1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_92 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000025.42 (tig00020556_g11029.t1)
 3.64 - - - 3.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000076.16 (tig00000076_g2317.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
Cpa|evm.model.tig00000093.75 (tig00000093_g3504.t1)
 - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000113.106 (tig00001049_g6669.t1)
 - 1.51 0.63 - 1.91 - - 0.51 - - - - - 2.05 2.13 0.52 - -0.12 - 2.47 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000113.72 (tig00000113_g5650.t1)
 1.08 - -1.62 -0.04 1.76 1.21 1.15 0.45 0.74 -0.12 -0.06 0.06 0.8 0.88 - - -0.65 -1.19 -1.97 - -1.01 -2.02 -1.28 0.6 -1.23 -0.51
Cpa|evm.model.tig00000139.7 (tig00000139_g8300.t1)
 - - - - 3.42 - - 3.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000144.197 (tig00000144_g9192.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000145.30 (tig00000145_g8827.t1)
 - - - - 3.58 - - - 3.81 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000147.11 (tig00000147_g9448.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000157.53 (tig00000836_g4707.t1)
 0.2 2.09 - 0.59 2.21 - - - 2.08 - 0.47 - - - - - 0.74 1.94 1.74 - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000158.26 (tig00000158_g10137.t1)
 - - - - 2.6 1.29 - - - - - -2.77 - - - - - - 2.18 3.03 - 0.67 - - - 1.61
- - 1.12 1.52 1.18 - - -0.22 0.95 - - - 0.29 - - - 0.98 0.91 2.53 0.57 1.52 - -0.48 - - -
Cpa|evm.model.tig00000180.12 (tig00000180_g13620.t1)
 - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000194.14 (tig00000194_g14741.t1)
 - 0.92 0.01 1.9 2.04 - 0.46 - - -0.1 - 1.43 - 1.57 1.57 - 1.57 -0.73 - - - -0.38 - - - -
Cpa|evm.model.tig00000206.5 (tig00020675_g12692.t1)
 - - - - - 4.06 - - - - - - - - - - - - - - 3.22 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000215.77 (tig00001049_g6669.t1)
 - - - - 4.68 - - -1.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000219.89 (tig00000219_g19525.t1)
 - - - - 3.63 - - - - - - - - 3.77 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000227.34 (tig00000227_g19821.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000248.73 (tig00021351_g20664.t1)
 - - - - 3.59 2.2 - - - - - - - - - 2.44 - - - 1.98 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000254.113 (tig00000254_g22570.t1)
 - 1.09 - - 2.13 1.86 1.29 - - - - 0.94 - 0.26 0.76 - - - - - 2.86 0.45 - - - -
Cpa|evm.model.tig00000293.25 (tig00000293_g23893.t1)
 - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000342.68 (tig00000342_g24256.t1)
 1.07 -1.45 -0.8 0.05 2.11 1.64 -1.02 -0.82 0.03 0.51 0.48 1.39 0.38 -1.2 - -0.89 0.17 -1.62 -0.39 - 0.15 - -0.11 -1.13 - -
Cpa|evm.model.tig00000388.31 (tig00020614_g12164.t1)
 - - - - 4.18 - -0.99 - - - 2.89 - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000402.63 (tig00000402_g240.t1)
 - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000404.66 (tig00000404_g426.t1)
 - - - - - - - 3.94 - - - - - - - - - - - 3.41 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000455.58 (tig00020553_g10741.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000552.4 (tig00000552_g2056.t1)
 - - - - 2.3 - - 2.81 - 2.51 - - - - - - - 1.85 - 2.27 - - - - - -
- - - - 3.99 - - - - - - - - - - - - - - - 3.34 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000658.19 (tig00000658_g2910.t1)
 - - - - 4.05 - - - - - - 3.24 - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000692.54 (tig00021338_g20366.t1)
 - 1.98 - - 3.63 - - - - - - - - 2.73 1.63 - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000743.9 (tig00021071_g17953.t1)
 0.58 -0.19 - 0.06 0.46 -1.55 - -0.54 0.86 0.34 -0.63 0.11 2.09 -2.15 -0.07 0.54 -0.36 1.17 -1.64 -1.89 - 1.42 -1.94 -1.66 -2.24 0.48
Cpa|evm.model.tig00000767.17 (tig00000826_g4598.t1)
 2.27 - - - 3.28 - - 2.79 - - - - - - - - - - - - - 2.18 - - - -
Cpa|evm.model.tig00000767.24 (tig00000767_g3969.t1)
 - - - - 3.54 - - - - - 3.85 - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000829.34 (tig00000829_g4677.t1)
 - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000842.48 (tig00021762_g23471.t2)
 - - - - 3.99 - - - - - - - - - - - - - - - 3.34 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000850.6 (tig00020564_g11455.t1)
 - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000863.57 (tig00000863_g5011.t1)
 -0.74 -0.67 -0.85 -0.81 1.22 1.0 -0.71 -0.17 -0.34 0.06 1.23 0.25 -0.45 -0.63 -0.02 -2.45 0.36 0.65 0.94 -1.66 -1.11 -2.69 -0.65 1.08 -0.77 -0.27
Cpa|evm.model.tig00000963.2 (tig00021489_g21651.t1)
 - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000983.9 (tig00020938_g16152.t1)
 - - -1.79 - 4.2 - -1.59 - - -1.88 - - - - - - - -2.38 -0.23 - - -0.73 2.15 - -0.62 -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001163.4 (tig00021680_g23058.t1)
 - - - - 2.47 - - - 2.75 - - 2.87 - - - - - - - 2.68 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001178.10 (tig00001178_g7390.t1)
 - - - - 3.34 - - - - - 3.37 - - - - - - - - - 2.46 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001220.3 (tig00001220_g7618.t1)
 -1.51 0.54 -1.2 -0.19 1.79 -0.12 - 0.27 0.48 -1.32 0.31 - 1.23 - 2.2 - -1.0 1.01 0.74 -0.4 0.13 - -1.58 -1.3 -0.85 -
Cpa|evm.model.tig00001307.12 (tig00000254_g22563.t1)
 - - - - 3.92 - - - - - - - - - - - - 3.44 - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001365.8 (tig00001365_g8360.t1)
 -3.12 -0.77 0.12 -0.31 2.1 2.0 2.04 0.75 0.15 -3.15 -2.46 -2.96 - -3.41 - - - -2.34 -1.99 - -1.16 -3.45 - 0.55 2.35 -2.97
Cpa|evm.model.tig00001409.5 (tig00021312_g20068.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001467.22 (tig00001467_g8771.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020510.10 (tig00020510_g9796.t1)
 - - - - 2.27 0.78 - - - - - - 0.66 - - - - 1.94 3.05 0.44 - - - 0.66 - 1.51
Cpa|evm.model.tig00020510.11 (tig00020510_g9799.t1)
 - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 3.02 3.22 - - - - - - - 1.67 - - - - - - 1.7 1.07 - - - -
Cpa|evm.model.tig00020538.81 (tig00020944_g16345.t1)
 - - - - 3.61 - - - - 3.79 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020545.2 (tig00020545_g10454.t1)
 - - - - 3.68 - - - - - 3.72 - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020553.265 (tig00020553_g10751.t1)
 - -1.41 - - -0.03 -0.98 -0.54 - - 0.55 - 0.11 0.42 - -1.08 -0.85 0.79 -1.58 2.86 - 1.74 1.2 0.67 - -0.08 0.09
Cpa|evm.model.tig00020561.8 (tig00020904_g15213.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020608.13 (tig00020608_g11935.t1)
 - 1.12 - 1.49 2.66 - 1.55 1.75 - - - 1.63 - - - - - - 2.41 - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020611.14 (tig00021374_g21135.t1)
 - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020614.123 (tig00020554_g10792.t1)
 - - - - 2.98 - - 3.16 - - - - - - - - - - 3.2 - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020629.52 (tig00020629_g12373.t1)
 2.1 1.85 2.1 0.59 1.06 -1.06 - 1.96 -0.95 - 0.44 - 0.34 - 0.84 - -0.84 - - -1.4 - - - - - -
- - - - 3.31 - - - - - - - 4.01 - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020704.3 (tig00020704_g13143.t1)
 - - - - 1.38 - - - - 1.37 - - - - - - - 0.89 - 2.38 - 1.09 1.11 1.38 - 2.78
Cpa|evm.model.tig00020796.1 (tig00020796_g13714.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020801.106 (tig00020801_g13991.t1)
 - - - - 4.09 - 2.32 - 1.99 - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020801.26 (tig00020801_g13911.t1)
 - - - - 3.64 - - - - - 3.75 - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020816.105 (tig00020816_g14192.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020824.20 (tig00020824_g14249.t1)
 - - - - 3.54 - - - - - 3.85 - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020825.20 (tig00020825_g14303.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.83 - - - - - 3.56 -
Cpa|evm.model.tig00020851.21 (tig00021137_g18999.t1)
 - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020904.142 (tig00020904_g15269.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 3.91 - - - - - - 3.46 - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020921.14 (tig00000215_g18604.t1)
 -1.15 0.98 -0.02 -1.61 1.32 -0.32 0.32 -1.21 - -0.44 -0.72 -2.6 - 0.49 1.41 0.67 1.22 1.68 -0.34 0.96 - -0.23 - -1.17 -3.3 -1.11
Cpa|evm.model.tig00020934.10 (tig00020934_g16082.t1)
 - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020934.7 (tig00020934_g16080.t1)
 - - - - 1.91 - - 2.1 - 2.12 - - - - 3.04 - - - - - 1.22 - - - 1.6 -
Cpa|evm.model.tig00020996.21 (tig00020996_g16935.t1)
 0.51 0.3 -1.38 0.06 1.35 -0.01 0.84 - 0.99 -1.65 1.68 0.81 0.43 - -1.69 -1.62 0.93 0.58 0.99 -1.98 - -1.0 - - -2.28 -0.03
Cpa|evm.model.tig00021014.13 (tig00000767_g3962.t1)
 - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021036.75 (tig00020816_g14217.t1)
 - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021037.13 (tig00021037_g17419.t1)
 - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021038.85 (tig00021038_g17574.t1)
 -1.41 -1.52 0.05 -0.11 2.3 2.54 -0.2 - 0.26 2.64 -0.55 - -1.11 - 0.35 - -2.93 -0.67 -3.48 -0.33 - -3.38 - - -3.8 -
Cpa|evm.model.tig00021070.29 (tig00021070_g17833.t1)
 - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021105.16 (tig00021105_g18231.t1)
 - - - - 3.84 - - - - - - - - 3.55 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021127.165 (tig00021127_g18851.t1)
 1.39 - - - 2.39 1.59 - - - 0.6 - - 0.58 1.8 - 0.67 - 1.02 0.68 0.61 -0.25 - - - 0.02 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 3.59 - - - - - - - - - - - - - - 3.8 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021238.24 (tig00000246_g21506.t1)
 2.21 - - - 3.21 2.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.41 - -
Cpa|evm.model.tig00021248.9 (tig00021248_g19620.t1)
 - - - - - - - 2.86 - - - - - - - - - 1.9 - 2.33 - - - 2.55 2.04 -
Cpa|evm.model.tig00021326.29 (tig00021326_g20295.t2)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021357.59 (tig00021357_g20782.t1)
 - - - - 4.47 - 1.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021435.8 (tig00021435_g21386.t1)
 -0.12 0.58 1.28 -3.03 2.25 0.88 - -2.22 0.71 0.86 0.91 1.58 -1.67 -2.0 1.92 - -1.39 -3.26 -3.46 -3.2 -4.1 -1.15 - - -1.79 -3.61
Cpa|evm.model.tig00021518.22 (tig00021518_g22039.t1)
 2.64 - - - 2.65 - - - - 2.9 - - - - - - - - 2.59 - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021535.11 (tig00021535_g22218.t1)
 -0.16 1.21 -2.2 0.53 0.31 -2.3 - -1.25 -0.37 0.43 0.34 -0.3 -1.81 -2.37 -1.13 - -0.19 1.43 1.28 -0.19 -0.73 1.58 -0.41 -0.28 -1.56 0.81
Cpa|evm.model.tig00021537.79 (tig00021537_g22328.t1)
 - - 0.87 - 1.59 - - -0.23 -0.13 2.27 -0.32 - 0.18 0.75 -0.5 -0.36 - 0.71 2.03 - -0.22 - - - 0.72 0.33
Cpa|evm.model.tig00021572.36 (tig00021572_g22417.t1)
 - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021616.2 (tig00021616_g22909.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021763.3 (tig00021763_g23510.t1)
 - - - - 4.59 - 0.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.