Heatmap: Cluster_42 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
BOF 92
BOF 92,Log
CCMP1516,Log,5mM sulfate,ESAW,15C
CCMP1516,Log,25mM sulfate,ESAW,15C
CCMP2090
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,18C
CCMP2090,Log,DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP370,pH7.8,Aquil,20C
CCMP370,pH8.1,Aquil,20C
CCMP371,17C
CCMP373,Log
CCMP373,Stationary
CCMP374,Log
CCMP374,Stationary
CCMP374,pH8.3,F/2-Si,18C
CCMP379,pH8.3,F/2-Si,18C
PLY M219,pH7.8,Aquil,20C
PLY M219,pH8.1,Aquil,20C
RCC1253
RCC3782
RCC6660,Log,pH7.2
RCC6660,Log,pH7.5
RCC6660,Log,pH7.8
RCC6660,Log,pH8.2
RCC6666,Log,pH7.2
RCC6666,Log,pH7.5
RCC6666,Log,pH7.8
RCC6666,Log,pH8.2
UNC1419,Log,Aquil,12C
- -5.08 -1.91 -1.57 - - - - - - -5.39 -3.42 - - - - -4.57 -3.46 -3.28 -4.41 -3.44 - 5.11 - - -5.61 - -5.18 -5.63 - -5.1 -4.1 -4.32 -5.02 -4.6 -5.79
- - 3.11 - - - - - - - - - - - - - - 3.13 - - - - 3.61 - - - 1.78 - - 1.55 - - - - - -
0.93 - 0.38 -0.45 -3.87 -2.69 -3.63 -2.74 -3.7 -3.89 -5.51 0.45 -4.49 -3.23 0.84 1.01 -1.42 - -2.56 -1.29 -8.43 - 4.02 1.09 0.65 - -2.41 -0.85 -1.03 -1.06 -0.85 -1.64 -0.57 -0.63 -0.88 -0.28
- - - - -0.51 - -3.67 - -2.9 - - - -4.05 -1.89 - - 0.6 - 1.42 -0.82 0.75 - 4.56 - - -1.19 - 0.01 -2.08 - - - 0.55 -0.36 -0.32 -
- - 3.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.55 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - -8.57 - - - - -9.36 - - - - -5.66 - - -5.7 -5.3 5.17 - - - -5.59 - - - - - - - -6.25 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.11 - - - 4.77 - - - - - - - - - - - - -
- - 1.16 0.04 - - - - -4.16 - -4.42 - - -2.2 - - - -0.36 -1.17 - - - 4.8 - - 1.11 - - - - 0.2 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.68 - - - - 3.37 - - - - - - - - - - - - -
-4.49 -0.01 -4.09 -3.98 -2.84 -4.24 -1.94 -3.33 -1.82 -5.14 -6.85 -6.58 -3.18 -1.48 -1.23 -1.47 -2.02 -0.73 -3.2 - - -6.13 4.88 - - 0.98 - -6.08 -5.49 - -5.01 -6.0 -3.79 -4.68 -5.84 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.09 1.69 - - - 4.35 - - 1.94 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - -
- - - - -2.26 -1.97 -0.27 -1.19 -1.84 -3.23 -2.82 - -3.1 -1.69 -1.42 -1.4 -3.18 -0.85 -0.66 - 0.76 - 4.78 - -0.58 0.17 -1.81 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.97 - - -1.16 - - - - - - - - - 2.1
- - - - - - - -5.16 - - - - - - - - - - - - -2.1 -2.03 5.15 - - - - - - - - - - - - -
- - - - -5.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.47 - - - - 3.79 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -0.72 2.18 3.4 - - - 3.98 - - 2.18 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - -
0.65 - -2.83 - -4.08 -2.0 -3.83 -3.2 -4.42 -3.02 -3.17 -1.2 -4.33 -3.64 -2.2 -1.91 -6.2 -1.51 -1.66 -0.41 -0.72 0.52 4.7 -4.67 -4.52 0.86 0.04 - - - - -5.27 -6.38 -4.54 - -
0.99 1.82 -6.17 - -4.19 -4.69 -3.09 -4.01 -3.19 -3.93 -4.2 -3.7 -3.33 -2.98 -3.53 -2.65 -5.74 0.0 0.33 - - -4.64 4.41 -2.09 -3.66 -1.14 -3.56 -1.8 -1.16 -2.04 -1.48 -0.55 -0.98 -0.42 -0.28 -0.27
- - - - - - - -7.7 - - - - - - - - -8.09 - - - -4.64 -2.95 5.16 - - -3.33 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.15 - - - -0.86 - - - - - - - - -
- - - - -2.0 -1.85 -0.44 - -2.2 -4.66 -5.03 - -3.71 -0.8 - - - 2.73 0.4 - - - 4.69 - - - - - - - - - - - - -
- - - - -5.35 - - - - -5.29 - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - -
- 1.83 - - - - - - - - - - - - - - -4.94 - - - - - 4.86 - - 0.3 - - -2.42 - -0.78 -0.78 -2.35 -0.72 - -
- - - - - -5.77 - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - -
- 2.99 - - -1.74 -2.14 - -1.85 -1.59 - - - -3.25 - - - -4.55 -0.32 - -0.66 - 3.02 4.04 - - - - - - - - -2.01 - - - -1.06
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.94 - - 3.57 2.54 - - - - - 1.56 - - -
-4.33 -1.09 -0.39 - -5.0 -4.02 -5.32 -5.34 -5.27 -5.53 - - -6.19 -5.48 - - -5.06 2.26 2.34 -3.98 -1.67 -3.61 4.55 - - -0.43 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -3.85 - - - - - 5.17 - - - -4.43 - - - - - - - - -
0.08 -3.58 -5.11 - - - - - - - - - -6.73 - - - -0.18 - - - - - 5.08 - - -3.78 - - - - - - - - - -
- - -1.33 - - - - -4.54 -3.99 - - - - - - - - 2.89 - - - 1.76 4.6 -1.17 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - -2.9 - - - - - -3.5 - - - - - - - - - 5.16 - - - - - - - - - - - - -
- - 2.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.94 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - -3.56 -1.53 -7.23 - - -2.32 - - 5.06 - - 0.98 - - - - - - - - - -3.72
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - -7.63 - -5.27 - -4.68 -7.21 - - - -5.86 -2.52 -1.75 - - -3.44 5.14 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 1.04 0.22 - 1.75 -1.72 4.83 - - -0.53 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -3.74 -0.79 -0.39 - - - 5.11 - - -3.02 - - - - - - - - - -
- -3.13 - - - - - - - - - - - - - - - -3.61 - - - -4.15 5.16 - - - - - - - - -5.3 -5.24 -5.17 - -
- - - - - -6.17 -5.04 -6.75 -5.45 - - - - -6.18 - - -4.12 0.92 0.33 - - - 5.03 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - -0.87 - -4.4 - - - - - -1.59 - - - - - - - - 5.12 - - - - - - - - - -1.93 - - -
- - - - 0.88 0.64 0.27 -0.16 -0.22 -2.6 -3.67 -4.3 0.25 0.43 - - -6.97 -2.64 2.28 - -3.2 - 4.42 - - -2.01 -6.89 - - - - - - - - -
- - - - - - - -10.06 - - -9.03 - - -8.7 - - -9.21 - - - - -4.92 5.02 - - -3.08 -5.31 -1.53 -0.99 -0.43 -1.15 -1.43 -2.77 -1.47 -1.4 -
- - 1.4 - - - - -2.47 - - - - - - - - - - - - - - 5.05 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - -3.35 - - - - 5.16 - - - - -4.48 -6.05 - - -5.92 -5.99 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - -
-2.18 -1.53 - - - - - -8.74 -9.22 - - -5.81 - - -6.2 -6.21 - -2.82 -2.67 - -4.61 -1.38 5.1 -6.39 -5.38 -6.23 -3.31 - - - -7.29 - - -5.28 -7.25 -3.28
- - -3.77 - - - - - -5.33 -6.26 - - - -6.62 -4.41 - -3.59 -1.58 0.51 - - -1.16 5.07 - - - - - - - - - - - - -
0.39 -0.55 - - -1.9 -2.44 -0.31 -1.13 0.15 -2.59 - -0.12 0.23 -0.9 - - 0.13 - - - -0.54 -1.05 4.08 2.46 0.34 - -0.41 - - - - - - - - 0.7
- - 0.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.03 - - 0.07 -0.27 - - - - - - - - -
- - - - - - -5.98 - - - - -3.58 - - - - -2.91 1.99 0.45 -3.78 - 0.5 4.81 - - -0.1 - - - - - - - - - -
- -6.11 -5.14 - - - -8.44 -10.18 -8.85 - - -7.21 - - - - -4.85 -0.98 -0.19 -6.41 - -4.22 5.09 - - -1.39 -5.41 - - - -4.51 - - - - -
- -0.28 - - - - - - - - - - - - - - -6.6 1.48 -1.82 - - - 4.95 - - 0.13 -5.23 - - - - - - - - -
- 0.63 - - - - - -8.66 - - - - - - - - -4.0 - - - - -2.62 5.07 - - -0.94 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.03 1.73 - - - - - - - - - - - -
- - - - - -4.0 - -3.4 - - - - -2.98 -2.81 - - -1.33 2.83 0.69 - - - 4.73 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -5.31 - - - - -6.17 5.17 - - - - - - - - - - - - -
- - - - -0.47 -0.73 -2.69 -0.32 -1.48 - -2.14 - -2.14 -2.09 - - - 2.1 1.8 - - 0.19 4.48 - - -1.14 -0.1 - - - - - - - - -
- -1.62 0.1 - - -4.35 -5.81 - -5.43 - - -30.5 - -4.99 - - 0.73 - - - - - 4.87 -1.26 -0.92 -1.32 - -1.73 -2.54 -1.94 -3.85 -1.4 -2.32 -1.12 -1.35 -
- - - 0.01 - - - - - -3.79 - -0.95 - - - - -3.67 2.42 1.11 - - -2.51 4.68 - - 0.12 - - - - - - - - - -
- -3.38 - - - - - - - - - - - - - -2.04 -3.22 2.8 2.36 -3.69 -3.22 - 4.54 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - -1.77 - - - - - -2.31 - - - - 0.78 - - - - 5.06 - - - - - - -1.34 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -3.02 - - - 0.14 - 5.06 - - 0.45 - - - - - - -3.61 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -8.17 -3.9 - - - - 5.15 - - -1.15 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - -
- - - - -4.37 -3.05 - -4.88 -3.45 - - - -5.64 -4.26 - - - -0.81 0.11 - - - 5.08 - - - -1.9 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -2.79 1.54 2.31 - - - 3.72 3.13 2.61 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -2.91 0.31 0.5 - - - 4.97 - - 0.55 - -1.4 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -6.36 - - -2.09 -2.67 -4.83 4.68 - - - 0.8 -0.61 0.26 0.71 0.32 -0.27 -0.92 -0.49 0.45 -
-2.89 1.51 -4.08 - -7.75 -4.74 -4.1 -5.21 -4.56 -7.78 -5.57 -3.36 -7.88 -4.88 - - -3.61 -1.36 1.22 - -3.77 -1.33 4.85 - - - - -5.07 -4.12 -2.86 -4.42 -4.43 -3.18 -4.37 -3.29 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.04 - - 1.65 - - - - - - - - - -
0.9 - -4.98 -22.76 -2.49 -2.22 -1.31 -2.8 -1.17 -3.95 -3.78 -2.8 -1.72 -1.82 -3.6 - -4.76 - - - - -2.77 4.98 - - -3.75 - - - - - - - - - -
-4.49 -3.9 - - - - - -7.18 -8.91 - - -5.58 -7.63 - -5.96 - - - - - - -5.04 4.7 1.9 1.32 - -6.29 -4.74 -3.06 -2.7 -2.22 -1.38 -0.76 -0.2 0.28 -
- - - - - - - - - - - - - - - - -5.3 0.55 0.89 - - -6.03 4.93 0.2 -0.39 -3.82 - - - - - - - -2.83 - -5.6
- - - - - - - - - - - - - - - - -2.86 - -3.11 - - - 5.16 -4.03 - - -4.2 - - - - - - - - -
- - - - - - - - -4.9 - - - - - - - - - - - - - 5.13 - - -0.09 - - - - - - - - - -
- - - 0.36 - - - - - -2.08 - - - -3.52 - 0.73 - - - - -0.92 - 4.93 - - - -0.69 -2.72 - - -2.67 - - - - -0.51
-1.38 -0.35 -2.24 -2.93 -3.6 -3.14 -1.88 -2.68 -2.03 -2.51 -2.06 -4.93 -3.47 -2.2 -1.71 -1.96 -1.38 -4.75 -2.76 - - -3.42 4.67 -1.36 -1.88 -2.14 -1.93 -0.87 -1.12 -0.53 -1.06 -0.63 -0.82 -0.8 -0.21 -2.24
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - -
- - -4.03 - - - - -3.87 -5.93 - - - - - - - -7.34 - - - - -3.68 5.16 - - - - - - - - - - - - -
-5.13 -1.15 -2.55 -2.17 -5.47 -4.09 -4.7 -3.68 -4.4 -2.88 -2.95 -6.21 -4.24 -3.55 -4.0 -4.99 -1.49 0.38 0.48 - -4.48 -2.08 4.77 -4.44 - -2.08 -2.75 -1.16 -2.58 -1.81 -1.25 -0.87 -1.19 -1.38 -1.08 -3.5
- - - - -6.52 - - -8.58 - - - -5.61 - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - -
-1.96 -1.62 -8.56 -7.85 -10.64 -7.95 - -5.88 -9.56 -9.21 -6.63 -3.65 -6.33 -11.01 -2.95 -2.88 -2.08 0.54 0.85 1.79 0.21 -3.51 4.67 -3.12 -3.62 -2.0 -3.86 -3.31 -3.11 -3.42 -4.61 -3.21 -2.59 -3.06 -3.17 -3.55
- - - - - - - -7.65 -6.53 - - - - - - - -8.9 -2.99 -1.8 - - -5.36 5.14 - - -5.14 -5.54 - - - - -2.53 -6.2 -4.17 -5.1 -
-4.49 -3.9 - - - - - -7.18 -8.91 - - -5.58 -7.63 - -5.96 - - - - - - -5.04 4.7 1.9 1.32 - -6.29 -4.74 -3.06 -2.7 -2.22 -1.38 -0.76 -0.2 0.28 -
3.92 2.25 - - - - - - - - - - -2.46 - - - - 1.85 0.23 - - - 3.48 - - - - - - - - - - - - -
-5.28 -0.44 - - - - -7.12 -9.08 -7.17 - -8.22 -5.33 - - - - -6.02 0.27 0.55 - - -6.1 5.02 - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.