Heatmap: Cluster_109 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
BOF 92
BOF 92,Log
CCMP1516,Log,5mM sulfate,ESAW,15C
CCMP1516,Log,25mM sulfate,ESAW,15C
CCMP2090
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,18C
CCMP2090,Log,DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP370,pH7.8,Aquil,20C
CCMP370,pH8.1,Aquil,20C
CCMP371,17C
CCMP373,Log
CCMP373,Stationary
CCMP374,Log
CCMP374,Stationary
CCMP374,pH8.3,F/2-Si,18C
CCMP379,pH8.3,F/2-Si,18C
PLY M219,pH7.8,Aquil,20C
PLY M219,pH8.1,Aquil,20C
RCC1253
RCC3782
RCC6660,Log,pH7.2
RCC6660,Log,pH7.5
RCC6660,Log,pH7.8
RCC6660,Log,pH8.2
RCC6666,Log,pH7.2
RCC6666,Log,pH7.5
RCC6666,Log,pH7.8
RCC6666,Log,pH8.2
UNC1419,Log,Aquil,12C
- -0.61 0.31 - -0.65 1.1 -1.43 0.84 -2.0 -0.32 0.25 0.74 0.13 -1.62 1.73 1.16 1.16 2.21 0.43 2.32 1.96 - 0.28 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - -
- - - - - 1.31 - - - - - - - 2.0 - - - - - - - - - - - 4.88 - - - - - - - - - -
-12.94 - - 2.16 0.58 1.02 1.84 1.09 - -24.94 1.64 - - -0.64 - - -0.77 - - - - - 3.02 -1.65 -0.65 - - - -0.23 0.1 1.64 - - - 0.57 1.25
- - - - -0.71 - - -2.36 0.26 - - - - - 2.16 1.17 -0.56 - - - - - - 1.98 0.98 4.11 1.75 - - - - - - - - -
- - - - - -1.51 - -2.67 - - - - - - - - - - 2.97 - - - - - - 4.55 2.1 - - - - - - - - -
4.29 2.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.59 - - - - - - - - - -
- - 4.04 - - - - - - - - 3.73 - - - - 2.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.89 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 1.81 - - - - - - - - - - - - 3.77 - - - - - - - 3.19 3.28 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - -
3.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.59 1.36 - - - - - - - - -
- - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.21 1.34 -0.72 -2.08 -0.69 -0.14 -0.2 -0.48 0.08 -1.06 -0.56 -1.09 -0.7 0.14 -0.48 0.33 -2.02 -4.5 -3.71 -3.83 -4.62 -4.25 -0.98 -0.77 -0.53 2.85 1.45 -0.32 0.13 -0.16 -1.05 0.7 0.4 0.75 0.86 -5.15
- - - - - 0.11 -0.33 -2.16 1.54 -2.35 -4.73 -0.9 -1.64 -0.58 - - -2.19 - - - - 1.22 - - - 4.74 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - -
3.97 - - - - -2.13 - - - - -2.71 -0.52 - - 0.91 - -0.61 - - - 0.26 -0.27 - 2.5 - 2.75 - - - -0.18 -0.78 - - -0.2 - -
- 4.97 - - 0.37 1.46 - - - - - - - - - - -0.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - -2.37 2.06 - 1.31 - 1.17 2.18 0.67 2.03 - - - 1.86 - - - 1.06 - - - - - - 2.9 - - - - 0.65 - 0.95
- - 1.8 - -0.44 - - 1.08 0.7 2.51 0.56 - 0.61 0.94 - - - -0.27 2.61 2.77 1.87 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.87 - -0.73 - 0.57 - -1.2 -0.75 1.02 0.45 -1.53 - - -2.12 - - - - - 1.55 - - - - 3.82 1.58 1.91 - - -0.44 - -0.39 -
- -1.25 -0.13 0.7 -1.94 -1.68 -0.9 -0.96 -2.24 -1.38 -0.54 - -1.21 -1.76 0.6 -24.6 0.43 0.43 4.05 - - -1.21 -5.25 0.56 - 2.47 -0.24 -1.83 - - - - - - - -
- - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.96 - - - -0.83 1.5 - - 4.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.65 -1.32 - -0.73 1.49 - - 4.34 0.64 2.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.54 - - -1.48 - -3.64 -1.11 0.64 3.68 -1.1 -1.77 - - - 1.58 2.95 - - 1.78 - - - - - - - - - - - - - -
-0.58 1.72 -0.12 -0.07 -2.55 -2.84 - -2.62 -2.08 -0.76 -0.58 -1.33 -4.29 -5.99 - - - -0.15 0.3 - - -3.23 2.11 - - 4.38 -2.44 - - - - - -3.1 - - -
2.66 0.65 -1.4 -0.38 -0.83 -0.92 -0.69 -0.06 -2.03 -4.88 0.81 -3.18 -0.93 -2.75 1.57 1.9 1.65 - - - - 1.07 -1.95 1.27 -1.17 - -1.37 -0.03 -0.62 -0.12 -0.37 -0.16 -0.83 -1.08 -0.51 -3.24
- - - - - - - - 1.67 - - 4.27 0.78 - - - - - - - - - - - - - 3.55 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.85 -0.68 - -0.75 -5.62 -3.43 -5.97 -3.39 -4.02 -4.92 -3.23 - -4.53 -4.41 -1.77 -0.89 -1.94 -3.04 - - - -1.69 -0.94 -3.2 -1.66 4.89 -5.52 -2.37 -4.94 -2.53 -0.62 -2.44 -2.57 -3.54 -1.73 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - -
- - 2.23 1.13 -1.06 -1.22 0.41 0.11 -0.59 -0.41 -1.55 0.18 -0.75 -2.38 -0.55 - -1.86 -0.39 - 0.86 - - -1.01 1.05 0.99 -1.69 -1.21 1.41 1.53 0.24 0.61 0.24 -0.24 0.37 -0.02 -0.43
- - - - - - - - - - - - 0.69 0.65 - - 2.22 - - - - - - 4.2 - - 3.29 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - -1.24 - - - - - 1.22 - - - 0.33 - - 5.0 - - - - - - - - - -
- - 3.01 - - 0.92 - - 0.35 - - 1.74 1.1 -0.59 - - 0.96 - - - - - 3.09 - - - - - - 1.74 2.27 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.42 - - 5.06 - - - - - - - - - -
- - - - - - - 2.54 - - 1.87 3.8 - 3.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - -
- - - - 0.42 - - 1.09 - - - - -0.84 0.09 - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - -
- - - - -0.4 1.54 0.24 -0.19 1.54 1.0 2.03 - 0.55 1.05 - - - - - - - - - - - 4.15 - - - - - - - - - -
- - - - 2.5 - 2.84 - - - 2.53 - - 2.29 - - - - - - - - 3.64 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 2.32 - - - - - -1.22 - - - - - - - - 4.93 - - - - - - - - - -
- - - - - -1.52 -0.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.92 - - - - - - - - - 2.26
- - - - - - - - 1.57 - - - - 1.06 - - - - - - - - 2.64 2.61 3.62 - - - - - - 2.66 - - - -
- - - - 0.42 - - 1.09 - - - - -0.84 0.09 - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - -
- - - - 0.86 - - 1.54 - - - - -0.4 0.53 - - - 4.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.32 - - - -0.8 - - -2.49 -7.18 - - - - - - - 0.52 - - - - - - - - 3.43 - - 1.62 - - - - - -6.86 -
- - - - 3.41 2.47 - 1.37 3.33 - - - 1.76 1.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 1.82 0.21 - 0.93 0.45 - - 0.7 - - - - 1.45 - - 1.46 4.39 - - - - - - - - - -
- -1.35 -0.09 0.93 0.82 0.75 1.0 1.42 1.02 -3.57 2.12 - 0.38 -1.44 1.05 0.75 1.71 - - - - 2.38 -0.64 - 0.14 - -0.06 - -0.79 -1.76 -2.54 -3.58 -3.46 -3.34 - -1.93
-1.82 -3.45 1.89 - - -1.36 -2.0 -2.05 -3.7 -1.72 -3.41 -0.22 -2.12 -2.46 -2.87 - -2.58 - - - - - - - - 4.74 1.2 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 0.42 - - 1.09 - - - - -0.84 0.09 - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - -
- - - - 0.41 -0.88 - 0.38 1.48 - - - 1.2 1.45 - - - - - - - 0.83 - - - 4.54 - - - - - - - - - -
- - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.