1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_145 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000042.264 (tig00000042_g15666.t1)
 - - - - 2.58 2.64 - - 2.44 - - 2.5 - - - - - - - - 1.45 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000042.81 (tig00000042_g15479.t1)
 2.46 2.22 2.52 2.02 0.01 -2.29 -0.17 -0.49 -1.21 -2.31 - -2.16 0.76 - -3.5 - - -3.99 -3.6 - -2.62 - -1.76 - - -
Cpa|evm.model.tig00000056.21 (tig00020528_g9988.t1)
 - - 3.07 - - - 0.27 - 0.06 0.98 - - - - 1.56 0.05 1.16 -0.68 - - - 2.71 - - - -
Cpa|evm.model.tig00000056.3 (tig00020528_g9994.t1)
 - 1.11 1.53 -0.1 - 0.19 0.39 - - - -0.05 - - 1.92 - - -0.09 1.24 1.66 - 1.09 1.27 0.87 - - -
Cpa|evm.model.tig00000076.123 (tig00000076_g2420.t1)
 0.57 1.09 2.31 1.76 1.03 -1.15 -1.7 0.38 -0.72 -2.75 - - -1.31 -3.29 -1.8 -1.06 -2.74 0.24 -0.17 0.97 -0.7 -3.1 -0.87 -2.1 0.34 -0.06
0.65 1.44 -0.43 1.3 0.02 0.36 1.35 -0.61 -1.69 0.64 -1.76 0.52 0.12 -1.75 -0.51 -2.86 -2.55 0.34 -1.79 -2.83 0.7 -0.05 0.79 - -1.38 -0.7
Cpa|evm.model.tig00000104.3 (tig00000104_g4812.t1)
 - - 4.47 - - - - - - 1.93 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000114.37 (tig00000114_g6045.t1)
 - - - 3.65 - 2.88 - - - - - - - - - - 2.6 - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000133.19 (tig00000133_g7680.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000145.19 (tig00000145_g8812.t1)
 -4.42 -0.35 -0.34 0.61 0.62 -0.4 1.04 0.56 1.3 -0.1 -0.41 0.35 - -2.72 -0.57 -4.66 0.13 0.74 0.3 0.97 0.33 - -2.16 -0.68 1.36 -3.07
Cpa|evm.model.tig00000157.24 (tig00000157_g9613.t1)
 0.96 - - - 2.02 1.35 - 2.62 1.87 - - 1.92 - - - - - - - - - -0.57 1.04 - 0.18 -
Cpa|evm.model.tig00000158.88 (tig00020553_g10513.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.98 - - - - - 3.49 1.31 1.41 - - - - - - - - - - - - - 0.78 -
Cpa|evm.model.tig00000215.4 (tig00000215_g18529.t1)
 - - 4.13 1.4 - - - - - - - - - - - - 2.55 - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000215.41 (tig00000215_g18579.t1)
 - - - 3.5 1.86 1.97 - 2.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.38
Cpa|evm.model.tig00000215.73 (tig00020689_g13001.t1)
 - - 4.11 - - - 3.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000217.50 (tig00000443_g780.t1)
 - - - 2.42 0.34 - 1.44 1.46 0.42 - - 1.55 0.87 - - - 0.67 1.48 1.23 0.11 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000219.88 (tig00022080_g23797.t1)
 - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000246.26 (tig00000246_g21518.t1)
 - - 3.69 - - - - 3.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000269.23 (tig00000269_g23673.t1)
 - - - 3.02 1.76 - - - 2.05 - - 2.15 - - - - - - - 1.68 - - - - 1.45 -
Cpa|evm.model.tig00000276.1 (tig00000276_g23506.t1)
 - - - 4.26 2.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000293.18 (tig00000293_g23885.t1)
 - - 3.72 - - - - - - - 3.68 - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000331.17 (tig00020531_g10065.t1)
 - 0.76 1.92 - -0.7 - - - - 0.51 - - - 0.55 - -0.26 -0.43 -1.15 1.17 0.92 -0.85 2.22 -1.07 - 0.51 1.9
Cpa|evm.model.tig00000405.31 (tig00000405_g463.t1)
 - - - 3.75 - - - - - - - - - - - - - 3.65 - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000411.15 (tig00000411_g519.t1)
 1.83 - 3.7 - - - - - - 1.65 2.66 - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000444.42 (tig00000444_g832.t1)
 - - - - - - - - 3.82 3.57 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000459.80 (tig00000459_g1147.t1)
 - - - 3.63 - - - - - - - 3.77 - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000607.8 (tig00000607_g2519.t1)
 - - - 4.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.65 - - -
Cpa|evm.model.tig00000622.2 (tig00000622_g2617.t1)
 - - - - - - 3.07 2.92 - 2.88 - - - - - - - 1.42 - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000629.7 (tig00000629_g2675.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000681.46 (tig00000681_g3100.t1)
 - - - 3.95 - - - - - - - - - - - - - 3.4 - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000823.5 (tig00000823_g4532.t1)
 - - 2.93 - - - - - - 1.88 - - - - 1.67 2.07 - - - - 0.99 - - - - 2.42
Cpa|evm.model.tig00000842.46 (tig00000842_g4860.t2)
 - - - 3.83 - - - - - - 1.86 - 2.28 - - - - 1.7 - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000912.13 (tig00000912_g5419.t1)
 - - 1.47 3.55 - - - - - - - - - - - - - 3.2 - - -0.05 - - - - 0.47
Cpa|evm.model.tig00001071.5 (tig00001071_g6795.t1)
 - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001497.5 (tig00001497_g9212.t1)
 -1.34 -0.15 1.47 1.93 1.86 2.51 0.21 - -0.91 - -0.08 -0.95 -0.64 -0.4 - -1.15 -1.07 0.42 - -0.42 -1.03 - - -0.43 - -
Cpa|evm.model.tig00020510.101 (tig00020510_g9887.t1)
 - - 3.72 - - - - - - 3.68 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020510.51 (tig00020616_g12256.t1)
 - - 3.12 3.2 - - - - - - - - - - 3.03 - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020557.11 (tig00020557_g11113.t1)
 - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020557.12 (tig00021234_g19422.t1)
 0.53 0.74 2.78 2.72 0.22 -2.51 -1.07 -1.63 -0.95 -1.57 -0.23 -0.43 -0.69 - 1.53 - - -1.57 -0.78 - - - - -1.91 - -3.02
Cpa|evm.model.tig00020557.13 (tig00020557_g11114.t1)
 0.45 1.45 2.54 2.05 0.52 0.13 -0.77 -1.34 -1.61 -0.52 -1.07 -0.21 -1.24 -3.28 0.88 -3.74 -0.92 -0.22 -0.22 -2.37 -3.3 -3.89 - -1.34 -4.25 -0.79
Cpa|evm.model.tig00020562.51 (tig00021013_g17049.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.61 -0.85 1.8 - 0.23 - -0.83 1.19 -0.94 0.4 - 0.31 0.26 0.22 - 1.84 0.56 -0.86 -0.2 -0.82 - 1.24 0.37 -1.53 -0.28
Cpa|evm.model.tig00020592.34 (tig00020592_g11667.t1)
 - - 2.29 - - - - - 2.27 - 2.25 - - - 2.04 - - - - - - - - 2.89 - -
- - - - - - 2.21 - 3.1 - - - - - 1.92 - 1.98 - - - 1.02 1.61 - - - -
Cpa|evm.model.tig00020611.5 (tig00000073_g1752.t1)
 - - 3.51 3.12 - - 0.08 - -0.08 - - - - - -0.38 0.01 - - -0.48 - - 0.48 - - - -
Cpa|evm.model.tig00020710.105 (tig00020710_g13368.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020724.1 (tig00020724_g13414.t1)
 - - 4.45 0.48 - - - - - - 0.33 - - - - - 0.63 - - - - - - - - -
- - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020801.72 (tig00021017_g17204.t1)
 - - 0.03 3.19 -0.08 - - - - - 1.62 0.12 - - - 2.55 - 1.02 -0.33 -0.3 -0.91 - - - - -0.48
Cpa|evm.model.tig00020824.26 (tig00021248_g19626.t1)
 - - - - - - 3.42 1.78 - - - 2.86 - - - - - 2.21 - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020824.41 (tig00021745_g23372.t1)
 0.94 - 3.2 1.83 2.65 - - - - - - -0.04 - - 1.78 - - - - - - -0.52 - - - -
Cpa|evm.model.tig00020825.5 (tig00020825_g14286.t1)
 1.27 - - 1.13 -1.99 0.12 1.5 1.28 0.14 0.8 -1.96 1.2 -0.05 - -2.14 -2.0 - -2.48 -1.06 -2.22 -0.75 1.12 0.5 -1.29 -2.57 1.23
Cpa|evm.model.tig00020878.2 (tig00020878_g14853.t1)
 - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020904.19 (tig00020816_g14135.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020904.20 (tig00020904_g15152.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020908.16 (tig00000663_g2937.t1)
 - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020909.18 (tig00020909_g15338.t1)
 - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020952.41 (tig00000396_g24894.t1)
 - -0.37 4.14 -0.43 - - -0.3 - -0.46 - -0.58 - - - - - - - -0.86 1.69 -1.49 -0.9 - - - -
Cpa|evm.model.tig00021015.2 (tig00021015_g17145.t1)
 - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021036.42 (tig00021036_g17315.t1)
 - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021038.63 (tig00021038_g17549.t1)
 - - 3.52 - - - - - - - - - - 3.86 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021047.1 (tig00000144_g9192.t1)
 - - 2.21 - - - - - - - - - - - 2.12 - 2.18 - 2.2 2.13 - 1.82 - - - -
Cpa|evm.model.tig00021105.20 (tig00021105_g18231.t1)
 - - - 3.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.41
Cpa|evm.model.tig00021105.7 (tig00021105_g18226.t1)
 1.16 -1.57 1.66 - -1.45 -0.06 - - 1.78 - - 0.54 0.33 1.28 -1.24 0.77 1.07 -1.9 0.43 0.18 - -1.55 -1.53 -0.55 0.77 -1.65
Cpa|evm.model.tig00021116.7 (tig00021116_g18407.t1)
 - - - 3.79 -0.12 - - - - 2.24 - - - - - - 2.7 - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021137.15 (tig00021137_g18980.t1)
 - - - 3.08 3.02 - - - - - - - - - - - - - - - 2.14 2.33 - - - -
Cpa|evm.model.tig00021167.6 (tig00021167_g19062.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021254.19 (tig00021254_g19699.t1)
 - - 3.31 - - - - 3.34 - - - - - - - - - 2.57 - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021254.57 (tig00021257_g19742.t1)
 -0.13 0.43 - 2.17 0.08 - 2.0 1.07 0.17 2.07 - 1.85 - - - - - 0.03 - - - - - - 1.11 -
Cpa|evm.model.tig00021326.31 (tig00021326_g20297.t1)
 - - 3.55 - - - - 3.16 - - - - - - - - -0.97 - 1.5 - - - - - - 0.99
Cpa|evm.model.tig00021357.76 (tig00021357_g20801.t2)
 - - - 1.86 0.55 - 0.85 0.73 0.83 0.8 - - - 0.68 - - - - - 2.16 - - - 1.45 2.36 -
Cpa|evm.model.tig00021518.18 (tig00021518_g22035.t1)
 - - 2.18 2.13 - - - - 2.3 - 2.19 2.29 - - - - - 1.43 - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021532.6 (tig00021532_g22186.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021586.2 (tig00021586_g22665.t1)
 - - - - - - 2.08 - 4.16 1.96 - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021589.50 (tig00021589_g22756.t1)
 - - - 3.58 - 2.88 - - - - - 2.74 - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021687.17 (tig00021687_g23125.t1)
 - - - 2.67 1.39 - 1.5 - - 1.45 1.42 2.59 - - - - 1.47 - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021745.27 (tig00000310_g23933.t1)
 - - - 3.99 - - - - - - -2.05 - - 3.31 - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.