Heatmap: Cluster_14 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
BOF 92
BOF 92,Log
CCMP1516,Log,5mM sulfate,ESAW,15C
CCMP1516,Log,25mM sulfate,ESAW,15C
CCMP2090
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,1HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,10HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,100HHQ+DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,18C
CCMP2090,Log,DMSO 24h,F/2-Si,18C
CCMP2090,Log,DMSO 72h,F/2-Si,18C
CCMP370,pH7.8,Aquil,20C
CCMP370,pH8.1,Aquil,20C
CCMP371,17C
CCMP373,Log
CCMP373,Stationary
CCMP374,Log
CCMP374,Stationary
CCMP374,pH8.3,F/2-Si,18C
CCMP379,pH8.3,F/2-Si,18C
PLY M219,pH7.8,Aquil,20C
PLY M219,pH8.1,Aquil,20C
RCC1253
RCC3782
RCC6660,Log,pH7.2
RCC6660,Log,pH7.5
RCC6660,Log,pH7.8
RCC6660,Log,pH8.2
RCC6666,Log,pH7.2
RCC6666,Log,pH7.5
RCC6666,Log,pH7.8
RCC6666,Log,pH8.2
UNC1419,Log,Aquil,12C
- - - - - -3.78 - - -3.98 - -3.3 - - -1.69 - - -5.88 4.81 2.57 - -0.3 - -0.85 - - - - - - - - - - - - -
- - -1.48 - - - - -2.05 - - - - -2.85 - - - - 4.62 3.41 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -1.46 - -2.94 -3.54 - -1.08 -1.15 - - - -4.25 - - - - 4.76 2.63 - - - -1.26 - - -0.56 - - - - - - - - - -
- 3.07 - - - - - - - - - - - - - - -1.89 4.43 1.58 - - 1.31 -1.84 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - -7.0 -6.43 -4.87 - -6.63 -4.84 -7.15 -5.68 - - -3.38 4.62 3.48 -4.02 - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.34 -0.02 -2.48 -0.99 -2.42 -2.59 -3.03 -3.14 -2.58 -1.04 -1.38 -5.32 -2.48 -3.08 -3.0 -3.13 -3.12 4.17 3.54 -2.55 -1.38 -4.45 -4.01 -2.97 -3.16 -3.27 -3.32 -3.19 -2.59 -3.23 -1.89 -3.22 -2.84 -2.69 -2.87 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 2.3 - - - - - - - - - -2.9 - - -2.89 - - - -
- -5.79 -3.06 - - - - - - - - - - - -4.57 -3.89 -3.23 4.63 3.4 -7.68 -3.68 -4.95 -4.8 -8.07 - -7.33 -6.25 -5.34 -5.65 -6.35 -6.18 -4.56 -5.35 -4.84 -4.72 -
- - - - - - - - - - - - - - - - -3.28 4.13 0.57 - - - 2.13 - - 2.45 - -0.26 -0.34 -0.51 0.18 0.61 -0.29 -0.78 -0.54 -
-3.46 0.01 -1.57 -3.05 -0.17 -2.43 -1.79 -3.03 -2.16 -2.1 -2.5 -6.08 -2.56 -1.79 -1.26 -1.37 -0.6 4.2 2.82 -1.85 -1.73 -1.96 -1.45 -0.39 -0.62 -0.36 0.13 -5.41 -5.04 -5.3 -5.2 -4.9 -5.96 -4.74 -3.3 -2.69
- - 1.91 1.82 - -8.17 -7.03 -7.65 -5.14 -8.35 -5.87 - -8.65 -6.46 - - - 4.42 1.84 -1.04 -2.37 - - - - - - - - - 0.65 -6.6 - -6.6 - 0.54
- 1.57 - - - - - - - - -2.43 - - - - - - 4.2 3.76 - - -0.25 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.69 3.2 -0.65 - -1.43 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.63 2.93 - - - - - - - 0.76 - 0.92 - - - - - - -
- - - - - - - - - - -3.4 - - - - - -5.7 4.8 2.17 - -1.35 0.64 - - - -0.13 -1.4 - - - - -3.03 - -2.07 - -
- - -7.13 - - - - - - - - - - - - - -12.41 4.52 1.09 - - - - 1.09 0.66 2.66 -8.92 - - - - - - - - -0.29
- - - - - - - - - - - - - - - - -2.98 4.56 2.02 - - - 2.7 - - 0.77 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -1.64 4.8 2.98 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.31 3.75 - - - - - - 1.42 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -2.65 4.42 3.38 - - - - - - 2.04 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.07 4.26 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -2.87 4.35 3.67 - - - -0.68 - - 1.11 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -2.57 4.59 2.68 - - - 2.24 - - - - -0.79 - - - - - - - -
0.06 0.13 - - - - - - - - - - - - - - -5.06 4.54 2.46 - - - - - - 1.71 0.52 -1.54 - - - - - - - -
- - 1.31 - -1.98 - -0.94 - 0.5 - -1.16 -1.04 -4.73 - 1.71 - -2.22 3.35 3.33 - 0.23 -0.34 - - -0.39 -2.09 0.89 - - - -1.55 - - - 0.53 -
- - - - - - - - - - - - - - 1.2 - - 4.2 2.62 - - - -0.28 - - 3.06 - - - - - - - - - -
- - - - - -3.22 - - - - - - - -1.49 - - - 4.46 3.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -3.81 -5.19 - -6.72 - -4.5 -8.38 -7.81 - - - -6.27 -4.79 - -4.84 -7.03 4.62 2.34 -3.66 - -3.02 - - - 2.58 - -5.97 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.92 2.49 - - - -2.65 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.88 2.73 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.02 -2.18 - 0.53 -1.79 -2.52 -2.92 -3.86 -2.5 -2.61 -1.37 -0.74 -2.49 -1.46 - - - 4.17 3.35 - - -2.89 0.46 - - -1.29 - - - - -0.58 - - - - -
- 1.51 - - - - - - - - - - - - - - -2.68 4.8 - - - - 1.11 - - 1.56 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -7.52 4.42 3.61 - -3.11 - - - - - - - - - - - - - - 1.13
- - - - - - -3.63 - - - -4.15 - - - - - - 4.77 2.89 - - - - - - - -1.99 - - -0.96 - - - - -1.67 -
- 2.03 - - - - - - -3.52 - - - - - 0.82 1.86 - 4.66 -1.25 - - - - - - - - - - - - -0.37 - - - -
- - - - - - - -1.4 - - - - - - - - - 4.42 3.61 - - - - - - - 0.2 - - - - - - -1.21 -1.12 -
- - 0.38 - - - - - - - - - - - - - - 4.86 1.46 - - - 0.57 - - - - - - - - - - - - 0.53
- - -0.35 - -5.05 -3.41 -4.16 - -4.43 - -5.7 1.74 -5.15 -3.79 - -3.19 - 4.36 2.24 - - - - - - 2.0 1.1 - - - - - - - - -
- - - - - -2.64 -4.46 -1.63 -3.23 - - - - -5.23 - - - 4.05 3.57 - - - - - - 0.01 - -22.37 -0.74 2.17 -0.46 - - - - -
- - - -1.12 - -3.99 -4.54 - - -19.58 - -3.2 - - - - - 4.49 3.68 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.85 2.44 - - - -1.25 - - 0.05 -1.51 - - - - - - - - -
-2.11 - -1.32 -0.59 -2.2 -2.12 -1.7 -1.62 -2.01 -2.18 -1.4 0.66 -2.58 -2.58 -2.83 - -6.52 4.1 3.44 - - -3.05 0.93 - - -0.72 -3.16 - - - - - - - - -
- - -0.37 - - - - - - - - - - - - - -3.01 4.85 1.45 - - - 1.82 - - - - - - - - - - - - -
- - -0.11 1.03 -2.04 -0.96 -1.74 -0.44 -2.53 -2.43 -1.88 -2.43 -0.92 -1.82 -0.78 -3.35 - 3.98 3.7 -3.2 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.11 1.03 -2.04 -0.96 -1.74 -0.44 -2.53 -2.43 -1.88 -2.43 -0.92 -1.82 -0.78 -3.35 - 3.98 3.7 -3.2 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 1.52 - -1.27 4.88 1.73 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -6.05 - -4.94 -4.66 -4.68 -4.51 -3.99 -4.06 -2.49 -2.6 -3.71 -3.31 -1.61 -2.74 -6.88 4.57 1.3 - -4.75 - - -4.76 -3.29 2.64 -6.27 -1.89 -1.48 -2.94 -2.96 -1.88 -1.6 -2.6 -1.56 -
- 0.18 1.33 - - - - - - - - - - - - -0.14 -0.61 4.81 -6.16 - - - 1.1 -3.29 - - - - - - - - - -1.03 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.69 3.34 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.48 3.47 - - - -0.44 - - -1.78 - - -0.7 -1.97 -1.46 -1.49 - - - -
- - -5.98 - - - - - -6.36 - - -6.28 - -6.27 - - -7.42 4.73 2.61 -5.43 -4.96 -3.53 1.51 -5.82 - -2.26 -3.7 - - - - - - - - -
- - 1.2 - - - - - - - - - - - - - -1.82 4.51 3.28 - - - - - - - -0.14 - - - - - - - - -
- - 1.2 - - - - - - - - - - - - - -1.82 4.51 3.28 - - - - - - - -0.14 - - - - - - - - -
- - -0.51 -0.48 -4.43 -5.16 -4.22 -7.84 - -3.29 -2.44 1.51 -6.41 -5.51 - - - 4.69 1.54 - - - 0.43 - - -3.49 -0.13 - - - -2.17 - - - - -
- - -3.56 - - - - -6.77 - - - - - - - - - 4.73 3.22 -3.01 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.74 3.22 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -1.01 - -4.47 -4.06 -4.29 -3.21 -4.3 -2.95 -4.3 -2.73 -3.25 -3.56 -4.15 0.81 1.07 -2.58 3.97 3.04 -4.32 -2.18 -6.75 -0.47 -0.15 -0.95 -4.17 -3.55 -1.24 -0.84 -0.48 -1.56 -1.01 -0.8 -0.81 -1.11 -4.94
- - - - - - - - - - - - - - - - -1.18 4.69 3.29 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -1.94 -2.35 -2.7 -4.85 -1.82 - - 1.66 -4.05 -3.25 - -2.5 -6.18 4.58 2.75 -1.29 - -1.75 - - - - -2.85 - - - - - - - - -
- - 1.5 - - - - - - - - - - - - - -4.16 4.75 1.84 - - -2.04 - - - 1.09 -1.58 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - -5.77 - - -1.04 4.87 1.48 - - - - -1.55 - -3.25 1.14 - - - -3.93 - - - - -0.25
- - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.91 0.44 - - - - - -6.45 -7.86 - - - -6.26 - - - -6.61 4.59 2.95 -4.68 - - -3.35 - - -1.32 -1.43 - -4.93 - - - - - - -
- - -0.9 - - -3.61 - -5.26 - -2.06 -3.33 -1.47 -4.58 -5.81 - - -1.16 4.64 1.77 -1.71 -2.36 - 2.21 - - -2.89 -0.97 - - - - - - - - -
- - -1.48 - - - - -2.05 - - - - -2.85 - - - - 4.62 3.41 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - -5.66 - -2.47 -6.21 4.5 3.51 - -2.96 -2.72 -2.75 - - 0.31 -3.57 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 1.18 0.19 -3.56 4.49 3.33 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - -0.39 0.6 -4.16 4.54 1.92 -0.2 0.11 0.35 - - - 0.13 1.21 - - - - - - - - -
- -3.32 -1.87 - - -5.73 -4.17 - -4.25 - -5.02 -3.96 - -7.29 - - - 4.67 3.19 - - -4.92 -0.74 - - -3.06 -4.77 - - - - - - - - -
- - -6.77 -5.68 - -11.31 -11.13 -12.86 - -10.56 - -10.86 -10.39 - -9.57 -11.31 -13.45 4.68 3.17 -9.76 - - 0.4 - - -8.81 -11.34 - - - -5.79 - - - - -5.43
- 1.47 -2.39 - - - - - - - - - - - - - - 4.81 2.03 - - - -0.02 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.77 1.5 - - - - - - - - -0.41 1.07 -0.86 -1.34 -0.29 -1.32 - -0.22 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 5.04 1.64 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - -2.65 - -6.3 4.65 3.39 -2.42 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.81 2.99 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.22 -2.45 -2.58 -1.63 -7.16 -6.74 -4.38 -5.33 -5.11 -5.3 -3.63 -2.94 -4.78 -5.35 - - -5.82 4.81 2.47 -4.83 -5.43 -7.59 -5.69 - - -1.01 -2.84 - - - -3.91 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.51 3.73 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - -1.03 - - - - - -2.2 - - - - 4.49 3.68 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - -1.0 - - - - 4.98 1.46 - - - - - - - 0.37 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.71 3.3 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - -4.88 - -4.32 - - - -4.7 - - -6.25 4.71 3.19 - - -1.7 -1.73 - - - - - - - - - - - - -
2.22 - 1.65 -0.02 -6.41 -5.86 -6.31 -8.09 - - - - -5.12 -6.73 - - - 4.06 1.09 0.28 1.07 1.74 -0.42 - - -0.79 -4.9 - - - - - - - -5.6 -1.79
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.53 3.45 - - - - - - 1.0 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 1.45 - - - 5.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - -7.02 - -6.96 - - - - -5.99 -5.81 - - -7.29 4.45 3.38 - - - 1.65 - - -0.95 - - - - - - - - - -
- - - - - - - -1.21 - -0.71 0.32 - - - - - - 4.9 0.69 1.12 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -1.71 - -3.01 - - - - - -4.87 - - - - - -2.47 4.66 0.96 - - - 2.01 - - 2.05 - - - - - - - - - -
- - -3.65 -1.86 -4.26 -2.84 -2.63 -3.96 -4.21 -5.74 -4.76 -4.19 -10.69 -3.17 - - - 4.42 3.71 -2.4 - - -2.23 - - -3.27 - - - - - - - - - -
- - - - - - - -5.1 - - - - -6.42 -5.48 - - -1.59 4.86 2.71 - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.12 0.25 -0.63 - -3.63 - -1.4 - - -1.44 - -0.82 - - - - -5.67 3.94 2.41 - - 1.3 - -1.97 -1.95 - - - - -1.4 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.14 3.38 - - - 1.25 - - 1.82 1.05 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 3.32 -4.93 - - - - - -5.16 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - -5.84 - - - - - - - - 4.66 3.38 - - -2.87 -2.11 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.51 3.38 - - - 1.49 - - - - - - - - - - - - -
- - 1.72 - - - - - - - - - - - - - - 4.49 3.3 - - -3.1 -3.05 - - -3.32 - - - - - - - - - -
- - - - - - - -1.25 - - - - - - - - - 4.83 - - - - - - - 2.83 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - -2.65 - -6.3 4.65 3.39 -2.42 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.63 0.66 -4.9 - - - - - - - -6.19 - - -4.77 -8.69 4.54 2.84 - - - - - -4.95 - - -1.76 -5.92 -3.51 -2.66 -2.63 - - -4.75 -4.97
- - - - - - - - - - - - -4.89 - - -2.51 -6.4 4.67 3.26 - - - -1.1 -2.7 - -2.53 - - - - - - - - - -
- - 0.67 0.3 -3.18 - - -4.03 -2.36 - - -0.67 -2.2 - - - - 4.65 1.91 - - - - 0.48 - -0.67 - -2.83 - - - - -1.6 -1.1 -2.7 -
- - - - -3.78 - -1.41 -1.66 -3.27 -3.74 -0.99 - - -4.86 - - - 4.51 3.3 - - -2.13 0.51 - - -2.36 - - - - - - - - - -
- 3.1 - - - - - -3.73 - -2.01 - -0.79 - - - - - 4.26 2.12 - 0.32 - - - - 0.79 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - -4.46 - -1.34 - -4.08 4.79 2.42 - - - 1.31 - - - - - - - - - - - - -
- - -0.3 -0.02 - -9.48 -8.35 -8.97 -7.35 -9.66 -7.18 -7.43 - -9.03 - - - 4.84 2.33 -2.35 -3.68 - - - - - - - - - -2.25 -7.92 - -7.91 - -
-3.75 -1.24 -3.07 - - - - - - - -4.75 -4.79 - - - -5.19 -2.82 4.52 3.33 -2.42 -0.87 -0.78 -2.95 - - -4.05 -1.38 -5.35 - - - -5.33 - - -6.23 -2.64
- - - - - - - - - - - - - - - - -2.46 4.68 1.06 - - - - - - 3.01 - - - - - - - - - -
- - -0.83 - - - - - - - - - - - - - - 4.99 1.61 - - - -1.64 - - -1.5 - - - - - - - - - -
- - -0.2 - - - - - - - - - - - - - - 4.73 3.08 - - - -3.56 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.79 3.07 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -6.56 - -5.65 -8.21 -6.63 - -5.54 - - -5.76 - - -4.03 4.49 3.3 -3.49 -4.16 - -2.56 - - 1.53 -3.03 -5.83 - -5.29 -3.18 -4.82 - -5.69 -5.72 -
- - - - - - - - - - - - - - - 0.29 - 4.74 3.02 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.55 -1.45 - - - - - - - - - - - - - - -5.67 3.99 3.31 -6.11 - -6.31 -3.51 - - - -5.73 0.78 0.11 0.96 -0.1 -0.31 -0.4 0.76 -0.83 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.