Heatmap: Cluster_36 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
BOF 92
BOF 92,Log
CCMP1516,Log,5mM sulfate,ESAW,15C
CCMP1516,Log,25mM sulfate,ESAW,15C
CCMP2090
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,18C
CCMP2090,Log,DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP370,pH7.8,Aquil,20C
CCMP370,pH8.1,Aquil,20C
CCMP371,17C
CCMP373,Log
CCMP373,Stationary
CCMP374,Log
CCMP374,Stationary
CCMP374,pH8.3,F/2-Si,18C
CCMP379,pH8.3,F/2-Si,18C
PLY M219,pH7.8,Aquil,20C
PLY M219,pH8.1,Aquil,20C
RCC1253
RCC3782
RCC6660,Log,pH7.2
RCC6660,Log,pH7.5
RCC6660,Log,pH7.8
RCC6660,Log,pH8.2
RCC6666,Log,pH7.2
RCC6666,Log,pH7.5
RCC6666,Log,pH7.8
RCC6666,Log,pH8.2
UNC1419,Log,Aquil,12C
- - - - - -2.75 - -2.63 - -1.49 -1.84 -1.96 - -2.3 - - -4.57 3.45 3.21 -1.21 - - - 2.79 2.76 - -1.79 - - - - - - - - -
- - 2.82 - - - - - - -2.66 0.87 1.2 - 2.17 - - - - - 3.04 - 3.58 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.67 -1.04 1.22 0.29 -2.92 -3.17 -1.64 -1.17 -2.82 -2.14 -3.47 -4.2 -1.98 -2.83 2.53 2.64 2.23 - -0.35 -2.47 0.62 0.1 - 1.69 1.38 -1.96 -0.9 - -1.4 -3.0 0.21 -2.59 - -4.58 - -0.63
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.71 1.78 1.35 1.7 1.41 1.76 1.08 1.02 1.01 1.53 1.89 1.01 - - - 0.87 -0.21 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-4.27 -4.13 -5.99 -5.13 - -9.89 -7.7 -8.52 -8.02 -7.24 - -7.64 - -8.84 -0.36 -0.05 2.13 -6.41 -4.6 - -4.34 -0.22 -5.4 -2.68 -2.22 -1.04 -2.79 1.41 1.69 2.37 2.22 0.12 0.18 0.54 1.13 2.62
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.9 - - - - - - - - - - - - - - - 0.42 - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - -
-1.61 - 0.11 0.53 -7.61 -5.2 -7.6 -5.04 -5.28 -5.23 -5.4 -3.28 -5.12 -5.97 -1.27 -1.33 -5.48 - - - -2.13 -2.25 1.45 -1.91 -2.89 4.47 1.36 -1.1 -0.63 -0.37 -2.08 -1.5 -1.77 -0.65 -1.37 -
3.35 - - - 0.07 - - - - - - - - - - - 2.33 - - 3.63 2.43 0.92 - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.34 - -9.74 -2.65 -3.16 -1.23 -3.16 - - - - -2.13 - - - - - - - - - - - -3.04 - - - - - - - - - 5.01
- - - - - - - - - - - - - - - 3.71 0.04 - 4.45 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.27 -2.14 0.19 0.49 -0.74 -1.4 -0.86 -0.87 -0.85 0.46 -0.14 -0.39 -0.65 -1.04 0.75 0.98 -0.14 -0.84 -0.43 -0.49 -1.78 -3.31 -0.4 1.16 0.95 -0.41 -0.2 0.1 0.13 -0.01 0.23 0.49 0.69 0.87 0.75 0.88
- - - - - - - 0.94 - - - - - - - - - - - - - 3.42 -14.14 - - 2.93 3.98 - - - - - - - - -
- - - -0.77 - -2.69 -1.8 -1.38 -1.07 -3.65 - - - -2.5 - - - 3.81 3.51 -4.51 -4.04 - - - - 3.06 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.03 - 1.69 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.64 3.16 - - - - - 4.38 - - - - - - - - -
0.6 -4.0 -2.42 -1.86 -5.07 -6.24 -3.88 -3.47 -3.63 -4.15 -3.46 -2.36 -7.37 -2.9 1.13 1.5 1.53 1.02 -0.32 -5.05 -0.18 2.2 - -0.7 -0.96 0.72 -1.47 0.17 0.0 0.85 -0.31 -1.14 -0.86 -0.32 -0.93 2.75
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - -20.4 - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - -2.88 - -4.04 - - - - - 2.09 1.98 3.69 - - - - - - - - 2.18 0.32 0.1 -0.01 -0.1 -0.14 -1.01 0.2 -1.01 1.19 -0.82
-4.27 -4.13 -5.99 -5.13 - -9.89 -7.7 -8.52 -8.02 -7.24 - -7.64 - -8.84 -0.36 -0.05 2.13 -6.41 -4.6 - -4.34 -0.22 -5.4 -2.68 -2.22 -1.04 -2.79 1.41 1.69 2.37 2.22 0.12 0.18 0.54 1.13 2.62
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.58 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.2 3.62 - - - - - - - - 2.44 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 3.59 4.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.1 -9.99 -0.46 0.24 - 1.26 -0.26 -0.46 1.93 1.74 -0.32 -13.74 - - 1.86 - -10.54 - - - - -0.35 - -0.51 3.09 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.52 3.7 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.54 3.68 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.2 3.62 - - - - - - - - 2.44 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 3.59 4.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.66 1.97 1.17 - -1.08 -0.47 -0.28 0.2 -0.58 -2.01 -1.7 -1.93 -1.25 -0.7 1.15 -0.29 -0.3 2.78 2.65 -3.93 0.46 -1.89 -2.77 - - -0.23 1.53 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.53 - 1.74 - - - -0.13 2.14 -1.87 0.23 - - - - 2.08 1.09 -0.68 - 1.82 - 1.6 - 0.58 - - 1.64 0.99 - - - - - - - - -
- - - - - 2.86 3.81 2.43 -3.67 - 0.38 - - - - - - - - - - 1.62 - - - 2.28 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.41 2.87 - - - - - - - - - - - - - - -1.27 2.82 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17
- - - - - -2.75 - -2.63 - -1.49 -1.84 -1.96 - -2.3 - - -4.57 3.45 3.21 -1.21 - - - 2.79 2.76 - -1.79 - - - - - - - - -
- - -0.32 1.53 -0.05 -0.46 -0.19 0.16 -0.22 1.58 2.25 0.16 -0.96 0.22 -0.07 -0.64 -3.64 - - 1.87 -23.0 0.59 - 0.92 -0.6 1.78 0.09 - -1.79 0.39 0.71 - -4.3 -4.31 - -
- - - - - -2.75 - -2.63 - -1.49 -1.84 -1.96 - -2.3 - - -4.57 3.45 3.21 -1.21 - - - 2.79 2.76 - -1.79 - - - - - - - - -
- - - - - - - -5.36 - - - - - - 0.18 1.88 2.02 - - 1.53 3.91 1.82 -0.27 -2.01 -0.3 0.73 1.1 - - - - - - - - -
- - 2.21 - 0.85 1.63 - 2.04 0.9 - - - -0.56 - - - - - - - - - - - - 4.31 - - - - - - - - - -
- - - - - - - 2.05 - - - - - - - - 4.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - -0.37 - - - - - - - - - 3.72 - - - - 3.94 - - - 2.75 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.96 - - - - - - - 2.71 - - - - - - - - 3.8 - -
- - 2.05 3.26 - -4.71 -2.21 - - -3.58 -1.26 - -3.47 -3.94 - - -3.21 3.19 - - 0.46 - - - - 3.04 - - - - 1.36 - - - - -
- - 2.62 - - - - - - - - - - - - - - - 0.9 - - - - -0.02 - 4.73 -0.94 - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.