Heatmap: Cluster_122 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	-N	2.5M NaCl,0.5h	2.5M NaCl,1h	2.5M NaCl,2h	CCAP 19/18,4.5M NaCl	CCAP 19/18,5M Glycerol	CCAP 19/3	CCAP 19/3,Log	CCAP 19/3,Log,3M NaCl,1h	CCAP 19/3,Log,3M NaCl,6h	Log	Mid-log,Low light	Mid-log,Medium light	Mid-log,High light	Mid-log,White light	Mid-log,Red light	Mid-log,Blue light	Strain 435	Strain 435,H2O2	Strain 435,NaCl	Strain 435,Sorbitol
Dusal.0002s00005.1 (33187996)	0.49	0.26	0.23	0.3	1.0	0.81	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.23	0.06	0.22	0.57	0.42	0.33	0.32	0.31	0.35
Dusal.0004s00074.1 (33201036)	0.75	0.13	0.16	0.31	0.95	1.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.19	0.17	0.2	0.12	0.14	0.58	0.58	0.7	0.65
Dusal.0008s00029.1 (33198888)	0.04	0.15	0.16	0.27	1.0	0.84	0.27	0.07	0.19	0.04	0.0	0.04	0.05	0.04	0.04	0.06	0.05	0.34	0.3	0.39	0.43
Dusal.0011s00026.1 (33192194)	0.5	0.15	0.19	0.23	1.0	0.89	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.21	0.3	0.13	0.15	0.27	0.39	0.42	0.34	0.41
Dusal.0028s00009.1 (33198465)	0.11	0.3	0.24	0.19	1.0	0.88	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.35	0.42	0.56
Dusal.0050s00012.1 (33193844)	0.38	0.17	0.11	0.15	0.92	1.0	0.42	0.1	0.14	0.07	0.14	0.14	0.2	0.22	0.27	0.25	0.29	0.3	0.47	0.58	0.55
Dusal.0052s00025.1 (33199551)	0.46	0.21	0.21	0.34	0.95	1.0	0.4	0.12	0.12	0.18	0.07	0.38	0.46	0.32	0.35	0.35	0.27	0.69	0.82	0.83	0.78
Dusal.0059s00006.1 (33203241)	0.1	0.22	0.22	0.3	0.88	1.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.1	0.07	0.07	0.15	0.12	0.48	0.57	0.42	0.46
Dusal.0062s00026.1 (33200776)	0.21	0.07	0.13	0.15	1.0	0.83	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.04	0.01	0.16	0.04	0.11	0.57	0.49	0.21	0.4
Dusal.0063s00009.1 (33196767)	0.3	0.16	0.2	0.3	1.0	0.93	0.34	0.03	0.01	0.1	0.1	0.31	0.32	0.15	0.35	0.36	0.49	0.45	0.52	0.59	0.62
Dusal.0068s00025.1 (33187218)	0.26	0.22	0.18	0.11	1.0	0.92	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.44	0.16	0.24
Dusal.0072s00013.1 (33199054)	0.28	0.16	0.17	0.38	1.0	0.93	0.63	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.2	0.2	0.46	0.3	0.37	0.65	0.72	0.97	0.89
Dusal.0077s00030.1 (33192455)	0.18	0.12	0.11	0.34	0.97	0.92	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.2	0.18	0.36	0.31	0.33	0.78	0.85	0.99	1.0
Dusal.0077s00033.1 (33192469)	0.49	0.45	0.37	0.4	0.99	1.0	0.52	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.21	0.16	0.2	0.28	0.23	0.38	0.41	0.42	0.34
Dusal.0082s00005.1 (33189226)	0.66	0.08	0.09	0.25	1.0	0.96	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.22	0.55	0.17
Dusal.0082s00025.1 (33189248)	0.62	0.21	0.27	0.24	1.0	0.75	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.45	0.28	0.19	0.25	0.22	0.25	0.28	0.33	0.26
Dusal.0096s00002.1 (33195824)	0.19	0.13	0.18	0.22	1.0	0.88	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.17	0.15	0.4	0.34	0.47	0.61	0.61	0.69	0.76
Dusal.0110s00013.1 (33194340)	0.22	0.27	0.39	0.26	1.0	0.86	0.28	0.01	0.02	0.1	0.02	0.04	0.04	0.02	0.02	0.05	0.09	0.34	0.38	0.32	0.4
Dusal.0126s00016.1 (33196543)	0.37	0.15	0.18	0.18	1.0	0.84	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.09	0.08	0.08	0.06	0.09	0.25	0.31	0.25	0.23
Dusal.0133s00004.1 (33199122)	0.52	0.23	0.21	0.4	1.0	0.94	0.45	0.15	0.17	0.19	0.1	0.25	0.31	0.19	0.32	0.46	0.44	0.49	0.47	0.66	0.65
Dusal.0145s00026.1 (33195886)	0.22	0.57	0.57	0.47	1.0	0.97	0.51	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.23	0.27	0.4	0.28	0.42	0.33	0.42	0.32	0.39
Dusal.0151s00011.1 (33191979)	0.5	0.04	0.08	0.18	1.0	0.99	0.39	0.01	0.01	0.0	0.0	0.07	0.11	0.05	0.08	0.11	0.13	0.38	0.35	0.38	0.42
Dusal.0154s00006.1 (33199323)	0.51	0.08	0.06	0.13	1.0	0.77	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.14	0.05	0.19	0.35	0.18	0.18	0.15	0.23	0.2
Dusal.0168s00012.1 (33200871)	0.44	0.49	0.53	0.18	1.0	0.98	0.65	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.35	0.19	0.48	0.45	0.62	0.34	0.36	0.09	0.33
Dusal.0198s00013.1 (33192669)	0.0	0.13	0.17	0.44	1.0	0.73	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.26	0.27	0.31
Dusal.0209s00012.1 (33199665)	1.0	0.16	0.14	0.2	0.92	0.85	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.18	0.21	0.36	0.26	0.28	0.27	0.24	0.32	0.31
Dusal.0223s00026.1 (33201358)	1.0	0.16	0.17	0.41	0.83	0.82	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.34	0.18	0.24	0.21	0.37	0.59	0.63	0.8	0.8
Dusal.0225s00019.1 (33185203)	0.57	0.34	0.31	0.36	1.0	0.89	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.3	0.18	0.22	0.42	0.41	0.35	0.35	0.41	0.38
Dusal.0249s00016.1 (33195366)	0.42	0.25	0.24	0.5	0.97	0.95	0.4	0.11	0.06	0.33	0.2	0.41	0.43	0.37	0.38	0.26	0.5	0.73	0.83	0.83	1.0
Dusal.0252s00001.1 (33187317)	0.33	0.16	0.18	0.17	0.92	1.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.51	0.43	0.43	0.34	0.37	0.3	0.49	0.51	0.29	0.45
Dusal.0257s00009.1 (33197520)	0.38	0.27	0.2	0.3	1.0	0.91	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.31	0.15	0.14	0.31	0.3	0.25	0.29	0.18	0.28
Dusal.0260s00014.1 (33185453)	0.51	0.17	0.19	0.28	1.0	0.97	0.52	0.01	0.01	0.01	0.01	0.2	0.22	0.17	0.42	0.52	0.39	0.67	0.71	0.82	1.0
Dusal.0262s00006.1 (33195640)	0.29	0.45	0.46	0.41	1.0	0.9	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.53	0.32	0.29	0.34	0.39	0.33	0.38	0.45	0.41
Dusal.0267s00002.1 (33198977)	0.59	0.55	0.45	0.21	1.0	0.88	0.51	0.04	0.04	0.11	0.06	0.05	0.43	0.19	0.33	0.34	0.41	0.29	0.28	0.05	0.06
Dusal.0277s00004.1 (33188119)	0.0	0.05	0.06	0.05	1.0	0.92	0.28	0.05	0.0	0.03	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.3	0.39	0.13	0.24
Dusal.0293s00006.1 (33190178)	0.42	0.11	0.13	0.18	1.0	0.93	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.23	0.25	0.15	0.09	0.13	0.39	0.43	0.54	0.55
Dusal.0295s00004.1 (33188627)	0.24	0.26	0.28	0.41	1.0	0.92	0.23	0.12	0.2	0.09	0.1	0.06	0.1	0.03	0.06	0.15	0.16	0.48	0.45	0.47	0.41
Dusal.0316s00010.1 (33189586)	0.72	0.16	0.14	0.22	0.98	1.0	0.41	0.09	0.23	0.2	0.3	0.4	0.45	0.35	0.38	0.38	0.44	0.64	0.68	0.75	0.7
Dusal.0316s00012.1 (33189585)	0.31	0.08	0.08	0.24	1.0	0.81	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.1	0.07	0.03	0.03	0.04	0.07	0.09	0.29	0.14
Dusal.0337s00002.1 (33185226)	0.17	0.47	0.52	0.33	1.0	0.92	0.28	0.0	0.0	0.01	0.0	0.27	0.25	0.27	0.3	0.29	0.29	0.39	0.34	0.15	0.21
Dusal.0340s00002.1 (33188270)	0.33	0.29	0.23	0.38	1.0	0.88	0.52	0.06	0.04	0.02	0.08	0.19	0.32	0.14	0.27	0.47	0.53	0.29	0.31	0.22	0.3
Dusal.0377s00001.1 (33195254)	0.18	0.06	0.11	0.15	1.0	0.69	0.33	0.03	0.04	0.05	0.0	0.14	0.18	0.02	0.06	0.18	0.2	0.27	0.28	0.16	0.2
Dusal.0400s00003.1 (33188084)	0.24	0.57	0.56	0.44	0.98	1.0	0.5	0.13	0.09	0.1	0.13	0.4	0.39	0.23	0.26	0.48	0.38	0.36	0.37	0.21	0.26
Dusal.0426s00006.1 (33189086)	0.88	0.16	0.14	0.21	1.0	0.88	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.18	0.13	0.1	0.16	0.19	0.29	0.31	0.36	0.34
Dusal.0460s00004.1 (33188214)	0.35	0.23	0.21	0.29	1.0	0.91	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.35	0.41	0.39	0.22	0.27	0.48	0.49	0.4	0.5
Dusal.0595s00001.1 (33191201)	1.0	0.14	0.1	0.13	0.97	0.88	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.38	0.48	0.18	0.31	0.27	0.45	0.48	0.34	0.43
Dusal.0630s00004.1 (33196446)	0.44	0.25	0.3	0.44	1.0	0.83	0.32	0.1	0.13	0.11	0.05	0.22	0.19	0.24	0.24	0.3	0.36	0.26	0.31	0.42	0.37
Dusal.0661s00004.1 (33199738)	0.23	0.12	0.15	0.44	1.0	0.88	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.26	0.18	0.41	0.31	0.38	0.5	0.57	0.81	0.71
Dusal.0662s00003.1 (33190735)	0.83	0.23	0.22	0.42	1.0	0.9	0.36	0.0	0.0	0.01	0.01	0.21	0.22	0.29	0.23	0.15	0.18	0.31	0.4	0.39	0.32
Dusal.0687s00001.1 (33187148)	0.37	0.11	0.1	0.25	1.0	1.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.41	0.33	0.53	0.39
Dusal.0726s00004.1 (33200794)	0.53	0.23	0.24	0.44	1.0	0.82	0.32	0.0	0.0	0.0	0.01	0.23	0.27	0.18	0.15	0.23	0.32	0.25	0.27	0.28	0.31
Dusal.0802s00001.1 (33199444)	0.32	0.08	0.06	0.08	1.0	0.96	0.41	0.03	0.06	0.07	0.05	0.18	0.28	0.2	0.1	0.13	0.15	0.24	0.37	0.17	0.33
Dusal.0858s00003.1 (33193680)	0.09	0.3	0.31	0.38	1.0	0.81	0.19	0.06	0.03	0.07	0.08	0.0	0.06	0.01	0.03	0.03	0.03	0.25	0.33	0.3	0.38
Dusal.0899s00002.1 (33193167)	0.53	0.62	0.61	0.42	1.0	0.89	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.49	0.42	0.39	0.24	0.4	0.44	0.49	0.5	0.45
Dusal.0912s00005.1 (33187590)	0.46	0.08	0.06	0.19	0.87	0.92	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.23	0.2	0.42	0.24	0.4	0.78	1.0	0.73	0.88
Dusal.0920s00004.1 (33200665)	0.52	0.19	0.21	0.29	1.0	0.93	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.22	0.29	0.31	0.38	0.23	0.44	0.4	0.71	0.46
Dusal.2542s00001.1 (33194084)	0.19	0.33	0.34	0.26	1.0	0.74	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.17	0.16	0.22	0.08	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)