Heatmap: Cluster_68 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000057.66 (tig00000057_g89.t1)	0.75	0.25	0.24	0.21	0.1	0.07	0.22	0.34	0.19	0.29	0.35	0.46	0.89	0.46	0.45	1.0	0.3	0.32	0.25	0.28	0.26	0.34	0.33	0.32	0.63	0.54
Cpa\|evm.model.tig00000079.4 (tig00000079_g2792.t1)	0.12	0.33	0.52	0.6	0.72	0.71	0.57	0.51	0.54	0.47	0.47	0.43	0.17	0.79	0.94	0.85	1.0	0.56	0.57	0.51	0.01	0.13	0.23	0.3	0.62	0.68
Cpa\|evm.model.tig00000144.92 (tig00000144_g9084.t1)	0.15	0.22	0.47	0.67	0.77	0.89	0.96	1.0	0.89	0.6	0.54	0.4	0.14	0.57	0.44	0.67	0.54	0.37	0.6	0.52	0.06	0.71	0.46	0.3	0.6	0.43
Cpa\|evm.model.tig00000157.121 (tig00000157_g9724.t1)	0.79	0.74	0.77	0.82	0.8	0.8	0.96	1.0	0.92	0.91	0.88	0.88	0.9	0.83	0.79	0.94	0.76	0.68	0.7	0.75	0.2	0.58	0.26	0.43	0.5	0.48
Cpa\|evm.model.tig00000194.100 (tig00000194_g14833.t1)	0.76	0.55	0.67	0.98	1.0	0.73	0.76	0.9	0.7	0.62	0.79	0.61	0.85	0.62	0.74	0.83	0.51	0.9	0.78	0.59	0.04	0.31	0.28	0.25	0.44	0.65
Cpa\|evm.model.tig00000241.23 (tig00000241_g20880.t1)	0.78	0.62	0.95	1.0	0.61	0.3	0.55	0.59	0.32	0.24	0.29	0.47	0.86	0.84	0.62	0.66	0.58	0.46	0.52	0.54	0.03	0.47	0.08	0.36	0.42	0.89
Cpa\|evm.model.tig00000317.10 (tig00000317_g24018.t1)	0.25	0.54	0.77	0.95	0.78	0.59	0.84	0.84	0.75	0.81	0.63	0.67	0.27	0.93	0.78	1.0	0.86	0.75	0.9	0.91	0.02	0.11	0.54	0.45	0.85	0.97
Cpa\|evm.model.tig00000325.4 (tig00000325_g24083.t1)	0.61	0.81	0.96	0.89	0.79	0.74	0.88	1.0	0.93	0.84	0.71	0.61	0.74	0.73	0.63	0.7	0.72	0.46	0.53	0.62	0.03	0.37	0.14	0.16	0.42	0.25
Cpa\|evm.model.tig00000448.68 (tig00000448_g903.t1)	0.71	0.46	0.46	0.6	0.49	0.36	0.46	0.53	0.12	0.18	0.2	0.27	1.0	0.11	0.04	0.8	0.02	0.03	0.05	0.17	0.29	0.61	0.11	0.18	0.52	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000448.71 (tig00000448_g903.t1)	0.54	0.4	0.47	0.45	0.45	0.26	0.42	0.43	0.1	0.21	0.19	0.19	0.74	0.14	0.03	1.0	0.02	0.02	0.02	0.17	0.25	0.36	0.09	0.14	0.48	0.46
Cpa\|evm.model.tig00000448.73 (tig00000448_g908.t1)	0.82	0.49	0.6	0.65	0.54	0.34	0.55	0.61	0.16	0.27	0.27	0.3	1.0	0.1	0.04	0.98	0.02	0.05	0.04	0.17	0.36	0.76	0.14	0.22	0.58	0.57
Cpa\|evm.model.tig00000622.12 (tig00000622_g2626.t1)	0.75	0.77	0.74	0.83	0.84	0.87	0.99	1.0	0.96	0.91	0.82	0.82	0.85	0.81	0.81	0.95	0.76	0.68	0.72	0.75	0.26	0.83	0.28	0.44	0.61	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000663.72 (tig00000663_g3005.t1)	0.74	0.72	0.76	0.78	0.8	0.79	0.94	1.0	0.95	0.91	0.87	0.84	0.84	0.76	0.74	0.87	0.71	0.59	0.76	0.66	0.19	0.56	0.22	0.43	0.45	0.48
Cpa\|evm.model.tig00000692.14 (tig00000692_g3208.t1)	0.08	0.14	0.09	0.09	0.18	0.33	0.32	0.14	0.11	0.05	0.05	0.03	0.05	0.47	0.86	1.0	0.22	0.2	0.24	0.09	0.02	0.07	0.06	0.02	0.05	0.05
Cpa\|evm.model.tig00000733.14 (tig00000733_g3778.t1)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.07	0.19	0.19	0.16	0.12	0.16	0.16	0.09	0.01	0.38	0.76	1.0	0.1	0.03	0.02	0.04	0.0	0.07	0.01	0.02	0.27	0.1
Cpa\|evm.model.tig00000754.25 (tig00000754_g3909.t1)	0.22	0.53	0.77	0.92	0.59	0.42	0.45	0.7	0.49	0.71	1.0	0.8	0.5	0.79	0.33	0.45	0.43	0.12	0.25	0.34	0.02	0.03	0.04	0.18	0.84	0.48
Cpa\|evm.model.tig00000754.8 (tig00000754_g3891.t1)	0.04	0.2	0.52	0.63	0.8	1.0	0.85	0.64	0.81	0.65	0.55	0.5	0.09	0.57	0.66	0.62	0.8	0.49	0.5	0.65	0.07	0.38	0.42	0.54	0.94	0.69
Cpa\|evm.model.tig00000821.65 (tig00000821_g4524.t1)	1.0	0.81	0.8	0.78	0.48	0.41	0.54	0.76	0.4	0.38	0.38	0.37	0.72	0.65	0.68	0.93	0.38	0.84	0.69	0.54	0.2	0.48	0.39	0.35	0.57	0.81
Cpa\|evm.model.tig00000828.14 (tig00000828_g4614.t1)	0.66	0.47	0.57	0.54	0.62	0.64	0.84	0.77	0.44	0.51	0.49	0.46	0.82	0.59	0.64	1.0	0.52	0.55	0.53	0.4	0.01	0.12	0.21	0.2	0.75	0.39
Cpa\|evm.model.tig00000903.39 (tig00000903_g5531.t1)	0.46	0.68	0.65	0.76	0.84	0.66	0.78	0.87	1.0	1.0	0.87	0.77	0.6	0.91	0.45	0.68	0.64	0.6	0.45	0.57	0.12	0.14	0.11	0.28	0.68	0.46
Cpa\|evm.model.tig00000989.16 (tig00000989_g6089.t1)	0.54	0.56	0.73	0.9	1.0	0.94	0.83	0.72	0.76	0.78	0.85	0.82	0.66	0.87	0.59	0.8	0.5	0.45	0.46	0.68	0.0	0.33	0.14	0.17	0.51	0.75
Cpa\|evm.model.tig00000989.50 (tig00000989_g6125.t1)	0.43	0.89	0.89	0.81	0.77	0.72	0.93	1.0	0.88	0.66	0.5	0.37	0.48	0.63	0.41	0.7	0.29	0.44	0.5	0.52	0.1	0.37	0.16	0.17	0.25	0.24
Cpa\|evm.model.tig00001067.33	0.38	0.26	0.18	0.22	0.45	0.45	0.35	0.32	0.3	0.22	0.15	0.12	0.39	0.17	0.49	1.0	0.12	0.28	0.22	0.13	0.12	0.04	0.36	0.15	0.17	0.16
Cpa\|evm.model.tig00001073.11 (tig00001073_g6819.t1)	0.03	0.2	0.49	0.73	0.79	0.8	1.0	0.96	0.79	0.83	0.63	0.59	0.05	0.4	0.33	0.6	0.42	0.54	0.46	0.6	0.04	0.79	0.42	0.49	0.76	0.41
Cpa\|evm.model.tig00001095.18 (tig00001095_g7035.t1)	0.74	0.64	0.84	0.83	0.99	0.71	0.98	0.86	0.94	0.74	0.79	0.76	0.98	0.94	0.9	1.0	0.85	0.87	0.79	0.75	0.11	0.23	0.36	0.51	0.75	0.7
Cpa\|evm.model.tig00001206.23 (tig00001206_g7510.t1)	0.74	0.74	0.76	0.82	0.79	0.77	0.93	1.0	0.93	0.91	0.92	0.93	0.87	0.85	0.75	0.89	0.66	0.54	0.56	0.67	0.18	0.55	0.34	0.46	0.5	0.47
Cpa\|evm.model.tig00001239.1 (tig00001239_g7754.t1)	0.7	0.7	0.72	0.76	0.86	0.67	0.77	0.75	0.65	0.65	0.65	0.56	0.69	0.91	1.0	0.98	0.8	0.66	0.59	0.63	0.02	0.22	0.51	0.42	0.82	0.54
Cpa\|evm.model.tig00001254.7 (tig00001254_g7813.t1)	0.58	0.36	0.32	0.31	0.17	0.09	0.15	0.21	0.1	0.14	0.19	0.23	0.64	0.22	0.31	1.0	0.11	0.09	0.08	0.06	0.18	0.34	0.32	0.13	0.35	0.33
Cpa\|evm.model.tig00001254.8 (tig00001254_g7813.t1)	0.35	0.23	0.22	0.18	0.1	0.05	0.1	0.13	0.06	0.09	0.11	0.12	0.38	0.22	0.32	1.0	0.12	0.08	0.09	0.05	0.14	0.17	0.2	0.08	0.27	0.26
Cpa\|evm.model.tig00020537.79 (tig00020537_g10306.t1)	0.63	0.47	0.46	0.54	0.26	0.19	0.28	0.46	0.23	0.27	0.29	0.3	0.67	0.16	0.35	1.0	0.17	0.43	0.32	0.33	0.06	0.26	0.26	0.14	0.55	0.49
Cpa\|evm.model.tig00020610.2 (tig00020610_g11940.t1)	0.38	0.34	0.4	0.57	0.73	0.7	0.77	0.72	0.91	0.8	0.89	0.63	0.35	0.33	0.33	0.56	0.44	0.55	0.47	0.44	0.09	0.92	0.49	0.63	1.0	0.68
Cpa\|evm.model.tig00020614.113 (tig00020614_g12230.t1)	0.82	0.8	0.91	0.9	0.74	0.6	0.6	0.6	0.38	0.39	0.36	0.38	0.91	0.68	0.62	0.64	1.0	0.68	0.63	0.55	0.12	0.61	0.35	0.39	0.66	0.82
Cpa\|evm.model.tig00020614.24 (tig00020614_g12134.t1)	0.81	0.68	0.71	0.81	0.64	0.43	0.75	0.8	0.55	0.49	0.54	0.47	0.88	0.67	0.66	1.0	0.62	0.6	0.66	0.73	0.05	0.25	0.25	0.55	0.74	0.73
Cpa\|evm.model.tig00020614.30 (tig00020614_g12141.t1)	0.35	0.36	0.33	0.54	0.75	0.76	0.9	0.82	0.85	0.82	0.62	0.41	0.42	0.57	0.64	1.0	0.56	0.48	0.5	0.56	0.17	0.57	0.36	0.35	0.46	0.36
Cpa\|evm.model.tig00020614.74 (tig00020614_g12188.t1)	0.84	0.96	0.9	0.93	0.89	0.84	1.0	0.96	0.88	0.68	0.82	0.82	0.93	0.8	0.91	0.85	0.6	0.81	0.53	0.45	0.04	0.56	0.51	0.36	0.88	0.65
Cpa\|evm.model.tig00020660.38 (tig00020660_g12538.t1)	0.01	0.03	0.1	0.21	0.41	0.64	0.68	0.57	0.58	0.39	0.3	0.18	0.01	0.17	0.33	1.0	0.22	0.28	0.26	0.22	0.03	0.11	0.25	0.15	0.25	0.14
Cpa\|evm.model.tig00020675.84 (tig00020675_g12663.t1)	0.62	0.51	0.58	0.56	0.31	0.18	0.29	0.34	0.23	0.35	0.46	0.58	0.74	0.29	0.24	1.0	0.19	0.4	0.33	0.32	0.1	0.17	0.37	0.37	0.49	0.68
Cpa\|evm.model.tig00020830.4 (tig00020830_g14386.t1)	0.13	0.24	0.33	0.47	0.56	0.54	0.68	0.58	0.52	0.37	0.32	0.3	0.04	0.39	0.35	1.0	0.37	0.46	0.31	0.29	0.05	0.28	0.22	0.12	0.38	0.28
Cpa\|evm.model.tig00020830.5 (tig00020830_g14386.t1)	0.06	0.28	0.38	0.55	0.7	0.73	0.72	0.65	0.61	0.41	0.34	0.32	0.05	0.37	0.34	1.0	0.32	0.37	0.37	0.27	0.08	0.55	0.41	0.13	0.46	0.42
Cpa\|evm.model.tig00020902.44 (tig00020902_g14996.t1)	0.04	0.15	0.15	0.3	0.6	0.98	0.81	0.8	0.4	0.33	0.24	0.18	0.02	0.29	0.33	1.0	0.4	0.65	0.59	0.51	0.03	0.1	0.3	0.22	0.46	0.28
Cpa\|evm.model.tig00020903.24 (tig00020903_g15092.t1)	0.31	0.4	0.27	0.24	0.35	0.55	0.64	0.5	0.44	0.21	0.13	0.09	0.24	0.65	0.71	1.0	0.59	0.58	0.52	0.41	0.01	0.15	0.08	0.08	0.38	0.19
Cpa\|evm.model.tig00020903.25 (tig00020903_g15092.t1)	0.37	0.45	0.33	0.31	0.38	0.57	0.75	0.65	0.56	0.25	0.16	0.13	0.33	0.61	0.62	1.0	0.56	0.55	0.38	0.36	0.0	0.13	0.11	0.07	0.45	0.18
Cpa\|evm.model.tig00020961.53 (tig00020961_g16675.t1)	0.51	0.36	0.29	0.36	0.26	0.21	0.39	0.58	0.4	0.31	0.22	0.18	0.58	0.34	0.36	1.0	0.22	0.5	0.37	0.2	0.07	0.19	0.21	0.11	0.39	0.3
Cpa\|evm.model.tig00020961.60 (tig00020961_g16682.t1)	0.24	0.28	0.19	0.2	0.31	0.48	0.6	0.47	0.59	0.31	0.21	0.17	0.19	0.46	0.65	1.0	0.39	0.38	0.33	0.3	0.07	0.17	0.37	0.19	0.28	0.22
Cpa\|evm.model.tig00021073.53 (tig00021073_g18059.t1)	0.55	0.65	0.61	0.73	0.8	0.74	0.67	0.69	0.7	0.67	0.71	0.7	0.64	0.41	1.0	0.41	0.33	0.63	0.58	0.39	0.03	0.45	0.43	0.29	0.64	0.48
Cpa\|evm.model.tig00021105.58 (tig00021105_g18272.t1)	0.71	0.57	0.56	0.57	0.37	0.29	0.5	0.64	0.35	0.38	0.38	0.35	0.65	0.55	0.58	1.0	0.4	0.65	0.54	0.46	0.07	0.21	0.22	0.25	0.56	0.53
Cpa\|evm.model.tig00021179.56 (tig00021179_g19272.t1)	0.67	0.3	0.26	0.19	0.12	0.09	0.16	0.28	0.12	0.15	0.24	0.35	0.9	0.23	0.17	1.0	0.1	0.17	0.14	0.1	0.03	0.11	0.1	0.16	0.57	0.24
Cpa\|evm.model.tig00021374.40 (tig00021374_g21123.t1)	0.02	0.02	0.0	0.0	0.01	0.1	0.23	0.13	0.42	0.08	0.05	0.03	0.02	0.44	0.86	1.0	0.16	0.25	0.35	0.07	0.11	0.01	0.18	0.1	0.04	0.01
Cpa\|evm.model.tig00021501.24 (tig00021501_g21962.t1)	0.55	0.5	0.65	0.62	0.66	0.69	0.85	0.85	0.86	0.83	0.77	0.68	0.72	0.76	0.77	1.0	0.56	0.42	0.47	0.68	0.08	0.57	0.24	0.23	0.39	0.38
Cpa\|evm.model.tig00021522.1 (tig00021522_g22095.t1)	0.97	0.59	0.77	0.7	0.49	0.48	0.69	0.9	0.4	0.37	0.36	0.33	0.53	0.51	0.53	1.0	0.35	0.47	0.49	0.41	0.04	0.19	0.2	0.13	0.55	0.66
Cpa\|evm.model.tig00021525.29 (tig00021525_g22146.t1)	0.14	0.42	0.6	0.63	0.68	0.76	0.77	0.68	0.74	0.55	0.56	0.52	0.08	0.93	1.0	0.9	0.77	0.81	0.69	0.73	0.01	0.2	0.5	0.28	0.88	0.65
Cpa\|evm.model.tig00021531.14 (tig00021531_g22177.t1)	0.09	0.26	0.34	0.39	0.5	0.54	0.54	0.45	0.41	0.31	0.26	0.21	0.12	0.62	0.68	1.0	0.44	0.44	0.42	0.34	0.01	0.13	0.15	0.11	0.56	0.26

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)