Heatmap: Cluster_25 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	-N	2.5M NaCl,0.5h	2.5M NaCl,1h	2.5M NaCl,2h	CCAP 19/18,4.5M NaCl	CCAP 19/18,5M Glycerol	CCAP 19/3	CCAP 19/3,Log	CCAP 19/3,Log,3M NaCl,1h	CCAP 19/3,Log,3M NaCl,6h	Log	Mid-log,Low light	Mid-log,Medium light	Mid-log,High light	Mid-log,White light	Mid-log,Red light	Mid-log,Blue light	Strain 435	Strain 435,H2O2	Strain 435,NaCl	Strain 435,Sorbitol
Dusal.0003s00046.1 (33187524)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.98	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0018s00033.1 (33187075)	0.77	0.37	0.43	0.82	0.63	0.56	1.0	0.22	0.21	0.24	0.07	0.32	0.43	0.19	0.18	0.66	0.5	0.31	0.35	0.52	0.33
Dusal.0022s00021.1 (33193883)	0.43	0.0	0.0	0.0	0.65	0.65	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	0.33	1.0	0.44	0.49	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0029s00029.1 (33203776)	0.06	0.03	0.03	0.02	1.0	0.84	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.08	0.04	0.13	0.2	0.14	0.07	0.07	0.03	0.06
Dusal.0029s00044.1 (33203736)	0.24	0.32	0.31	0.75	1.0	0.87	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.49	0.19	0.12	0.24	0.32	0.46	0.44	0.74	0.56
Dusal.0035s00015.1 (33196657)	1.0	0.18	0.19	0.09	0.33	0.32	0.5	0.1	0.07	0.11	0.12	0.43	0.25	0.43	0.58	0.43	0.5	0.3	0.38	0.37	0.42
Dusal.0036s00020.1 (33190422)	0.3	0.04	0.05	0.16	1.0	0.86	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.44	0.22	0.38	0.35	0.36	0.06	0.07	0.12	0.09
Dusal.0048s00016.1 (33189491)	0.66	0.17	0.34	0.78	1.0	0.84	0.21	0.18	0.23	0.14	0.15	0.26	0.44	0.41	0.17	0.34	0.35	0.13	0.11	0.27	0.13
Dusal.0070s00011.1 (33189345)	0.42	0.05	0.05	0.13	1.0	0.9	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.48	0.18	0.2	0.3	0.26	0.02	0.01	0.03	0.03
Dusal.0073s00033.1 (33194598)	0.72	0.23	0.29	0.42	0.75	0.65	0.27	0.01	0.01	0.01	0.01	0.81	1.0	0.47	0.59	0.78	0.7	0.33	0.36	0.36	0.39
Dusal.0078s00023.1 (33203800)	0.94	0.0	0.0	0.0	0.76	0.6	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.71	0.78	0.35	0.45	0.86	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0079s00015.1 (33199427)	1.0	0.27	0.29	0.34	0.5	0.51	0.6	0.17	0.15	0.22	0.23	0.67	0.61	0.66	0.82	0.58	0.66	0.32	0.35	0.27	0.33
Dusal.0095s00036.1 (33190272)	0.53	0.06	0.06	0.08	0.66	0.51	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.66	0.27	0.12	1.0	0.94	0.02	0.03	0.04	0.02
Dusal.0109s00009.1 (33202367)	0.07	0.08	0.06	0.09	1.0	0.88	0.2	0.01	0.0	0.0	0.0	0.05	0.11	0.03	0.04	0.17	0.13	0.06	0.07	0.06	0.08
Dusal.0142s00012.1 (33187903)	0.02	0.01	0.01	0.03	1.0	0.82	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01
Dusal.0142s00013.1 (33187894)	0.01	0.0	0.0	0.0	1.0	0.65	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0144s00017.1 (33198186)	0.96	0.18	0.21	0.38	1.0	0.92	0.55	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.43	0.24	0.9	0.34	0.46	0.37	0.39	0.52	0.44
Dusal.0173s00020.1 (33191840)	0.68	0.14	0.12	0.09	1.0	0.94	0.53	0.21	0.2	0.23	0.22	0.47	0.69	0.38	0.83	0.78	0.68	0.46	0.52	0.17	0.29
Dusal.0182s00003.1 (33203871)	0.62	0.14	0.12	0.06	1.0	0.74	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.37	0.11	0.08	0.1	0.18	0.04	0.06	0.03	0.04
Dusal.0191s00007.1 (33186455)	0.5	0.04	0.1	0.22	1.0	0.84	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.75	0.79	0.29	0.4	0.73	0.61	0.02	0.02	0.03	0.01
Dusal.0196s00015.1 (33200614)	0.52	0.21	0.23	0.72	0.92	0.8	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.25	0.09	0.26	0.68	0.31	0.68	0.7	1.0	0.97
Dusal.0204s00001.1 (33199774)	0.49	0.44	0.46	0.63	1.0	0.83	0.73	0.04	0.07	0.06	0.08	0.36	0.49	0.32	0.43	0.48	0.57	0.34	0.39	0.44	0.37
Dusal.0205s00008.1 (33197336)	0.16	0.1	0.17	0.26	1.0	0.92	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.55	0.51	0.3	0.86	0.93	0.75	0.12	0.12	0.13	0.13
Dusal.0221s00003.1 (33197579)	0.59	0.16	0.18	0.27	0.94	0.85	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.56	0.4	0.62	0.94	1.0	0.23	0.31	0.31	0.35
Dusal.0233s00019.1 (33196202)	0.49	0.26	0.22	0.22	0.66	0.7	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.67	0.64	0.85	1.0	0.63	0.68	0.39	0.43	0.36	0.4
Dusal.0241s00003.1 (33190233)	0.32	0.23	0.29	0.55	0.43	0.4	0.07	0.24	0.17	0.24	0.08	0.49	1.0	0.38	0.42	0.52	0.51	0.28	0.33	0.72	0.39
Dusal.0250s00013.1 (33198083)	0.25	0.22	0.19	0.3	0.51	0.47	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.65	0.66	0.5	1.0	0.87	0.74	0.5	0.53	0.52	0.6
Dusal.0250s00020.1 (33198094)	0.92	0.11	0.1	0.09	0.41	0.37	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.3	0.32	0.62	0.75	1.0	0.13	0.14	0.07	0.12
Dusal.0260s00021.1 (33185472)	0.2	0.27	0.27	0.34	1.0	0.86	0.26	0.07	0.08	0.2	0.11	0.08	0.2	0.05	0.01	0.01	0.02	0.12	0.16	0.44	0.16
Dusal.0261s00013.1 (33200527)	1.0	0.06	0.05	0.03	0.35	0.34	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.32	0.32	0.48	0.5	0.64	0.08	0.09	0.06	0.07
Dusal.0263s00012.1 (33192433)	0.5	0.13	0.14	0.2	1.0	0.98	0.25	0.09	0.05	0.1	0.06	0.41	0.5	0.42	0.4	0.5	0.56	0.27	0.31	0.34	0.38
Dusal.0277s00002.1 (33188112)	0.33	0.4	0.42	0.5	1.0	0.86	0.55	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.43	0.12	0.34	0.47	0.43	0.44	0.48	0.55	0.48
Dusal.0299s00006.1 (33185773)	0.7	0.18	0.19	0.18	0.96	0.96	0.34	0.2	0.19	0.11	0.33	0.95	1.0	0.83	0.77	0.8	0.82	0.05	0.06	0.11	0.05
Dusal.0317s00010.1 (33192301)	0.33	0.3	0.28	0.55	1.0	0.92	0.33	0.02	0.01	0.02	0.0	0.64	0.63	0.43	0.44	0.62	0.63	0.22	0.22	0.28	0.23
Dusal.0320s00011.1 (33189563)	0.11	0.37	0.33	0.17	0.34	0.37	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.34	0.22	0.89	1.0	0.54	0.71	0.58	0.26	0.39
Dusal.0334s00012.1 (33189149)	0.7	0.24	0.21	0.44	1.0	0.72	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.95	0.23	0.33	0.37	0.37	0.1	0.1	0.47	0.21
Dusal.0343s00019.1 (33185606)	0.58	0.12	0.15	0.4	0.64	0.55	0.85	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.45	0.12	0.36	0.99	1.0	0.42	0.54	0.52	0.59
Dusal.0345s00012.1 (33198544)	1.0	0.12	0.13	0.13	0.68	0.58	0.49	0.14	0.1	0.22	0.05	0.29	0.33	0.13	0.22	0.58	0.54	0.14	0.18	0.26	0.24
Dusal.0352s00011.1 (33191237)	1.0	0.27	0.32	0.54	0.57	0.47	0.21	0.12	0.15	0.25	0.1	0.23	0.33	0.15	0.24	0.32	0.31	0.23	0.25	0.29	0.22
Dusal.0372s00003.1 (33200475)	0.85	0.25	0.26	0.32	1.0	0.94	0.86	0.07	0.1	0.17	0.03	0.58	0.77	0.46	0.31	0.5	0.54	0.36	0.44	0.51	0.47
Dusal.0379s00012.1 (33191220)	1.0	0.33	0.33	0.58	0.64	0.57	0.21	0.11	0.12	0.17	0.09	0.19	0.29	0.11	0.31	0.4	0.42	0.39	0.41	0.42	0.43
Dusal.0390s00005.1 (33199536)	0.95	0.26	0.26	0.15	0.67	0.54	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.79	0.54	0.64	0.49	0.67	1.0	0.57	0.81	0.84	0.79
Dusal.0398s00006.1 (33187705)	0.18	0.03	0.03	0.08	1.0	0.66	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.12	0.04	0.15	0.17	0.22	0.02	0.02	0.06	0.02
Dusal.0431s00003.1 (33195516)	0.4	0.06	0.06	0.02	1.0	0.83	0.08	0.1	0.07	0.02	0.05	0.07	0.09	0.06	0.12	0.14	0.17	0.01	0.02	0.01	0.02
Dusal.0459s00001.1 (33201724)	0.28	0.0	0.0	0.0	0.93	1.0	0.6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.67	0.69	0.63	0.45	0.44	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0498s00003.1 (33193563)	0.33	0.4	0.43	0.52	0.58	0.5	0.41	0.11	0.11	0.2	0.13	0.27	0.31	0.2	0.41	0.72	0.43	1.0	0.94	0.83	0.98
Dusal.0498s00011.1 (33193568)	0.01	0.27	0.28	0.15	0.34	0.36	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.01	0.04	0.03	0.06	0.09	0.89	0.86	0.41	1.0
Dusal.0506s00009.1 (33191795)	0.46	0.16	0.12	0.16	0.92	0.99	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.29	0.29	1.0	0.82	0.45	0.61	0.55	0.3	0.52
Dusal.0526s00006.1 (33187850)	0.58	0.0	0.0	0.0	0.3	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.37	0.22	0.13	0.43	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0541s00008.1 (33201777)	0.53	0.01	0.01	0.0	1.0	0.81	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.29	0.19	0.1	0.27	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0574s00010.1 (33187463)	0.5	0.43	0.42	0.33	1.0	0.92	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.35	0.39	0.17	0.28	0.45	0.22	0.19	0.16	0.25
Dusal.0597s00007.1 (33201525)	0.59	0.19	0.18	0.12	1.0	0.89	0.31	0.36	0.33	0.19	0.05	0.5	0.76	0.45	0.35	0.56	0.6	0.1	0.11	0.12	0.12
Dusal.0621s00012.1 (33197912)	0.17	0.05	0.07	0.11	1.0	0.81	0.52	0.07	0.11	0.08	0.09	0.11	0.16	0.05	0.08	0.19	0.17	0.04	0.08	0.05	0.07
Dusal.0622s00003.1 (33200098)	0.33	0.22	0.22	0.32	1.0	1.0	0.66	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.47	0.44	0.5	0.43	0.45	0.27	0.27	0.4	0.32
Dusal.0641s00015.1 (33186228)	0.03	0.0	0.0	0.0	0.77	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.35	0.16	0.21	1.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0652s00004.1 (33198103)	0.55	0.13	0.13	0.11	1.0	0.95	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.29	0.16	0.43	0.39	0.39	0.25	0.27	0.12	0.16
Dusal.0657s00003.1 (33197634)	0.4	0.09	0.08	0.03	0.33	0.33	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.17	0.29	0.12	0.18	0.28	0.11	0.13	0.13	0.15
Dusal.0671s00011.1 (33199980)	1.0	0.27	0.32	0.54	0.47	0.44	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.97	0.96	0.73	0.59	0.48	0.54	0.48	0.5	0.85	0.62
Dusal.0680s00003.1 (33198154)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0686s00002.1 (33191473)	1.0	0.33	0.39	0.36	0.49	0.27	0.21	0.32	0.24	0.3	0.14	0.1	0.21	0.02	0.2	0.44	0.45	0.11	0.17	0.25	0.21
Dusal.0721s00001.1 (33203172)	0.49	0.15	0.17	0.33	0.68	0.62	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.41	0.34	0.42	0.39	0.44	0.74	0.83	1.0	0.89
Dusal.0748s00002.1 (33198072)	0.05	0.01	0.01	0.01	1.0	0.85	0.11	0.09	0.06	0.02	0.07	0.12	0.13	0.13	0.2	0.21	0.2	0.0	0.01	0.0	0.0
Dusal.0760s00004.1 (33190088)	0.51	0.2	0.22	0.31	1.0	0.9	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.46	0.41	0.48	0.54	0.58	0.16	0.19	0.24	0.2
Dusal.0789s00001.1 (33200238)	1.0	0.07	0.07	0.12	0.76	0.7	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.45	0.25	0.2	0.28	0.23	0.11	0.12	0.17	0.13
Dusal.0834s00005.1 (33188580)	0.25	0.07	0.06	0.05	1.0	0.98	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.48	0.26	0.63	0.6	0.32	0.17	0.18	0.14	0.19
Dusal.0847s00003.1 (33203922)	0.16	0.03	0.06	0.11	0.39	0.34	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.8	0.36	1.0	0.24	0.24	0.51	0.07	0.1	0.23	0.11
Dusal.0928s00001.1 (33199831)	0.58	0.19	0.19	0.33	0.99	1.0	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.69	0.42	0.81	0.62	0.61	0.67	0.77	0.43	0.67
Dusal.1015s00003.1 (33195119)	0.47	0.24	0.28	0.71	1.0	0.69	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.22	0.09	0.27	0.47	0.54	0.08	0.06	0.18	0.11
Dusal.1051s00003.1 (33185538)	0.5	0.0	0.0	0.0	0.75	0.56	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.66	0.42	0.06	0.6	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.1140s00003.1 (33194949)	0.73	0.05	0.06	0.04	1.0	0.77	0.33	0.0	0.0	0.0	0.01	0.75	0.71	0.76	0.49	0.44	0.51	0.02	0.02	0.03	0.03
Dusal.1321s00001.1 (33202024)	0.36	0.34	0.37	0.67	0.69	0.59	0.33	0.1	0.08	0.05	0.37	0.21	0.23	0.16	0.46	0.54	0.5	0.66	0.76	1.0	0.75
Dusal.1390s00002.1 (33199244)	0.82	0.35	0.33	0.55	0.61	0.5	0.43	0.11	0.12	0.22	0.07	0.16	0.3	0.1	0.2	0.28	0.36	0.64	0.77	1.0	0.93
Dusal.1430s00003.1 (33193069)	0.29	0.22	0.26	0.76	1.0	0.79	0.27	0.04	0.03	0.03	0.04	0.27	0.37	0.14	0.24	0.41	0.42	0.22	0.19	0.34	0.28
Dusal.1445s00001.1 (33200826)	0.0	0.08	0.07	0.05	0.35	0.39	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.15	0.11	1.0	0.56	0.24	0.15	0.13	0.06	0.13

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)