Heatmap: Cluster_104 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000042.36 (tig00000042_g15427.t1)	0.01	0.01	0.05	0.07	0.1	0.11	0.12	0.1	0.15	0.15	0.16	0.15	0.01	0.11	0.07	0.12	0.07	0.08	0.08	0.07	0.25	0.11	1.0	0.26	0.12	0.13
Cpa\|evm.model.tig00000073.65 (tig00000073_g1748.t1)	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.09	0.03	1.0	0.06	0.04	0.04
Cpa\|evm.model.tig00000093.61 (tig00000396_g24894.t1)	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.04	0.06	0.09	0.05	0.06	0.02	0.01	0.07	0.04	0.05	0.01	0.06	0.02	0.03	0.06	0.01	1.0	0.22	0.07	0.17
Cpa\|evm.model.tig00000114.47 (tig00000114_g6052.t1)	0.09	0.04	0.02	0.02	0.06	0.1	0.13	0.11	0.16	0.18	0.18	0.2	0.07	0.11	0.06	0.07	0.08	0.13	0.09	0.09	0.09	0.14	1.0	0.2	0.15	0.13
Cpa\|evm.model.tig00000128.21 (tig00000128_g7222.t1)	0.14	0.19	0.09	0.12	0.09	0.08	0.1	0.14	0.15	0.12	0.19	0.2	0.09	0.06	0.05	0.05	0.06	0.12	0.12	0.07	0.18	0.04	1.0	0.17	0.16	0.11
Cpa\|evm.model.tig00000144.26 (tig00000144_g9015.t1)	0.02	0.02	0.04	0.1	0.12	0.12	0.12	0.14	0.18	0.15	0.14	0.13	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.08	0.05	0.06	0.08	0.04	1.0	0.2	0.12	0.07
Cpa\|evm.model.tig00000145.26 (tig00000145_g8822.t1)	0.04	0.04	0.03	0.05	0.05	0.03	0.02	0.03	0.05	0.05	0.06	0.04	0.02	0.04	0.04	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.03	1.0	0.13	0.04	0.05
Cpa\|evm.model.tig00000190.46	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.14	0.09	1.0	0.09	0.05	0.05
Cpa\|evm.model.tig00000241.194 (tig00000241_g21061.t1)	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.02	0.07	0.05	1.0	0.09	0.05	0.04
Cpa\|evm.model.tig00000319.15 (tig00000319_g24127.t1)	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.05	0.05	0.02	0.17	0.04	1.0	0.09	0.04	0.06
Cpa\|evm.model.tig00000383.100 (tig00000383_g24710.t1)	0.01	0.02	0.03	0.05	0.06	0.07	0.07	0.08	0.1	0.1	0.1	0.09	0.0	0.05	0.03	0.04	0.06	0.07	0.05	0.05	0.07	0.09	1.0	0.15	0.15	0.11
Cpa\|evm.model.tig00000402.22 (tig00000402_g200.t1)	0.08	0.08	0.05	0.07	0.05	0.03	0.05	0.05	0.06	0.04	0.07	0.04	0.14	0.01	0.02	0.01	0.09	0.03	0.03	0.02	0.07	0.01	1.0	0.01	0.07	0.03
Cpa\|evm.model.tig00000523.40 (tig00000523_g1862.t1)	0.05	0.07	0.07	0.09	0.13	0.14	0.17	0.14	0.17	0.15	0.15	0.16	0.04	0.05	0.11	0.06	0.1	0.16	0.14	0.11	0.08	0.13	1.0	0.3	0.2	0.09
Cpa\|evm.model.tig00000615.39 (tig00000615_g2567.t1)	0.11	0.14	0.11	0.12	0.14	0.15	0.13	0.11	0.12	0.12	0.14	0.13	0.1	0.08	0.13	0.11	0.1	0.19	0.16	0.09	0.14	0.07	1.0	0.3	0.08	0.09
Cpa\|evm.model.tig00000658.7 (tig00000658_g2902.t1)	0.07	0.04	0.06	0.05	0.05	0.08	0.05	0.06	0.06	0.11	0.09	0.08	0.05	0.09	0.06	0.07	0.08	0.12	0.13	0.12	0.23	0.03	1.0	0.22	0.1	0.14
Cpa\|evm.model.tig00000681.20 (tig00000681_g3068.t1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.14	0.0	0.12	0.08	0.12	0.0	0.09	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0
Cpa\|evm.model.tig00000691.17 (tig00000691_g3166.t1)	0.1	0.04	0.06	0.09	0.19	0.16	0.25	0.2	0.18	0.09	0.08	0.06	0.07	0.04	0.03	0.07	0.08	0.15	0.13	0.09	0.2	0.06	1.0	0.16	0.3	0.1
Cpa\|evm.model.tig00000769.25 (tig00000769_g4019.t1)	0.14	0.21	0.23	0.23	0.17	0.14	0.13	0.16	0.18	0.19	0.18	0.18	0.16	0.05	0.07	0.07	0.12	0.16	0.13	0.16	0.04	0.14	1.0	0.17	0.13	0.1
Cpa\|evm.model.tig00000863.4 (tig00000863_g4961.t1)	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.05	0.05	0.04	0.01	0.12	0.15	0.04	0.04	0.06	0.03	0.04	0.13	0.02	1.0	0.23	0.06	0.09
Cpa\|evm.model.tig00000863.5 (tig00000202_g16612.t1)	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.06	0.04	0.04	0.01	0.14	0.14	0.07	0.05	0.05	0.03	0.03	0.14	0.02	1.0	0.19	0.06	0.08
Cpa\|evm.model.tig00000863.6 (tig00000630_g2713.t1)	0.02	0.01	0.01	0.02	0.0	0.02	0.04	0.04	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.1	0.1	0.02	0.03	0.05	0.03	0.02	0.15	0.03	1.0	0.25	0.12	0.07
Cpa\|evm.model.tig00000863.7 (tig00000863_g4961.t1)	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.04	0.03	0.02	0.04	0.05	0.03	0.01	0.08	0.09	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.12	0.03	1.0	0.16	0.06	0.06
Cpa\|evm.model.tig00000863.8 (tig00000863_g4962.t1)	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.05	0.05	0.04	0.01	0.08	0.1	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.13	0.02	1.0	0.2	0.07	0.06
Cpa\|evm.model.tig00000880.41 (tig00000880_g5199.t1)	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.06	0.05	0.02	0.05	0.06	0.06	0.06	0.0	0.01	0.02	0.01	0.0	0.04	0.03	0.02	0.08	0.05	1.0	0.2	0.02	0.03
Cpa\|evm.model.tig00000939.13 (tig00000939_g5490.t1)	0.04	0.06	0.05	0.07	0.07	0.09	0.08	0.06	0.08	0.06	0.07	0.06	0.02	0.06	0.06	0.05	0.06	0.1	0.1	0.07	0.28	0.11	1.0	0.23	0.12	0.11
Cpa\|evm.model.tig00001030.39 (tig00001030_g6478.t1)	0.09	0.03	0.04	0.07	0.09	0.09	0.08	0.09	0.11	0.08	0.1	0.1	0.09	0.04	0.06	0.05	0.04	0.05	0.05	0.03	0.18	0.07	1.0	0.24	0.11	0.09
Cpa\|evm.model.tig00001067.8 (tig00001067_g6767.t1)	0.05	0.09	0.1	0.17	0.15	0.11	0.17	0.16	0.24	0.19	0.17	0.13	0.03	0.11	0.13	0.15	0.13	0.18	0.17	0.15	0.1	0.21	1.0	0.17	0.18	0.16
Cpa\|evm.model.tig00001107.20 (tig00001107_g7104.t1)	0.17	0.11	0.07	0.04	0.05	0.09	0.15	0.18	0.15	0.13	0.11	0.1	0.15	0.06	0.07	0.05	0.1	0.15	0.12	0.13	0.16	0.05	1.0	0.15	0.14	0.09
Cpa\|evm.model.tig00001343.8 (tig00001343_g8333.t1)	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.05	0.0	0.0	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.0	0.11	0.02	1.0	0.19	0.23	0.09
Cpa\|evm.model.tig00001371.19 (tig00001371_g8436.t1)	0.08	0.05	0.06	0.07	0.08	0.11	0.1	0.11	0.15	0.16	0.2	0.21	0.09	0.09	0.09	0.11	0.1	0.13	0.13	0.13	0.25	0.12	1.0	0.38	0.17	0.16
Cpa\|evm.model.tig00001388.14 (tig00001388_g8584.t1)	0.03	0.01	0.03	0.08	0.11	0.08	0.12	0.1	0.15	0.17	0.19	0.15	0.05	0.08	0.09	0.08	0.06	0.12	0.12	0.07	0.19	0.14	1.0	0.25	0.14	0.08
Cpa\|evm.model.tig00001471.10 (tig00001471_g8872.t1)	0.11	0.07	0.05	0.05	0.06	0.06	0.08	0.08	0.1	0.11	0.13	0.14	0.08	0.06	0.08	0.06	0.07	0.09	0.1	0.06	0.19	0.05	1.0	0.26	0.13	0.15
Cpa\|evm.model.tig00001527.11 (tig00001527_g9262.t1)	0.05	0.17	0.16	0.14	0.13	0.12	0.14	0.16	0.15	0.1	0.09	0.06	0.03	0.04	0.11	0.03	0.09	0.17	0.28	0.1	0.07	0.06	1.0	0.07	0.06	0.05
Cpa\|evm.model.tig00001590.2 (tig00001590_g9374.t1)	0.06	0.09	0.09	0.11	0.13	0.12	0.13	0.13	0.2	0.22	0.26	0.3	0.08	0.07	0.05	0.08	0.07	0.1	0.09	0.09	0.11	0.14	1.0	0.36	0.16	0.14
Cpa\|evm.model.tig00001623.9 (tig00001623_g9423.t1)	0.06	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.04	0.05	0.06	0.05	0.07	0.06	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.19	0.06	1.0	0.12	0.08	0.05
Cpa\|evm.model.tig00020538.51 (tig00020538_g10359.t1)	0.05	0.05	0.05	0.05	0.07	0.05	0.04	0.06	0.06	0.06	0.06	0.08	0.07	0.03	0.04	0.03	0.04	0.07	0.04	0.02	0.08	0.08	1.0	0.22	0.13	0.09
Cpa\|evm.model.tig00020556.54 (tig00020556_g11024.t1)	0.04	0.04	0.0	0.01	0.05	0.0	0.09	0.02	0.06	0.01	0.05	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.04	0.07	0.0	1.0	0.02	0.01	0.0
Cpa\|evm.model.tig00020560.30 (tig00020560_g11095.t1)	0.04	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.05	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.09	0.01	1.0	0.08	0.06	0.05
Cpa\|evm.model.tig00020610.147 (tig00020610_g12094.t1)	0.01	0.04	0.09	0.03	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.07	0.07	0.05	0.0	0.1	0.14	0.05	0.05	0.0	1.0	0.11	0.03	0.09
Cpa\|evm.model.tig00020611.9 (tig00020611_g12104.t1)	0.01	0.02	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.0	0.04	0.04	0.01	0.06	0.02	1.0	0.1	0.08	0.04
Cpa\|evm.model.tig00020629.34 (tig00020629_g12356.t1)	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.0	0.02	0.14	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.05	0.02	1.0	0.07	0.03	0.04
Cpa\|evm.model.tig00020629.41 (tig00020629_g12364.t1)	0.13	0.13	0.11	0.14	0.16	0.15	0.15	0.12	0.13	0.14	0.14	0.16	0.11	0.16	0.15	0.16	0.13	0.12	0.17	0.12	0.09	0.1	1.0	0.17	0.14	0.14
Cpa\|evm.model.tig00020734.52 (tig00020734_g13606.t1)	0.16	0.07	0.05	0.09	0.06	0.07	0.07	0.11	0.19	0.11	0.25	0.28	0.14	0.03	0.08	0.05	0.03	0.1	0.1	0.08	0.09	0.06	1.0	0.06	0.12	0.03
Cpa\|evm.model.tig00020801.98 (tig00020801_g13982.t1)	0.07	0.1	0.09	0.1	0.12	0.12	0.13	0.13	0.14	0.2	0.23	0.25	0.06	0.11	0.09	0.13	0.11	0.11	0.11	0.09	0.11	0.1	1.0	0.33	0.19	0.14
Cpa\|evm.model.tig00020816.65 (tig00020816_g14153.t1)	0.01	0.02	0.03	0.03	0.09	0.1	0.07	0.06	0.04	0.03	0.02	0.02	0.0	0.03	0.02	0.05	0.02	0.07	0.06	0.03	0.03	0.02	1.0	0.07	0.08	0.06
Cpa\|evm.model.tig00020878.19 (tig00020878_g14865.t1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.24	0.0	1.0	0.05	0.0	0.0
Cpa\|evm.model.tig00020904.115 (tig00020904_g15244.t1)	0.11	0.04	0.03	0.04	0.04	0.05	0.1	0.11	0.12	0.15	0.18	0.15	0.1	0.02	0.04	0.03	0.05	0.07	0.06	0.06	0.13	0.01	1.0	0.3	0.12	0.05
Cpa\|evm.model.tig00020927.31 (tig00020927_g15960.t1)	0.07	0.05	0.05	0.09	0.07	0.06	0.08	0.07	0.09	0.06	0.08	0.08	0.05	0.03	0.04	0.03	0.03	0.06	0.05	0.05	0.21	0.12	1.0	0.19	0.18	0.08
Cpa\|evm.model.tig00020930.16 (tig00020930_g16026.t1)	0.01	0.04	0.03	0.05	0.07	0.08	0.11	0.08	0.12	0.11	0.12	0.1	0.02	0.05	0.05	0.05	0.05	0.1	0.06	0.04	0.14	0.17	1.0	0.31	0.15	0.11
Cpa\|evm.model.tig00020965.38 (tig00020965_g16853.t1)	0.06	0.06	0.02	0.02	0.0	0.0	0.02	0.02	0.04	0.09	0.07	0.04	0.02	0.01	0.0	0.02	0.0	0.05	0.09	0.03	0.04	0.0	1.0	0.05	0.0	0.09
Cpa\|evm.model.tig00021037.66 (tig00021037_g17474.t1)	0.03	0.02	0.02	0.07	0.06	0.06	0.04	0.07	0.09	0.07	0.1	0.06	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.03	0.02	0.19	0.14	1.0	0.26	0.15	0.1
Cpa\|evm.model.tig00021068.2 (tig00021068_g17800.t1)	0.1	0.1	0.13	0.12	0.06	0.03	0.04	0.06	0.04	0.05	0.07	0.07	0.07	0.1	0.1	0.08	0.06	0.09	0.08	0.08	0.15	0.07	1.0	0.14	0.13	0.21
Cpa\|evm.model.tig00021127.86 (tig00021127_g18763.t1)	0.06	0.06	0.05	0.07	0.07	0.1	0.07	0.07	0.09	0.08	0.09	0.12	0.05	0.04	0.06	0.04	0.05	0.07	0.09	0.05	0.22	0.04	1.0	0.18	0.11	0.07
Cpa\|evm.model.tig00021168.29 (tig00021168_g19095.t1)	0.0	0.01	0.0	0.03	0.02	0.02	0.04	0.02	0.05	0.03	0.03	0.04	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.17	0.01	1.0	0.05	0.03	0.02
Cpa\|evm.model.tig00021181.6 (tig00021181_g19310.t1)	0.04	0.08	0.11	0.11	0.13	0.15	0.13	0.12	0.16	0.17	0.15	0.2	0.04	0.07	0.09	0.14	0.11	0.18	0.18	0.13	0.09	0.02	1.0	0.27	0.11	0.17
Cpa\|evm.model.tig00021326.22 (tig00021326_g20289.t1)	0.03	0.07	0.04	0.11	0.07	0.05	0.05	0.08	0.05	0.05	0.08	0.07	0.02	0.04	0.05	0.03	0.03	0.08	0.07	0.04	0.22	0.06	1.0	0.1	0.13	0.1
Cpa\|evm.model.tig00021332.15 (tig00021332_g20334.t1)	0.02	0.08	0.11	0.13	0.14	0.12	0.14	0.13	0.14	0.14	0.14	0.15	0.02	0.12	0.13	0.13	0.11	0.15	0.13	0.1	0.24	0.2	1.0	0.25	0.18	0.17
Cpa\|evm.model.tig00021621.5 (tig00021621_g22961.t1)	0.01	0.04	0.06	0.06	0.09	0.05	0.08	0.1	0.07	0.1	0.09	0.07	0.02	0.04	0.06	0.05	0.04	0.06	0.07	0.08	0.05	0.02	1.0	0.11	0.08	0.05

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)