Heatmap: Cluster_185 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000144.157 (tig00000144_g9151.t1)	0.62	0.4	0.38	0.55	0.51	0.48	0.71	0.59	0.35	0.21	0.16	0.24	0.27	0.29	0.34	0.36	0.33	0.61	0.45	0.32	0.09	0.77	0.41	0.11	1.0	0.65
Cpa\|evm.model.tig00000157.51 (tig00000157_g9641.t1)	0.08	0.06	0.03	0.04	0.05	0.03	0.06	0.05	0.07	0.07	0.08	0.09	0.03	0.6	0.47	0.33	0.26	0.54	0.48	0.48	0.26	0.12	0.22	0.49	0.74	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000254.62 (tig00000254_g22514.t1)	0.43	0.48	0.45	0.57	0.66	0.72	0.78	0.65	0.73	0.6	0.6	0.54	0.37	0.49	0.66	0.52	0.5	0.62	0.62	0.55	0.03	0.67	0.58	0.9	1.0	0.97
Cpa\|evm.model.tig00000293.31 (tig00000310_g23927.t1)	0.27	0.22	0.18	0.24	0.22	0.23	0.19	0.16	0.26	0.32	0.34	0.46	0.26	0.52	0.62	0.7	0.32	0.69	0.52	0.57	0.53	0.3	1.0	0.79	0.73	0.88
Cpa\|evm.model.tig00000385.10 (tig00000385_g24737.t1)	0.06	0.08	0.11	0.11	0.05	0.02	0.07	0.12	0.18	0.16	0.13	0.09	0.08	0.32	0.44	0.28	0.16	0.63	0.39	0.32	0.32	0.13	0.7	0.63	1.0	0.97
Cpa\|evm.model.tig00000385.11 (tig00000385_g24738.t1)	0.1	0.11	0.13	0.13	0.09	0.06	0.11	0.17	0.23	0.19	0.18	0.1	0.09	0.4	0.59	0.36	0.19	0.58	0.46	0.39	0.27	0.15	0.52	0.5	0.66	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000396.36 (tig00000396_g24905.t1)	0.26	0.32	0.25	0.63	0.66	0.41	0.51	0.58	0.65	0.47	0.52	0.33	0.17	0.31	0.29	0.43	0.3	0.79	0.55	0.32	0.11	0.54	0.68	0.53	1.0	0.77
Cpa\|evm.model.tig00000396.42 (tig00000396_g24911.t1)	0.43	0.39	0.41	0.55	0.56	0.53	0.66	0.67	0.58	0.57	0.52	0.48	0.44	0.39	0.3	0.5	0.38	0.49	0.5	0.36	0.08	0.73	0.62	0.42	1.0	0.72
Cpa\|evm.model.tig00000448.77 (tig00000448_g913.t1)	0.44	0.37	0.3	0.55	0.57	0.42	0.56	0.54	0.52	0.51	0.59	0.46	0.36	0.46	0.38	0.57	0.38	0.63	0.4	0.42	0.09	0.99	0.37	0.66	1.0	0.7
Cpa\|evm.model.tig00000449.3 (tig00000449_g930.t1)	0.19	0.15	0.18	0.27	0.25	0.17	0.25	0.25	0.29	0.27	0.34	0.28	0.23	0.63	0.78	0.56	0.51	0.58	0.8	0.37	0.19	0.38	0.45	0.79	1.0	0.78
Cpa\|evm.model.tig00000449.4 (tig00000449_g930.t1)	0.19	0.18	0.18	0.3	0.32	0.35	0.27	0.3	0.33	0.34	0.31	0.34	0.31	0.44	0.46	0.53	0.3	0.53	0.52	0.24	0.25	0.39	0.45	0.67	1.0	0.82
Cpa\|evm.model.tig00000470.2 (tig00000470_g1169.t1)	0.31	0.53	0.54	0.67	0.71	0.64	0.61	0.69	0.63	0.66	0.63	0.57	0.22	0.59	0.77	0.59	0.68	0.73	1.0	0.72	0.19	0.6	0.64	0.88	0.9	0.99
Cpa\|evm.model.tig00000624.4 (tig00000624_g2643.t1)	0.51	0.32	0.26	0.8	0.51	0.55	0.71	0.67	0.56	0.37	0.38	0.28	0.32	0.24	0.26	0.37	0.3	0.46	0.31	0.29	0.11	0.47	0.88	0.68	1.0	0.61
Cpa\|evm.model.tig00000663.30 (tig00000663_g2962.t1)	0.49	0.36	0.4	0.51	0.4	0.45	0.53	0.49	0.54	0.58	0.51	0.38	0.35	0.24	0.21	0.22	0.33	0.41	0.31	0.43	0.06	0.72	0.55	0.61	1.0	0.76
Cpa\|evm.model.tig00000711.6 (tig00000711_g3367.t1)	0.54	0.73	0.56	0.7	0.53	0.45	0.54	0.59	0.49	0.42	0.43	0.37	0.41	0.3	0.33	0.3	0.34	0.46	0.46	0.34	0.08	0.21	0.79	0.46	1.0	0.57
Cpa\|evm.model.tig00000806.42 (tig00000806_g4371.t1)	0.53	0.2	0.28	0.56	0.54	0.35	0.66	0.72	0.56	0.35	0.57	0.43	0.55	0.22	0.28	0.29	0.18	0.45	0.37	0.19	0.21	0.67	0.7	0.7	1.0	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000823.27 (tig00000823_g4553.t1)	0.38	0.33	0.36	0.49	0.51	0.37	0.43	0.45	0.38	0.36	0.42	0.33	0.3	0.56	0.33	0.45	0.35	0.5	0.6	0.37	0.57	0.69	0.73	0.69	1.0	0.98
Cpa\|evm.model.tig00000889.3 (tig00000889_g5290.t1)	0.37	0.24	0.26	0.46	0.37	0.4	0.47	0.44	0.38	0.34	0.36	0.29	0.2	0.41	0.36	0.33	0.36	0.43	0.47	0.37	0.04	0.37	0.55	0.61	1.0	0.76
Cpa\|evm.model.tig00000949.28 (tig00000949_g5741.t1)	0.51	0.54	0.59	0.68	0.56	0.47	0.6	0.63	0.44	0.46	0.5	0.45	0.46	0.39	0.44	0.39	0.37	0.68	0.73	0.49	0.06	0.52	0.74	0.59	0.94	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000989.49 (tig00000989_g6123.t1)	0.34	0.29	0.33	0.54	0.53	0.53	0.68	0.66	0.61	0.43	0.51	0.31	0.26	0.38	0.37	0.54	0.41	0.59	0.49	0.37	0.12	0.8	0.6	0.78	1.0	0.76
Cpa\|evm.model.tig00001029.30 (tig00001029_g6430.t2)	0.72	0.59	0.59	0.74	0.81	0.58	0.73	0.73	0.57	0.42	0.44	0.38	0.43	0.38	0.44	0.47	0.54	0.79	0.8	0.55	0.07	0.86	0.76	0.42	1.0	0.74
Cpa\|evm.model.tig00001093.14 (tig00001093_g6891.t1)	0.61	0.65	0.64	0.71	0.69	0.54	0.64	0.63	0.56	0.55	0.56	0.5	0.46	0.5	0.53	0.49	0.5	0.57	0.62	0.49	0.1	1.0	0.75	0.68	0.91	0.61
Cpa\|evm.model.tig00001249.7 (tig00001249_g7777.t1)	0.39	0.35	0.4	0.48	0.38	0.27	0.27	0.32	0.52	0.47	0.49	0.5	0.26	0.25	0.19	0.18	0.34	0.56	0.32	0.31	0.02	0.65	0.48	0.51	1.0	0.79
Cpa\|evm.model.tig00001304.14 (tig00001304_g8114.t1)	0.18	0.26	0.35	0.56	0.38	0.3	0.42	0.55	0.36	0.48	0.38	0.29	0.36	1.0	0.55	0.67	0.71	0.9	0.69	0.85	0.16	0.16	0.43	0.28	0.97	0.95
Cpa\|evm.model.tig00001333.34 (tig00001333_g8204.t1)	0.35	0.37	0.48	0.58	0.59	0.43	0.62	0.69	0.65	0.63	0.5	0.38	0.24	0.46	0.39	0.45	0.43	0.82	0.56	0.55	0.15	0.67	0.95	0.49	1.0	0.78
Cpa\|evm.model.tig00001366.22 (tig00001366_g8399.t1)	0.77	0.49	0.53	0.48	0.48	0.58	0.64	0.6	0.56	0.44	0.47	0.38	0.63	0.43	0.43	0.35	0.35	0.59	0.59	0.42	0.05	0.56	0.52	0.43	1.0	0.74
Cpa\|evm.model.tig00001415.8 (tig00001415_g8675.t1)	0.4	0.34	0.41	0.53	0.44	0.3	0.42	0.37	0.45	0.51	0.56	0.58	0.41	0.55	0.56	0.4	0.4	0.73	0.62	0.38	0.25	0.4	0.75	0.57	0.93	1.0
Cpa\|evm.model.tig00001718.3 (tig00001718_g9581.t1)	0.29	0.37	0.4	0.58	0.64	0.49	0.53	0.59	0.75	0.7	0.75	0.54	0.16	0.65	0.57	0.72	0.43	0.76	0.66	0.39	0.55	0.6	0.8	0.65	0.96	1.0
Cpa\|evm.model.tig00020537.50 (tig00020537_g10273.t1)	0.49	0.49	0.55	0.62	0.55	0.42	0.51	0.46	0.54	0.41	0.57	0.52	0.3	0.52	0.49	0.54	0.41	0.53	0.51	0.45	0.16	0.32	0.96	0.59	1.0	0.82
Cpa\|evm.model.tig00020564.41 (tig00020564_g11441.t1)	0.57	0.45	0.42	0.6	0.62	0.75	0.72	0.66	0.68	0.49	0.47	0.38	0.44	0.32	0.35	0.38	0.39	0.59	0.46	0.38	0.1	0.86	0.55	0.54	1.0	0.72
Cpa\|evm.model.tig00020675.7 (tig00020675_g12588.t1)	0.33	0.41	0.42	0.61	0.59	0.46	0.59	0.57	0.58	0.49	0.53	0.39	0.24	0.28	0.31	0.3	0.38	0.58	0.51	0.4	0.08	0.69	0.89	0.48	1.0	0.63
Cpa\|evm.model.tig00020710.121 (tig00020710_g13385.t1)	0.49	0.31	0.24	0.68	0.65	0.37	0.52	0.53	0.47	0.42	0.54	0.31	0.28	0.21	0.21	0.28	0.21	0.53	0.23	0.2	0.12	0.61	0.76	0.75	1.0	0.56
Cpa\|evm.model.tig00020723.26 (tig00020723_g13445.t1)	0.63	0.65	0.7	0.82	0.79	0.58	0.76	0.75	0.71	0.73	0.65	0.55	0.5	0.51	0.57	0.58	0.6	0.94	0.68	0.59	0.3	0.75	0.9	0.59	1.0	0.81
Cpa\|evm.model.tig00020746.11 (tig00020746_g13665.t2)	0.48	0.37	0.28	0.56	0.55	0.37	0.41	0.48	0.21	0.22	0.33	0.23	0.24	0.16	0.24	0.21	0.23	0.33	0.35	0.28	0.01	0.28	0.52	0.33	1.0	0.54
Cpa\|evm.model.tig00020780.65 (tig00020780_g13814.t1)	0.42	0.44	0.33	0.63	0.63	0.5	0.56	0.55	0.54	0.48	0.53	0.33	0.25	0.41	0.33	0.37	0.39	0.59	0.45	0.37	0.1	0.81	0.66	0.54	1.0	0.75
Cpa\|evm.model.tig00020904.127 (tig00020904_g15256.t1)	0.22	0.29	0.25	0.41	0.44	0.35	0.39	0.43	0.56	0.36	0.39	0.28	0.17	0.64	0.31	0.38	0.36	0.65	0.56	0.43	0.56	0.45	0.54	0.43	0.73	1.0
Cpa\|evm.model.tig00020961.132 (tig00020961_g16753.t1)	0.57	0.52	0.48	0.63	0.76	0.7	0.78	0.72	0.63	0.45	0.44	0.42	0.52	0.42	0.49	0.56	0.39	0.72	0.56	0.43	0.1	0.78	0.4	0.21	1.0	0.69
Cpa\|evm.model.tig00021098.38 (tig00021098_g18207.t1)	0.59	0.66	0.76	0.97	0.84	0.76	0.87	1.0	0.8	0.73	0.71	0.53	0.42	0.52	0.64	0.46	0.57	0.92	0.98	0.78	0.34	0.9	0.91	0.55	0.96	0.91
Cpa\|evm.model.tig00021217.5 (tig00021217_g19332.t1)	0.36	0.29	0.3	0.63	0.64	0.48	0.41	0.52	0.31	0.4	0.5	0.38	0.16	0.32	0.28	0.39	0.23	0.46	0.33	0.34	0.11	0.33	0.85	0.68	1.0	0.71
Cpa\|evm.model.tig00021352.19 (tig00021352_g20687.t1)	0.6	0.59	0.44	0.58	0.68	0.64	0.55	0.57	0.5	0.54	0.43	0.36	0.41	0.34	0.29	0.27	0.36	0.53	0.49	0.45	0.09	0.29	0.59	0.53	1.0	0.63
Cpa\|evm.model.tig00021374.6 (tig00021374_g21089.t1)	0.21	0.16	0.15	0.4	0.53	0.38	0.25	0.36	0.12	0.15	0.21	0.12	0.08	0.1	0.16	0.23	0.13	0.27	0.27	0.21	0.01	0.47	0.44	0.2	1.0	0.51
Cpa\|evm.model.tig00021374.7 (tig00021374_g21089.t1)	0.34	0.39	0.34	0.87	1.0	0.69	0.54	0.5	0.24	0.25	0.48	0.28	0.3	0.19	0.21	0.28	0.34	0.59	0.36	0.32	0.02	0.27	0.86	0.94	0.86	0.73
Cpa\|evm.model.tig00021433.13 (tig00021433_g21266.t1)	0.32	0.19	0.19	0.32	0.26	0.2	0.26	0.33	0.36	0.29	0.41	0.31	0.19	0.1	0.11	0.1	0.1	0.51	0.21	0.11	0.03	0.48	0.4	0.26	1.0	0.48
Cpa\|evm.model.tig00021433.20 (tig00021433_g21273.t1)	0.21	0.25	0.39	0.44	0.29	0.29	0.46	0.44	0.31	0.37	0.21	0.21	0.12	0.37	0.55	0.52	0.43	0.91	0.53	0.56	0.39	0.55	0.62	0.34	1.0	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021462.10 (tig00021462_g21575.t1)	0.62	0.49	0.35	0.37	0.36	0.28	0.37	0.41	0.48	0.54	0.48	0.36	0.48	0.38	0.32	0.31	0.29	0.73	0.38	0.24	0.03	0.74	0.53	0.42	1.0	0.64
Cpa\|evm.model.tig00021569.22 (tig00021569_g22353.t1)	0.0	0.01	0.0	0.03	0.03	0.09	0.0	0.06	0.02	0.05	0.02	0.04	0.0	0.23	0.38	0.3	0.49	0.49	0.49	0.19	0.45	0.11	0.65	0.84	0.53	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021719.18 (tig00021719_g23163.t1)	0.49	0.45	0.3	0.56	0.43	0.32	0.53	0.53	0.61	0.52	0.59	0.42	0.43	0.33	0.29	0.23	0.37	0.76	0.47	0.42	0.06	0.49	0.73	0.25	1.0	0.52
Cpa\|evm.model.tig00022075.78 (tig00022075_g23639.t1)	0.25	0.32	0.36	0.5	0.57	0.51	0.5	0.4	0.43	0.32	0.3	0.28	0.25	0.29	0.46	0.4	0.24	0.47	0.26	0.24	0.07	0.79	0.42	0.31	1.0	0.72

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)