Heatmap: Cluster_171 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000037.15 (tig00000037_g10084.t1)	0.17	0.1	0.07	0.14	0.1	0.05	0.08	0.14	0.15	0.1	0.17	0.12	0.09	0.08	0.05	0.06	0.06	0.11	0.08	0.06	0.42	0.32	1.0	0.4	0.34	0.2
Cpa\|evm.model.tig00000113.31 (tig00000113_g5600.t1)	0.48	0.41	0.38	0.49	0.48	0.43	0.41	0.43	0.42	0.36	0.36	0.47	0.46	0.42	0.26	0.44	0.32	0.45	0.36	0.29	0.52	0.49	1.0	0.59	0.73	0.44
Cpa\|evm.model.tig00000144.49 (tig00000144_g9041.t1)	0.18	0.16	0.13	0.19	0.2	0.25	0.17	0.21	0.19	0.15	0.17	0.14	0.12	0.1	0.15	0.11	0.15	0.23	0.25	0.13	0.27	0.64	1.0	0.52	0.37	0.25
Cpa\|evm.model.tig00000144.64 (tig00000144_g9055.t1)	0.12	0.18	0.18	0.23	0.35	0.35	0.35	0.29	0.28	0.14	0.19	0.1	0.03	0.15	0.16	0.17	0.19	0.21	0.24	0.22	0.39	0.51	1.0	0.22	0.47	0.34
Cpa\|evm.model.tig00000157.78 (tig00000157_g9667.t1)	0.14	0.02	0.02	0.16	0.08	0.03	0.07	0.07	0.06	0.08	0.14	0.07	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.24	0.45	1.0	0.66	0.46	0.25
Cpa\|evm.model.tig00000269.121 (tig00000269_g23784.t1)	0.21	0.05	0.07	0.2	0.22	0.14	0.16	0.2	0.17	0.19	0.17	0.11	0.08	0.05	0.04	0.06	0.04	0.14	0.08	0.03	0.27	0.25	1.0	0.41	0.56	0.34
Cpa\|evm.model.tig00000378.10 (tig00000378_g24501.t1)	0.34	0.4	0.43	0.45	0.61	0.52	0.48	0.44	0.43	0.46	0.55	0.58	0.4	0.53	0.45	0.56	0.42	0.51	0.42	0.38	0.47	0.5	1.0	0.76	0.74	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000451.6 (tig00000451_g965.t1)	0.3	0.16	0.18	0.21	0.16	0.06	0.1	0.1	0.1	0.12	0.21	0.25	0.23	0.19	0.13	0.16	0.09	0.27	0.14	0.12	0.23	0.42	1.0	0.5	0.43	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000523.5 (tig00000523_g1825.t1)	0.39	0.25	0.26	0.31	0.3	0.3	0.27	0.32	0.31	0.32	0.38	0.42	0.42	0.38	0.33	0.36	0.29	0.46	0.34	0.28	0.3	0.23	1.0	0.35	0.41	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000551.4 (tig00000551_g2025.t1)	0.17	0.13	0.12	0.11	0.09	0.07	0.09	0.1	0.1	0.12	0.16	0.21	0.16	0.13	0.09	0.15	0.15	0.14	0.11	0.11	0.45	0.2	1.0	0.49	0.46	0.23
Cpa\|evm.model.tig00000663.38 (tig00000663_g2970.t1)	0.27	0.24	0.2	0.23	0.11	0.1	0.16	0.26	0.31	0.26	0.38	0.31	0.24	0.17	0.17	0.18	0.15	0.21	0.2	0.12	0.54	0.2	1.0	0.65	0.41	0.27
Cpa\|evm.model.tig00000663.39 (tig00000663_g2971.t1)	0.36	0.33	0.28	0.47	0.48	0.41	0.45	0.41	0.38	0.31	0.35	0.3	0.28	0.2	0.24	0.21	0.17	0.31	0.28	0.2	0.27	0.4	1.0	0.41	0.64	0.38
Cpa\|evm.model.tig00000692.60 (tig00000692_g3258.t1)	0.35	0.35	0.36	0.42	0.31	0.24	0.28	0.33	0.19	0.2	0.24	0.22	0.32	0.21	0.18	0.2	0.18	0.38	0.26	0.18	0.36	0.62	1.0	0.33	0.82	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000743.15 (tig00000743_g3867.t1)	0.33	0.19	0.15	0.15	0.11	0.13	0.18	0.15	0.15	0.2	0.2	0.19	0.17	0.06	0.09	0.1	0.09	0.13	0.16	0.12	0.33	0.46	1.0	0.46	0.22	0.23
Cpa\|evm.model.tig00000808.2 (tig00000808_g4386.t1)	0.45	0.24	0.15	0.32	0.18	0.14	0.22	0.27	0.23	0.29	0.36	0.32	0.37	0.17	0.14	0.09	0.07	0.27	0.16	0.09	0.35	0.16	1.0	0.52	0.43	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000821.48 (tig00000821_g4507.t1)	0.26	0.24	0.16	0.22	0.16	0.11	0.13	0.22	0.18	0.22	0.31	0.31	0.28	0.07	0.04	0.07	0.06	0.09	0.1	0.06	0.48	0.19	1.0	0.26	0.3	0.24
Cpa\|evm.model.tig00000821.49 (tig00000821_g4507.t1)	0.32	0.17	0.12	0.2	0.14	0.11	0.13	0.17	0.14	0.16	0.26	0.21	0.17	0.08	0.04	0.07	0.08	0.11	0.08	0.06	0.39	0.29	1.0	0.3	0.32	0.15
Cpa\|evm.model.tig00000851.30 (tig00000851_g4914.t1)	0.26	0.25	0.21	0.27	0.24	0.17	0.16	0.18	0.18	0.2	0.22	0.24	0.22	0.14	0.13	0.12	0.18	0.22	0.15	0.16	0.35	0.48	1.0	0.43	0.51	0.35
Cpa\|evm.model.tig00000870.5 (tig00000870_g5124.t1)	0.35	0.2	0.17	0.27	0.17	0.09	0.17	0.22	0.24	0.32	0.43	0.32	0.36	0.1	0.15	0.12	0.1	0.17	0.12	0.07	0.4	0.31	1.0	0.4	0.65	0.23
Cpa\|evm.model.tig00000949.2 (tig00000949_g5713.t1)	0.32	0.08	0.07	0.1	0.07	0.08	0.11	0.18	0.11	0.11	0.16	0.21	0.21	0.07	0.06	0.03	0.09	0.13	0.1	0.05	0.32	0.28	1.0	0.38	0.33	0.42
Cpa\|evm.model.tig00001027.28 (tig00001027_g6400.t1)	0.03	0.03	0.03	0.06	0.06	0.04	0.05	0.05	0.06	0.05	0.06	0.07	0.01	0.09	0.08	0.09	0.06	0.15	0.13	0.04	0.35	0.63	1.0	0.34	0.39	0.21
Cpa\|evm.model.tig00001067.29 (tig00001067_g6788.t1)	0.33	0.5	0.35	0.44	0.39	0.4	0.32	0.3	0.3	0.26	0.29	0.38	0.21	0.26	0.17	0.31	0.17	0.28	0.26	0.18	0.42	0.39	1.0	0.45	0.74	0.32
Cpa\|evm.model.tig00001155.3 (tig00001155_g7311.t1)	0.36	0.25	0.18	0.21	0.14	0.09	0.14	0.15	0.1	0.1	0.14	0.19	0.41	0.14	0.13	0.14	0.17	0.14	0.13	0.08	0.33	0.19	1.0	0.22	0.55	0.28
Cpa\|evm.model.tig00001331.5 (tig00001331_g8168.t1)	0.28	0.12	0.19	0.2	0.14	0.1	0.15	0.23	0.24	0.23	0.32	0.39	0.28	0.08	0.08	0.08	0.13	0.16	0.16	0.17	0.29	0.05	1.0	0.41	0.53	0.33
Cpa\|evm.model.tig00001368.3 (tig00001368_g8402.t1)	0.19	0.16	0.19	0.34	0.27	0.19	0.26	0.35	0.29	0.32	0.37	0.28	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.19	0.15	0.15	0.32	0.35	1.0	0.42	0.62	0.56
Cpa\|evm.model.tig00001374.7 (tig00001374_g8499.t1)	0.18	0.09	0.05	0.07	0.08	0.13	0.19	0.2	0.26	0.31	0.31	0.28	0.14	0.07	0.09	0.08	0.11	0.19	0.14	0.12	0.54	0.22	1.0	0.5	0.3	0.23
Cpa\|evm.model.tig00001376.19 (tig00001376_g8540.t1)	0.3	0.28	0.29	0.25	0.24	0.24	0.26	0.27	0.3	0.32	0.35	0.38	0.29	0.23	0.22	0.35	0.25	0.28	0.26	0.26	0.44	0.33	1.0	0.74	0.34	0.26
Cpa\|evm.model.tig00001532.10 (tig00001532_g9277.t1)	0.39	0.32	0.4	0.52	0.34	0.18	0.2	0.22	0.09	0.13	0.15	0.19	0.37	0.22	0.19	0.27	0.25	0.36	0.22	0.16	0.55	0.62	0.9	0.36	1.0	0.68
Cpa\|evm.model.tig00001574.5 (tig00001574_g9352.t1)	0.05	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.07	0.12	0.16	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.02	0.25	0.08	1.0	0.67	0.09	0.04
Cpa\|evm.model.tig00001623.1 (tig00001623_g9414.t1)	0.15	0.11	0.12	0.17	0.18	0.17	0.18	0.19	0.27	0.23	0.3	0.29	0.19	0.22	0.13	0.22	0.14	0.19	0.16	0.11	0.39	0.18	1.0	0.49	0.34	0.31
Cpa\|evm.model.tig00020553.221 (tig00020553_g10711.t1)	0.12	0.03	0.01	0.07	0.1	0.04	0.11	0.1	0.06	0.04	0.08	0.07	0.16	0.02	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.02	0.34	0.04	1.0	0.23	0.27	0.31
Cpa\|evm.model.tig00020553.264 (tig00020553_g10750.t1)	0.04	0.05	0.04	0.09	0.05	0.07	0.09	0.07	0.08	0.08	0.06	0.06	0.03	0.09	0.2	0.13	0.1	0.14	0.07	0.1	0.24	0.29	1.0	0.52	0.16	0.26
Cpa\|evm.model.tig00020553.65 (tig00020553_g10554.t1)	0.4	0.41	0.44	0.44	0.32	0.26	0.35	0.4	0.31	0.32	0.35	0.36	0.35	0.27	0.26	0.25	0.24	0.39	0.29	0.25	0.51	0.23	1.0	0.4	0.6	0.41
Cpa\|evm.model.tig00020604.28 (tig00020604_g11865.t1)	0.21	0.13	0.08	0.07	0.07	0.08	0.1	0.15	0.2	0.25	0.32	0.35	0.19	0.13	0.11	0.14	0.12	0.15	0.13	0.09	0.44	0.23	1.0	0.6	0.29	0.21
Cpa\|evm.model.tig00020616.42 (tig00020616_g12278.t1)	0.12	0.02	0.04	0.07	0.06	0.04	0.06	0.07	0.1	0.12	0.14	0.12	0.08	0.1	0.11	0.06	0.05	0.08	0.07	0.05	0.42	0.15	1.0	0.81	0.3	0.24
Cpa\|evm.model.tig00020629.55 (tig00020912_g15874.t2)	0.28	0.16	0.08	0.18	0.17	0.08	0.17	0.21	0.23	0.24	0.37	0.26	0.27	0.09	0.11	0.09	0.08	0.28	0.13	0.09	0.32	0.41	1.0	0.61	0.46	0.41
Cpa\|evm.model.tig00020723.28 (tig00020723_g13449.t1)	0.14	0.15	0.02	0.04	0.01	0.0	0.05	0.08	0.0	0.04	0.03	0.05	0.09	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.05	0.01	0.36	0.07	1.0	0.09	0.53	0.15
Cpa\|evm.model.tig00020725.5 (tig00020725_g13531.t1)	0.07	0.08	0.1	0.14	0.11	0.09	0.1	0.1	0.09	0.1	0.09	0.08	0.05	0.14	0.1	0.13	0.09	0.14	0.14	0.09	0.37	0.22	1.0	0.26	0.22	0.28
Cpa\|evm.model.tig00020902.93 (tig00020902_g15041.t1)	0.18	0.04	0.05	0.13	0.1	0.05	0.06	0.09	0.11	0.14	0.22	0.21	0.13	0.08	0.12	0.1	0.05	0.15	0.09	0.04	0.24	0.44	1.0	0.65	0.32	0.31
Cpa\|evm.model.tig00020912.61 (tig00020912_g15832.t1)	0.1	0.1	0.1	0.27	0.32	0.27	0.31	0.34	0.17	0.15	0.14	0.07	0.05	0.11	0.13	0.17	0.14	0.21	0.17	0.1	0.41	0.51	1.0	0.43	0.6	0.38
Cpa\|evm.model.tig00020961.108 (tig00020961_g16727.t1)	0.14	0.11	0.09	0.1	0.08	0.11	0.19	0.21	0.24	0.19	0.28	0.3	0.17	0.07	0.06	0.05	0.06	0.07	0.06	0.09	0.51	0.1	1.0	0.36	0.35	0.25
Cpa\|evm.model.tig00020961.143 (tig00020961_g16762.t1)	0.11	0.09	0.09	0.13	0.1	0.07	0.12	0.13	0.12	0.11	0.13	0.12	0.1	0.1	0.11	0.09	0.09	0.11	0.12	0.11	0.36	0.17	1.0	0.29	0.26	0.27
Cpa\|evm.model.tig00021168.8 (tig00021168_g19073.t1)	0.41	0.29	0.19	0.16	0.09	0.1	0.16	0.17	0.14	0.18	0.2	0.22	0.3	0.18	0.19	0.2	0.11	0.27	0.23	0.18	0.2	0.17	1.0	0.43	0.56	0.26
Cpa\|evm.model.tig00021357.51 (tig00021357_g20776.t1)	0.33	0.16	0.11	0.18	0.17	0.18	0.27	0.29	0.29	0.27	0.31	0.28	0.28	0.13	0.16	0.1	0.11	0.23	0.17	0.1	0.51	0.31	1.0	0.54	0.76	0.4
Cpa\|evm.model.tig00021435.5 (tig00021435_g21383.t1)	0.16	0.22	0.2	0.14	0.18	0.22	0.22	0.2	0.25	0.26	0.3	0.29	0.11	0.12	0.22	0.13	0.2	0.27	0.24	0.22	0.33	0.5	1.0	0.66	0.37	0.3
Cpa\|evm.model.tig00021464.36	0.15	0.11	0.16	0.23	0.22	0.29	0.33	0.27	0.26	0.18	0.14	0.19	0.12	0.31	0.29	0.33	0.26	0.3	0.36	0.21	0.55	0.73	1.0	0.39	0.8	0.54
Cpa\|evm.model.tig00021493.27 (tig00021493_g21872.t1)	0.38	0.28	0.19	0.19	0.13	0.08	0.13	0.16	0.09	0.11	0.13	0.15	0.38	0.14	0.15	0.15	0.13	0.22	0.21	0.09	0.48	0.34	1.0	0.31	0.83	0.25
Cpa\|evm.model.tig00021579.9 (tig00021579_g22432.t1)	0.38	0.22	0.2	0.32	0.33	0.32	0.32	0.35	0.34	0.34	0.47	0.52	0.4	0.24	0.15	0.17	0.14	0.2	0.2	0.16	0.3	0.32	1.0	0.56	0.61	0.51

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)