Heatmap: Cluster_53 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
BOF 92
BOF 92,Log
CCMP1516,Log,5mM sulfate,ESAW,15C
CCMP1516,Log,25mM sulfate,ESAW,15C
CCMP2090
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,18C
CCMP2090,Log,DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP370,pH7.8,Aquil,20C
CCMP370,pH8.1,Aquil,20C
CCMP371,17C
CCMP373,Log
CCMP373,Stationary
CCMP374,Log
CCMP374,Stationary
CCMP374,pH8.3,F/2-Si,18C
CCMP379,pH8.3,F/2-Si,18C
PLY M219,pH7.8,Aquil,20C
PLY M219,pH8.1,Aquil,20C
RCC1253
RCC3782
RCC6660,Log,pH7.2
RCC6660,Log,pH7.5
RCC6660,Log,pH7.8
RCC6660,Log,pH8.2
RCC6666,Log,pH7.2
RCC6666,Log,pH7.5
RCC6666,Log,pH7.8
RCC6666,Log,pH8.2
UNC1419,Log,Aquil,12C
- - 2.33 - - - - -2.16 0.03 -0.47 1.11 0.73 -0.91 - 0.94 - 1.51 - - 2.35 0.3 - - 0.56 - 1.86 - - - - - - - - - 3.08
- - - - - - - - - - - -0.94 - - - - -4.34 1.22 - - - - - - - - - 0.72 3.94 2.35 - - - 3.46 - -
- - 2.58 2.45 - - - -1.16 - -5.06 - -2.82 - -3.06 - - 1.01 - - - - -0.33 - - - - -0.65 - 2.03 - 0.81 - - 3.18 - 2.45
- - -0.57 0.94 1.1 0.04 1.46 0.98 0.61 -1.4 -0.86 2.28 -0.38 1.66 - - -3.03 - -2.15 - - - - - - -0.31 - 2.27 1.36 - 0.22 -1.02 0.26 -1.3 1.3 -
- -24.63 - -10.06 - 2.35 - - 0.44 - - - - -12.33 - - 0.89 - - - - 4.62 - - - - - - - - - 1.6 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.04 - 2.98 - 3.55 - - - -
- - 1.49 - 1.58 1.91 1.5 2.62 0.52 2.94 1.39 0.33 1.03 0.44 - - - -1.11 - - - - - - - - -1.65 - - - - -2.82 -2.86 - - -
- - 1.56 2.97 - - - - - - - 0.45 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.5 -0.25 0.63 1.49 2.26 -1.77 1.11 3.1
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.55 - - - - 2.28 2.17 - 0.27 -3.03 1.57 4.03 1.62 -
- 1.66 - - -2.16 -1.37 -1.94 -2.0 -1.6 -1.74 -1.31 -1.39 -1.01 -1.02 - - -0.44 1.53 0.77 0.3 -0.75 - - - - -1.48 -1.66 1.52 0.75 1.32 -0.27 1.01 1.41 1.42 1.45 1.82
2.45 -1.12 0.97 -8.28 -10.44 -1.03 -2.14 -0.47 0.04 -1.24 -2.39 - -2.11 - 2.03 2.63 -1.05 - - - - -2.09 -0.71 -0.16 -12.14 - 0.46 -0.34 2.54 - - - 1.22 1.0 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.82 - - - - 2.95 - -
- - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - 4.2 - - -3.03 - - - - - - - 3.74 - - - - - - 1.59
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.95 - - 2.93 2.35 1.89 2.96 2.03 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 -20.66 - - - - - - -
0.78 0.32 0.87 - - -2.61 -0.67 -0.39 -1.23 -2.38 0.64 -2.15 -3.54 -3.07 1.47 0.43 0.51 0.73 - -0.15 -1.02 0.9 1.61 1.29 0.82 0.43 0.52 0.18 -0.52 0.02 -1.84 -0.24 -2.47 0.46 -0.45 -1.78
- - - - - - 3.53 3.61 - 1.17 1.62 - 1.08 2.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.74 -0.65 2.14 2.94 2.76 0.97 1.66 1.7 2.73 -1.36 -0.19
-0.08 - - - -4.64 -3.96 - -1.82 - -2.03 -2.5 -2.44 -1.93 - -1.61 -0.08 -1.35 -0.94 - - -2.0 - -0.61 -0.73 -1.71 - - -0.35 1.98 1.41 -0.57 2.15 1.82 3.24 0.17 1.67
2.05 - - - -3.8 -0.95 -6.74 -2.8 -0.91 -26.84 -1.9 -0.87 -14.72 -3.23 - - -4.15 1.84 1.35 0.41 -0.35 -1.21 -1.24 - -0.79 0.78 -0.28 1.38 1.86 -2.84 - 0.04 2.11 -1.37 -0.68 2.22
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - -
-1.04 -0.27 -1.64 0.9 0.34 0.09 -0.09 0.67 0.05 1.0 0.4 -2.41 0.1 -0.43 0.23 0.44 -4.06 0.02 -0.02 -0.79 -0.61 0.26 0.01 -0.2 -0.57 1.08 -0.45 -2.4 0.64 -17.69 -1.28 -1.26 0.15 1.18 -2.78 1.47
- - 1.46 1.85 0.34 -0.53 0.09 -0.26 0.11 -0.64 -0.2 0.4 -0.75 0.15 - -29.99 -11.9 - - -0.0 1.59 - -4.34 - - 0.44 -19.02 1.12 2.0 - -9.12 -3.93 -12.67 2.15 -14.56 2.03
- - - - 2.85 -0.56 - - 2.29 - - - 0.97 -0.55 - - - 2.94 3.13 - - - - - - - 2.04 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 4.49 - - - 3.64 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - -
- - -1.45 - -24.16 -1.02 - - - - - - - - - - -2.6 - - - - - - - - - - - 4.44 - - - - -14.17 - 3.73
- - - - - - - - 1.2 - - - - - - - 1.71 - - - - 4.32 - 3.39 - - - - - - - - - - - -
- - 3.16 - - -1.02 -1.13 2.8 - - - - - - - - - - - - 3.49 - - - - - - - 2.98 - - - - - - -
- 0.27 - - -0.19 -1.07 -1.16 1.08 -1.45 0.98 0.05 -1.35 -0.76 -1.0 3.34 -3.43 -0.75 - - -3.33 - -0.48 0.67 2.47 2.84 - -3.36 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - -
- -14.85 -1.09 0.89 -1.28 -0.6 -0.81 -0.33 -0.65 0.95 -0.16 -0.12 -1.4 -1.49 - -0.22 -1.42 0.48 0.39 0.96 1.38 -1.18 0.77 0.81 -17.64 -1.3 0.28 -0.74 0.27 -31.87 1.08 0.81 -0.25 1.07 -0.44 1.47
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - -
- - - - 0.37 1.27 0.42 1.45 0.06 -0.23 0.37 -0.5 0.51 -0.87 - - - - - 3.28 3.27 - - - - - - - - - - - - - - 1.58
- 1.45 - - - - - - - - - - - - 1.94 - -0.19 - 1.68 - - - - - - 0.93 - -0.24 0.79 2.11 1.86 0.89 2.67 1.49 0.91 -
- - - - - - - - - - - - - - - - -1.36 - - - - - - - - - - - 4.86 - 2.73 - - - - -
- - 1.55 0.74 -0.97 -1.02 -1.34 -1.44 -0.82 0.15 0.13 0.93 -1.6 -1.75 -21.05 -4.99 -2.73 -3.08 - - -0.4 -3.21 -1.6 - -1.92 1.63 0.77 1.51 1.47 0.7 -0.42 0.74 1.1 0.26 -0.21 1.96
- - - - - 1.07 - 0.46 - - - - - -1.52 - - -0.65 3.96 - - - - - - - 2.49 - 1.17 1.64 1.57 - - - 1.04 - -
0.18 2.48 -2.62 -2.31 - -2.44 -3.6 -0.95 -3.37 -3.74 -1.03 -4.14 -2.93 -3.45 1.4 - -6.65 -2.47 - - -2.32 -4.33 -3.07 - - -3.12 -5.08 -2.45 2.51 - - 0.48 1.58 2.66 0.01 2.64
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.33 2.31 - 2.38 - 4.38 - - -
- 2.13 - -3.03 - -4.04 -4.61 -3.54 -0.91 - - -1.91 - -1.6 - - -1.4 - - - - -0.26 0.28 - - - -0.29 2.45 1.56 - 1.72 1.06 2.11 2.04 1.24 1.25
- - - -1.64 0.94 1.03 0.91 1.38 1.07 1.5 1.39 -0.98 1.18 0.87 0.26 - -4.07 - - - - -2.6 - 2.23 2.01 1.88 -4.24 - - - - - - - - 0.27
-1.46 - 0.53 1.06 0.29 -1.19 0.28 -0.41 0.68 0.33 0.36 -0.46 -0.07 -0.6 - - -4.74 - - - - - -1.54 - - 1.34 0.23 -0.4 2.16 -2.6 1.12 -2.84 0.31 0.86 -2.0 2.79
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.85 - - - 2.43 3.34 3.73 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.36 - 3.84 0.79 1.79 2.06 2.55 0.74 - 1.82 -
0.18 - 2.03 -0.66 -0.8 0.44 0.58 0.79 1.13 -0.21 0.12 1.5 0.91 0.62 - - -4.57 - - - - 1.86 -0.13 1.32 2.35 -0.8 0.9 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.95 - - 2.93 2.35 1.89 2.96 2.03 - - -
- - -0.44 -0.69 -1.14 0.67 0.38 -1.73 -0.86 -1.93 -4.43 - -0.22 -0.11 - - - - - - - - 0.97 - - - - 3.18 2.82 -7.92 - - 3.13 0.59 - -
- - - - 2.16 1.97 1.27 2.77 0.85 2.85 1.25 1.44 0.64 1.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - -0.83 - 0.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.15 1.89 2.73 1.94 1.44 2.1 3.2 1.35 -
1.08 2.28 - 0.87 - - -1.37 - -2.01 - - - - - - - - -2.41 1.02 - - -2.41 - - - 0.99 -26.41 1.14 2.03 -12.41 - -1.61 1.92 2.58 -5.03 2.52
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.24 2.74 3.39 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.35 - - - 3.96 - -
- 2.7 - - -4.19 -3.69 -4.31 -1.93 -3.03 -1.68 -1.68 -1.92 - -1.8 - - -3.42 -0.18 -0.58 -0.13 -1.64 - - - - -1.52 -1.42 0.61 1.23 0.48 0.05 1.63 1.61 2.3 1.66 1.86
- - 3.07 - - - - - 1.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.32 - 4.35 - -
-0.86 -0.84 1.08 -4.0 -2.21 -2.05 -2.73 -2.0 -2.43 0.24 -0.66 -2.34 -3.06 -2.77 -0.52 -1.87 -1.32 -3.08 -1.42 -0.72 -1.23 -0.44 -3.38 0.67 -1.48 -1.5 -2.08 0.61 2.24 1.79 1.24 0.39 1.21 2.66 -0.43 -1.37
- - - - - - - - - - - - - - - - -0.75 - - - - -26.62 - - -14.91 - - 3.43 2.7 2.12 1.66 2.28 2.1 0.18 -25.44 -1.51
- 4.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.46 3.01 2.91 1.26 -0.79
- - - - - - - - - - - 0.33 - - 0.95 - -1.79 - - 1.13 1.65 - - - 0.8 - - 3.73 1.62 0.65 - -0.16 0.89 1.52 0.93 -
3.59 2.16 - - -0.24 -0.66 -1.2 0.41 -0.22 1.6 0.32 -0.62 -0.53 0.57 0.45 - -2.26 - - - - 0.36 - - - - - -0.18 -0.06 0.56 - 0.01 0.12 - - -
- - 4.64 - - 1.86 - - - 0.91 - 1.97 - - - - -0.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.01
- - 0.77 3.39 -4.06 -6.27 - - -3.7 -3.42 - -3.55 - -4.23 - - -5.32 - - - - - - -2.92 - 0.07 - -3.27 2.86 -2.33 - - 0.82 2.23 - 3.04
-17.78 1.88 - - - - -19.26 - - - - -0.09 - - - - -1.54 - - - - 2.2 - - - - - - 2.66 1.76 1.67 - 2.47 2.15 1.84 -
2.65 -1.49 -0.36 - 0.12 -0.56 -0.32 0.43 -0.96 -0.22 0.32 -0.7 -0.87 -0.57 0.72 1.12 -2.48 0.29 2.13 -0.75 0.42 0.38 -2.63 -0.82 -0.44 0.42 0.46 -1.9 -0.96 -1.22 -1.6 -1.06 -2.13 -1.23 -1.05 -4.56
- - 3.16 - - -1.02 -1.13 2.8 - - - - - - - - - - - - 3.49 - - - - - - - 2.98 - - - - - - -
-0.46 1.91 0.41 2.45 - -2.5 -3.66 -4.22 -2.62 - -4.12 -3.05 - -3.73 2.23 0.14 -1.42 - -2.2 - - -0.64 1.0 -14.42 -0.38 - -1.22 0.74 0.02 -2.09 -0.5 1.22 0.3 2.29 0.77 -
- - - - - - - - - - - - - - - - -0.29 - - - - - 1.05 - - - 1.75 - 3.8 - - -0.0 2.88 2.09 1.68 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.79 - - - - 4.32 3.65 - -
- - 2.54 0.01 1.27 1.27 0.94 1.89 -1.33 2.02 1.48 2.1 1.35 0.18 - - -2.08 0.63 0.81 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.26 - - - 0.99 - - -0.25 - - - - - - - -1.65 - - - - - - - - 1.23 - - - - - 2.29 0.83 4.25 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -1.18 - - -0.11 - - - - - 1.71 - 1.56 2.68 1.69 0.22 2.27 2.29 2.17 1.75 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.35 - - - 3.96 - -
- 3.33 1.02 - - - -2.49 - - - - 0.25 - - - - -0.61 - - - - - - - - 1.14 1.94 -0.74 3.26 - 1.02 -1.42 0.84 -0.63 -0.3 -
-0.54 -1.82 -0.16 1.31 -0.66 -0.52 -1.36 0.14 -0.6 0.4 -0.62 -1.25 -1.19 -0.53 - - - - 0.27 -6.03 -0.06 - -6.83 - - -0.37 1.32 0.59 -0.34 0.43 1.79 -0.87 -22.33 2.47 0.2 2.28
- - - 2.08 - - - - - -1.6 - - - - - - -1.17 - - - - - -0.8 - - 0.95 - 2.5 0.78 2.09 2.7 2.35 1.55 -4.04 1.18 -
- 3.33 1.02 - - - -2.49 - - - - 0.25 - - - - -0.61 - - - - - - - - 1.14 1.94 -0.74 3.26 - 1.02 -1.42 0.84 -0.63 -0.3 -
- - - - -0.97 - - -1.47 0.23 - - - -1.22 -2.09 - - - - - - - - - - - 0.43 - 2.32 - 0.28 - 2.68 1.81 3.47 2.23 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - -
- - - - -1.11 1.36 0.71 1.45 - - 0.35 - -0.69 -1.76 - - -0.87 - - - - - - - - - - 1.57 3.2 2.25 2.62 1.48 - - - -
- - 1.01 - - - - - - - - - - - 0.76 1.36 - - - - - - - - - - -0.58 2.32 2.74 1.94 1.0 1.27 1.27 1.69 1.81 -
- - -1.18 0.58 -1.22 -0.97 -1.09 -1.09 -0.93 -1.16 -0.63 - -2.72 -1.45 - - -3.97 - -0.38 - - -2.21 -2.23 - - 1.42 1.45 0.69 1.81 -24.13 0.35 -5.61 1.81 2.66 -7.79 2.84
- - - - 0.82 0.02 - 1.7 - - -1.6 2.41 -0.94 - - 3.12 -1.89 2.06 - 0.79 - - 2.07 - - - 0.21 - - - - 0.36 - 0.36 - 0.04
- - 1.73 - - - - - - - - 2.29 - - - - -1.57 - - 1.79 2.17 - - - - - - 2.01 3.39 1.42 -0.4 - -0.38 - -0.33 -
- - - - 0.97 3.18 2.02 2.65 - - 1.46 - - 2.66 - - -0.47 - - - - - -6.82 - - - - - - 2.27 - - - - - -
- - 1.82 3.4 - - - -17.2 - - -0.13 2.14 -0.34 - - - - 2.0 2.45 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.67
- - -1.32 -2.78 -1.69 -1.85 -1.94 -1.67 -2.11 -1.35 -1.39 -1.76 -1.23 -1.83 - -1.09 0.44 - - - -1.8 -3.84 - - -3.58 - - 0.1 2.47 2.29 1.39 0.89 2.91 2.13 0.99 -2.98
- - - - - - 3.53 3.61 - 1.17 1.62 - 1.08 2.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.26 - - - 0.99 - - -0.25 - - - - - - - -1.65 - - - - - - - - 1.23 - - - - - 2.29 0.83 4.25 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.01 1.1 - - 0.72 3.5 1.77 -0.82 -1.81 2.14 1.24 0.83 -
- - 2.82 - 2.02 - - 2.64 - 2.24 2.52 1.5 0.47 - - - - - - - - - - 1.99 - - - - - - - - - - - -
- - 1.17 - - - - -1.44 -2.56 - - - - -2.75 - - -1.47 - - -1.59 - - -8.88 0.02 - 0.08 - -13.87 -8.19 - 0.32 - -5.84 4.86 - -
- 3.0 - - 0.62 - - - 1.09 - -0.02 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - 3.68 - 2.17 - 1.11 - 1.48 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - -2.36 - - - - - - - - - - - 0.71 0.49 -1.46 - - 3.15 - 0.99 1.84 2.99 1.57 2.81 -
- - 0.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.51 - - - - 2.12 3.49 2.82 - 0.98 -1.29 2.74 -11.46 -
- - - - - - - 4.97 - - - - - 2.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.19 1.41 1.19 0.99 - - -4.18 - - - -2.81 -1.39 - -4.56 -0.4 -0.06 -1.79 0.17 -0.65 -0.64 -0.87 -2.59 - -0.99 -1.57 - - 1.37 2.42 1.32 1.12 0.01 1.26 2.1 0.41 -
- - 1.66 - -0.92 - 0.13 - - - - - - -2.56 - 1.39 -2.83 2.55 2.42 - - 1.32 1.46 - - - - - 0.01 0.42 1.06 - 2.69 -0.1 - -
- - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - -1.89 - - - - - - - - - - - - - - - - -0.41 - - - 4.07 - 1.38 -0.82 2.77 3.03 -
1.12 - -1.05 0.13 0.67 0.63 -0.17 1.42 0.95 1.2 1.24 - 0.33 0.53 0.44 -0.33 -0.67 - - 0.71 0.56 -0.13 1.13 0.26 0.83 - 1.14 -2.59 -0.98 - -2.59 -1.79 -1.68 -2.72 -3.19 -1.33
- - - - 2.5 0.82 2.05 1.91 - 3.02 2.33 1.1 0.45 2.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.78 -4.02 - - -0.0 - - -3.17 - - - - - - - -0.3 1.32 -17.96 0.38 - 1.7 - - - - - -0.25 3.9 - 0.2 - 2.22 - - 1.86
- - - 3.56 -2.91 -4.06 -2.31 -1.56 -1.75 -0.22 -3.6 - -1.7 -0.68 - - 0.47 - - - -0.26 2.37 - - - -1.11 - - 3.01 - 2.45 - - - - -
- - -9.94 -8.57 -13.37 -11.01 - - - -1.18 -12.38 - - -14.14 - - - 3.03 -9.57 -8.45 -10.07 -12.63 - - - - - 2.13 -7.92 -9.69 2.82 -6.98 -7.87 3.16 2.79 -9.59
-27.38 -0.23 0.14 -1.83 -2.22 -0.61 -1.34 -1.38 -2.25 -1.54 0.63 -3.0 -2.77 -0.48 -6.1 -0.16 -3.1 - 1.11 -6.18 -0.1 -1.83 -0.36 - 0.4 -2.14 0.79 1.08 1.44 0.09 0.29 0.93 2.19 2.03 -0.57 1.15
- - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.26 - - - 0.99 - - -0.25 - - - - - - - -1.65 - - - - - - - - 1.23 - - - - - 2.29 0.83 4.25 - -
- - - - - - - - -2.82 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.57 - 1.87 3.49 3.62 1.8 -0.67 - -1.66 0.38 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.