Heatmap: Cluster_53 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000025.25 (tig00000025_g7934.t1)	0.48	1.0	0.9	0.53	0.15	0.08	0.16	0.3	0.39	0.62	0.73	0.89	0.67	0.12	0.19	0.12	0.34	0.32	0.3	0.51	0.02	0.17	0.11	0.19	0.37	0.27
Cpa\|evm.model.tig00000076.85 (tig00000076_g2383.t1)	0.65	1.0	0.87	0.72	0.59	0.34	0.23	0.27	0.26	0.43	0.56	0.63	0.58	0.1	0.2	0.13	0.38	0.44	0.32	0.52	0.01	0.49	0.14	0.36	0.2	0.22
Cpa\|evm.model.tig00000133.49 (tig00000133_g7713.t1)	0.94	0.87	0.66	0.42	0.21	0.13	0.2	0.31	0.33	0.39	0.49	0.65	1.0	0.04	0.13	0.06	0.25	0.41	0.3	0.46	0.05	0.04	0.13	0.19	0.14	0.15
Cpa\|evm.model.tig00000157.36 (tig00000157_g9626.t1)	0.79	1.0	0.89	0.72	0.51	0.22	0.21	0.28	0.33	0.45	0.54	0.66	0.86	0.06	0.08	0.08	0.3	0.36	0.25	0.58	0.01	0.25	0.03	0.13	0.19	0.19
Cpa\|evm.model.tig00000178.77 (tig00000178_g12793.t1)	0.7	0.87	0.9	0.95	0.75	0.49	0.58	0.7	0.6	0.77	0.9	0.92	1.0	0.0	0.0	0.0	0.52	0.01	0.01	0.01	0.0	0.04	0.0	0.0	0.03	0.08
Cpa\|evm.model.tig00000178.78 (tig00000178_g12795.t1)	0.61	0.53	0.53	0.48	0.46	0.41	0.37	0.4	0.27	0.34	0.48	0.57	1.0	0.02	0.02	0.02	0.24	0.03	0.03	0.02	0.05	0.07	0.05	0.03	0.06	0.12
Cpa\|evm.model.tig00000241.103	0.98	1.0	0.9	0.75	0.55	0.38	0.32	0.37	0.38	0.44	0.57	0.74	0.89	0.19	0.23	0.27	0.26	0.43	0.4	0.67	0.02	0.14	0.03	0.16	0.24	0.28
Cpa\|evm.model.tig00000342.50 (tig00000342_g24234.t1)	0.93	0.7	0.51	0.3	0.14	0.07	0.21	0.31	0.29	0.45	0.48	0.62	1.0	0.13	0.14	0.13	0.27	0.45	0.23	0.39	0.02	0.15	0.09	0.22	0.26	0.25
Cpa\|evm.model.tig00000551.5 (tig00000551_g2026.t1)	0.96	1.0	0.75	0.48	0.26	0.19	0.23	0.36	0.46	0.58	0.75	0.95	0.98	0.12	0.14	0.15	0.33	0.34	0.3	0.45	0.02	0.25	0.16	0.44	0.29	0.24
Cpa\|evm.model.tig00000704.29 (tig00000704_g3317.t1)	0.88	0.93	0.74	0.68	0.52	0.36	0.32	0.42	0.54	0.58	0.76	0.89	1.0	0.09	0.13	0.13	0.35	0.42	0.35	0.54	0.15	0.35	0.23	0.33	0.39	0.39
Cpa\|evm.model.tig00000718.43 (tig00000718_g3718.t1)	0.86	0.99	0.87	0.71	0.49	0.31	0.34	0.48	0.54	0.61	0.72	0.82	1.0	0.12	0.12	0.12	0.27	0.4	0.24	0.4	0.02	0.27	0.11	0.25	0.43	0.29
Cpa\|evm.model.tig00000718.44 (tig00000718_g3719.t1)	0.79	1.0	0.88	0.63	0.41	0.26	0.26	0.39	0.5	0.55	0.63	0.71	0.88	0.03	0.1	0.04	0.32	0.44	0.3	0.57	0.01	0.2	0.06	0.24	0.27	0.28
Cpa\|evm.model.tig00000803.4 (tig00000803_g4322.t1)	0.77	0.92	0.78	0.7	0.47	0.21	0.32	0.48	0.32	0.42	0.55	0.63	1.0	0.06	0.1	0.15	0.08	0.1	0.12	0.2	0.03	0.13	0.04	0.08	0.24	0.16
Cpa\|evm.model.tig00000841.12 (tig00000841_g4738.t1)	0.85	0.87	0.95	1.0	0.85	0.6	0.62	0.66	0.66	0.81	0.87	0.84	0.85	0.35	0.18	0.27	0.46	0.32	0.29	0.45	0.05	0.33	0.23	0.56	0.43	0.51
Cpa\|evm.model.tig00000944.28 (tig00000944_g5952.t1)	1.0	0.97	0.7	0.54	0.29	0.14	0.23	0.36	0.38	0.48	0.57	0.64	0.99	0.11	0.14	0.12	0.3	0.52	0.33	0.49	0.06	0.19	0.1	0.2	0.35	0.3
Cpa\|evm.model.tig00001033.18 (tig00001033_g6498.t1)	0.83	1.0	0.79	0.58	0.38	0.26	0.28	0.38	0.37	0.36	0.45	0.56	0.92	0.12	0.11	0.13	0.27	0.37	0.24	0.36	0.09	0.45	0.09	0.28	0.35	0.28
Cpa\|evm.model.tig00001056.2 (tig00001056_g6622.t1)	0.74	0.98	1.0	0.84	0.65	0.58	0.48	0.55	0.61	0.49	0.59	0.73	0.91	0.16	0.15	0.14	0.26	0.31	0.33	0.37	0.01	0.15	0.05	0.13	0.22	0.22
Cpa\|evm.model.tig00001056.3 (tig00001056_g6623.t1)	0.68	1.0	0.9	0.8	0.61	0.39	0.43	0.5	0.51	0.53	0.6	0.65	0.81	0.2	0.16	0.2	0.39	0.48	0.32	0.51	0.0	0.22	0.01	0.05	0.3	0.18
Cpa\|evm.model.tig00001067.12 (tig00001067_g6772.t1)	0.83	0.75	0.57	0.63	0.28	0.07	0.11	0.21	0.21	0.3	0.48	0.6	1.0	0.03	0.02	0.03	0.13	0.18	0.1	0.22	0.02	0.21	0.03	0.12	0.32	0.29
Cpa\|evm.model.tig00001095.14 (tig00001095_g7030.t1)	0.83	0.99	1.0	0.88	0.65	0.43	0.39	0.5	0.58	0.56	0.65	0.74	0.85	0.22	0.23	0.34	0.43	0.42	0.34	0.61	0.18	0.6	0.15	0.45	0.44	0.48
Cpa\|evm.model.tig00001234.5 (tig00001234_g7727.t1)	0.77	1.0	0.79	0.57	0.33	0.16	0.2	0.31	0.4	0.43	0.48	0.55	0.76	0.1	0.17	0.13	0.39	0.5	0.34	0.57	0.03	0.23	0.08	0.18	0.29	0.29
Cpa\|evm.model.tig00020553.128 (tig00020553_g10616.t1)	0.61	0.95	0.78	0.58	0.29	0.19	0.43	0.53	0.6	0.95	0.93	1.0	0.78	0.07	0.16	0.07	0.33	0.44	0.34	0.5	0.04	0.04	0.11	0.3	0.34	0.17
Cpa\|evm.model.tig00020554.160 (tig00020554_g10939.t1)	0.76	0.9	1.0	0.8	0.6	0.49	0.54	0.66	0.7	0.7	0.77	0.92	0.76	0.23	0.3	0.37	0.43	0.55	0.49	0.49	0.03	0.32	0.22	0.36	0.45	0.32
Cpa\|evm.model.tig00020563.76 (tig00020563_g11257.t1)	0.69	0.58	0.53	0.88	0.75	0.38	0.57	0.67	0.55	0.75	0.85	0.81	1.0	0.05	0.04	0.05	0.52	0.12	0.07	0.11	0.03	0.23	0.04	0.1	0.19	0.29
Cpa\|evm.model.tig00020564.39 (tig00020564_g11439.t1)	0.98	1.0	0.79	0.74	0.45	0.29	0.33	0.51	0.49	0.46	0.62	0.76	0.96	0.1	0.1	0.09	0.22	0.37	0.24	0.42	0.19	0.33	0.4	0.42	0.41	0.45
Cpa\|evm.model.tig00020601.10 (tig00020601_g11717.t1)	0.7	1.0	0.76	0.61	0.31	0.16	0.18	0.25	0.29	0.3	0.37	0.52	0.82	0.19	0.22	0.2	0.36	0.4	0.23	0.36	0.05	0.16	0.12	0.18	0.5	0.27
Cpa\|evm.model.tig00020604.16 (tig00020604_g11851.t1)	0.89	1.0	0.83	0.63	0.42	0.28	0.39	0.46	0.47	0.46	0.49	0.54	0.91	0.12	0.16	0.11	0.32	0.44	0.27	0.52	0.0	0.1	0.03	0.08	0.27	0.22
Cpa\|evm.model.tig00020604.17 (tig00020604_g11852.t1)	0.66	0.81	0.73	0.54	0.35	0.25	0.35	0.48	0.59	0.69	0.84	1.0	0.76	0.03	0.04	0.06	0.21	0.31	0.19	0.45	0.15	0.22	0.16	0.32	0.26	0.22
Cpa\|evm.model.tig00020604.18 (tig00020604_g11852.t1)	0.57	0.72	0.67	0.52	0.34	0.2	0.33	0.46	0.52	0.69	0.88	1.0	0.72	0.03	0.03	0.06	0.21	0.34	0.15	0.41	0.15	0.25	0.19	0.4	0.29	0.2
Cpa\|evm.model.tig00020610.123 (tig00020610_g12068.t1)	0.91	0.98	0.82	0.63	0.44	0.33	0.4	0.52	0.46	0.45	0.54	0.61	1.0	0.19	0.18	0.21	0.34	0.47	0.29	0.44	0.07	0.47	0.12	0.35	0.47	0.39
Cpa\|evm.model.tig00020801.46 (tig00020801_g13928.t1)	0.72	1.0	0.92	0.75	0.28	0.26	0.52	0.75	0.41	0.59	0.62	0.58	0.81	0.23	0.22	0.25	0.28	0.4	0.42	0.33	0.04	0.03	0.26	0.11	0.43	0.33
Cpa\|evm.model.tig00020830.99 (tig00020830_g14482.t1)	0.92	0.84	1.0	0.79	0.53	0.51	0.66	0.82	0.71	0.67	0.79	0.74	0.86	0.01	0.0	0.01	0.59	0.08	0.05	0.18	0.0	0.16	0.0	0.03	0.13	0.27
Cpa\|evm.model.tig00020848.90 (tig00020848_g14621.t1)	0.85	1.0	0.86	0.64	0.36	0.16	0.18	0.27	0.26	0.34	0.46	0.59	0.85	0.02	0.09	0.02	0.14	0.3	0.2	0.48	0.05	0.28	0.07	0.18	0.23	0.28
Cpa\|evm.model.tig00020848.91 (tig00020848_g14621.t1)	0.85	1.0	0.88	0.69	0.35	0.11	0.18	0.3	0.27	0.36	0.5	0.64	0.91	0.02	0.08	0.02	0.14	0.33	0.16	0.44	0.05	0.32	0.09	0.18	0.26	0.27
Cpa\|evm.model.tig00020904.22 (tig00020904_g15155.t1)	0.95	0.99	0.83	0.65	0.43	0.26	0.32	0.46	0.51	0.53	0.63	0.76	1.0	0.16	0.17	0.2	0.42	0.53	0.4	0.65	0.2	0.33	0.13	0.41	0.32	0.35
Cpa\|evm.model.tig00020927.55 (tig00020927_g15986.t1)	0.86	0.96	0.93	0.81	0.65	0.45	0.44	0.54	0.65	0.71	0.82	0.99	1.0	0.11	0.18	0.12	0.37	0.36	0.28	0.58	0.11	0.54	0.52	0.65	0.44	0.38
Cpa\|evm.model.tig00020934.6 (tig00020934_g16079.t1)	0.73	0.83	0.66	0.55	0.53	0.46	0.54	0.56	0.56	0.69	0.77	0.77	1.0	0.17	0.09	0.2	0.23	0.18	0.12	0.21	0.07	0.16	0.18	0.19	0.13	0.08
Cpa\|evm.model.tig00020951.36 (tig00020951_g16436.t1)	0.72	0.7	0.66	0.69	0.6	0.44	0.59	0.73	0.55	0.77	0.9	0.86	1.0	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0	0.0	0.01	0.0	0.09	0.0	0.0	0.07	0.18
Cpa\|evm.model.tig00020951.37 (tig00020951_g16437.t1)	0.69	0.73	0.63	0.68	0.52	0.3	0.43	0.52	0.46	0.68	0.89	0.88	1.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.01	0.01	0.02	0.0	0.05	0.0	0.0	0.02	0.07
Cpa\|evm.model.tig00020951.40 (tig00021281_g19919.t1)	0.68	0.64	0.6	0.66	0.56	0.33	0.42	0.52	0.32	0.52	0.68	0.65	1.0	0.0	0.0	0.0	0.73	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.04	0.17
Cpa\|evm.model.tig00020951.41 (tig00020951_g16440.t1)	0.61	0.54	0.45	0.59	0.43	0.24	0.31	0.39	0.28	0.5	0.62	0.63	1.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.01	0.01	0.01	0.0	0.05	0.01	0.0	0.02	0.05
Cpa\|evm.model.tig00020951.42 (tig00020951_g16442.t1)	0.78	0.67	0.54	0.53	0.57	0.62	0.87	0.92	0.94	1.0	0.88	0.78	0.86	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.01	0.0	0.05	0.0	0.02	0.26	0.5
Cpa\|evm.model.tig00021070.120 (tig00021070_g17938.t1)	0.83	0.74	0.57	0.43	0.29	0.2	0.32	0.43	0.51	0.63	0.79	1.0	0.88	0.06	0.08	0.1	0.33	0.42	0.28	0.48	0.01	0.24	0.23	0.41	0.35	0.23
Cpa\|evm.model.tig00021105.50 (tig00021105_g18262.t1)	0.75	1.0	0.81	0.55	0.31	0.15	0.25	0.36	0.34	0.39	0.5	0.61	0.88	0.18	0.21	0.24	0.37	0.44	0.27	0.56	0.04	0.24	0.06	0.14	0.23	0.2
Cpa\|evm.model.tig00021105.51 (tig00021105_g18262.t1)	0.71	1.0	0.69	0.5	0.28	0.18	0.23	0.3	0.3	0.34	0.41	0.48	0.68	0.19	0.24	0.25	0.36	0.49	0.35	0.55	0.05	0.32	0.08	0.13	0.31	0.25
Cpa\|evm.model.tig00021123.35 (tig00021123_g18518.t1)	0.67	1.0	0.94	0.71	0.46	0.17	0.16	0.24	0.31	0.4	0.51	0.6	0.72	0.03	0.07	0.05	0.26	0.4	0.24	0.55	0.01	0.4	0.02	0.13	0.23	0.21
Cpa\|evm.model.tig00021127.71 (tig00021127_g18748.t1)	0.84	0.71	0.67	0.57	0.46	0.33	0.44	0.56	0.58	0.67	0.75	0.79	1.0	0.16	0.16	0.16	0.37	0.48	0.33	0.55	0.24	0.32	0.47	0.32	0.5	0.37
Cpa\|evm.model.tig00021432.19 (tig00021432_g21211.t1)	0.92	0.74	0.57	0.47	0.37	0.22	0.27	0.34	0.33	0.45	0.54	0.67	1.0	0.02	0.13	0.03	0.28	0.44	0.25	0.51	0.0	0.12	0.03	0.07	0.26	0.16
Cpa\|evm.model.tig00021494.15 (tig00021494_g21927.t1)	0.8	1.0	0.88	0.71	0.51	0.33	0.23	0.32	0.41	0.44	0.63	0.74	0.81	0.06	0.1	0.13	0.21	0.21	0.24	0.36	0.02	0.14	0.09	0.12	0.15	0.21
Cpa\|evm.model.tig00021494.16 (tig00021494_g21928.t1)	0.67	1.0	0.8	0.7	0.52	0.28	0.21	0.27	0.33	0.44	0.55	0.66	0.76	0.05	0.08	0.19	0.28	0.41	0.26	0.48	0.0	0.23	0.02	0.16	0.3	0.28
Cpa\|evm.model.tig00021582.28 (tig00021582_g22626.t1)	0.6	1.0	0.85	0.86	0.55	0.37	0.51	0.6	0.49	0.47	0.5	0.63	0.56	0.26	0.27	0.29	0.29	0.38	0.32	0.29	0.11	0.18	0.34	0.32	0.36	0.34
Cpa\|evm.model.tig00021682.4 (tig00021682_g23093.t1)	0.94	0.78	0.37	0.29	0.09	0.03	0.08	0.19	0.23	0.42	0.64	0.77	1.0	0.04	0.05	0.03	0.14	0.23	0.14	0.21	0.02	0.2	0.07	0.17	0.23	0.17

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)