Heatmap: Cluster_124 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000055.1 (tig00000055_g20101.t1)	1.0	0.58	0.37	0.14	0.04	0.05	0.12	0.26	0.15	0.12	0.16	0.24	0.94	0.18	0.15	0.17	0.25	0.14	0.17	0.15	0.0	0.03	0.02	0.04	0.37	0.14
Cpa\|evm.model.tig00000057.49 (tig00000057_g68.t1)	0.9	0.51	0.31	0.27	0.15	0.05	0.09	0.11	0.16	0.18	0.32	0.43	1.0	0.08	0.13	0.12	0.21	0.2	0.09	0.14	0.07	0.4	0.15	0.19	0.27	0.19
Cpa\|evm.model.tig00000076.95 (tig00000076_g2392.t1)	0.69	0.06	0.04	0.01	0.0	0.0	0.01	0.02	0.02	0.04	0.12	0.36	1.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.2	0.09	0.04	0.11	0.06	0.06
Cpa\|evm.model.tig00000093.128 (tig00000093_g3556.t1)	0.95	0.49	0.35	0.23	0.14	0.1	0.19	0.29	0.11	0.18	0.25	0.3	1.0	0.08	0.11	0.11	0.09	0.11	0.12	0.11	0.01	0.05	0.08	0.08	0.47	0.14
Cpa\|evm.model.tig00000093.254 (tig00000093_g3675.t1)	0.8	0.31	0.13	0.04	0.01	0.0	0.01	0.04	0.0	0.0	0.01	0.03	1.0	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.03	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.04
Cpa\|evm.model.tig00000113.87 (tig00000113_g5668.t1)	0.87	0.48	0.34	0.19	0.1	0.07	0.18	0.26	0.16	0.21	0.28	0.41	1.0	0.12	0.09	0.5	0.12	0.17	0.14	0.16	0.02	0.13	0.09	0.06	0.29	0.14
Cpa\|evm.model.tig00000113.88 (tig00000113_g5668.t1)	0.81	0.43	0.32	0.2	0.1	0.06	0.16	0.25	0.14	0.18	0.25	0.35	1.0	0.1	0.08	0.35	0.09	0.16	0.11	0.14	0.02	0.08	0.04	0.06	0.12	0.15
Cpa\|evm.model.tig00000113.89 (tig00020780_g13759.t1)	1.0	0.54	0.31	0.19	0.1	0.09	0.18	0.27	0.17	0.22	0.28	0.35	0.99	0.13	0.12	0.5	0.13	0.17	0.18	0.2	0.03	0.12	0.05	0.11	0.25	0.22
Cpa\|evm.model.tig00000204.72 (tig00000204_g17739.t1)	1.0	0.29	0.24	0.18	0.03	0.01	0.04	0.12	0.05	0.03	0.05	0.12	0.67	0.15	0.02	0.08	0.02	0.03	0.04	0.04	0.24	0.09	0.02	0.07	0.24	0.26
Cpa\|evm.model.tig00000204.73 (tig00000204_g17739.t1)	1.0	0.31	0.27	0.18	0.05	0.02	0.04	0.13	0.06	0.03	0.06	0.12	0.66	0.16	0.03	0.09	0.03	0.04	0.05	0.06	0.17	0.07	0.02	0.06	0.18	0.22
Cpa\|evm.model.tig00000219.42 (tig00000219_g19481.t1)	0.89	0.54	0.43	0.27	0.05	0.04	0.15	0.24	0.12	0.19	0.25	0.29	1.0	0.03	0.01	0.01	0.09	0.21	0.13	0.16	0.01	0.04	0.02	0.01	0.14	0.16
Cpa\|evm.model.tig00000219.43 (tig00000219_g19482.t1)	1.0	0.51	0.23	0.09	0.04	0.05	0.19	0.3	0.2	0.25	0.29	0.38	0.89	0.08	0.1	0.09	0.16	0.18	0.12	0.15	0.13	0.05	0.16	0.13	0.39	0.14
Cpa\|evm.model.tig00000227.54 (tig00000227_g19848.t1)	0.85	0.42	0.36	0.3	0.09	0.04	0.1	0.12	0.06	0.06	0.09	0.19	1.0	0.23	0.23	0.17	0.1	0.06	0.07	0.08	0.01	0.08	0.05	0.05	0.22	0.23
Cpa\|evm.model.tig00000241.128 (tig00000241_g20994.t1)	0.74	0.15	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	1.0	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.0	0.02	0.28	0.0	0.0	0.01	0.0
Cpa\|evm.model.tig00000241.141 (tig00000241_g21006.t1)	0.7	0.41	0.24	0.16	0.14	0.09	0.11	0.13	0.05	0.08	0.12	0.18	1.0	0.03	0.03	0.04	0.05	0.09	0.08	0.11	0.01	0.12	0.01	0.02	0.04	0.03
Cpa\|evm.model.tig00000241.47 (tig00000241_g20906.t1)	1.0	0.4	0.21	0.21	0.06	0.03	0.1	0.2	0.15	0.19	0.29	0.34	0.84	0.13	0.12	0.1	0.1	0.16	0.11	0.14	0.03	0.18	0.24	0.26	0.37	0.32
Cpa\|evm.model.tig00000241.48 (tig00000241_g20906.t1)	1.0	0.46	0.29	0.21	0.06	0.04	0.1	0.18	0.14	0.18	0.29	0.44	0.89	0.13	0.19	0.14	0.15	0.17	0.11	0.16	0.03	0.3	0.26	0.17	0.25	0.37
Cpa\|evm.model.tig00000248.3 (tig00000248_g21772.t1)	1.0	0.2	0.17	0.09	0.01	0.0	0.05	0.04	0.07	0.19	0.16	0.03	0.67	0.06	0.01	0.11	0.3	0.01	0.01	0.06	0.04	0.0	0.03	0.05	0.6	0.07
Cpa\|evm.model.tig00000254.109 (tig00000254_g22565.t1)	1.0	0.46	0.29	0.31	0.23	0.1	0.11	0.12	0.09	0.12	0.22	0.45	0.99	0.33	0.37	0.35	0.2	0.23	0.15	0.1	0.05	0.25	0.16	0.18	0.2	0.15
Cpa\|evm.model.tig00000334.13 (tig00000334_g24109.t1)	1.0	0.38	0.2	0.13	0.09	0.07	0.15	0.21	0.05	0.08	0.12	0.15	0.96	0.12	0.13	0.1	0.1	0.21	0.13	0.11	0.03	0.03	0.04	0.04	0.11	0.09
Cpa\|evm.model.tig00000342.56 (tig00000342_g24240.t1)	1.0	0.73	0.47	0.25	0.13	0.1	0.22	0.36	0.25	0.27	0.35	0.47	0.99	0.1	0.12	0.13	0.31	0.3	0.23	0.27	0.09	0.22	0.18	0.19	0.61	0.22
Cpa\|evm.model.tig00000473.4 (tig00000473_g1203.t1)	1.0	0.37	0.23	0.08	0.02	0.02	0.06	0.16	0.03	0.07	0.09	0.16	0.91	0.05	0.08	0.05	0.07	0.11	0.1	0.1	0.28	0.09	0.12	0.07	0.28	0.18
Cpa\|evm.model.tig00000475.12 (tig00000475_g1239.t1)	0.81	0.67	0.27	0.3	0.1	0.01	0.03	0.05	0.0	0.01	0.03	0.06	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.06	0.06	0.01	0.03	0.07	0.04
Cpa\|evm.model.tig00000545.4 (tig00000545_g1977.t1)	0.86	0.36	0.21	0.3	0.14	0.06	0.08	0.11	0.04	0.08	0.17	0.24	1.0	0.05	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.02	0.11	0.05	0.04	0.04	0.3	0.13
Cpa\|evm.model.tig00000605.18 (tig00000605_g2482.t1)	1.0	0.25	0.16	0.21	0.14	0.1	0.16	0.31	0.2	0.22	0.3	0.26	0.93	0.17	0.04	0.12	0.06	0.15	0.13	0.12	0.16	0.23	0.15	0.24	0.42	0.37
Cpa\|evm.model.tig00000658.26 (tig00000658_g2916.t1)	0.86	0.76	0.38	0.35	0.27	0.19	0.22	0.28	0.22	0.26	0.37	0.41	1.0	0.22	0.18	0.51	0.15	0.26	0.13	0.1	0.09	0.31	0.1	0.12	0.19	0.12
Cpa\|evm.model.tig00000718.36 (tig00000718_g3711.t1)	0.68	0.59	0.46	0.39	0.2	0.13	0.26	0.34	0.09	0.14	0.19	0.24	1.0	0.06	0.05	0.08	0.06	0.07	0.08	0.17	0.11	0.14	0.06	0.09	0.13	0.14
Cpa\|evm.model.tig00000792.58 (tig00000792_g4209.t1)	1.0	0.7	0.51	0.35	0.1	0.04	0.08	0.15	0.01	0.01	0.02	0.04	0.94	0.05	0.1	0.07	0.1	0.16	0.11	0.13	0.01	0.19	0.01	0.01	0.2	0.14
Cpa\|evm.model.tig00000949.10 (tig00000949_g5722.t1)	0.83	0.4	0.3	0.29	0.25	0.23	0.34	0.37	0.23	0.2	0.21	0.25	1.0	0.34	0.32	0.39	0.45	0.4	0.3	0.22	0.3	0.28	0.17	0.25	0.41	0.32
Cpa\|evm.model.tig00000989.46 (tig00000989_g6119.t1)	1.0	0.76	0.52	0.33	0.04	0.01	0.01	0.05	0.01	0.03	0.08	0.17	0.9	0.09	0.04	0.06	0.04	0.06	0.04	0.04	0.2	0.21	0.03	0.14	0.37	0.32
Cpa\|evm.model.tig00001126.5 (tig00001126_g7116.t1)	0.91	0.47	0.42	0.28	0.13	0.09	0.18	0.25	0.12	0.16	0.22	0.28	1.0	0.41	0.4	0.54	0.23	0.2	0.26	0.19	0.15	0.42	0.08	0.16	0.25	0.25
Cpa\|evm.model.tig00001187.17 (tig00001187_g7466.t1)	0.91	0.33	0.25	0.15	0.09	0.07	0.18	0.29	0.12	0.14	0.29	0.57	1.0	0.05	0.04	0.06	0.11	0.11	0.06	0.13	0.17	0.11	0.08	0.12	0.37	0.22
Cpa\|evm.model.tig00001224.18 (tig00001224_g7640.t1)	1.0	0.39	0.27	0.17	0.12	0.12	0.2	0.28	0.12	0.1	0.12	0.17	0.99	0.2	0.35	0.23	0.19	0.25	0.26	0.17	0.01	0.08	0.08	0.04	0.38	0.17
Cpa\|evm.model.tig00001339.13 (tig00001339_g8269.t1)	1.0	0.72	0.51	0.39	0.3	0.23	0.27	0.32	0.23	0.27	0.34	0.46	1.0	0.16	0.19	0.22	0.4	0.31	0.3	0.27	0.02	0.15	0.04	0.1	0.14	0.09
Cpa\|evm.model.tig00001408.12 (tig00001408_g8607.t1)	1.0	0.74	0.46	0.22	0.08	0.05	0.11	0.18	0.12	0.12	0.16	0.25	0.97	0.16	0.12	0.19	0.14	0.22	0.19	0.14	0.04	0.06	0.03	0.05	0.26	0.13
Cpa\|evm.model.tig00001576.14 (tig00001576_g9370.t1)	1.0	0.6	0.48	0.24	0.11	0.13	0.25	0.38	0.35	0.36	0.43	0.59	0.92	0.24	0.28	0.19	0.4	0.22	0.28	0.32	0.1	0.27	0.2	0.34	0.44	0.3
Cpa\|evm.model.tig00001576.15 (tig00001576_g9370.t1)	1.0	0.67	0.47	0.3	0.11	0.08	0.27	0.45	0.39	0.44	0.52	0.71	0.97	0.24	0.27	0.23	0.44	0.32	0.25	0.34	0.13	0.25	0.27	0.44	0.59	0.34
Cpa\|evm.model.tig00020553.76 (tig00020553_g10566.t1)	0.86	0.46	0.52	0.5	0.33	0.15	0.15	0.18	0.13	0.18	0.29	0.43	1.0	0.16	0.29	0.16	0.28	0.21	0.17	0.2	0.15	0.34	0.17	0.27	0.33	0.37
Cpa\|evm.model.tig00020610.103 (tig00020610_g12049.t1)	0.9	0.59	0.49	0.41	0.13	0.04	0.09	0.17	0.02	0.04	0.11	0.21	1.0	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.05	0.12	0.26	0.07	0.01	0.07	0.08	0.13
Cpa\|evm.model.tig00020610.107 (tig00020610_g12053.t1)	0.87	0.66	0.53	0.55	0.2	0.06	0.11	0.21	0.01	0.04	0.08	0.14	1.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.12	0.11	0.09	0.01	0.03	0.12	0.12
Cpa\|evm.model.tig00020610.95 (tig00020610_g12040.t1)	0.65	0.25	0.24	0.18	0.11	0.18	0.25	0.29	0.16	0.22	0.27	0.39	1.0	0.31	0.22	0.36	0.19	0.34	0.22	0.15	0.17	0.07	0.22	0.16	0.26	0.25
Cpa\|evm.model.tig00020675.11 (tig00020675_g12592.t1)	1.0	0.57	0.37	0.3	0.11	0.03	0.08	0.17	0.01	0.01	0.02	0.06	0.86	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.14	0.02	0.03	0.0	0.02	0.07	0.09
Cpa\|evm.model.tig00020675.17 (tig00020675_g12598.t1)	1.0	0.56	0.47	0.44	0.31	0.21	0.2	0.28	0.16	0.24	0.32	0.47	0.99	0.3	0.17	0.21	0.15	0.21	0.18	0.23	0.01	0.25	0.03	0.07	0.28	0.29
Cpa\|evm.model.tig00020710.100 (tig00020710_g13365.t1)	1.0	0.33	0.3	0.24	0.12	0.08	0.17	0.23	0.17	0.23	0.28	0.34	0.81	0.04	0.04	0.04	0.1	0.16	0.09	0.16	0.02	0.01	0.14	0.19	0.26	0.29
Cpa\|evm.model.tig00020830.55 (tig00020830_g14438.t1)	1.0	0.69	0.44	0.25	0.12	0.07	0.18	0.31	0.16	0.2	0.28	0.32	0.96	0.17	0.17	0.17	0.26	0.32	0.22	0.27	0.01	0.09	0.08	0.11	0.56	0.22
Cpa\|evm.model.tig00020943.4 (tig00020943_g16247.t1)	1.0	0.52	0.36	0.14	0.02	0.0	0.02	0.1	0.05	0.13	0.24	0.34	0.9	0.09	0.06	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.04	0.05	0.12	0.27	0.28	0.27
Cpa\|evm.model.tig00020943.5 (tig00020943_g16247.t1)	1.0	0.63	0.47	0.21	0.02	0.01	0.02	0.08	0.08	0.11	0.22	0.35	0.87	0.06	0.06	0.05	0.03	0.05	0.09	0.06	0.02	0.03	0.07	0.09	0.25	0.27
Cpa\|evm.model.tig00020943.56 (tig00020943_g16299.t1)	1.0	0.88	0.5	0.27	0.17	0.18	0.21	0.15	0.09	0.11	0.15	0.29	0.95	0.21	0.11	0.15	0.19	0.22	0.15	0.17	0.06	0.13	0.02	0.05	0.13	0.07
Cpa\|evm.model.tig00020943.6 (tig00020943_g16248.t1)	1.0	0.62	0.43	0.22	0.04	0.01	0.02	0.11	0.09	0.16	0.25	0.38	0.98	0.07	0.1	0.09	0.06	0.09	0.08	0.13	0.03	0.01	0.08	0.08	0.33	0.25
Cpa\|evm.model.tig00020961.121 (tig00020961_g16741.t1)	0.84	0.52	0.34	0.29	0.17	0.11	0.18	0.24	0.21	0.2	0.24	0.32	1.0	0.27	0.28	0.28	0.24	0.29	0.24	0.21	0.08	0.26	0.12	0.19	0.23	0.21
Cpa\|evm.model.tig00021038.96 (tig00021038_g17585.t1)	1.0	0.64	0.41	0.27	0.06	0.01	0.03	0.07	0.01	0.01	0.02	0.04	0.84	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.08	0.01	0.01	0.0	0.01	0.04	0.04
Cpa\|evm.model.tig00021038.97 (tig00021038_g17585.t1)	1.0	0.71	0.43	0.3	0.07	0.01	0.04	0.08	0.01	0.01	0.02	0.05	0.96	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.08	0.01	0.0	0.0	0.01	0.04	0.04
Cpa\|evm.model.tig00021179.80	0.87	1.0	0.37	0.32	0.2	0.11	0.05	0.16	0.07	0.12	0.17	0.29	0.94	0.14	0.07	0.08	0.04	0.14	0.17	0.07	0.05	0.04	0.02	0.09	0.09	0.05
Cpa\|evm.model.tig00021234.40 (tig00021234_g19418.t1)	0.45	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.05	0.02	0.09	0.24	0.46	1.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.24	0.08	0.04	0.06	0.14	0.08
Cpa\|evm.model.tig00021238.23 (tig00021238_g19560.t1)	0.71	0.28	0.25	0.33	0.23	0.19	0.21	0.23	0.06	0.07	0.09	0.15	1.0	0.21	0.1	0.17	0.05	0.1	0.07	0.06	0.17	0.14	0.05	0.08	0.22	0.18
Cpa\|evm.model.tig00021318.33 (tig00021318_g20151.t1)	1.0	0.53	0.41	0.31	0.13	0.03	0.06	0.16	0.08	0.07	0.15	0.25	0.87	0.11	0.05	0.08	0.06	0.09	0.07	0.08	0.02	0.03	0.01	0.03	0.22	0.2
Cpa\|evm.model.tig00021332.11 (tig00021332_g20327.t1)	0.92	0.57	0.33	0.27	0.12	0.07	0.15	0.23	0.04	0.12	0.18	0.24	1.0	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.04	0.13	0.07	0.07	0.03	0.18	0.2	0.15
Cpa\|evm.model.tig00021373.7 (tig00021373_g21074.t1)	1.0	0.67	0.49	0.32	0.09	0.02	0.04	0.09	0.09	0.11	0.22	0.37	0.95	0.17	0.09	0.12	0.08	0.1	0.09	0.09	0.05	0.14	0.17	0.19	0.45	0.29
Cpa\|evm.model.tig00021432.52 (tig00021432_g21244.t1)	0.96	0.66	0.45	0.3	0.17	0.12	0.16	0.28	0.22	0.19	0.27	0.38	1.0	0.13	0.16	0.57	0.24	0.28	0.24	0.26	0.14	0.11	0.31	0.13	0.45	0.19
Cpa\|evm.model.tig00021434.66 (tig00021434_g21370.t1)	1.0	0.25	0.2	0.06	0.03	0.03	0.06	0.17	0.09	0.12	0.14	0.21	0.74	0.17	0.06	0.05	0.04	0.1	0.04	0.04	0.22	0.08	0.23	0.06	0.5	0.19
Cpa\|evm.model.tig00021493.56 (tig00021493_g21894.t1)	0.97	0.68	0.28	0.15	0.03	0.01	0.0	0.01	0.01	0.04	0.13	0.33	1.0	0.04	0.02	0.05	0.06	0.03	0.03	0.01	0.08	0.04	0.08	0.05	0.04	0.08
Cpa\|evm.model.tig00021493.57 (tig00021493_g21895.t2)	0.9	1.0	0.35	0.14	0.02	0.0	0.0	0.02	0.01	0.02	0.08	0.28	0.89	0.07	0.01	0.02	0.09	0.04	0.03	0.02	0.08	0.04	0.08	0.06	0.08	0.05

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)