Heatmap: Cluster_66 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000042.12 (tig00000042_g15398.t1)	0.92	0.35	0.33	0.41	0.38	0.27	0.36	0.34	0.39	0.41	0.54	0.84	1.0	0.58	0.54	0.41	0.32	0.48	0.38	0.38	0.13	1.0	0.61	0.48	0.91	0.75
Cpa\|evm.model.tig00000073.6 (tig00000073_g1688.t1)	0.78	0.51	0.39	0.48	0.6	0.56	0.67	0.51	0.43	0.7	0.73	0.95	0.82	0.51	0.3	0.36	0.19	0.22	0.22	0.23	0.07	1.0	0.61	0.67	0.7	0.61
Cpa\|evm.model.tig00000157.126 (tig00000157_g9729.t1)	0.81	0.49	0.39	0.39	0.33	0.29	0.41	0.45	0.41	0.58	0.72	0.86	1.0	0.66	0.46	0.69	0.57	0.6	0.37	0.44	0.1	0.95	0.23	0.46	0.7	0.5
Cpa\|evm.model.tig00000190.23 (tig00000190_g13846.t1)	0.35	0.15	0.08	0.02	0.08	0.11	0.31	0.24	0.44	0.66	0.61	0.56	0.15	0.33	0.18	0.14	0.15	0.22	0.1	0.14	0.03	0.22	0.15	1.0	0.77	0.37
Cpa\|evm.model.tig00000197.1 (tig00000197_g15683.t1)	0.75	0.53	0.44	0.45	0.34	0.25	0.27	0.28	0.27	0.36	0.44	0.5	0.72	0.56	0.68	0.67	0.42	0.42	0.38	0.27	0.14	0.91	0.65	0.64	1.0	0.76
Cpa\|evm.model.tig00000197.2 (tig00000197_g15683.t1)	0.84	0.62	0.54	0.48	0.34	0.22	0.33	0.35	0.32	0.4	0.5	0.61	0.89	0.67	0.74	0.79	0.51	0.51	0.38	0.34	0.14	0.94	0.62	0.76	1.0	0.75
Cpa\|evm.model.tig00000204.23 (tig00000204_g17692.t1)	0.77	0.41	0.32	0.43	0.36	0.32	0.51	0.54	0.51	0.46	0.56	0.66	1.0	0.4	0.42	0.37	0.24	0.25	0.23	0.17	0.23	0.6	0.63	0.48	0.51	0.4
Cpa\|evm.model.tig00000248.13 (tig00000248_g21781.t1)	0.76	0.53	0.5	0.57	0.39	0.31	0.43	0.54	0.31	0.46	0.58	0.71	1.0	0.46	0.34	0.35	0.39	0.31	0.23	0.2	0.05	0.86	0.2	0.55	0.69	0.57
Cpa\|evm.model.tig00000254.58 (tig00000254_g22511.t1)	0.66	0.53	0.44	0.3	0.13	0.09	0.21	0.39	0.17	0.27	0.49	0.63	1.0	0.28	0.23	0.24	0.29	0.3	0.24	0.31	0.14	0.55	0.33	0.34	0.56	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000254.59 (tig00000254_g22512.t1)	0.69	0.19	0.18	0.16	0.11	0.07	0.11	0.14	0.06	0.12	0.22	0.45	1.0	0.29	0.18	0.25	0.16	0.14	0.09	0.11	0.23	0.87	0.1	0.15	0.28	0.21
Cpa\|evm.model.tig00000254.60 (tig00000254_g22512.t1)	0.69	0.19	0.13	0.14	0.11	0.08	0.12	0.14	0.06	0.1	0.23	0.4	1.0	0.23	0.14	0.2	0.14	0.11	0.1	0.1	0.24	0.75	0.08	0.15	0.27	0.23
Cpa\|evm.model.tig00000269.113 (tig00000269_g23775.t1)	0.67	0.33	0.33	0.55	0.35	0.24	0.34	0.44	0.54	0.59	0.65	0.66	0.94	0.21	0.15	0.15	0.3	0.27	0.17	0.13	0.04	1.0	0.12	0.29	0.69	0.39
Cpa\|evm.model.tig00000319.17 (tig00000319_g24129.t1)	0.76	0.35	0.23	0.17	0.09	0.06	0.08	0.09	0.07	0.1	0.25	0.49	1.0	0.24	0.2	0.22	0.21	0.15	0.13	0.07	0.06	0.62	0.05	0.12	0.27	0.15
Cpa\|evm.model.tig00000325.13 (tig00000325_g24095.t1)	0.61	0.43	0.37	0.42	0.41	0.34	0.57	0.56	0.43	0.6	0.6	0.59	0.72	0.41	0.33	0.33	0.51	0.47	0.35	0.36	0.08	1.0	0.24	0.36	0.62	0.43
Cpa\|evm.model.tig00000342.48 (tig00000342_g24231.t1)	0.88	0.72	0.64	0.62	0.43	0.35	0.4	0.39	0.4	0.52	0.65	0.9	0.86	0.59	0.41	0.48	0.42	0.46	0.42	0.39	0.15	1.0	0.6	0.95	0.92	0.76
Cpa\|evm.model.tig00000431.4 (tig00020693_g13056.t1)	1.0	0.38	0.58	0.82	0.74	0.6	0.5	0.64	0.85	0.61	0.82	0.9	0.7	0.1	0.1	0.18	0.11	0.15	0.25	0.12	0.11	0.93	0.74	0.71	0.99	0.59
Cpa\|evm.model.tig00000545.21 (tig00000545_g1993.t1)	1.0	0.56	0.37	0.41	0.35	0.61	0.4	0.24	0.21	0.31	0.42	0.63	0.88	0.05	0.05	0.04	0.08	0.18	0.15	0.13	0.05	0.82	0.42	0.48	0.36	0.29
Cpa\|evm.model.tig00000704.19 (tig00000704_g3309.t1)	0.7	0.5	0.49	0.47	0.53	0.5	0.59	0.7	0.67	0.76	0.82	0.96	0.87	0.56	0.46	0.6	0.49	0.6	0.46	0.48	0.19	1.0	0.59	0.45	0.69	0.54
Cpa\|evm.model.tig00000760.9 (tig00000760_g3932.t1)	0.78	0.51	0.34	0.35	0.37	0.35	0.44	0.55	0.49	0.51	0.66	0.69	1.0	0.24	0.31	0.23	0.19	0.31	0.22	0.23	0.03	0.86	0.24	0.39	0.39	0.44
Cpa\|evm.model.tig00000851.27 (tig00000851_g4912.t1)	0.61	0.54	0.42	0.34	0.19	0.14	0.23	0.29	0.23	0.48	0.64	0.7	0.77	0.53	0.44	0.54	0.37	0.48	0.3	0.21	0.11	0.66	0.22	0.66	1.0	0.56
Cpa\|evm.model.tig00000880.18 (tig00000880_g5174.t1)	0.85	0.39	0.38	0.47	0.63	0.55	0.66	0.62	0.71	0.69	0.82	0.85	1.0	0.57	0.44	0.57	0.29	0.35	0.3	0.25	0.16	0.72	0.62	0.47	0.63	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000981.20 (tig00000981_g5874.t1)	0.73	0.48	0.5	0.41	0.18	0.12	0.23	0.36	0.14	0.2	0.26	0.31	1.0	0.28	0.38	0.26	0.32	0.36	0.23	0.26	0.1	0.8	0.15	0.14	0.4	0.4
Cpa\|evm.model.tig00001001.1 (tig00021275_g19878.t1)	0.81	0.52	0.36	0.33	0.2	0.18	0.27	0.34	0.34	0.54	0.67	0.8	0.96	0.16	0.11	0.1	0.14	0.3	0.12	0.17	0.1	1.0	0.07	0.14	0.38	0.28
Cpa\|evm.model.tig00001029.43 (tig00001029_g6444.t2)	0.65	0.35	0.58	0.62	0.3	0.15	0.3	0.28	0.18	0.22	0.4	0.51	1.0	0.29	0.24	0.47	0.5	0.29	0.22	0.14	0.24	0.88	0.44	0.57	0.64	0.49
Cpa\|evm.model.tig00001033.6 (tig00001033_g6487.t1)	0.85	0.4	0.32	0.32	0.25	0.27	0.55	0.61	0.5	0.58	0.6	0.51	1.0	0.36	0.3	0.28	0.27	0.33	0.3	0.23	0.28	0.31	0.59	0.54	0.61	0.46
Cpa\|evm.model.tig00001042.28 (tig00001042_g6600.t1)	0.89	0.59	0.42	0.77	0.77	0.54	0.56	0.58	0.8	0.64	0.83	0.89	0.92	0.25	0.23	0.22	0.22	0.3	0.29	0.27	0.05	1.0	0.8	0.51	0.7	0.46
Cpa\|evm.model.tig00001254.13 (tig00001254_g7818.t1)	0.99	0.65	0.5	0.51	0.49	0.44	0.66	0.75	0.71	0.72	0.76	0.81	1.0	0.54	0.5	0.49	0.43	0.59	0.63	0.43	0.26	0.54	0.65	0.71	0.93	0.62
Cpa\|evm.model.tig00001258.2 (tig00001258_g7823.t1)	0.82	0.67	0.53	0.89	0.68	0.66	0.63	0.55	0.43	0.36	0.51	0.72	1.0	0.05	0.07	0.08	0.08	0.11	0.11	0.14	0.11	0.81	0.3	0.52	1.0	0.43
Cpa\|evm.model.tig00001415.10 (tig00001415_g8677.t1)	0.87	0.87	0.65	0.5	0.15	0.13	0.35	0.56	0.5	0.63	0.71	0.76	0.94	0.38	0.34	0.36	0.3	0.52	0.37	0.32	0.09	0.94	0.31	0.42	1.0	0.67
Cpa\|evm.model.tig00001416.5 (tig00001416_g8952.t1)	0.75	0.55	0.46	0.45	0.51	0.43	0.53	0.56	0.51	0.57	0.67	0.82	1.0	0.46	0.36	0.42	0.31	0.44	0.38	0.34	0.07	0.88	0.35	0.38	0.58	0.46
Cpa\|evm.model.tig00001501.6 (tig00001501_g9221.t1)	0.64	0.44	0.42	0.41	0.53	0.55	0.58	0.54	0.66	0.61	0.72	0.81	0.78	0.62	0.47	0.6	0.64	0.48	0.51	0.44	0.28	1.0	0.22	0.61	0.4	0.44
Cpa\|evm.model.tig00020553.294 (tig00020553_g10778.t1)	0.5	0.34	0.36	0.5	0.48	0.48	0.81	0.78	0.61	0.54	0.6	0.55	0.74	0.46	0.25	0.41	0.24	0.36	0.23	0.25	0.21	1.0	0.39	0.45	0.66	0.61
Cpa\|evm.model.tig00020554.73 (tig00020554_g10853.t1)	0.88	0.67	0.73	0.83	0.79	0.74	0.63	0.61	0.57	0.6	0.72	0.91	1.0	0.41	0.35	0.37	0.38	0.52	0.37	0.32	0.16	0.86	0.83	0.52	0.63	0.57
Cpa\|evm.model.tig00020560.9 (tig00020560_g11074.t1)	1.0	0.85	0.66	0.43	0.21	0.14	0.19	0.35	0.32	0.53	0.62	0.73	0.96	0.37	0.28	0.53	0.32	0.45	0.34	0.4	0.06	0.91	0.32	0.49	0.86	0.75
Cpa\|evm.model.tig00020592.13 (tig00020592_g11644.t1)	1.0	0.55	0.53	0.65	0.56	0.39	0.28	0.41	0.4	0.5	0.65	0.68	0.51	0.09	0.07	0.14	0.04	0.05	0.09	0.07	0.11	0.15	0.48	0.43	0.26	0.55
Cpa\|evm.model.tig00020610.104 (tig00020610_g12050.t1)	1.0	0.63	0.64	0.6	0.44	0.33	0.45	0.59	0.35	0.35	0.37	0.41	0.98	0.39	0.57	0.49	0.44	0.62	0.56	0.44	0.17	0.59	0.19	0.3	0.56	0.58
Cpa\|evm.model.tig00020629.116 (tig00020629_g12440.t1)	0.82	0.53	0.46	0.51	0.45	0.41	0.62	0.66	0.52	0.58	0.69	0.68	1.0	0.63	0.3	0.45	0.35	0.51	0.25	0.37	0.12	0.99	0.25	0.35	0.68	0.79
Cpa\|evm.model.tig00020693.27 (tig00020693_g13034.t1)	0.83	0.74	0.58	0.44	0.26	0.21	0.41	0.48	0.56	0.62	0.71	0.77	1.0	0.43	0.31	0.44	0.25	0.47	0.31	0.38	0.16	0.85	0.69	0.6	0.48	0.58
Cpa\|evm.model.tig00020703.27 (tig00020703_g13129.t1)	0.96	0.28	0.14	0.06	0.02	0.02	0.07	0.14	0.08	0.18	0.32	0.53	1.0	0.12	0.09	0.11	0.1	0.18	0.12	0.11	0.13	0.72	0.06	0.26	0.39	0.26
Cpa\|evm.model.tig00020734.29 (tig00020734_g13585.t1)	0.8	0.4	0.35	0.26	0.11	0.05	0.09	0.15	0.14	0.22	0.41	0.65	0.97	0.66	0.35	0.42	0.29	0.27	0.19	0.2	0.11	1.0	0.16	0.46	0.38	0.31
Cpa\|evm.model.tig00020830.38 (tig00020830_g14419.t1)	0.59	0.46	0.49	0.43	0.26	0.09	0.08	0.16	0.15	0.15	0.23	0.38	0.67	0.17	0.16	0.36	0.2	0.28	0.22	0.28	0.54	1.0	0.07	0.16	0.48	0.4
Cpa\|evm.model.tig00020830.41 (tig00020830_g14423.t1)	0.81	0.49	0.41	0.48	0.52	0.52	0.65	0.69	0.66	0.62	0.72	0.77	0.87	0.61	0.48	0.47	0.44	0.5	0.46	0.35	0.15	1.0	0.3	0.38	0.37	0.42
Cpa\|evm.model.tig00020848.38 (tig00020848_g14565.t1)	0.89	0.68	0.48	0.46	0.29	0.22	0.41	0.58	0.66	0.81	0.83	0.81	1.0	0.44	0.43	0.5	0.39	0.57	0.54	0.41	0.09	0.56	0.49	0.46	0.7	0.53
Cpa\|evm.model.tig00020851.19 (tig00020851_g14717.t1)	0.46	0.23	0.34	0.42	0.4	0.4	0.48	0.53	0.5	0.41	0.45	0.47	0.37	0.06	0.07	0.05	0.08	0.18	0.14	0.17	0.07	0.31	0.32	0.41	1.0	0.31
Cpa\|evm.model.tig00021036.115 (tig00021036_g17400.t1)	0.89	0.76	0.66	0.77	0.72	0.78	0.73	0.71	0.59	0.49	0.72	0.92	1.0	0.24	0.29	0.33	0.21	0.34	0.41	0.26	0.2	0.52	0.72	0.62	0.53	0.54
Cpa\|evm.model.tig00021038.69 (tig00021038_g17557.t1)	0.81	0.7	0.69	0.63	0.54	0.53	0.43	0.37	0.52	0.54	0.77	0.95	0.8	0.59	0.45	0.73	0.29	0.29	0.34	0.27	0.25	1.0	0.73	0.65	0.42	0.49
Cpa\|evm.model.tig00021070.36 (tig00021070_g17839.t1)	0.66	0.49	0.36	0.33	0.14	0.13	0.23	0.38	0.55	0.66	0.84	0.78	0.8	0.44	0.18	0.44	0.23	0.48	0.17	0.19	0.16	0.48	0.36	0.8	1.0	0.46
Cpa\|evm.model.tig00021105.40 (tig00021105_g18253.t1)	1.0	0.72	0.52	0.47	0.28	0.29	0.52	0.59	0.61	0.6	0.67	0.71	0.99	0.23	0.32	0.19	0.3	0.35	0.26	0.26	0.05	0.79	0.54	0.43	0.56	0.5
Cpa\|evm.model.tig00021126.12 (tig00021126_g18462.t1)	0.51	0.36	0.34	0.31	0.21	0.12	0.13	0.17	0.13	0.18	0.3	0.53	0.52	0.35	0.21	0.65	0.33	0.29	0.19	0.21	0.3	1.0	0.09	0.27	0.31	0.25
Cpa\|evm.model.tig00021222.6 (tig00021222_g19363.t1)	0.73	0.41	0.29	0.19	0.08	0.04	0.08	0.11	0.07	0.11	0.17	0.29	0.81	0.24	0.28	0.26	0.23	0.33	0.23	0.16	0.4	1.0	0.21	0.19	0.25	0.22
Cpa\|evm.model.tig00021281.44 (tig00021281_g19942.t1)	0.66	0.34	0.23	0.19	0.1	0.07	0.08	0.1	0.08	0.04	0.11	0.28	1.0	0.6	0.22	0.3	0.14	0.26	0.24	0.1	0.27	0.58	0.22	0.09	0.31	0.27
Cpa\|evm.model.tig00021290.15 (tig00021290_g19979.t1)	0.78	0.4	0.32	0.67	0.58	0.32	0.53	0.43	0.39	0.51	0.71	0.86	1.0	0.56	0.23	0.34	0.29	0.26	0.24	0.16	0.13	0.88	0.35	0.39	0.54	0.35
Cpa\|evm.model.tig00021357.53 (tig00021357_g20778.t1)	0.91	0.69	0.57	0.58	0.55	0.36	0.51	0.58	0.58	0.71	0.8	0.78	0.91	0.54	0.57	0.52	0.49	0.55	0.4	0.6	0.3	0.93	0.79	1.0	0.89	0.83
Cpa\|evm.model.tig00021374.10 (tig00021374_g21093.t1)	0.82	0.57	0.39	0.56	0.25	0.09	0.19	0.29	0.29	0.42	0.75	0.98	1.0	0.2	0.15	0.19	0.2	0.24	0.16	0.24	0.14	0.89	0.53	0.65	0.45	0.45
Cpa\|evm.model.tig00021501.16 (tig00021501_g21956.t1)	0.59	0.26	0.2	0.41	0.3	0.17	0.25	0.25	0.3	0.27	0.61	0.67	0.57	0.33	0.2	0.25	0.17	0.16	0.17	0.13	0.15	1.0	0.41	0.41	0.29	0.19
Cpa\|evm.model.tig00021537.73 (tig00021537_g22324.t1)	0.96	0.58	0.41	0.36	0.15	0.05	0.14	0.38	0.34	0.55	0.72	1.0	0.97	0.38	0.16	0.2	0.12	0.18	0.25	0.26	0.09	0.73	0.54	0.51	0.99	0.72

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)