Heatmap: Cluster_115 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	-N	2.5M NaCl,0.5h	2.5M NaCl,1h	2.5M NaCl,2h	CCAP 19/18,4.5M NaCl	CCAP 19/18,5M Glycerol	CCAP 19/3	CCAP 19/3,Log	CCAP 19/3,Log,3M NaCl,1h	CCAP 19/3,Log,3M NaCl,6h	Log	Mid-log,Low light	Mid-log,Medium light	Mid-log,High light	Mid-log,White light	Mid-log,Red light	Mid-log,Blue light	Strain 435	Strain 435,H2O2	Strain 435,NaCl	Strain 435,Sorbitol
Dusal.0001s00049.1 (33198829)	1.0	0.33	0.33	0.33	0.65	0.54	0.81	0.19	0.22	0.25	0.12	0.29	0.52	0.19	0.29	0.38	0.55	0.6	0.76	0.52	0.61
Dusal.0001s00052.1 (33198789)	0.32	0.25	0.19	0.29	1.0	0.98	0.74	0.33	0.26	0.29	0.18	0.31	0.26	0.19	0.39	0.44	0.53	0.53	0.63	0.61	0.62
Dusal.0013s00031.1 (33200946)	1.0	0.44	0.38	0.72	0.73	0.58	0.94	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.35	0.2	0.37	0.52	0.42	0.77	0.84	0.99	0.97
Dusal.0018s00050.1 (33187083)	0.0	0.14	0.16	0.24	1.0	0.8	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.05	0.03	0.06	0.11	0.13	0.34	0.4	0.38	0.34
Dusal.0019s00025.1 (33192535)	0.65	0.42	0.42	0.51	1.0	0.95	0.99	0.1	0.08	0.04	0.02	0.36	0.4	0.27	0.59	0.39	0.41	0.84	0.98	0.61	0.83
Dusal.0024s00052.1 (33202188)	0.47	0.39	0.4	0.35	1.0	0.89	0.5	0.1	0.12	0.09	0.12	0.22	0.32	0.16	0.2	0.18	0.25	0.47	0.6	0.49	0.5
Dusal.0036s00005.1 (33190411)	0.2	0.27	0.32	0.45	0.88	0.8	0.69	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.2	0.31	0.35	0.24	0.3	0.89	0.65	0.6	1.0
Dusal.0041s00031.1 (33194527)	0.7	0.32	0.33	0.38	1.0	0.87	0.73	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.48	0.3	0.68	0.78	0.68	0.7	0.87	0.67	0.85
Dusal.0058s00023.1 (33199375)	0.52	0.4	0.46	0.81	1.0	0.72	0.78	0.1	0.08	0.04	0.06	0.15	0.43	0.11	0.21	0.31	0.27	0.77	0.92	0.88	0.85
Dusal.0059s00014.1 (33203248)	0.54	0.22	0.21	0.23	0.79	1.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.18	0.11	0.23	0.15	0.1	0.68	0.68	0.47	0.77
Dusal.0061s00009.1 (33190670)	0.39	0.29	0.28	0.46	0.75	0.6	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.46	0.12	0.59	0.9	1.0	0.82	0.93	0.66	1.0
Dusal.0067s00021.1 (33194691)	0.61	0.38	0.38	0.43	0.96	0.93	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.54	0.35	0.65	0.71	0.55	0.78	0.94	0.6	0.93
Dusal.0073s00015.1 (33194603)	0.65	0.22	0.23	0.16	1.0	0.79	0.62	0.11	0.07	0.17	0.08	0.29	0.38	0.08	0.37	0.73	0.85	0.48	0.61	0.48	0.73
Dusal.0087s00023.1 (33189739)	0.98	0.44	0.4	0.76	0.52	0.41	1.0	0.07	0.11	0.24	0.06	0.27	0.42	0.12	0.26	0.39	0.44	0.66	0.88	0.64	0.7
Dusal.0099s00029.1 (33188813)	0.15	0.14	0.14	0.21	0.54	0.5	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.5	0.28	0.46	0.68	0.64	0.83	0.95	0.88	1.0
Dusal.0102s00015.1 (33190557)	0.29	0.4	0.4	0.27	1.0	0.91	0.59	0.03	0.03	0.03	0.11	0.19	0.21	0.11	0.39	0.33	0.26	0.51	0.46	0.19	0.48
Dusal.0102s00017.1 (33190551)	0.35	0.41	0.45	0.3	1.0	0.69	0.61	0.0	0.0	0.0	0.07	0.19	0.25	0.05	0.46	0.57	0.42	0.61	0.69	0.21	0.56
Dusal.0102s00023.1 (33190538)	0.91	0.14	0.15	0.41	0.82	0.75	0.45	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.53	0.36	0.32	0.73	0.6	0.49	0.67	1.0	0.73
Dusal.0106s00003.1 (33193494)	0.76	0.19	0.28	0.49	1.0	0.96	0.89	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.34	0.41	0.78	0.42	0.54	0.91	1.0	0.79	0.92
Dusal.0114s00003.1 (33202248)	0.57	0.44	0.54	0.26	0.74	0.68	0.59	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.24	0.11	0.33	0.12	0.2	0.6	1.0	0.36	0.76
Dusal.0119s00024.1 (33195170)	0.04	0.19	0.15	0.22	0.99	1.0	0.57	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.13	0.13	0.15	0.09	0.12	0.63	0.7	0.57	0.57
Dusal.0131s00006.1 (33186814)	0.35	0.29	0.23	0.22	1.0	0.85	0.67	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.19	0.17	0.17	0.21	0.24	0.39	0.56	0.62	0.53
Dusal.0136s00006.1 (33201612)	0.59	0.36	0.37	0.44	1.0	0.91	0.72	0.01	0.01	0.01	0.04	0.41	0.42	0.35	0.35	0.44	0.51	0.85	0.79	0.72	0.76
Dusal.0143s00001.1 (33194287)	0.06	0.18	0.14	0.28	1.0	0.84	0.52	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.12	0.08	0.08	0.14	0.21	0.4	0.49	0.42	0.52
Dusal.0166s00005.1 (33188738)	0.4	0.34	0.26	0.37	1.0	0.98	0.79	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.58	0.25	0.42	0.98	0.79	0.66	0.75	0.8	0.86
Dusal.0173s00024.1 (33191851)	0.53	0.34	0.39	0.63	0.59	0.55	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.28	0.12	0.46	0.36	0.36	0.81	0.9	0.72	0.9
Dusal.0183s00002.1 (33202622)	0.66	0.33	0.33	0.4	0.94	1.0	0.6	0.17	0.17	0.15	0.27	0.39	0.41	0.44	0.58	0.34	0.32	0.73	0.82	0.65	0.81
Dusal.0205s00007.1 (33197326)	0.25	0.3	0.27	0.2	1.0	0.91	0.54	0.01	0.01	0.02	0.06	0.26	0.35	0.27	0.32	0.31	0.37	0.72	0.81	0.46	0.55
Dusal.0208s00004.1 (33194137)	0.5	0.34	0.41	0.41	1.0	0.78	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.15	0.05	0.18	0.39	0.39	0.61	0.76	0.58	0.72
Dusal.0208s00006.1 (33194132)	0.72	0.61	0.57	0.58	1.0	0.76	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.22	0.04	0.24	0.52	0.33	0.69	0.84	0.76	0.82
Dusal.0217s00010.1 (33197550)	0.45	0.38	0.35	0.41	0.84	0.77	0.9	0.04	0.04	0.11	0.07	0.35	0.49	0.29	0.4	0.44	0.51	0.86	1.0	0.64	0.99
Dusal.0217s00015.1 (33197553)	0.57	0.26	0.24	0.28	0.58	0.47	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.67	0.15	0.28	0.51	0.96	0.7	0.83	0.6	1.0
Dusal.0226s00017.1 (33193543)	0.74	0.25	0.29	0.3	1.0	0.94	0.65	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.25	0.14	0.3	0.44	0.33	0.7	0.69	0.65	0.88
Dusal.0246s00002.1 (33197696)	1.0	0.58	0.54	0.7	0.7	0.61	0.91	0.05	0.04	0.08	0.04	0.31	0.54	0.22	0.36	0.48	0.58	0.63	0.81	0.61	0.77
Dusal.0262s00002.1 (33195655)	0.31	0.47	0.52	0.83	1.0	0.88	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.44	0.16	0.52	0.7	0.59	0.77	0.92	0.82	0.88
Dusal.0278s00002.1 (33193456)	0.55	0.38	0.42	0.6	0.87	0.8	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.55	0.6	0.52	0.57	0.47	0.56	0.82	1.0	0.87	0.82
Dusal.0338s00003.1 (33203893)	0.29	0.28	0.33	0.53	1.0	0.91	0.59	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.39	0.34	0.5	0.4	0.29	0.72	0.89	0.61	0.84
Dusal.0338s00004.1 (33203891)	0.26	0.29	0.38	0.64	0.91	0.8	0.65	0.0	0.0	0.0	0.01	0.4	0.54	0.27	0.32	0.57	0.49	0.83	1.0	0.74	0.75
Dusal.0383s00009.1 (33199473)	0.82	0.38	0.39	0.34	0.82	0.72	0.71	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.36	0.18	0.55	0.81	0.74	0.86	0.98	0.61	1.0
Dusal.0389s00003.1 (33193628)	0.85	0.44	0.45	0.39	0.88	0.78	0.7	0.0	0.01	0.01	0.02	0.39	0.42	0.12	0.64	0.83	0.73	0.78	1.0	0.68	1.0
Dusal.0427s00014.1 (33194217)	0.31	0.41	0.4	0.48	1.0	0.92	0.83	0.01	0.0	0.01	0.01	0.16	0.17	0.19	0.74	0.44	0.38	0.56	0.59	0.63	0.75
Dusal.0452s00014.1 (33191422)	0.66	0.21	0.22	0.31	1.0	0.85	0.71	0.1	0.09	0.25	0.17	0.2	0.26	0.11	0.3	0.58	0.49	0.6	0.78	0.52	0.85
Dusal.0465s00006.1 (33200556)	0.37	0.25	0.32	0.4	0.71	0.67	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.41	0.16	0.36	0.46	0.4	0.87	1.0	0.64	0.69
Dusal.0476s00005.1 (33198119)	0.09	0.08	0.11	0.17	0.73	0.59	0.48	0.01	0.01	0.01	0.01	0.4	0.42	0.17	0.39	0.49	0.56	0.57	0.79	1.0	0.83
Dusal.0511s00006.1 (33195053)	0.26	0.24	0.18	0.12	1.0	0.86	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.5	0.12	0.38	0.67	0.63	0.52	0.54	0.17	0.66
Dusal.0518s00007.1 (33194443)	0.53	0.24	0.25	0.53	1.0	0.91	0.82	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.33	0.19	0.55	0.48	0.37	0.6	0.62	0.81	0.79
Dusal.0579s00008.1 (33194030)	0.82	0.41	0.4	0.31	0.98	1.0	0.97	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.42	0.41	0.67	0.61	0.48	0.97	0.98	0.58	0.78
Dusal.0653s00005.1 (33193998)	0.69	0.51	0.5	0.72	0.79	0.9	0.98	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.34	0.31	0.43	0.46	0.36	0.93	0.96	0.86	1.0
Dusal.0659s00004.1 (33197121)	0.98	0.52	0.57	0.77	0.95	0.92	0.96	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.13	0.07	0.22	0.14	0.16	0.81	1.0	0.72	0.89
Dusal.0659s00006.1 (33197124)	0.22	0.26	0.29	0.43	1.0	0.9	0.53	0.01	0.0	0.02	0.04	0.16	0.2	0.1	0.17	0.32	0.31	0.59	0.74	0.76	0.73
Dusal.0748s00001.1 (33198070)	0.36	0.39	0.39	0.24	1.0	0.9	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.17	0.1	0.4	0.45	0.34	0.63	0.7	0.26	0.61
Dusal.0803s00004.1 (33203426)	0.81	0.46	0.51	0.52	0.69	0.64	0.74	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.19	0.13	0.56	0.45	0.44	0.93	1.0	0.42	0.79
Dusal.0808s00004.1 (33188926)	0.21	0.33	0.31	0.47	1.0	0.92	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.13	0.07	0.06	0.13	0.11	0.48	0.55	0.7	0.58
Dusal.0813s00007.1 (33201242)	0.58	0.28	0.29	0.59	1.0	0.91	0.84	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.41	0.24	0.32	0.34	0.42	0.75	0.75	0.72	0.75
Dusal.0862s00006.1 (33191519)	0.28	0.33	0.33	0.47	0.98	1.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.23	0.23	0.42	0.25	0.24	0.67	0.7	0.53	0.66
Dusal.1153s00001.1 (33189181)	1.0	0.35	0.42	0.58	0.95	0.94	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.04	0.28	0.25	0.17	0.79	0.85	0.59	0.87
Dusal.1184s00001.1 (33192421)	0.57	0.33	0.33	0.52	1.0	0.84	0.9	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.21	0.15	0.26	0.35	0.44	0.55	0.62	0.6	0.64
Dusal.1344s00001.1 (33186849)	0.69	0.49	0.4	0.41	1.0	0.83	0.77	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.44	0.43	0.44	0.84	0.48	0.85	0.97	0.79	1.0
Dusal.1675s00001.1 (33198115)	0.79	0.08	0.06	0.15	0.86	0.79	0.6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.48	0.29	0.31	0.5	0.47	0.55	0.72	1.0	0.84
Dusal.1785s00001.1 (33185632)	0.5	0.16	0.21	0.35	0.87	0.82	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.63	0.3	0.33	0.94	1.0	0.52	0.82	0.85	0.87
Dusal.3212s00001.1 (33196450)	0.98	0.42	0.33	0.57	0.62	0.55	0.84	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.1	0.05	0.28	0.38	0.36	0.59	0.72	0.9	1.0
Dusal.3328s00001.1 (33189545)	1.0	0.46	0.51	0.33	0.57	0.51	0.81	0.27	0.39	0.15	0.11	0.21	0.33	0.07	0.18	0.52	0.44	0.56	0.63	0.39	0.5
Dusal.3801s00001.1 (33195357)	0.27	0.4	0.36	0.67	1.0	0.96	0.84	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.35	0.21	0.35	0.42	0.45	0.84	0.92	0.7	0.94
Dusal.5146s00001.1 (33189050)	0.61	0.56	0.62	0.64	1.0	0.96	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.29	0.13	0.48	0.69	0.68	0.84	0.78	0.79	0.89

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)