Heatmap: Cluster_29 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	-N	2.5M NaCl,0.5h	2.5M NaCl,1h	2.5M NaCl,2h	CCAP 19/18,4.5M NaCl	CCAP 19/18,5M Glycerol	CCAP 19/3	CCAP 19/3,Log	CCAP 19/3,Log,3M NaCl,1h	CCAP 19/3,Log,3M NaCl,6h	Log	Mid-log,Low light	Mid-log,Medium light	Mid-log,High light	Mid-log,White light	Mid-log,Red light	Mid-log,Blue light	Strain 435	Strain 435,H2O2	Strain 435,NaCl	Strain 435,Sorbitol
Dusal.0001s00029.1 (33198792)	0.1	0.22	0.28	0.36	1.0	0.86	0.43	0.09	0.11	0.14	0.77	0.09	0.13	0.05	0.09	0.19	0.18	0.12	0.16	0.13	0.12
Dusal.0003s00034.1 (33187531)	0.38	0.25	0.26	0.42	1.0	0.86	0.48	0.43	0.32	0.15	0.69	0.41	0.49	0.26	0.27	0.56	0.57	0.15	0.14	0.16	0.19
Dusal.0003s00041.1 (33187521)	0.14	0.06	0.07	0.17	1.0	0.89	0.33	0.0	0.0	0.0	0.48	0.7	0.6	0.67	0.54	0.76	0.64	0.14	0.16	0.23	0.26
Dusal.0007s00018.1 (33201199)	0.41	0.05	0.06	0.17	1.0	0.77	0.39	0.0	0.01	0.01	0.35	0.15	0.21	0.08	0.18	0.37	0.38	0.08	0.14	0.13	0.12
Dusal.0007s00035.1 (33201195)	0.22	0.14	0.17	0.35	1.0	0.84	0.59	0.28	0.18	0.3	0.39	0.31	0.37	0.19	0.26	0.46	0.65	0.11	0.14	0.15	0.15
Dusal.0015s00006.1 (33190966)	0.34	0.13	0.13	0.12	0.79	0.84	0.49	0.0	0.0	0.0	0.6	0.65	0.51	0.55	0.7	0.65	1.0	0.37	0.41	0.27	0.46
Dusal.0017s00019.1 (33200511)	0.0	0.01	0.0	0.0	1.0	0.81	0.06	0.0	0.0	0.0	0.7	0.18	0.6	0.04	0.26	0.56	0.41	0.02	0.01	0.03	0.0
Dusal.0040s00019.1 (33197296)	0.37	0.07	0.07	0.05	1.0	0.84	0.62	0.29	0.21	0.23	0.61	0.29	0.33	0.28	0.42	0.52	0.51	0.14	0.14	0.06	0.08
Dusal.0050s00025.1 (33193832)	0.22	0.0	0.0	0.0	1.0	0.87	0.06	0.08	0.05	0.04	0.76	0.13	0.13	0.12	0.09	0.14	0.1	0.01	0.0	0.0	0.0
Dusal.0060s00019.1 (33186551)	0.71	0.14	0.17	0.13	1.0	0.85	0.41	0.01	0.0	0.01	0.83	0.4	0.57	0.14	0.35	0.73	0.74	0.12	0.11	0.04	0.06
Dusal.0060s00025.1 (33186541)	0.36	0.15	0.12	0.12	1.0	0.85	0.56	0.1	0.05	0.05	0.82	0.34	0.53	0.33	0.62	0.34	0.33	0.02	0.02	0.02	0.02
Dusal.0061s00031.1 (33190692)	0.19	0.05	0.06	0.17	1.0	0.85	0.27	0.18	0.16	0.3	0.3	0.17	0.38	0.18	0.17	0.24	0.16	0.19	0.18	0.32	0.18
Dusal.0068s00008.1 (33187238)	0.19	0.16	0.17	0.22	1.0	0.84	0.41	0.26	0.22	0.42	0.36	0.11	0.2	0.1	0.15	0.23	0.27	0.14	0.16	0.27	0.22
Dusal.0075s00003.1 (33201916)	0.74	0.31	0.29	0.34	1.0	0.87	0.24	0.0	0.0	0.0	0.98	0.28	0.4	0.29	0.49	0.33	0.29	0.27	0.26	0.35	0.32
Dusal.0075s00005.1 (33201905)	0.0	0.02	0.05	0.05	0.66	0.66	0.03	0.0	0.0	0.0	1.0	0.13	0.03	0.06	0.07	0.07	0.09	0.0	0.01	0.0	0.0
Dusal.0083s00013.1 (33186045)	0.82	0.22	0.19	0.12	1.0	1.0	0.17	0.34	0.16	0.27	0.49	0.17	0.18	0.15	0.41	0.28	0.36	0.42	0.41	0.13	0.38
Dusal.0093s00027.1 (33185345)	0.11	0.04	0.05	0.07	1.0	0.77	0.24	0.22	0.1	0.37	0.34	0.03	0.06	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02
Dusal.0108s00019.1 (33189542)	0.04	0.03	0.09	0.12	1.0	0.91	0.0	0.22	0.08	0.49	0.85	0.08	0.09	0.13	0.1	0.12	0.16	0.04	0.05	0.04	0.04
Dusal.0112s00002.1 (33195932)	0.53	0.04	0.03	0.04	0.97	0.71	0.65	0.09	0.08	0.03	1.0	0.17	0.43	0.06	0.18	0.45	0.39	0.02	0.03	0.02	0.01
Dusal.0118s00011.1 (33199936)	0.18	0.17	0.21	0.38	1.0	0.75	0.55	0.3	0.2	0.25	0.45	0.26	0.28	0.23	0.28	0.38	0.34	0.12	0.12	0.21	0.17
Dusal.0129s00008.1 (33194516)	0.0	0.1	0.15	0.04	1.0	0.61	0.23	0.0	0.02	0.28	0.61	0.03	0.17	0.02	0.03	0.2	0.12	0.2	0.16	0.05	0.11
Dusal.0150s00002.1 (33196069)	0.17	0.14	0.14	0.12	1.0	0.64	0.12	0.07	0.05	0.06	0.36	0.1	0.26	0.05	0.13	0.2	0.19	0.03	0.03	0.03	0.03
Dusal.0160s00013.1 (33188322)	0.14	0.09	0.13	0.19	1.0	0.85	0.13	0.13	0.02	0.07	0.42	0.32	0.37	0.32	0.29	0.31	0.29	0.11	0.18	0.17	0.2
Dusal.0169s00018.1 (33195036)	0.95	0.13	0.14	0.24	0.76	0.63	0.25	0.33	0.31	0.54	0.79	0.69	0.73	0.47	0.44	1.0	0.69	0.22	0.23	0.42	0.32
Dusal.0173s00023.1 (33191859)	1.0	0.16	0.18	0.37	0.64	0.64	0.0	0.06	0.04	0.15	0.73	0.29	0.37	0.25	0.79	0.41	0.45	0.24	0.24	0.23	0.3
Dusal.0209s00004.1 (33199682)	0.41	0.27	0.26	0.22	0.61	0.59	0.34	0.47	0.47	0.56	1.0	0.57	0.54	0.47	0.44	0.61	0.56	0.25	0.23	0.22	0.26
Dusal.0248s00017.1 (33189811)	0.19	0.04	0.03	0.05	1.0	0.7	0.45	0.01	0.03	0.01	0.56	0.12	0.31	0.1	0.04	0.07	0.07	0.07	0.13	0.11	0.09
Dusal.0252s00018.1 (33187310)	0.02	0.06	0.09	0.11	1.0	0.81	0.06	0.0	0.01	0.0	0.38	0.11	0.2	0.18	0.12	0.17	0.19	0.03	0.03	0.06	0.05
Dusal.0265s00017.1 (33188558)	0.62	0.01	0.0	0.01	0.52	0.48	0.08	0.0	0.0	0.0	1.0	0.3	0.28	0.23	0.07	0.23	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0269s00001.1 (33186342)	0.1	0.16	0.2	0.29	1.0	0.91	0.48	0.27	0.12	0.37	0.69	0.21	0.18	0.03	0.18	0.11	0.09	0.13	0.18	0.12	0.33
Dusal.0269s00011.1 (33186352)	0.42	0.0	0.01	0.0	1.0	0.82	0.64	0.02	0.12	0.06	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0280s00002.1 (33203404)	0.0	0.03	0.0	0.0	1.0	0.99	0.17	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0	0.0	0.0	0.06	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0287s00010.1 (33203094)	0.39	0.12	0.14	0.19	0.76	0.88	0.48	0.49	0.37	0.58	0.84	0.28	0.29	0.29	1.0	0.38	0.3	0.32	0.33	0.18	0.22
Dusal.0302s00005.1 (33200302)	0.78	0.03	0.0	0.06	0.73	1.0	0.16	0.27	0.1	0.06	0.87	0.11	0.0	0.08	0.07	0.0	0.0	0.08	0.08	0.02	0.12
Dusal.0305s00017.1 (33191319)	0.3	0.09	0.09	0.35	1.0	0.69	0.17	0.02	0.02	0.02	0.46	0.22	0.41	0.11	0.28	0.45	0.47	0.07	0.06	0.16	0.1
Dusal.0329s00006.1 (33198129)	0.09	0.09	0.12	0.13	1.0	0.92	0.53	0.01	0.0	0.0	0.77	0.08	0.12	0.07	0.12	0.18	0.13	0.07	0.07	0.1	0.09
Dusal.0359s00007.1 (33199881)	0.25	0.23	0.28	0.29	1.0	0.91	0.36	0.36	0.39	0.36	0.75	0.41	0.5	0.23	0.57	0.52	0.51	0.33	0.38	0.29	0.39
Dusal.0374s00006.1 (33192014)	0.29	0.12	0.14	0.23	1.0	0.79	0.33	0.07	0.07	0.06	0.63	0.13	0.24	0.07	0.12	0.31	0.28	0.16	0.16	0.19	0.17
Dusal.0380s00006.1 (33193503)	0.43	0.08	0.08	0.1	0.6	0.55	0.02	0.0	0.0	0.0	1.0	0.29	0.47	0.16	0.3	0.42	0.49	0.2	0.17	0.12	0.15
Dusal.0426s00014.1 (33189092)	0.21	0.0	0.02	0.02	0.95	1.0	0.24	0.26	0.12	0.15	0.44	0.24	0.26	0.13	0.66	0.33	0.44	0.0	0.02	0.02	0.02
Dusal.0435s00006.1 (33202528)	0.43	0.23	0.25	0.32	1.0	0.9	0.21	0.2	0.21	0.3	0.56	0.35	0.42	0.3	0.39	0.41	0.46	0.33	0.32	0.39	0.35
Dusal.0488s00002.1 (33201763)	0.45	0.17	0.18	0.1	0.72	0.66	0.0	0.04	0.12	0.03	1.0	0.13	0.24	0.06	0.29	0.31	0.52	0.03	0.01	0.03	0.02
Dusal.0505s00004.1 (33187287)	0.09	0.0	0.03	0.01	1.0	0.94	0.75	0.05	0.03	0.11	0.58	0.33	0.41	0.31	0.4	0.2	0.39	0.02	0.04	0.03	0.04
Dusal.0510s00006.1 (33200256)	0.26	0.06	0.07	0.06	0.99	1.0	0.26	0.11	0.07	0.04	0.67	0.43	0.47	0.62	0.68	0.46	0.41	0.01	0.0	0.0	0.0
Dusal.0525s00002.1 (33195725)	0.12	0.03	0.03	0.03	0.84	0.66	0.04	0.03	0.01	0.02	1.0	0.24	0.42	0.12	0.23	0.35	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0595s00011.1 (33191204)	0.5	0.19	0.19	0.24	0.71	0.5	0.1	0.03	0.02	0.02	0.86	0.21	1.0	0.13	0.29	0.78	0.8	0.03	0.03	0.07	0.03
Dusal.0669s00006.1 (33197928)	0.19	0.12	0.14	0.05	1.0	0.8	0.33	0.1	0.02	0.14	0.41	0.12	0.25	0.08	0.07	0.52	0.47	0.16	0.14	0.05	0.12
Dusal.0720s00007.1 (33198849)	0.32	0.18	0.24	0.45	1.0	0.9	0.1	0.16	0.14	0.08	0.39	0.34	0.31	0.33	0.47	0.4	0.5	0.17	0.23	0.28	0.24
Dusal.0761s00003.1 (33195878)	0.35	0.06	0.11	0.08	1.0	0.84	0.45	0.25	0.18	0.22	0.62	0.23	0.46	0.18	0.32	0.54	0.54	0.08	0.08	0.04	0.07
Dusal.0779s00008.1 (33187349)	0.0	0.02	0.04	0.03	1.0	0.75	0.05	0.0	0.03	0.01	0.43	0.05	0.05	0.01	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02
Dusal.0791s00006.1 (33196744)	0.32	0.06	0.08	0.11	0.99	1.0	0.34	0.13	0.09	0.08	0.63	0.37	0.39	0.4	0.69	0.55	0.56	0.02	0.02	0.03	0.02
Dusal.0975s00004.1 (33188984)	0.61	0.0	0.0	0.0	0.89	0.89	0.53	0.14	0.1	0.09	0.69	0.15	0.12	0.2	1.0	0.14	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.1127s00001.1 (33192976)	0.17	0.37	0.36	0.33	0.75	0.79	0.27	0.12	0.11	0.11	1.0	0.43	0.44	0.47	0.56	0.4	0.58	0.45	0.43	0.47	0.52
Dusal.1593s00002.1 (33189559)	0.61	0.03	0.06	0.07	0.8	0.65	0.55	0.18	0.14	0.07	0.73	0.39	0.45	0.48	1.0	0.38	0.44	0.01	0.02	0.01	0.03
Dusal.2740s00001.1 (33188972)	0.15	0.11	0.13	0.24	1.0	0.9	0.33	0.19	0.16	0.27	0.81	0.19	0.34	0.1	0.17	0.35	0.34	0.08	0.14	0.21	0.11

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)