Heatmap: Cluster_89 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
BOF 92
BOF 92,Log
CCMP1516,Log,5mM sulfate,ESAW,15C
CCMP1516,Log,25mM sulfate,ESAW,15C
CCMP2090
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,18C
CCMP2090,Log,DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP370,pH7.8,Aquil,20C
CCMP370,pH8.1,Aquil,20C
CCMP371,17C
CCMP373,Log
CCMP373,Stationary
CCMP374,Log
CCMP374,Stationary
CCMP374,pH8.3,F/2-Si,18C
CCMP379,pH8.3,F/2-Si,18C
PLY M219,pH7.8,Aquil,20C
PLY M219,pH8.1,Aquil,20C
RCC1253
RCC3782
RCC6660,Log,pH7.2
RCC6660,Log,pH7.5
RCC6660,Log,pH7.8
RCC6660,Log,pH8.2
RCC6666,Log,pH7.2
RCC6666,Log,pH7.5
RCC6666,Log,pH7.8
RCC6666,Log,pH8.2
UNC1419,Log,Aquil,12C
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.09 - 1.24 2.06 2.6 2.44 1.94 1.52 1.24 -2.15 1.1 0.85 - - - - 1.36 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 2.24 - - - 4.97 - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.63 - - - - - - - - - - - - - -0.04 - - - - - - 2.47 - 2.23 - - - - - - - - - -
2.81 3.66 3.61 - - -1.06 1.58 - - - - - -1.0 - - - -2.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.52 2.15 2.75 - -1.31 -0.81 0.71 - -2.68 -4.01 0.29 -1.51 -2.39 -1.95 -0.17 -0.19 -1.66 - - - - - -1.57 - -1.36 0.12 - 1.33 - 1.35 2.0 -0.18 -0.0 -1.24 0.89 -
- - 1.09 - 1.24 2.06 2.6 2.44 1.94 1.52 1.24 -2.15 1.1 0.85 - - - - 1.36 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.85 3.78 -4.35 -1.22 -0.72 -1.51 -1.18 -0.54 -1.2 -0.29 -0.61 -1.08 - - -7.31 - - - - - -3.84 - 0.03 2.33 1.21 - -3.04 -1.72 - -2.5 -3.19 -1.56 -4.72 -0.84
- - 3.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.38
- 4.48 - - 0.41 -12.83 - - - - - - - - - - 2.65 - - 1.84 - - - - - - - - - - - - - - - 1.3
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.84 - - 0.54 - - - - - - - - - - -0.69 2.24 - - - 1.48 - - - - - - -1.08 - - - - -1.1 -0.97 4.42
- - 4.52 - -0.16 - - -6.65 -0.93 -1.35 -0.47 -0.3 0.94 0.4 - - 1.65 - - 1.46 - - - - - - - - -1.0 - - - - - - -
- - 5.01 - 1.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 5.16 - - - - - - - - - - - - - -2.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.39 3.56 - 1.73 - - - - - - - - - - - - -
-2.68 - 0.14 -1.49 -1.75 -0.19 0.66 0.35 0.54 0.56 1.02 0.57 0.43 0.56 - - - 2.32 3.48 -3.34 - - -0.63 0.3 0.79 - -2.65 -10.24 - - -1.44 - - - - -0.51
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.42 - 1.29 - - - - - - 0.63 - - 1.28 1.99 1.28 -0.22 -0.25 -
- - 4.97 - - - - - - - - - - - - - -1.63 - - - - - - - - 2.13 - - - - - - - - - -
- 3.04 - - - -1.87 - - - - - - - - - 0.52 - 3.71 1.5 - - - - - - - - -0.65 1.18 - -0.58 -0.48 -0.55 0.52 1.91 -
- - 3.96 3.73 -3.37 -3.13 -3.91 -5.33 -5.64 - -5.35 -4.24 -3.04 -3.69 - - -6.15 - - - - - - - - - 0.97 - - - 2.21 - - - - -
- 2.14 - - - - - - - - - - - - - - -5.32 3.58 3.61 - - - - 1.75 0.77 - 1.27 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.26 - - - - -1.28 0.03 - - - - - 2.29 - -1.41 - - - 2.96 - - - - - - - - - - - - 1.28 - -
- 1.29 - - - - - - - -1.59 - - - - - - - - 0.99 - - - -0.13 - - - - - - - - - - - - 4.92
- - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.87 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.77 - - - - - - 4.8 - 0.88 - - - - -0.04 - 0.99 -
- - - - - 1.13 - - 1.08 - - - 0.96 - - - 1.39 - - - 4.76 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 2.13 - - 3.79 1.59 3.66 - - 1.11 - - - - - - - - - -
- - 4.63 - - - - - - - - - - - - - -0.04 - - - - - - 2.47 - 2.23 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.16 - - - - - - - - - -
- - 4.52 - -0.42 -0.93 0.95 -1.38 0.76 -1.37 - - 1.67 2.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.02 - - - - - - - - - - -0.24 - - - 3.58 3.76 - - - 0.43 0.26 1.26 - - -0.69 - - - - - - - -
- - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.03 - - - - - - - - - - - - - - 3.17 - - - - - - - 1.4 - 1.12 3.52 - - - - - - - - 1.39
3.03 - - - - - - - - - - - - - - 3.17 - - - - - - - 1.4 - 1.12 3.52 - - - - - - - - 1.39
- - 2.75 - -1.13 -1.81 -0.68 -3.22 -3.87 -2.69 -1.57 - -0.46 -1.59 1.94 1.95 - 1.69 1.87 - - - - 0.95 1.96 -0.31 1.85 - - - - - - - - 0.45
- - 3.33 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.02 0.92 - - - -1.36 1.32 -1.53 1.29 0.67 1.79 -1.21 1.93 0.98 1.52 1.12 -
- - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.06 - - - - - - - 2.05
- - 4.14 3.02 -2.85 -6.21 -6.26 -3.53 -4.22 -2.91 -4.41 -3.92 -2.85 - - - -6.97 -1.73 -0.22 - -3.61 - - - - -3.3 2.62 -5.43 - - 1.08 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.71 3.31 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 2.38 3.85 4.03 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 3.57 - 3.12 - - 3.24 2.58 - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.23 4.03 - - - -0.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.77 -0.7 2.79 1.7 -0.31 -4.41 - -6.55 -2.83 -1.24 -1.8 2.41 -6.11 -3.47 -1.42 -0.41 0.5 - - 0.64 1.85 -1.99 -2.15 - - -1.43 -1.01 -4.18 - - -0.6 -2.48 -1.76 -0.19 -2.45 -
-2.95 -2.61 1.84 - -6.09 - -5.91 -2.16 -5.12 -4.97 -1.06 -4.44 -6.82 -7.57 0.53 0.47 -0.36 0.33 -0.26 -3.6 -0.57 -5.96 -1.12 0.71 1.13 0.58 -1.12 0.6 1.04 1.61 0.73 1.33 1.13 1.6 0.85 -0.44
- - 1.24 - - - - - -4.98 - - - - -4.71 -1.72 - -1.56 - - 3.05 2.31 -0.84 1.85 1.46 1.83 - - -1.86 0.78 0.73 -2.84 -0.21 -0.82 1.55 -0.35 -1.93
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17
- - 4.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.57 - 1.66 - -
- - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.78 4.78 - - - - - - - - - - - - - -2.66 1.89 1.73 - - - -0.62 - - -4.51 - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.