Heatmap: Cluster_72 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000053.10 (tig00000053_g23494.t1)	0.3	0.36	0.39	0.46	0.47	0.47	0.47	0.43	0.45	0.4	0.34	0.29	0.3	0.42	0.64	0.58	0.47	0.79	0.69	0.5	0.36	1.0	0.55	0.46	0.42	0.48
Cpa\|evm.model.tig00000057.99 (tig00000057_g119.t1)	0.26	0.26	0.25	0.21	0.16	0.12	0.21	0.22	0.19	0.24	0.23	0.22	0.31	0.38	0.42	0.44	0.28	0.39	0.33	0.22	0.35	1.0	0.37	0.31	0.29	0.37
Cpa\|evm.model.tig00000076.44 (tig00000076_g2343.t1)	0.07	0.06	0.06	0.06	0.06	0.03	0.06	0.07	0.06	0.08	0.07	0.05	0.06	0.1	0.09	0.56	0.04	0.15	0.18	0.08	0.2	1.0	0.1	0.1	0.05	0.13
Cpa\|evm.model.tig00000076.60 (tig00000076_g2360.t1)	0.04	0.16	0.13	0.21	0.2	0.17	0.14	0.15	0.12	0.13	0.12	0.11	0.04	0.36	0.57	0.34	0.21	0.72	0.5	0.19	0.23	1.0	0.34	0.22	0.3	0.35
Cpa\|evm.model.tig00000093.244 (tig00000093_g3666.t1)	0.04	0.11	0.16	0.2	0.33	0.47	0.33	0.35	0.31	0.2	0.26	0.27	0.06	0.28	0.21	0.21	0.13	0.25	0.2	0.15	0.04	1.0	0.43	0.23	0.3	0.21
Cpa\|evm.model.tig00000093.256 (tig00000093_g3677.t1)	0.23	0.31	0.28	0.35	0.26	0.16	0.2	0.3	0.29	0.28	0.34	0.28	0.34	0.61	0.51	0.84	0.19	0.66	0.35	0.08	0.19	1.0	0.35	0.36	0.46	0.28
Cpa\|evm.model.tig00000144.21 (tig00000144_g9010.t1)	0.44	0.56	0.53	0.54	0.6	0.6	0.7	0.66	0.62	0.61	0.52	0.46	0.37	0.52	0.87	0.56	0.66	0.92	1.0	0.78	0.54	0.87	0.58	0.57	0.45	0.47
Cpa\|evm.model.tig00000147.30 (tig00000403_g282.t1)	0.07	0.17	0.16	0.25	0.39	0.57	0.35	0.34	0.45	0.61	0.48	0.42	0.09	0.2	0.33	0.3	0.27	0.63	0.75	0.32	0.1	1.0	0.84	0.34	0.28	0.29
Cpa\|evm.model.tig00000219.66 (tig00000219_g19502.t1)	0.21	0.19	0.18	0.26	0.29	0.23	0.29	0.28	0.34	0.39	0.42	0.37	0.25	0.62	0.59	0.66	0.37	0.59	0.38	0.27	0.31	1.0	0.4	0.51	0.41	0.41
Cpa\|evm.model.tig00000241.191 (tig00000241_g21059.t1)	0.38	0.45	0.53	0.48	0.49	0.45	0.45	0.44	0.36	0.37	0.31	0.31	0.39	0.62	0.82	0.73	0.53	0.68	0.67	0.5	0.41	1.0	0.49	0.49	0.41	0.74
Cpa\|evm.model.tig00000367.27 (tig00000367_g24463.t1)	0.23	0.29	0.31	0.25	0.14	0.08	0.16	0.21	0.2	0.28	0.25	0.21	0.33	0.41	0.58	0.55	0.38	0.62	0.54	0.28	0.64	1.0	0.63	0.4	0.49	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000367.36 (tig00000367_g24472.t1)	0.26	0.57	0.5	0.46	0.58	0.68	0.74	0.72	0.96	0.9	0.81	0.61	0.19	0.46	0.81	0.66	0.62	0.89	1.0	0.67	0.19	0.74	0.95	0.63	0.36	0.46
Cpa\|evm.model.tig00000385.21 (tig00000792_g4216.t1)	0.32	0.42	0.43	0.43	0.51	0.52	0.6	0.55	0.38	0.37	0.34	0.22	0.28	0.56	0.57	0.68	0.7	1.0	0.98	0.77	0.24	0.93	1.0	0.34	0.69	0.5
Cpa\|evm.model.tig00000402.40 (tig00000402_g217.t1)	0.12	0.14	0.15	0.14	0.16	0.17	0.21	0.18	0.15	0.17	0.13	0.12	0.1	0.31	0.37	0.3	0.27	0.46	0.45	0.28	0.26	1.0	0.16	0.22	0.22	0.38
Cpa\|evm.model.tig00000478.19 (tig00000478_g1268.t1)	0.23	0.26	0.31	0.39	0.58	0.63	0.6	0.56	0.45	0.46	0.38	0.29	0.22	0.27	0.39	0.68	0.33	0.83	0.74	0.58	0.3	1.0	0.28	0.46	0.4	0.65
Cpa\|evm.model.tig00000478.20 (tig00000478_g1269.t1)	0.09	0.1	0.12	0.14	0.17	0.16	0.17	0.15	0.15	0.15	0.11	0.11	0.08	0.31	0.25	0.56	0.13	0.28	0.24	0.16	0.19	1.0	0.2	0.27	0.26	0.39
Cpa\|evm.model.tig00000555.6 (tig00000555_g2133.t1)	0.36	0.37	0.35	0.4	0.38	0.31	0.25	0.22	0.23	0.26	0.21	0.21	0.27	0.49	0.6	0.52	0.4	0.71	0.56	0.35	0.25	1.0	0.37	0.36	0.49	0.43
Cpa\|evm.model.tig00000655.16 (tig00000655_g2842.t1)	0.15	0.22	0.28	0.28	0.27	0.3	0.32	0.26	0.33	0.26	0.22	0.2	0.16	0.57	0.44	0.58	0.36	0.66	0.5	0.39	0.24	1.0	0.31	0.29	0.55	0.38
Cpa\|evm.model.tig00000692.37 (tig00000692_g3232.t1)	0.48	0.48	0.61	0.51	0.39	0.36	0.49	0.5	0.48	0.41	0.39	0.33	0.44	0.72	0.84	0.89	0.71	0.82	0.73	0.58	0.58	1.0	0.6	0.51	0.53	0.66
Cpa\|evm.model.tig00000711.15 (tig00000711_g3375.t1)	0.21	0.37	0.48	0.39	0.49	0.61	0.54	0.56	0.46	0.42	0.4	0.29	0.16	0.65	0.73	0.64	0.45	0.89	0.64	0.5	0.34	1.0	0.91	0.3	0.57	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000754.22 (tig00000754_g3905.t2)	0.25	0.25	0.25	0.25	0.29	0.29	0.36	0.34	0.32	0.32	0.27	0.26	0.23	0.49	0.45	0.51	0.39	0.63	0.46	0.38	0.2	1.0	0.31	0.31	0.32	0.36
Cpa\|evm.model.tig00000792.39 (tig00000792_g4190.t1)	0.17	0.16	0.17	0.18	0.17	0.13	0.2	0.19	0.19	0.18	0.19	0.16	0.18	0.27	0.41	0.27	0.4	0.48	0.32	0.21	0.44	1.0	0.46	0.36	0.57	0.35
Cpa\|evm.model.tig00000802.59 (tig00000802_g4308.t1)	0.43	0.55	0.48	0.6	0.57	0.53	0.59	0.54	0.52	0.47	0.54	0.48	0.4	0.54	0.45	0.54	0.37	0.82	0.8	0.44	0.41	1.0	0.63	0.49	0.57	0.44
Cpa\|evm.model.tig00000806.51 (tig00000806_g4381.t1)	0.27	0.29	0.32	0.36	0.47	0.62	0.47	0.38	0.48	0.51	0.45	0.45	0.23	0.34	0.34	0.43	0.39	0.62	0.63	0.51	0.22	1.0	0.51	0.61	0.47	0.46
Cpa\|evm.model.tig00000829.2 (tig00000525_g1950.t1)	0.51	0.5	0.39	0.5	0.59	0.65	0.62	0.59	0.72	0.71	0.72	0.69	0.49	0.38	0.43	0.48	0.46	0.72	0.81	0.47	0.11	1.0	0.54	0.57	0.39	0.32
Cpa\|evm.model.tig00000863.52 (tig00000863_g5006.t1)	0.01	0.09	0.15	0.19	0.29	0.32	0.27	0.23	0.28	0.23	0.21	0.17	0.01	0.3	0.18	0.27	0.2	0.21	0.25	0.2	0.11	1.0	0.32	0.3	0.19	0.33
Cpa\|evm.model.tig00000940.5 (tig00000940_g5543.t1)	0.43	0.55	0.56	0.5	0.63	0.67	0.77	0.94	0.63	0.72	0.68	0.61	0.47	0.5	0.54	0.75	0.44	0.67	0.82	0.59	0.34	1.0	0.52	0.48	0.46	0.91
Cpa\|evm.model.tig00000949.36 (tig00000949_g5749.t1)	0.02	0.15	0.35	0.44	0.59	0.77	0.62	0.45	0.55	0.42	0.3	0.26	0.02	0.79	0.67	0.76	0.55	0.64	0.47	0.48	0.19	1.0	0.39	0.41	0.52	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000989.36 (tig00000989_g6109.t1)	0.61	0.75	0.69	0.79	0.71	0.54	0.59	0.69	0.54	0.56	0.59	0.5	0.53	0.59	0.79	0.63	0.57	0.95	1.0	0.55	0.44	1.0	0.79	0.48	0.78	0.71
Cpa\|evm.model.tig00001024.21 (tig00001024_g6329.t1)	0.33	0.28	0.24	0.32	0.38	0.27	0.36	0.42	0.45	0.35	0.46	0.35	0.3	0.46	0.68	0.55	0.4	0.74	0.68	0.32	0.59	1.0	0.83	0.79	0.49	0.54
Cpa\|evm.model.tig00001086.37 (tig00001086_g6872.t1)	0.42	0.34	0.38	0.4	0.36	0.26	0.34	0.38	0.29	0.35	0.33	0.32	0.41	0.55	0.65	0.61	0.45	0.73	0.6	0.39	0.53	1.0	0.5	0.41	0.42	0.49
Cpa\|evm.model.tig00001094.23 (tig00001094_g6996.t1)	0.8	0.68	0.63	0.58	0.61	0.59	0.61	0.57	0.54	0.53	0.49	0.54	0.72	0.58	0.59	0.64	0.68	0.93	0.7	0.67	0.51	1.0	0.45	0.52	0.7	0.7
Cpa\|evm.model.tig00001127.8 (tig00001264_g7862.t1)	0.14	0.1	0.07	0.1	0.13	0.09	0.13	0.13	0.18	0.18	0.19	0.2	0.14	0.28	0.24	0.3	0.11	0.16	0.1	0.08	0.2	1.0	0.27	0.22	0.21	0.1
Cpa\|evm.model.tig00001181.21 (tig00001181_g7435.t1)	0.13	0.32	0.38	0.36	0.43	0.56	0.44	0.39	0.45	0.49	0.36	0.31	0.1	0.24	0.36	0.34	0.41	0.56	0.55	0.39	0.03	1.0	0.3	0.3	0.43	0.43
Cpa\|evm.model.tig00001222.13 (tig00001222_g7609.t1)	0.33	0.32	0.25	0.46	0.37	0.41	0.44	0.44	0.51	0.34	0.3	0.29	0.32	0.37	0.3	0.3	0.14	0.56	0.3	0.19	0.54	1.0	0.36	0.36	0.62	0.58
Cpa\|evm.model.tig00001222.15 (tig00001222_g7609.t1)	0.25	0.33	0.22	0.36	0.24	0.34	0.35	0.43	0.36	0.25	0.26	0.29	0.23	0.33	0.21	0.27	0.22	0.55	0.3	0.2	0.53	1.0	0.47	0.23	0.52	0.45
Cpa\|evm.model.tig00001284.1 (tig00001284_g7999.t1)	0.16	0.21	0.19	0.24	0.22	0.23	0.27	0.26	0.24	0.2	0.16	0.14	0.13	0.21	0.36	0.27	0.21	0.37	0.42	0.18	0.28	1.0	0.32	0.35	0.28	0.23
Cpa\|evm.model.tig00001336.15 (tig00001336_g8232.t1)	0.21	0.2	0.25	0.29	0.28	0.22	0.26	0.25	0.19	0.21	0.19	0.2	0.26	0.46	0.51	0.6	0.37	0.43	0.46	0.27	0.34	1.0	0.46	0.33	0.31	0.37
Cpa\|evm.model.tig00001466.5 (tig00001466_g8783.t1)	0.75	0.69	0.55	0.57	0.73	0.72	0.64	0.55	0.52	0.48	0.48	0.5	0.64	0.82	0.57	1.0	0.69	0.93	0.75	0.6	0.54	0.96	0.67	0.61	0.84	1.0
Cpa\|evm.model.tig00001669.3 (tig00001669_g9557.t2)	0.41	0.19	0.11	0.1	0.12	0.15	0.26	0.26	0.18	0.15	0.13	0.12	0.37	0.3	0.36	0.3	0.2	0.5	0.43	0.14	0.46	1.0	0.32	0.23	0.34	0.26
Cpa\|evm.model.tig00020538.62 (tig00020538_g10369.t1)	0.11	0.2	0.13	0.16	0.2	0.17	0.17	0.18	0.19	0.17	0.15	0.11	0.11	0.23	0.28	0.36	0.13	0.46	0.31	0.12	0.36	1.0	0.24	0.2	0.2	0.26
Cpa\|evm.model.tig00020603.35 (tig00020603_g11765.t1)	0.26	0.24	0.19	0.26	0.27	0.29	0.35	0.3	0.35	0.29	0.31	0.28	0.25	0.4	0.3	0.44	0.29	0.36	0.34	0.2	0.13	1.0	0.64	0.32	0.41	0.39
Cpa\|evm.model.tig00020614.86 (tig00020614_g12201.t1)	0.17	0.24	0.3	0.33	0.47	0.64	0.6	0.48	0.57	0.5	0.37	0.32	0.17	0.73	0.65	0.73	0.59	0.75	0.64	0.55	0.19	1.0	0.53	0.49	0.45	0.39
Cpa\|evm.model.tig00020614.90 (tig00020614_g12204.t1)	0.32	0.28	0.21	0.27	0.26	0.21	0.29	0.33	0.28	0.33	0.31	0.34	0.26	0.42	0.57	0.38	0.25	0.49	0.28	0.24	0.3	1.0	0.33	0.33	0.43	0.34
Cpa\|evm.model.tig00020675.90 (tig00020675_g12673.t1)	0.18	0.24	0.26	0.27	0.33	0.27	0.26	0.24	0.24	0.27	0.23	0.23	0.24	0.42	0.66	0.53	0.3	0.51	0.51	0.32	0.11	1.0	0.2	0.25	0.22	0.36
Cpa\|evm.model.tig00020724.2 (tig00020724_g13415.t1)	0.1	0.15	0.2	0.25	0.26	0.23	0.31	0.19	0.26	0.15	0.27	0.17	0.12	0.24	0.33	0.23	0.16	0.46	0.38	0.13	0.32	1.0	0.17	0.39	0.51	0.25
Cpa\|evm.model.tig00020824.7 (tig00020824_g14233.t1)	0.01	0.02	0.09	0.09	0.19	0.37	0.41	0.16	0.09	0.13	0.08	0.08	0.02	0.75	0.84	0.53	0.67	0.7	0.47	0.22	0.07	0.81	1.0	0.2	0.32	0.24
Cpa\|evm.model.tig00020828.5 (tig00020828_g14364.t1)	0.05	0.13	0.16	0.14	0.1	0.07	0.14	0.19	0.18	0.22	0.23	0.24	0.08	0.39	0.5	0.54	0.3	0.52	0.39	0.19	0.47	1.0	0.59	0.3	0.36	0.27
Cpa\|evm.model.tig00020944.18 (tig00020944_g16360.t1)	0.64	0.65	0.67	0.7	0.61	0.53	0.52	0.51	0.46	0.4	0.38	0.37	0.54	0.66	0.68	0.82	0.52	0.92	0.77	0.43	0.37	0.81	0.56	0.46	1.0	0.66
Cpa\|evm.model.tig00020961.56 (tig00020961_g16678.t1)	0.11	0.29	0.37	0.43	0.55	0.65	0.78	0.66	0.95	0.78	0.64	0.45	0.11	0.55	0.48	0.6	0.51	1.0	0.74	0.56	0.14	0.72	0.82	0.56	0.35	0.44
Cpa\|evm.model.tig00021070.71 (tig00021070_g17876.t1)	0.12	0.26	0.34	0.36	0.53	0.68	0.67	0.48	0.48	0.35	0.25	0.24	0.11	0.79	0.73	0.97	0.55	0.8	0.6	0.55	0.16	1.0	0.46	0.43	0.45	0.47
Cpa\|evm.model.tig00021127.46 (tig00021127_g18723.t1)	0.06	0.08	0.16	0.17	0.2	0.28	0.27	0.22	0.26	0.24	0.17	0.13	0.07	0.24	0.75	0.29	0.39	0.84	0.87	0.65	0.66	1.0	0.64	0.35	0.27	0.35
Cpa\|evm.model.tig00021234.14 (tig00021234_g19388.t1)	0.33	0.28	0.32	0.4	0.42	0.47	0.45	0.42	0.39	0.29	0.28	0.28	0.24	0.37	0.51	0.5	0.31	0.63	0.67	0.36	0.37	1.0	0.2	0.3	0.37	0.4
Cpa\|evm.model.tig00021350.29 (tig00021350_g20646.t1)	0.48	0.58	0.59	0.55	0.53	0.48	0.49	0.52	0.48	0.47	0.43	0.42	0.46	0.53	0.86	0.66	0.48	0.77	0.77	0.47	0.41	1.0	0.49	0.51	0.6	0.51
Cpa\|evm.model.tig00021352.29 (tig00021352_g20699.t1)	0.76	0.65	0.69	0.72	0.63	0.52	0.59	0.64	0.43	0.47	0.46	0.51	0.86	0.43	0.77	0.5	0.6	0.86	0.69	0.52	0.42	1.0	0.69	0.39	0.85	0.7
Cpa\|evm.model.tig00021435.4 (tig00021435_g21382.t1)	0.11	0.13	0.17	0.18	0.22	0.21	0.21	0.19	0.2	0.23	0.18	0.18	0.14	0.28	0.44	0.32	0.35	0.59	0.45	0.34	0.1	1.0	0.23	0.25	0.23	0.26
Cpa\|evm.model.tig00021463.21 (tig00021463_g21629.t1)	0.28	0.27	0.3	0.29	0.23	0.25	0.25	0.3	0.27	0.23	0.25	0.23	0.33	0.32	0.41	0.33	0.19	0.31	0.25	0.18	0.29	1.0	0.4	0.27	0.35	0.36
Cpa\|evm.model.tig00021517.26	0.11	0.15	0.21	0.33	0.43	0.52	0.5	0.49	0.6	0.5	0.44	0.4	0.07	0.29	0.36	0.35	0.23	0.57	0.52	0.24	0.25	1.0	0.88	0.25	0.42	0.27
Cpa\|evm.model.tig00021537.19 (tig00021537_g22274.t1)	0.15	0.12	0.15	0.16	0.23	0.26	0.27	0.25	0.17	0.13	0.14	0.1	0.1	0.25	0.28	0.35	0.22	0.29	0.35	0.17	0.36	1.0	0.3	0.27	0.33	0.32
Cpa\|evm.model.tig00021580.7 (tig00021580_g22597.t1)	0.11	0.13	0.11	0.13	0.15	0.15	0.14	0.16	0.15	0.17	0.13	0.12	0.12	0.15	0.2	0.4	0.08	0.2	0.16	0.11	0.16	1.0	0.13	0.24	0.22	0.23
Cpa\|evm.model.tig00021582.41 (tig00021582_g22638.t1)	0.08	0.13	0.21	0.28	0.32	0.44	0.47	0.4	0.44	0.29	0.21	0.15	0.06	0.52	0.46	0.66	0.43	0.58	0.48	0.35	0.25	1.0	0.42	0.29	0.37	0.39
Cpa\|evm.model.tig00021617.6 (tig00000880_g5166.t1)	0.15	0.19	0.23	0.28	0.49	0.59	0.57	0.52	0.56	0.5	0.45	0.32	0.1	0.33	0.31	0.29	0.39	0.55	0.67	0.36	0.19	1.0	0.25	0.5	0.63	0.36

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)