Heatmap: Cluster_39 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000025.54 (tig00000025_g7958.t2)
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 1.0 0.17 0.0 0.05 0.0
Cpa|evm.model.tig00000056.15 (tig00000056_g24062.t1)
0.06 0.03 0.0 0.12 0.1 0.04 0.07 0.18 0.11 0.13 0.15 0.14 0.05 0.0 0.0 0.05 0.08 0.1 0.0 0.03 0.14 1.0 0.49 0.3 0.78 0.72
Cpa|evm.model.tig00000056.7 (tig00000056_g24052.t1)
0.12 0.03 0.0 0.22 0.04 0.09 0.0 0.05 0.19 0.22 0.14 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.03 1.0 0.24 0.37 0.52 0.03
Cpa|evm.model.tig00000093.193 (tig00000093_g3616.t1)
0.36 0.25 0.16 0.21 0.23 0.2 0.22 0.23 0.32 0.22 0.36 0.27 0.43 0.14 0.1 0.12 0.13 0.24 0.21 0.09 0.36 1.0 0.51 0.36 0.36 0.3
Cpa|evm.model.tig00000157.88 (tig00000157_g9679.t1)
0.0 0.0 0.0 0.13 0.23 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.06 0.06 0.0 0.0 0.0 0.27 0.07 0.19 0.1 0.0 0.6 0.84 0.15 0.35 1.0 0.42
Cpa|evm.model.tig00000194.11 (tig00000194_g14737.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000219.33 (tig00000219_g19474.t1)
0.0 0.19 0.0 0.27 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.52 0.0 0.15 0.0 0.2 0.53 1.0 0.0 0.0 0.42 0.0
Cpa|evm.model.tig00000262.35 (tig00000262_g23086.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000378.29 (tig00000378_g24520.t1)
0.06 0.29 0.07 0.3 0.28 0.08 0.0 0.23 0.08 0.2 0.07 0.08 0.0 0.64 0.8 0.35 0.24 0.38 0.24 0.05 0.22 1.0 0.17 0.0 0.23 0.29
0.08 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.12 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 1.0 0.37 0.05 0.71 0.15
Cpa|evm.model.tig00000444.33 (tig00000983_g5901.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000448.56 (tig00000448_g876.t1)
0.33 0.09 0.07 0.04 0.0 0.19 0.08 0.02 0.0 0.11 0.02 0.06 0.08 0.06 0.11 0.04 0.02 0.2 0.3 0.0 0.15 1.0 0.14 0.09 0.08 0.22
Cpa|evm.model.tig00000455.33 (tig00000455_g1024.t1)
0.08 0.04 0.07 0.15 0.1 0.04 0.15 0.18 0.16 0.13 0.3 0.07 0.05 0.05 0.01 0.07 0.02 0.18 0.06 0.06 0.28 0.91 0.65 0.38 1.0 0.6
Cpa|evm.model.tig00000459.75 (tig00000459_g1143.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000622.7 (tig00000622_g2622.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000624.15 (tig00000624_g2657.t1)
0.25 0.0 0.08 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 1.0 0.14 0.19 0.68 0.04
Cpa|evm.model.tig00000681.77 (tig00000681_g3140.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000711.65 (tig00000711_g3427.t1)
0.0 0.0 0.0 0.18 0.12 0.0 0.0 0.01 0.01 0.05 0.05 0.08 0.02 0.03 0.0 0.04 0.0 0.01 0.01 0.0 0.03 0.67 0.0 0.0 1.0 0.05
Cpa|evm.model.tig00000760.18 (tig00000760_g3939.t1)
0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.14 0.0 0.11 0.36
Cpa|evm.model.tig00000764.10 (tig00000764_g3985.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000829.28 (tig00000829_g4669.t1)
0.15 0.1 0.18 0.1 0.24 0.04 0.06 0.08 0.15 0.17 0.17 0.19 0.05 0.01 0.03 0.13 0.08 0.12 0.07 0.01 0.2 1.0 0.31 0.11 0.47 0.32
Cpa|evm.model.tig00000851.7 (tig00000851_g4891.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.23 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000852.12 (tig00000852_g5026.t1)
0.11 0.17 0.08 0.28 0.15 0.11 0.1 0.22 0.35 0.28 0.35 0.26 0.08 0.0 0.0 0.02 0.0 0.1 0.0 0.0 0.02 1.0 0.26 0.17 0.39 0.73
Cpa|evm.model.tig00001025.8 (tig00001025_g6364.t1)
0.11 0.02 0.06 0.14 0.11 0.15 0.18 0.18 0.22 0.24 0.19 0.13 0.04 0.06 0.07 0.24 0.05 0.2 0.06 0.04 0.19 1.0 0.54 0.4 0.71 0.18
Cpa|evm.model.tig00001206.34 (tig00001206_g7517.t1)
0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 1.0 0.11 0.02 0.32 0.11
Cpa|evm.model.tig00001208.6 (tig00001208_g7521.t1)
0.3 0.1 0.14 0.11 0.11 0.08 0.13 0.21 0.16 0.18 0.08 0.04 0.31 0.12 0.02 0.08 0.03 0.08 0.02 0.0 0.14 1.0 0.17 0.1 0.18 0.18
0.15 0.19 0.07 0.24 0.2 0.02 0.06 0.14 0.2 0.23 0.38 0.17 0.23 0.0 0.05 0.07 0.02 0.05 0.06 0.03 0.2 1.0 0.89 0.18 0.49 0.24
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 1.0 0.17 0.0 0.46 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 1.0 0.12 0.13 0.68 0.17
Cpa|evm.model.tig00001574.6 (tig00001574_g9353.t1)
0.56 0.46 0.36 0.31 0.26 0.31 0.36 0.44 0.33 0.33 0.38 0.48 0.66 0.25 0.31 0.35 0.32 0.22 0.21 0.27 0.09 0.77 0.37 0.24 1.0 0.36
Cpa|evm.model.tig00001576.6 (tig00001576_g9367.t1)
0.0 0.01 0.0 0.03 0.03 0.0 0.05 0.03 0.02 0.05 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.09 0.02 0.09 0.02 0.0 0.01 1.0 0.37 0.0 0.05 0.04
Cpa|evm.model.tig00020553.112 (tig00020553_g10599.t2)
0.19 0.0 0.0 0.0 0.19 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 1.0 1.0 0.62 0.0 0.31 0.0
Cpa|evm.model.tig00020553.287 (tig00020553_g10771.t1)
0.01 0.0 0.05 0.25 0.19 0.1 0.29 0.25 0.19 0.27 0.07 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.07 0.03 0.02 0.08 0.71 0.07 0.05 1.0 0.07
Cpa|evm.model.tig00020592.40 (tig00020592_g11676.t1)
0.11 0.08 0.01 0.15 0.07 0.01 0.05 0.04 0.0 0.04 0.06 0.09 0.06 0.01 0.01 0.0 0.01 0.03 0.02 0.0 0.03 1.0 0.13 0.14 0.79 0.19
Cpa|evm.model.tig00020693.21 (tig00020693_g13028.t1)
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.69 0.0 0.0 0.59 0.0
Cpa|evm.model.tig00020723.50 (tig00020723_g13469.t1)
0.07 0.05 0.0 0.04 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.15 1.0 0.42 0.12 0.21 0.14
Cpa|evm.model.tig00020849.16 (tig00020849_g14646.t1)
0.1 0.09 0.0 0.35 0.0 0.0 0.08 0.02 0.05 0.08 0.2 0.17 0.17 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.26 1.0 0.02 0.43 0.76 0.22
Cpa|evm.model.tig00020911.9 (tig00020911_g15710.t1)
0.22 0.09 0.09 0.47 0.07 0.01 0.05 0.19 0.11 0.09 0.23 0.22 0.09 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.03 0.03 1.0 0.23 0.18 0.74 0.33
Cpa|evm.model.tig00020927.7 (tig00020927_g15936.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020964.5 (tig00020964_g16774.t1)
0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 1.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020965.30 (tig00000850_g4799.t1)
0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.97 0.16 0.0 0.54 0.0
Cpa|evm.model.tig00021037.23 (tig00021037_g17429.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021045.19 (tig00021045_g17663.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.51 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.1 0.0 0.01 0.17 0.09 0.08 0.16 0.33 0.05 0.04 0.05 1.0 0.41 0.19 0.81 0.27
Cpa|evm.model.tig00021098.3 (tig00021098_g18169.t1)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.67 0.06
Cpa|evm.model.tig00021108.49 (tig00021326_g20298.t1)
0.09 0.1 0.11 0.09 0.07 0.03 0.08 0.12 0.07 0.14 0.08 0.12 0.08 0.01 0.0 0.03 0.0 0.13 0.04 0.03 0.18 1.0 0.04 0.05 0.7 0.09
0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.83 0.4 0.9 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.25 0.0 0.0 0.5 0.73 0.0 0.0 1.0 0.27
Cpa|evm.model.tig00021254.32 (tig00021721_g23223.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 1.0 0.06 0.43 0.28 0.16
Cpa|evm.model.tig00021318.50 (tig00020961_g16767.t1)
0.0 0.28 0.19 1.0 0.58 0.58 0.34 0.25 0.16 0.24 0.03 0.07 0.07 0.04 0.2 0.13 0.11 0.13 0.22 0.37 0.7 0.9 0.18 0.31 0.29 0.16
Cpa|evm.model.tig00021326.36 (tig00000754_g3896.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021332.14 (tig00021332_g20333.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 1.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021428.37 (tig00021428_g21181.t1)
0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.59 0.6 0.0 1.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021589.37 (tig00020918_g15895.t1)
0.19 0.04 0.03 0.05 0.06 0.14 0.06 0.16 0.06 0.06 0.01 0.02 0.08 0.18 0.04 0.06 0.02 0.07 0.11 0.02 0.13 0.6 0.05 0.16 1.0 0.16

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)