Heatmap: Cluster_17 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
-N
2.5M NaCl,0.5h
2.5M NaCl,1h
2.5M NaCl,2h
CCAP 19/18,4.5M NaCl
CCAP 19/18,5M Glycerol
CCAP 19/3
CCAP 19/3,Log
CCAP 19/3,Log,3M NaCl,1h
CCAP 19/3,Log,3M NaCl,6h
Log
Mid-log,Low light
Mid-log,Medium light
Mid-log,High light
Mid-log,White light
Mid-log,Red light
Mid-log,Blue light
Strain 435
Strain 435,H2O2
Strain 435,NaCl
Strain 435,Sorbitol
Dusal.0005s00012.1 (33196916)
1.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.27 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.69 0.2 0.17 0.29 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0005s00013.1 (33196939)
0.33 0.13 0.13 0.29 0.41 0.35 0.29 0.07 0.08 0.09 0.05 0.51 1.0 0.5 0.28 0.42 0.48 0.11 0.12 0.25 0.15
Dusal.0008s00019.1 (33198870)
1.0 0.04 0.04 0.08 0.21 0.2 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.98 0.38 0.09 0.3 0.09 0.02 0.03 0.05 0.03
Dusal.0015s00030.1 (33190949)
0.79 0.06 0.1 0.06 0.26 0.24 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 1.0 0.45 0.38 0.38 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0021s00003.1 (33197776)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.28 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 1.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
Dusal.0038s00012.1 (33192355)
1.0 0.06 0.07 0.15 0.15 0.12 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.56 0.17 0.06 0.1 0.16 0.03 0.03 0.05 0.04
Dusal.0040s00030.1 (33197283)
0.27 0.1 0.12 0.1 0.35 0.31 0.2 0.0 0.0 0.01 0.01 0.42 1.0 0.27 0.17 0.5 0.44 0.09 0.1 0.07 0.07
Dusal.0048s00035.1 (33189463)
0.13 0.07 0.09 0.09 0.3 0.35 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 1.0 0.22 0.15 0.15 0.26 0.18 0.2 0.2 0.24
Dusal.0070s00006.1 (33189330)
1.0 0.03 0.01 0.07 0.34 0.3 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.47 0.17 0.02 0.17 0.31 0.01 0.01 0.03 0.06
Dusal.0071s00002.1 (33185714)
0.09 0.0 0.0 0.0 0.13 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 1.0 0.1 0.05 0.27 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0074s00012.1 (33188455)
1.0 0.11 0.1 0.25 0.41 0.35 0.07 0.21 0.27 0.13 0.07 0.35 0.45 0.32 0.1 0.26 0.33 0.08 0.09 0.18 0.12
Dusal.0086s00006.1 (33192760)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.31 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 1.0 0.24 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0100s00019.1 (33202458)
0.38 0.1 0.11 0.11 0.44 0.36 0.22 0.12 0.08 0.05 0.1 0.5 1.0 0.3 0.26 0.27 0.32 0.14 0.13 0.15 0.16
Dusal.0109s00022.1 (33202363)
0.17 0.02 0.03 0.02 0.78 0.64 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.96 0.46 0.05 0.11 0.1 0.0 0.01 0.01 0.01
Dusal.0142s00007.1 (33187915)
0.69 0.07 0.07 0.06 0.37 0.32 0.23 0.16 0.13 0.1 0.06 0.39 1.0 0.35 0.17 0.35 0.31 0.05 0.05 0.04 0.04
Dusal.0147s00009.1 (33195558)
0.69 0.03 0.03 0.05 0.16 0.12 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 1.0 0.11 0.03 0.06 0.22 0.0 0.01 0.0 0.0
Dusal.0149s00022.1 (33186632)
0.05 0.05 0.04 0.03 0.36 0.32 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 1.0 0.3 0.04 0.11 0.16 0.04 0.05 0.03 0.04
Dusal.0171s00001.1 (33202855)
1.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.44 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.6 0.22 0.37 0.33 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0201s00013.1 (33186097)
0.58 0.28 0.32 0.49 0.89 0.7 0.49 0.0 0.0 0.0 0.01 0.49 1.0 0.21 0.15 0.62 0.45 0.34 0.31 0.41 0.38
Dusal.0238s00016.1 (33193659)
0.22 0.14 0.12 0.12 0.29 0.23 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 1.0 0.22 0.07 0.46 0.43 0.02 0.02 0.02 0.02
Dusal.0240s00018.1 (33202725)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 1.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0250s00019.1 (33198095)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 1.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0257s00022.1 (33197519)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 1.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0297s00016.1 (33197357)
0.06 0.0 0.0 0.0 0.54 0.52 0.0 0.01 0.02 0.06 0.05 0.39 1.0 0.51 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0301s00007.1 (33195486)
0.15 0.01 0.01 0.0 0.5 0.4 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 1.0 0.27 0.1 0.17 0.1 0.01 0.04 0.01 0.02
Dusal.0321s00005.1 (33203148)
0.14 0.01 0.01 0.0 0.66 0.45 0.1 0.07 0.08 0.11 0.38 0.45 1.0 0.3 0.17 0.26 0.25 0.02 0.02 0.02 0.02
Dusal.0324s00013.1 (33186995)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 1.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0360s00002.1 (33194966)
0.78 0.0 0.0 0.0 0.45 0.29 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 1.0 0.13 0.1 0.4 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0376s00012.1 (33188046)
0.46 0.17 0.18 0.25 0.35 0.32 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 1.0 0.35 0.16 0.29 0.31 0.21 0.16 0.25 0.21
Dusal.0381s00005.1 (33189378)
1.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.34 0.01 0.06 0.05 0.01 0.04 0.18 0.58 0.13 0.0 0.05 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0419s00007.1 (33196977)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 1.0 0.39 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
Dusal.0420s00013.1 (33194855)
0.61 0.2 0.26 0.27 0.61 0.5 0.35 0.1 0.05 0.09 0.03 0.54 1.0 0.35 0.31 0.61 0.48 0.2 0.22 0.29 0.23
Dusal.0446s00007.1 (33201124)
1.0 0.03 0.02 0.03 0.6 0.55 0.06 0.19 0.13 0.15 0.2 0.44 0.71 0.3 0.28 0.35 0.47 0.06 0.05 0.02 0.05
Dusal.0451s00001.1 (33200270)
0.03 0.06 0.07 0.02 0.57 0.51 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 1.0 0.57 0.05 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0
Dusal.0455s00006.1 (33198933)
0.12 0.0 0.0 0.0 0.51 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 1.0 0.44 0.04 0.06 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0524s00011.1 (33201135)
0.14 0.0 0.0 0.0 0.4 0.36 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 1.0 0.22 0.04 0.05 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0
Dusal.0562s00008.1 (33189684)
1.0 0.03 0.04 0.06 0.25 0.21 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.82 0.26 0.03 0.09 0.3 0.01 0.03 0.02 0.01
Dusal.0562s00010.1 (33189683)
0.61 0.01 0.01 0.01 0.17 0.13 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 1.0 0.2 0.03 0.06 0.32 0.0 0.01 0.01 0.0
Dusal.0562s00011.1 (33189679)
0.59 0.02 0.02 0.06 0.29 0.19 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 1.0 0.14 0.01 0.08 0.29 0.0 0.01 0.01 0.0
Dusal.0562s00012.1 (33189681)
0.58 0.06 0.1 0.17 0.24 0.2 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 1.0 0.18 0.02 0.08 0.28 0.0 0.01 0.03 0.01
Dusal.0598s00007.1 (33189787)
0.0 0.09 0.11 0.0 0.51 0.2 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 1.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0609s00006.1 (33195749)
1.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.22 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.53 0.24 0.23 0.33 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0620s00002.1 (33193412)
1.0 0.0 0.0 0.01 0.34 0.32 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.78 0.54 0.07 0.26 0.53 0.03 0.24 0.0 0.0
Dusal.0656s00005.1 (33192417)
1.0 0.1 0.11 0.13 0.75 0.48 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.87 0.19 0.12 0.25 0.35 0.05 0.08 0.04 0.05
Dusal.0656s00006.1 (33192411)
0.65 0.0 0.0 0.0 0.51 0.35 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 1.0 0.26 0.13 0.4 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0656s00007.1 (33192409)
0.31 0.22 0.23 0.23 0.79 0.56 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 1.0 0.3 0.16 0.3 0.46 0.19 0.24 0.24 0.26
Dusal.0690s00004.1 (33188592)
0.13 0.0 0.0 0.0 0.39 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 1.0 0.36 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0699s00002.1 (33197708)
0.06 0.0 0.0 0.0 0.3 0.21 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 1.0 0.21 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0713s00001.1 (33190971)
0.72 0.07 0.07 0.08 0.54 0.36 0.18 0.14 0.06 0.2 0.0 0.27 1.0 0.13 0.15 0.52 0.52 0.03 0.03 0.03 0.02
Dusal.0799s00003.1 (33202122)
0.3 0.2 0.22 0.24 0.31 0.25 0.24 0.12 0.09 0.05 0.04 0.75 1.0 0.48 0.16 0.59 0.53 0.06 0.08 0.13 0.09
Dusal.0907s00002.1 (33189152)
0.58 0.17 0.22 0.23 0.35 0.24 0.24 0.05 0.04 0.04 0.03 0.6 1.0 0.33 0.07 0.62 0.74 0.03 0.05 0.1 0.06
Dusal.0957s00007.1 (33197871)
0.6 0.05 0.07 0.14 0.56 0.41 0.19 0.0 0.01 0.0 0.0 0.33 1.0 0.19 0.07 0.17 0.21 0.11 0.14 0.13 0.14
Dusal.0993s00003.1 (33196708)
0.31 0.03 0.04 0.11 0.36 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 1.0 0.16 0.02 0.08 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0993s00004.1 (33196707)
0.9 0.01 0.02 0.03 0.48 0.31 0.11 0.01 0.0 0.0 0.38 0.32 1.0 0.16 0.03 0.09 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.1019s00003.1 (33197563)
0.28 0.02 0.3 0.22 0.46 0.45 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 1.0 0.44 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.05 0.05
Dusal.1833s00001.1 (33189254)
0.01 0.0 0.0 0.0 0.43 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 1.0 0.41 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.2177s00001.1 (33186697)
1.0 0.04 0.11 0.02 0.44 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.88 0.19 0.07 0.24 0.5 0.02 0.06 0.02 0.13
Dusal.2478s00001.1 (33194889)
0.3 0.27 0.29 0.41 0.58 0.48 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 1.0 0.18 0.19 0.33 0.29 0.3 0.33 0.33 0.33
Dusal.2824s00001.1 (33188250)
1.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.63 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.88 0.33 0.26 0.2 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.2879s00001.1 (33195604)
1.0 0.05 0.03 0.05 0.3 0.31 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.45 0.25 0.17 0.25 0.23 0.08 0.08 0.08 0.07

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)