Heatmap: Cluster_90 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
-N
2.5M NaCl,0.5h
2.5M NaCl,1h
2.5M NaCl,2h
CCAP 19/18,4.5M NaCl
CCAP 19/18,5M Glycerol
CCAP 19/3
CCAP 19/3,Log
CCAP 19/3,Log,3M NaCl,1h
CCAP 19/3,Log,3M NaCl,6h
Log
Mid-log,Low light
Mid-log,Medium light
Mid-log,High light
Mid-log,White light
Mid-log,Red light
Mid-log,Blue light
Strain 435
Strain 435,H2O2
Strain 435,NaCl
Strain 435,Sorbitol
Dusal.0002s00017.1 (33187957)
0.09 0.39 0.37 0.52 0.6 0.66 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 1.0 1.0 0.87 0.43 0.44 0.4 0.42 0.52 0.44
Dusal.0004s00012.1 (33201075)
0.26 0.12 0.12 0.07 0.37 0.37 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.51 0.93 0.88 0.75 1.0 0.26 0.33 0.41 0.36
Dusal.0004s00045.1 (33201039)
0.59 0.16 0.12 0.07 0.48 0.49 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.65 0.85 0.56 0.59 0.66 0.5 0.56 0.44 0.41
Dusal.0005s00005.1 (33196949)
0.21 0.04 0.03 0.01 0.19 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.85 0.94 0.79 0.53 0.91 0.05 0.06 0.09 0.05
Dusal.0011s00014.1 (33192185)
0.71 0.0 0.0 0.0 0.09 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.75 0.86 0.88 1.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0018s00015.1 (33187086)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.55 1.0 0.79 0.43 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0024s00003.1 (33202176)
0.25 0.04 0.07 0.11 0.48 0.48 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.56 0.99 0.62 0.34 0.55 0.13 0.16 0.21 0.18
Dusal.0027s00024.1 (33191532)
0.28 0.03 0.04 0.02 0.36 0.36 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.77 0.78 0.66 0.62 0.65 0.09 0.07 0.05 0.06
Dusal.0027s00036.1 (33191550)
0.36 0.05 0.05 0.07 0.29 0.3 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.74 0.88 0.55 0.55 0.54 0.11 0.1 0.1 0.13
Dusal.0028s00027.1 (33198449)
0.7 0.1 0.09 0.09 0.4 0.36 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.88 0.69 0.56 0.57 0.51 0.16 0.23 0.08 0.12
Dusal.0030s00016.1 (33195324)
0.32 0.01 0.01 0.01 0.04 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.65 0.77 1.0 0.48 0.53 0.01 0.02 0.01 0.01
Dusal.0033s00011.1 (33202510)
0.69 0.27 0.3 0.5 0.65 0.54 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.89 0.82 0.59 0.64 0.89 0.38 0.43 0.57 0.41
Dusal.0036s00026.1 (33190413)
0.24 0.0 0.0 0.0 0.14 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.67 1.0 0.71 0.57 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0065s00010.1 (33185859)
0.15 0.0 0.0 0.0 0.2 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.55 1.0 0.96 0.67 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0070s00028.1 (33189340)
0.44 0.03 0.03 0.07 0.3 0.28 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.67 0.51 0.46 0.45 0.54 0.04 0.05 0.05 0.05
Dusal.0076s00012.1 (33195213)
0.09 0.0 0.0 0.0 0.34 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.47 0.97 1.0 0.28 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0077s00012.1 (33192473)
0.21 0.28 0.43 0.58 0.61 0.55 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.79 0.84 0.7 0.57 0.83 0.45 0.58 0.56 0.46
Dusal.0096s00001.1 (33195813)
0.19 0.12 0.15 0.18 0.53 0.47 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.71 0.84 0.72 0.51 0.74 0.05 0.05 0.1 0.07
Dusal.0096s00014.1 (33195819)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.58 1.0 0.69 0.54 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0097s00003.1 (33203719)
1.0 0.08 0.09 0.07 0.38 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.73 0.67 0.91 0.69 0.62 0.03 0.03 0.02 0.04
Dusal.0101s00027.1 (33199195)
0.56 0.2 0.2 0.25 0.38 0.38 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.84 1.0 0.71 0.62 0.75 0.25 0.25 0.16 0.25
Dusal.0121s00021.1 (33195088)
0.36 0.11 0.1 0.06 0.23 0.22 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.44 1.0 0.41 0.35 0.61 0.23 0.29 0.38 0.26
Dusal.0155s00006.1 (33194764)
0.61 0.06 0.07 0.03 0.35 0.28 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.45 1.0 0.54 0.33 0.55 0.3 0.46 0.3 0.27
Dusal.0175s00003.1 (33199721)
0.35 0.41 0.38 0.33 0.64 0.61 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 1.0 0.95 0.89 0.65 0.58 0.31 0.32 0.47 0.37
Dusal.0220s00008.1 (33187174)
0.2 0.21 0.18 0.2 0.56 0.52 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 1.0 0.99 0.39 0.45 0.71 0.53 0.47 0.5 0.57
Dusal.0244s00007.1 (33186506)
0.46 0.3 0.28 0.24 0.49 0.5 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.98 0.76 0.83 0.81 0.94 0.17 0.2 0.18 0.23
Dusal.0245s00001.1 (33192633)
0.07 0.02 0.02 0.1 0.33 0.35 0.18 0.0 0.0 0.0 0.01 0.84 1.0 0.55 0.56 0.62 0.65 0.09 0.09 0.13 0.09
Dusal.0272s00005.1 (33196433)
0.55 0.13 0.17 0.28 0.36 0.36 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 1.0 0.7 0.48 0.49 0.52 0.13 0.09 0.2 0.1
Dusal.0277s00001.1 (33188132)
0.03 0.0 0.0 0.0 0.16 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.56 1.0 0.91 0.43 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0282s00010.1 (33199287)
0.52 0.16 0.1 0.16 0.56 0.56 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.61 0.38 0.52 1.0 0.93 0.35 0.32 0.4 0.26
Dusal.0298s00002.1 (33203588)
0.8 0.09 0.08 0.04 0.65 0.62 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.6 0.26 0.47 0.78 1.0 0.28 0.31 0.52 0.57
Dusal.0310s00001.1 (33193433)
0.53 0.07 0.05 0.06 0.34 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.54 0.52 1.0 0.6 0.64 0.14 0.09 0.08 0.1
Dusal.0319s00013.1 (33201933)
0.63 0.07 0.07 0.02 0.4 0.38 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.53 1.0 0.35 0.33 0.48 0.14 0.17 0.13 0.16
Dusal.0338s00002.1 (33203900)
0.99 0.0 0.0 0.0 0.12 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.58 0.72 1.0 0.74 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0347s00009.1 (33190079)
0.62 0.0 0.0 0.0 0.22 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.58 0.78 1.0 0.59 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0347s00013.1 (33190077)
0.98 0.02 0.02 0.05 0.33 0.35 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.64 0.7 0.78 0.83 1.0 0.16 0.15 0.24 0.28
Dusal.0351s00006.1 (33194404)
0.37 0.05 0.07 0.03 0.53 0.52 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.71 0.94 0.65 0.32 0.42 0.27 0.24 0.12 0.26
Dusal.0353s00008.1 (33185589)
0.53 0.08 0.09 0.05 0.35 0.35 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.45 0.98 0.63 0.58 0.88 0.4 0.51 0.58 0.4
Dusal.0358s00017.1 (33203375)
0.2 0.07 0.06 0.05 0.15 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.85 1.0 1.0 0.75 0.81 0.17 0.22 0.13 0.13
Dusal.0363s00011.1 (33186887)
0.86 0.12 0.11 0.18 0.32 0.35 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.68 0.91 1.0 0.89 0.9 0.18 0.19 0.18 0.21
Dusal.0364s00013.1 (33192091)
1.0 0.22 0.16 0.06 0.44 0.35 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.53 0.74 0.55 0.48 0.58 0.33 0.4 0.35 0.4
Dusal.0372s00009.1 (33200481)
0.21 0.0 0.0 0.0 0.22 0.16 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.51 0.64 1.0 0.5 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0386s00011.1 (33191481)
0.21 0.04 0.05 0.12 0.26 0.27 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 1.0 0.68 0.46 0.48 0.38 0.04 0.04 0.06 0.05
Dusal.0395s00002.1 (33190052)
0.04 0.04 0.04 0.11 0.37 0.38 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.76 0.64 0.93 1.0 0.95 0.08 0.08 0.15 0.12
Dusal.0402s00008.1 (33196866)
0.36 0.3 0.29 0.33 0.49 0.46 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.79 1.0 0.38 0.54 0.7 0.26 0.28 0.39 0.34
Dusal.0413s00005.1 (33191115)
0.93 0.16 0.17 0.2 0.48 0.51 0.12 0.32 0.29 0.39 0.21 1.0 0.68 0.68 1.0 0.93 0.82 0.36 0.32 0.35 0.31
Dusal.0418s00003.1 (33188108)
0.05 0.0 0.0 0.0 0.1 0.08 0.0 0.11 0.08 0.06 0.03 0.77 0.66 0.66 1.0 0.84 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0423s00009.1 (33192034)
0.44 0.15 0.2 0.41 0.47 0.42 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 1.0 0.74 0.27 0.43 0.35 0.1 0.1 0.2 0.11
Dusal.0467s00022.1 (33194487)
0.16 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.75 0.76 0.81 0.4 0.7 0.01 0.01 0.02 0.02
Dusal.0478s00003.1 (33189903)
0.17 0.0 0.0 0.0 0.12 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.37 1.0 0.63 0.38 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0489s00012.1 (33192709)
0.52 0.0 0.0 0.0 0.39 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.56 0.69 1.0 0.54 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0507s00013.1 (33195950)
0.74 0.0 0.0 0.0 0.18 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.46 0.56 1.0 0.6 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0517s00001.1 (33199337)
0.41 0.13 0.1 0.05 0.2 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.57 1.0 0.76 0.52 0.84 0.38 0.47 0.42 0.43
Dusal.0517s00004.1 (33199332)
0.16 0.02 0.03 0.06 0.22 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.49 0.47 1.0 0.85 0.7 0.07 0.08 0.1 0.08
Dusal.0576s00002.1 (33196161)
0.63 0.16 0.13 0.07 0.33 0.34 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.56 1.0 0.54 0.38 0.51 0.4 0.45 0.46 0.4
Dusal.0588s00007.1 (33195779)
0.86 0.11 0.11 0.07 0.32 0.34 0.02 0.11 0.11 0.28 0.16 0.64 0.44 0.69 0.67 0.64 1.0 0.14 0.14 0.08 0.12
Dusal.0636s00006.1 (33193075)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.67 0.79 1.0 0.45 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0649s00008.1 (33200320)
0.28 0.07 0.05 0.06 0.27 0.27 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.91 1.0 0.82 0.52 0.82 0.3 0.36 0.2 0.29
Dusal.0705s00005.1 (33186294)
0.74 0.09 0.09 0.1 0.44 0.46 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.9 0.67 1.0 0.97 0.88 0.16 0.17 0.14 0.2
Dusal.0784s00004.1 (33199593)
0.19 0.05 0.07 0.1 0.68 0.77 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.88 0.99 0.4 0.29 1.0 0.47 0.57 0.46 0.63
Dusal.0827s00001.1 (33193375)
0.2 0.0 0.0 0.0 0.23 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.36 1.0 0.91 0.65 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0897s00005.1 (33189698)
0.61 0.0 0.0 0.0 0.19 0.2 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.46 1.0 0.86 0.73 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0911s00005.1 (33191405)
0.54 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.61 1.0 0.9 0.65 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.1312s00001.1 (33195605)
0.22 0.23 0.23 0.42 0.57 0.52 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 1.0 0.99 0.26 0.59 0.65 0.07 0.08 0.19 0.1
Dusal.1328s00001.1 (33201794)
0.18 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.81 1.0 0.73 0.64 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.1346s00004.1 (33194940)
0.62 0.0 0.0 0.0 0.12 0.11 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.6 1.0 0.64 0.51 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.1508s00001.1 (33198265)
0.06 0.0 0.0 0.0 0.09 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.53 1.0 0.7 0.22 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.2257s00001.1 (33192731)
0.46 0.0 0.0 0.0 0.31 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.65 1.0 0.69 0.54 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.2300s00001.1 (33190840)
0.35 0.0 0.0 0.0 0.51 0.44 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.52 0.58 1.0 0.04 0.75 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.2303s00001.1 (33202413)
0.22 0.21 0.2 0.35 0.6 0.56 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.78 1.0 0.64 0.43 0.63 0.18 0.24 0.39 0.3
Dusal.2364s00001.1 (33201510)
0.06 0.0 0.0 0.0 0.27 0.27 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 1.0 0.69 0.51 0.5 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.2543s00001.1 (33197679)
0.46 0.06 0.06 0.02 0.49 0.53 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.46 0.46 0.56 0.8 1.0 0.38 0.41 0.46 0.4
Dusal.3004s00001.1 (33192821)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.53 1.0 0.75 0.41 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.3014s00001.1 (33192642)
0.86 0.11 0.09 0.06 0.59 0.41 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.8 0.84 0.33 0.68 0.85 0.31 0.47 0.54 0.39
Dusal.3059s00001.1 (33196640)
0.18 0.27 0.18 0.19 0.37 0.39 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.91 0.81 1.0 0.88 0.87 0.16 0.16 0.13 0.22
Dusal.3597s00001.1 (33188484)
0.08 0.15 0.19 0.13 0.33 0.32 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.64 1.0 0.66 0.5 0.78 0.2 0.25 0.35 0.29
Dusal.4122s00001.1 (33187732)
0.52 0.24 0.15 0.23 0.1 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.82 0.94 0.62 0.45 0.66 0.31 0.19 0.33 0.29
Dusal.4732s00001.1 (33200912)
0.14 0.0 0.0 0.0 0.16 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.88 0.96 1.0 0.85 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)