Heatmap: Cluster_9 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000042.106 (tig00000042_g15501.t1)
-0.41 -0.17 -0.29 -0.3 0.16 0.5 0.46 0.24 0.11 0.12 -0.28 -0.17 -0.64 -1.11 -0.37 -0.63 -0.12 0.84 0.65 0.43 -1.13 -1.03 0.9 0.22 -0.19 -0.39
Cpa|evm.model.tig00000042.22 (tig00000042_g15408.t1)
0.55 0.96 0.52 -0.04 -0.72 -0.91 -0.55 -0.15 0.05 -0.16 -0.0 0.04 0.43 -0.15 0.21 0.02 -0.07 0.26 0.6 -0.02 -1.23 -0.96 0.41 -0.12 -0.86 -0.56
Cpa|evm.model.tig00000093.212 (tig00000093_g3637.t1)
-0.65 0.1 -0.03 0.09 0.53 0.69 0.32 0.21 0.18 0.09 0.15 -0.02 -0.98 -0.17 -0.04 0.06 -0.0 0.06 0.0 -0.03 -1.96 -1.14 0.91 -0.03 -0.37 -0.49
Cpa|evm.model.tig00000093.226 (tig00000093_g3651.t1)
-0.75 -0.08 -0.17 0.62 0.62 0.12 0.19 0.24 0.08 -0.05 0.08 -0.35 -1.1 -0.34 -0.46 -0.4 -0.76 0.42 0.18 -0.09 -1.06 -0.61 1.43 0.13 -0.44 -0.29
Cpa|evm.model.tig00000133.4 (tig00000133_g7663.t1)
-2.1 -1.88 -1.97 -2.49 -1.15 -1.03 -0.94 -0.65 -0.38 -0.61 -0.19 -0.59 -1.2 -0.61 0.99 0.0 0.51 0.64 0.27 0.62 -0.76 -1.66 1.54 1.11 1.29 0.83
Cpa|evm.model.tig00000133.5 (tig00021439_g21459.t1)
-2.17 -2.12 -1.7 -1.36 -1.14 -1.22 -0.53 -0.0 -0.56 -0.02 0.34 0.1 -0.72 -1.03 -0.54 0.74 0.02 1.22 0.29 -0.81 -3.71 -3.12 1.97 0.64 1.25 0.7
Cpa|evm.model.tig00000144.122 (tig00000144_g9117.t1)
0.12 0.41 0.11 -0.06 -0.39 -0.42 -0.24 -0.09 0.22 0.3 0.32 0.2 -0.44 -1.09 -0.44 -0.31 -0.14 0.27 0.6 0.3 -1.68 -1.09 0.78 0.68 -0.06 -0.32
Cpa|evm.model.tig00000144.8 (tig00000144_g8998.t1)
-2.69 -0.62 -0.6 -0.35 0.22 -0.09 -0.54 -0.87 -0.88 -0.74 -0.75 -1.3 -3.67 0.41 -0.41 0.18 -0.21 0.36 0.06 0.16 -1.35 -0.6 2.13 0.71 0.52 1.11
Cpa|evm.model.tig00000157.63 (tig00020876_g14844.t1)
- - - - - - - - - - - - - -0.88 -2.16 0.7 1.27 1.09 0.72 -0.05 -0.59 0.06 2.85 1.41 1.25 1.33
Cpa|evm.model.tig00000157.64 (tig00000157_g9651.t1)
- - - - - - - - - - - - - -0.16 -1.51 -0.06 0.82 1.16 0.65 0.5 -0.45 0.54 2.88 0.66 1.93 0.88
Cpa|evm.model.tig00000157.65 (tig00000157_g9651.t1)
- - - - - - - - - - - - - 0.26 -0.8 0.42 0.82 1.01 1.17 0.78 -0.59 1.36 2.35 0.99 1.34 1.2
Cpa|evm.model.tig00000157.66 (tig00000157_g9652.t1)
- - - - - - - - - - - - - 0.1 -0.36 0.14 0.7 0.92 1.04 0.95 -0.67 0.01 2.33 1.52 1.61 1.55
Cpa|evm.model.tig00000157.67 (tig00000157_g9653.t1)
- - - - - - - - - - - - - 0.26 -0.23 0.45 1.05 0.74 1.02 1.11 -0.19 0.64 2.23 1.39 1.15 1.42
Cpa|evm.model.tig00000158.63 (tig00000158_g10168.t1)
-0.63 -0.37 -0.84 -0.56 -0.37 0.37 -0.28 -0.83 0.12 -0.21 -0.5 -0.45 -0.54 -0.28 0.02 -0.29 0.4 0.38 0.16 -0.38 0.15 -1.12 1.56 0.75 -0.18 0.64
Cpa|evm.model.tig00000178.59 (tig00000178_g12771.t1)
0.71 0.64 0.24 -0.44 -0.56 -0.3 0.06 0.4 0.19 0.2 0.44 0.47 0.21 -0.78 -1.37 -1.3 -0.49 0.63 -0.59 0.72 -0.56 -2.5 0.42 -0.15 0.15 -0.56
Cpa|evm.model.tig00000178.60 (tig00000178_g12771.t1)
0.72 0.76 0.16 -0.41 -0.32 0.38 0.2 0.19 0.28 0.28 0.28 0.39 0.19 -0.25 -0.97 -1.11 -0.24 -0.05 0.39 0.14 -0.64 -2.36 0.16 -0.45 -0.22 -0.49
Cpa|evm.model.tig00000178.9 (tig00000178_g12715.t1)
-0.17 0.38 -0.7 -0.0 -0.01 -1.92 0.03 0.65 0.49 0.46 -0.21 -0.43 -1.33 -0.45 -1.64 0.16 -1.27 -0.15 0.36 -3.08 -1.47 -1.85 1.75 1.02 0.65 0.1
Cpa|evm.model.tig00000190.50 (tig00000190_g13867.t1)
-1.5 -0.02 0.21 0.11 -0.46 -1.5 -0.83 -0.54 -0.51 -0.23 -0.43 -0.5 -1.39 0.36 0.21 0.19 -0.35 0.53 0.41 0.01 -1.19 -0.9 1.71 0.48 0.23 0.81
Cpa|evm.model.tig00000197.9 (tig00000197_g15689.t1)
0.06 -0.58 -2.04 -1.52 0.11 0.69 0.82 0.54 0.62 0.2 -0.1 -0.57 0.18 -1.4 -0.57 -1.8 -1.1 0.14 -0.35 -0.44 -2.08 0.44 1.33 0.83 0.56 -0.77
-0.81 -1.29 -1.26 -0.6 -0.02 0.08 0.75 0.25 0.19 0.23 -0.04 -0.87 -1.52 -0.37 -0.96 -0.98 -0.01 1.1 0.39 0.21 -1.31 -1.84 1.12 -0.19 1.03 0.74
Cpa|evm.model.tig00000237.31 (tig00000237_g20480.t1)
0.14 -0.37 -1.01 0.51 -0.34 -0.55 -1.28 -0.04 -0.68 0.1 -0.56 -0.16 -1.15 0.34 -0.11 -0.38 -1.96 0.74 0.12 -2.85 -0.71 -2.11 1.87 0.69 1.49 -0.78
Cpa|evm.model.tig00000241.125 (tig00000241_g20991.t1)
-0.01 -0.05 -0.1 -0.34 -0.08 0.22 0.37 0.23 0.09 -0.15 -0.32 -0.45 -0.06 -0.37 -0.06 -0.12 -0.04 0.06 0.48 0.07 0.11 -0.2 1.09 0.01 -0.94 -0.88
Cpa|evm.model.tig00000241.61 (tig00000241_g20919.t1)
-0.81 -1.07 -1.37 -0.79 0.2 0.17 0.64 0.53 0.12 -0.02 -0.42 -0.48 -1.62 -0.44 -0.66 0.06 0.14 0.99 0.91 0.36 -2.15 -1.83 1.14 -0.24 0.45 0.34
Cpa|evm.model.tig00000342.43 (tig00000342_g24226.t1)
-0.3 -0.15 -0.13 -0.01 0.31 0.23 0.58 0.34 0.36 0.15 0.07 -0.14 -0.23 -0.19 -0.14 -0.07 0.01 0.41 0.23 0.12 -3.91 -1.15 1.09 -1.21 -0.13 -0.53
Cpa|evm.model.tig00000342.53 (tig00000342_g24237.t1)
-0.13 0.18 -0.06 -0.12 -0.11 0.08 0.58 0.66 0.67 0.44 0.26 -0.1 -0.18 -0.46 -0.11 -0.55 -0.13 -0.07 -0.07 0.2 -4.85 -0.27 0.73 -0.78 -0.27 -0.31
Cpa|evm.model.tig00000383.111 (tig00000383_g24720.t1)
0.58 0.74 0.13 -0.93 -0.91 0.09 -0.28 -0.18 -0.25 0.3 -0.14 -0.38 0.22 -0.18 0.18 -0.27 0.09 0.28 0.79 0.51 -1.11 -1.23 0.17 -0.39 -0.25 0.16
Cpa|evm.model.tig00000383.94 (tig00000383_g24704.t1)
-1.53 -0.23 -0.31 -0.35 0.31 0.58 0.06 -0.23 -0.46 -0.45 -0.41 -0.58 -2.06 -0.84 0.2 0.05 0.21 0.56 0.52 0.45 -0.39 -1.28 1.46 0.63 -0.02 -0.27
Cpa|evm.model.tig00000402.77 (tig00000402_g252.t1)
-0.48 -0.38 -0.55 -0.06 -0.13 -0.24 0.15 0.22 -0.19 0.02 0.07 -0.32 -0.51 -0.58 -0.98 -1.27 -0.26 0.75 0.2 -0.16 -0.85 -0.51 1.78 -0.28 0.71 0.13
-0.02 0.19 0.02 -0.35 -1.03 -0.59 -0.75 -0.55 -0.34 -0.04 0.0 0.37 0.01 -0.79 -0.27 -0.89 -0.96 0.69 1.23 0.37 -1.0 -1.91 1.5 0.33 -0.21 0.19
Cpa|evm.model.tig00000430.49 (tig00000430_g638.t1)
-1.88 0.51 0.25 0.08 0.26 0.78 0.43 0.23 0.29 -0.16 -0.65 -0.92 -1.99 -0.82 -0.22 -0.82 -0.33 0.16 0.49 -0.21 -2.09 0.05 1.73 -0.65 -0.01 -0.55
Cpa|evm.model.tig00000478.12 (tig00000478_g1262.t1)
0.15 0.4 -0.32 -0.62 -0.57 -0.11 0.03 0.13 0.19 -0.14 -0.25 -0.4 -0.16 -0.24 0.6 0.19 -0.09 0.17 0.17 -0.33 0.03 -0.46 1.24 0.06 -0.49 -0.98
Cpa|evm.model.tig00000498.6 (tig00000498_g1582.t1)
-2.19 -0.89 0.06 0.24 0.33 0.31 0.15 0.17 0.27 0.11 -0.01 -0.27 -1.74 -0.37 -0.12 -0.35 -0.55 0.91 0.24 0.1 -1.26 -0.66 1.61 -0.2 -0.11 -0.55
Cpa|evm.model.tig00000581.28 (tig00000581_g2235.t1)
-1.37 -1.46 -1.45 -1.47 -0.63 -0.57 -0.24 -0.64 -0.68 -0.52 -1.01 -1.62 -1.26 0.04 0.56 -0.08 0.38 0.36 0.46 0.43 -0.47 -1.85 1.76 0.59 1.15 1.2
Cpa|evm.model.tig00000691.36 (tig00000691_g3189.t1)
-0.56 0.49 0.31 -0.06 0.05 0.39 -0.23 -0.03 -0.04 -0.23 -0.36 -0.49 -1.35 -0.99 0.21 -0.1 -0.17 0.68 0.77 0.46 -0.61 -2.31 1.19 0.35 -0.58 -0.76
Cpa|evm.model.tig00000737.31 (tig00000737_g3811.t1)
-0.36 -0.34 -0.16 0.08 0.31 0.23 0.46 0.37 0.32 0.25 0.19 -0.27 -0.85 -1.24 -0.15 -0.73 -0.11 0.52 0.35 0.21 -2.62 -1.45 1.4 -0.08 -0.13 -0.54
Cpa|evm.model.tig00000802.36 (tig00000802_g4285.t1)
-0.85 -0.04 0.12 0.09 0.15 0.11 0.28 0.16 0.28 0.1 0.11 0.12 -0.86 -0.23 -0.04 -0.11 -0.45 0.09 0.06 -0.07 -1.04 -0.55 1.2 0.42 -0.29 -0.68
Cpa|evm.model.tig00000821.6 (tig00000821_g4465.t1)
-2.85 -0.63 -1.02 -0.92 -0.08 0.54 -0.38 0.58 1.27 1.1 -0.14 -1.81 -2.61 -0.96 -1.03 0.03 -0.72 0.96 1.31 1.0 -0.74 -4.17 1.06 -1.18 -0.41 -0.66
Cpa|evm.model.tig00000823.17 (tig00000823_g4545.t1)
-0.33 -0.22 0.06 0.28 0.31 0.59 0.23 0.26 0.12 -0.13 0.04 0.04 -0.52 -0.43 -0.42 -0.24 -0.14 0.05 0.51 0.31 -0.92 -1.26 1.07 -0.09 -1.0 -0.33
Cpa|evm.model.tig00000849.14 (tig00000849_g4756.t1)
-1.23 -0.15 -0.07 0.11 0.59 0.62 0.48 0.24 -0.07 0.06 0.45 0.3 -1.02 -1.41 -0.96 -1.36 -0.77 -0.0 0.02 -0.34 -2.32 -1.47 1.74 0.56 0.08 -0.29
Cpa|evm.model.tig00000851.33 (tig00000851_g4917.t1)
-0.33 -0.16 -0.07 -0.33 0.07 -0.24 -0.18 -0.28 -0.17 -0.04 -0.22 -0.23 -0.61 0.12 0.6 0.48 -0.51 0.11 0.3 -0.97 -0.44 -1.47 1.62 0.33 -0.29 -0.05
Cpa|evm.model.tig00000863.48 (tig00000863_g5003.t1)
-1.08 -0.31 -0.31 -0.16 0.18 0.17 0.14 0.09 0.28 0.13 0.04 -0.24 -1.27 -1.23 -0.32 -0.76 -0.29 0.3 0.33 0.1 -0.94 0.48 1.52 0.68 -0.16 -0.93
Cpa|evm.model.tig00000870.1 (tig00000870_g5118.t1)
-2.16 -3.1 -3.21 -1.87 -1.98 -1.41 -1.1 -1.87 -1.12 -1.16 -0.8 -0.01 -3.23 -0.03 -0.3 0.01 -0.17 0.67 0.43 -0.42 0.35 -1.5 2.35 0.79 1.78 1.07
Cpa|evm.model.tig00000880.13 (tig00000880_g5170.t1)
-0.37 -0.24 -0.06 0.06 0.27 0.26 0.27 0.27 0.33 0.35 0.28 0.15 -0.49 -0.82 -0.25 -0.67 -0.02 -0.04 0.02 0.16 -2.62 0.01 1.45 -0.46 -0.67 -0.7
Cpa|evm.model.tig00000900.17 (tig00000900_g5371.t1)
0.61 0.52 0.29 0.2 0.25 0.37 0.09 0.07 0.14 -0.2 -0.23 -0.07 0.33 -0.79 -0.46 -0.38 -0.54 -0.25 -0.32 -0.37 -0.18 -0.93 1.12 -0.29 -0.53 -0.39
Cpa|evm.model.tig00000944.43 (tig00000944_g5965.t1)
-0.29 -0.02 -0.06 0.2 0.32 0.37 0.31 0.23 0.07 -0.1 -0.01 -0.19 -0.41 -0.71 -0.23 -0.33 -0.32 0.62 0.27 -0.09 -2.83 -0.46 0.98 -0.31 0.01 0.19
Cpa|evm.model.tig00000970.18 (tig00000970_g5836.t1)
-0.17 -0.28 -0.27 -0.31 -0.43 -0.25 0.05 0.06 0.04 0.29 0.23 0.26 -0.09 -0.79 -0.16 -0.18 0.23 0.78 0.87 0.85 -1.68 -0.88 0.75 -0.64 -0.46 -0.61
Cpa|evm.model.tig00001007.11 (tig00001007_g6241.t1)
-1.0 -0.32 -0.47 0.44 1.18 1.07 0.64 0.32 -0.13 -0.01 -0.23 -0.83 -1.41 -1.7 -0.54 -1.03 -0.06 0.16 0.32 0.58 -6.16 -3.4 1.58 -0.13 -0.64 -0.36
Cpa|evm.model.tig00001007.7 (tig00001007_g6237.t1)
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-2.25 -0.51 -0.74 0.11 0.82 0.84 0.58 0.2 0.05 -0.1 -0.73 -0.6 -2.29 -1.19 -0.57 -0.18 -0.48 0.33 0.56 -0.17 -1.64 0.48 1.58 -0.56 0.29 -0.28
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0.4 -0.27 0.59 -0.01 -0.21 -0.48 -0.34 0.19 0.19 -0.75 -0.21 0.56 0.07 0.38 -0.05 -0.06 -0.94 -0.76 0.71 -0.33 -1.01 -1.97 1.22 -0.31 0.21 -0.17
Cpa|evm.model.tig00021590.11 (tig00021590_g22768.t1)
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Cpa|evm.model.tig00021612.13 (tig00021612_g22861.t1)
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Cpa|evm.model.tig00021612.55 (tig00020903_g15105.t1)
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Cpa|evm.model.tig00021682.10 (tig00021682_g23100.t1)
-0.42 -0.38 -0.68 -0.81 -0.87 -0.69 -0.07 -0.55 0.08 0.29 0.03 0.15 -0.17 0.04 0.21 0.21 0.02 0.5 0.52 0.08 -0.42 -1.09 1.23 0.56 -0.21 0.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.