BOF 92
BOF 92,Log
CCMP1516,Log,5mM sulfate,ESAW,15C
CCMP1516,Log,25mM sulfate,ESAW,15C
CCMP2090
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,18C
CCMP2090,Log,DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP370,pH7.8,Aquil,20C
CCMP370,pH8.1,Aquil,20C
CCMP371,17C
CCMP373,Log
CCMP373,Stationary
CCMP374,Log
CCMP374,Stationary
CCMP374,pH8.3,F/2-Si,18C
CCMP379,pH8.3,F/2-Si,18C
PLY M219,pH7.8,Aquil,20C
PLY M219,pH8.1,Aquil,20C
RCC1253
RCC3782
RCC6660,Log,pH7.2
RCC6660,Log,pH7.5
RCC6660,Log,pH7.8
RCC6660,Log,pH8.2
RCC6666,Log,pH7.2
RCC6666,Log,pH7.5
RCC6666,Log,pH7.8
RCC6666,Log,pH8.2
UNC1419,Log,Aquil,12C
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.85 - - - - 5.15 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 1.25 - - - - - - - - - - 5.07 - - - - - - - - - -
- -2.23 -3.18 -3.95 -8.47 -7.09 - -8.97 - - - -6.22 -8.97 -8.35 -3.14 -3.78 -8.76 - - - - - -0.95 - - 5.12 - - - - - - - - - -
- - - - -1.91 - - - - -2.22 - - - - - - - - - - - - - - - 5.12 -0.48 - - - - - - - - -
-3.92 -0.97 -3.56 -5.18 -3.06 -2.91 -2.77 -2.54 -2.66 -2.66 -3.03 -0.86 -2.79 -2.65 -4.83 -3.57 -3.9 -0.7 -0.67 -3.27 -3.32 -4.7 -4.58 -1.17 -1.6 4.75 -1.74 -1.22 -0.78 -0.55 -1.25 -1.29 -1.54 -1.15 -1.22 -4.21
- - 2.91 - - - -1.98 -1.93 - - - - - - - - -4.34 - - - - - - - - 4.8 - - - - - - - - - -
- 0.81 1.55 - - -6.91 - -6.98 - - - - - -7.78 - -0.57 -4.23 -3.17 -2.11 - - - -2.26 - -1.6 4.52 - 1.39 -1.68 -0.17 -1.19 -1.27 0.98 - -2.43 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - -
- - - - - - -11.29 - - - - - - - -7.35 -8.32 -4.72 1.07 0.99 -9.16 - -9.31 0.61 - - 4.91 -7.84 -4.86 -4.15 -5.35 -6.51 -4.23 -4.17 -5.31 -4.92 -
- - 0.3 - - - - -4.79 - - - - - - - - - - - - - -4.51 - - - 5.12 - - - - -5.63 - - - - -
- -7.03 -6.83 - - - - - - - - - - - - - -10.98 - -1.71 -7.9 -6.47 - - - - 5.16 - - - - - - - - - -
- - - 0.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.11 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.11 0.63 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - -2.07 -0.89 - - - -0.2 - - 5.1 - - - - - - - - - -
- - 0.85 - - - - - - - - - - - - - -2.5 - - - - - - - - 5.09 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -0.62 0.99 -0.04 - - - - - - 5.02 -5.52 - - - - - - - - -
- - 1.22 - - - - - -6.3 - - - - - - - -3.42 2.09 0.24 - - - 1.67 - - 4.64 - - - - - - - - - -
-5.51 -3.07 -1.05 -0.65 -2.25 -2.63 -1.86 -1.79 -2.49 -2.01 -1.87 -3.06 -2.48 -1.92 -6.13 -6.48 -2.45 0.95 1.11 -9.09 - -6.01 1.01 0.46 0.6 4.48 -4.59 -3.02 -3.43 -2.91 -2.43 -3.18 -3.12 -2.91 -3.25 -8.49
- - 2.89 - - - -0.59 -1.32 -3.18 -1.19 -3.44 - -1.65 -2.46 - - - - - - - -0.92 - - - 4.69 - - - - - - - - - -
-2.65 -3.03 - - -6.3 -4.6 -3.26 -3.75 -4.02 -5.47 - -4.32 -4.61 -4.56 -4.71 -4.69 -5.99 - - - -2.11 0.06 -4.92 - - 4.82 - -1.48 -0.79 -0.66 -0.86 -0.24 -0.11 -0.35 -0.21 -
- - 1.0 - - - - - - - - - -3.46 - - - - - 0.39 - - - - - - 4.83 2.07 - - - - - - - - -
-7.02 - -3.25 -6.09 -9.37 -7.4 -6.99 -7.88 -11.16 -8.72 -7.99 -8.33 -8.41 -7.51 -7.72 - -7.99 -8.04 -6.09 - - -3.8 - -6.26 -6.11 5.16 -5.78 -5.42 -8.59 -6.21 -8.52 - - -8.73 -6.2 -
- - - - - - - - - - - - - - - - -0.69 2.23 - - - - - - - 4.83 - - - - 1.18 - - - - -
- - -1.63 - - - - -4.97 -3.6 - -4.69 - -4.25 - - - - - - - - - - - - 4.94 2.22 - - - -4.25 - - - - -
-1.91 -1.81 -5.5 - - - -7.51 - - - -8.22 - - - -1.65 -0.83 -4.5 0.56 0.34 -4.57 -3.87 - 2.64 -0.06 -0.23 4.55 -3.32 - - - - -5.83 -6.81 - - -
- - -1.31 -2.56 -4.63 - - - - - -3.79 - -5.8 - -1.16 -1.59 -3.44 - - - -1.53 -2.6 -3.81 0.26 -0.82 5.0 - - - - - - - -4.8 - -
- - 1.14 - - - -1.02 - - - -2.36 - - - - - -0.84 - - - - - - - -0.11 4.91 - - - - - - 0.72 - - -
- - -1.12 -2.24 -3.15 -6.59 -6.19 -5.19 -7.17 - -4.35 -1.49 -5.9 - - - -3.15 2.48 0.42 -3.98 -3.68 -4.18 -0.15 - - 4.71 - - - - -1.93 - - -2.47 - -
-7.02 - -3.25 -6.09 -9.37 -7.4 -6.99 -7.88 -11.16 -8.72 -7.99 -8.33 -8.41 -7.51 -7.72 - -7.99 -8.04 -6.09 - - -3.8 - -6.26 -6.11 5.16 -5.78 -5.42 -8.59 -6.21 -8.52 - - -8.73 -6.2 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.91 - - 5.14 - - - -3.21 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -7.01 0.61 -0.6 - - - -6.59 - - 5.08 -7.14 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - -2.33 - -1.69 - - - - - - - - - - - - - 5.15 - - - - - - - - - -
- -3.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -3.09 - - - - 5.16 - - - - - - - - - -
- - 1.81 - - - - -8.26 - - - - -8.09 -7.25 - - -6.44 - - - - -5.07 - -2.0 -2.28 4.65 1.74 -2.1 -0.81 -0.74 -1.81 -1.2 -1.62 -1.69 -1.15 -1.33
- - 2.11 - - - - - - - - - - - - - - 0.43 - - - - - - - 4.92 - - - - - - - - - -
- - - 0.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.11 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -3.72 0.56 2.06 - - - -1.38 - - 4.88 -1.41 - - - - - - - - -
-0.42 -2.73 - - - - - - - - - - - - - - -2.98 1.29 -0.24 -0.92 -1.45 -3.79 2.08 - - 4.73 - - - - - - - - - -
- 0.25 - - - - - - - - - - - - - - -4.49 0.77 -0.04 - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.11 0.63 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.91 - - 5.09 - - - - - - - - - -
- - - - -2.14 -1.56 -1.9 - -2.04 - - - -2.87 -4.25 -2.33 - -6.02 - - - - 0.92 - - - 5.03 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 1.18 - - - - - - - 5.08 - - - - - - - - - -
- - - - - - - -6.01 - -4.69 - - - -5.03 - - -4.61 -2.03 - -2.01 - -1.95 - - - 5.13 - - - - - - -4.21 - - -6.8
- - 1.22 - - - - - -6.3 - - - - - - - -3.42 2.09 0.24 - - - 1.67 - - 4.64 - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.