Heatmap: Cluster_111 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
-N
2.5M NaCl,0.5h
2.5M NaCl,1h
2.5M NaCl,2h
CCAP 19/18,4.5M NaCl
CCAP 19/18,5M Glycerol
CCAP 19/3
CCAP 19/3,Log
CCAP 19/3,Log,3M NaCl,1h
CCAP 19/3,Log,3M NaCl,6h
Log
Mid-log,Low light
Mid-log,Medium light
Mid-log,High light
Mid-log,White light
Mid-log,Red light
Mid-log,Blue light
Strain 435
Strain 435,H2O2
Strain 435,NaCl
Strain 435,Sorbitol
Dusal.0023s00030.1 (33198018)
0.08 0.06 0.06 0.05 0.53 0.48 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 1.0 0.4 0.19 0.25 0.3 0.06 0.12 0.13 0.12
Dusal.0031s00041.1 (33192236)
0.3 0.0 0.0 0.0 0.43 0.38 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 1.0 0.41 0.09 0.2 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0045s00043.1 (33191646)
0.07 0.0 0.0 0.0 0.41 0.47 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 1.0 0.65 0.38 0.15 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0048s00034.1 (33189461)
0.15 0.0 0.0 0.0 0.33 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 1.0 0.19 0.08 0.15 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0070s00042.1 (33189334)
0.26 0.16 0.11 0.09 0.57 0.35 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 1.0 0.32 0.16 0.34 0.32 0.01 0.02 0.04 0.01
Dusal.0091s00023.1 (33193982)
0.19 0.09 0.09 0.06 0.32 0.36 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 1.0 0.32 0.27 0.28 0.22 0.09 0.09 0.05 0.06
Dusal.0100s00027.1 (33202462)
0.11 0.0 0.0 0.0 0.22 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 1.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0115s00015.1 (33201309)
0.64 0.21 0.2 0.22 0.56 0.53 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 1.0 0.76 0.28 0.4 0.47 0.24 0.17 0.24 0.25
Dusal.0129s00001.1 (33194518)
0.22 0.02 0.02 0.01 0.17 0.14 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 1.0 0.2 0.03 0.1 0.08 0.03 0.03 0.02 0.01
Dusal.0138s00017.1 (33197021)
0.54 0.04 0.04 0.03 0.2 0.19 0.04 0.0 0.01 0.0 0.01 0.51 1.0 0.3 0.1 0.26 0.27 0.08 0.07 0.07 0.05
Dusal.0190s00021.1 (33189428)
0.09 0.0 0.0 0.0 0.89 0.87 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 1.0 0.63 0.29 0.31 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0201s00014.1 (33186093)
0.21 0.13 0.1 0.28 0.61 0.52 0.29 0.05 0.08 0.03 0.04 0.59 1.0 0.44 0.33 0.42 0.45 0.12 0.11 0.1 0.14
Dusal.0203s00024.1 (33199255)
0.11 0.01 0.01 0.0 0.25 0.2 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 1.0 0.26 0.07 0.1 0.1 0.0 0.0 0.0 0.01
Dusal.0219s00008.1 (33193389)
0.4 0.0 0.0 0.0 0.1 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 1.0 0.12 0.06 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0229s00005.1 (33187443)
0.44 0.0 0.0 0.0 0.39 0.36 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 1.0 0.44 0.2 0.11 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0244s00005.1 (33186520)
0.02 0.0 0.0 0.0 0.12 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 1.0 0.17 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0270s00018.1 (33190002)
0.46 0.05 0.04 0.04 0.46 0.44 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 1.0 0.62 0.32 0.33 0.45 0.13 0.12 0.07 0.12
Dusal.0281s00016.1 (33190368)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.17 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 1.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.04 0.05
Dusal.0292s00019.1 (33188600)
0.28 0.03 0.04 0.02 0.85 0.77 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 1.0 0.64 0.23 0.18 0.2 0.02 0.02 0.01 0.02
Dusal.0314s00022.1 (33191077)
0.05 0.0 0.0 0.0 1.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.95 0.31 0.15 0.2 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0320s00002.1 (33189572)
0.37 0.0 0.0 0.0 0.66 0.62 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 1.0 0.61 0.38 0.17 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0324s00010.1 (33186997)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 1.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0368s00009.1 (33194814)
0.09 0.05 0.07 0.1 1.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.82 0.51 0.32 0.25 0.42 0.04 0.04 0.04 0.05
Dusal.0376s00006.1 (33188035)
0.15 0.0 0.0 0.0 0.8 0.82 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 1.0 0.81 0.21 0.24 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0394s00012.1 (33202271)
0.24 0.01 0.01 0.01 0.16 0.14 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 1.0 0.62 0.1 0.15 0.19 0.01 0.01 0.01 0.01
Dusal.0484s00007.1 (33186277)
0.26 0.0 0.0 0.0 0.83 0.71 0.05 0.04 0.01 0.01 0.02 0.63 1.0 0.49 0.18 0.22 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0489s00004.1 (33192693)
0.54 0.03 0.04 0.03 0.28 0.29 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 1.0 0.56 0.17 0.13 0.21 0.02 0.03 0.03 0.02
Dusal.0495s00004.1 (33189555)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 1.0 0.37 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0588s00004.1 (33195781)
0.03 0.02 0.01 0.01 0.21 0.21 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 1.0 0.37 0.01 0.0 0.0 0.03 0.03 0.02 0.04
Dusal.0608s00002.1 (33188256)
0.32 0.08 0.07 0.03 0.71 0.9 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 1.0 0.99 0.22 0.47 0.69 0.03 0.06 0.0 0.01
Dusal.0649s00010.1 (33200314)
0.42 0.09 0.11 0.11 0.58 0.57 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 1.0 0.44 0.25 0.25 0.4 0.12 0.16 0.11 0.16
Dusal.0712s00009.1 (33190997)
0.15 0.0 0.0 0.0 0.91 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.74 0.49 0.36 0.15 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0755s00007.1 (33194806)
0.36 0.05 0.04 0.05 0.58 0.52 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 1.0 0.51 0.19 0.28 0.35 0.04 0.04 0.05 0.04
Dusal.0759s00009.1 (33194756)
0.1 0.0 0.0 0.0 0.17 0.17 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 1.0 0.3 0.11 0.11 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0815s00002.1 (33186611)
0.13 0.0 0.0 0.0 0.16 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 1.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0823s00004.1 (33201512)
0.08 0.0 0.0 0.0 0.92 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.83 0.4 0.16 0.16 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0907s00001.1 (33189150)
0.29 0.0 0.0 0.0 0.56 0.42 0.12 0.22 0.16 0.15 0.05 0.82 1.0 0.7 0.12 0.6 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0912s00004.1 (33187591)
0.35 0.0 0.0 0.0 0.18 0.16 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 1.0 0.32 0.1 0.14 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0956s00002.1 (33193526)
0.31 0.09 0.09 0.22 0.29 0.28 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 1.0 0.33 0.21 0.33 0.26 0.2 0.22 0.29 0.24
Dusal.0977s00004.1 (33197305)
0.5 0.14 0.13 0.1 0.55 0.47 0.13 0.01 0.0 0.0 0.0 0.65 1.0 0.63 0.27 0.27 0.31 0.2 0.18 0.15 0.2
Dusal.1030s00002.1 (33200309)
0.07 0.09 0.08 0.05 0.17 0.16 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 1.0 0.35 0.05 0.06 0.04 0.04 0.04 0.03 0.02
Dusal.1103s00002.1 (33190216)
0.27 0.15 0.13 0.17 0.65 0.68 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 1.0 0.33 0.17 0.34 0.29 0.08 0.09 0.09 0.09
Dusal.1127s00003.1 (33192977)
0.19 0.05 0.06 0.15 0.24 0.23 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 1.0 0.38 0.2 0.17 0.18 0.07 0.06 0.13 0.08
Dusal.1245s00002.1 (33199158)
0.39 0.2 0.18 0.22 0.61 0.57 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 1.0 0.37 0.36 0.39 0.52 0.16 0.14 0.18 0.14
Dusal.1379s00003.1 (33187098)
0.24 0.0 0.0 0.0 1.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.87 0.54 0.34 0.13 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.1511s00001.1 (33185915)
0.2 0.06 0.06 0.07 0.51 0.43 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 1.0 0.59 0.13 0.38 0.5 0.02 0.02 0.02 0.01
Dusal.1814s00001.1 (33198531)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 1.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)