Heatmap: Cluster_160 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000056.20 (tig00000056_g24052.t2)	0.32	0.24	0.28	0.6	0.56	0.43	0.56	0.44	0.52	0.71	0.93	1.0	0.45	0.02	0.0	0.04	0.0	0.18	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03
Cpa\|evm.model.tig00000056.24 (tig00000056_g24070.t1)	0.29	0.29	0.49	0.53	0.62	0.66	0.73	0.75	0.92	0.72	0.79	1.0	0.38	0.5	0.33	0.49	0.32	0.46	0.36	0.39	0.07	0.24	0.25	0.36	0.19	0.36
Cpa\|evm.model.tig00000076.57 (tig00000076_g2357.t1)	0.39	0.38	0.52	0.6	0.63	0.69	0.84	0.85	1.0	0.84	0.69	0.62	0.55	0.73	0.52	0.77	0.46	0.78	0.5	0.48	0.07	0.92	0.4	0.34	0.46	0.59
Cpa\|evm.model.tig00000113.99 (tig00000113_g5681.t1)	0.39	0.48	0.52	0.4	0.81	0.46	0.47	0.42	0.2	0.47	0.74	0.95	1.0	0.16	0.24	0.26	0.24	0.17	0.13	0.25	0.0	0.0	0.01	0.12	0.01	0.16
Cpa\|evm.model.tig00000133.7 (tig00000269_g23700.t2)	0.14	0.44	0.42	0.52	0.65	0.71	1.0	0.78	0.62	0.8	0.88	0.91	0.75	0.48	0.19	0.51	0.19	0.64	0.37	0.3	0.1	0.57	0.65	0.35	0.71	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000158.114 (tig00000158_g10215.t1)	0.76	0.68	0.55	0.55	0.64	0.56	0.73	0.81	0.98	0.87	1.0	0.95	0.82	0.75	0.84	0.71	0.34	0.46	0.41	0.35	0.09	0.27	0.4	0.66	0.63	0.53
Cpa\|evm.model.tig00000158.40 (tig00000158_g10152.t1)	0.06	0.0	0.0	0.29	0.0	0.15	0.46	0.27	0.45	0.95	1.0	0.54	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.09	0.06	0.22	0.0	0.18	0.06	0.2	0.24	0.05
Cpa\|evm.model.tig00000158.69 (tig00000158_g10175.t1)	0.42	0.44	0.49	0.68	0.9	1.0	0.89	0.79	0.97	0.88	0.81	0.91	0.61	0.7	0.59	0.65	0.48	0.58	0.48	0.59	0.09	0.5	0.43	0.5	0.5	0.7
Cpa\|evm.model.tig00000189.47 (tig00000189_g14345.t1)	0.5	0.22	0.22	0.19	0.43	0.66	0.78	0.92	0.62	1.0	0.9	0.92	0.87	0.39	0.25	0.21	0.28	0.31	0.25	0.23	0.01	0.06	0.82	0.33	0.59	0.34
Cpa\|evm.model.tig00000190.58 (tig00000190_g13875.t1)	0.52	0.48	0.71	0.67	0.97	0.72	0.87	0.81	1.0	0.91	0.95	0.94	0.69	0.78	0.47	0.91	0.51	0.6	0.51	0.48	0.05	0.45	0.47	0.22	0.17	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000215.122 (tig00000215_g18664.t1)	0.55	0.3	0.25	0.4	0.47	0.47	0.74	0.57	0.91	0.82	0.99	1.0	0.69	0.34	0.38	0.42	0.38	0.45	0.3	0.18	0.07	0.51	0.5	0.38	0.64	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000215.70 (tig00000215_g18607.t1)	0.55	0.59	0.57	0.79	0.58	0.56	0.57	0.44	0.53	0.54	0.67	0.9	1.0	0.32	0.37	0.3	0.17	0.11	0.19	0.28	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.08
Cpa\|evm.model.tig00000219.27 (tig00000219_g19467.t1)	0.52	0.5	0.55	0.51	0.64	0.65	0.76	0.77	0.88	0.99	0.94	1.0	0.63	0.83	0.69	0.7	0.57	0.57	0.44	0.6	0.27	0.54	0.64	0.43	0.71	0.6
Cpa\|evm.model.tig00000269.33 (tig00000269_g23690.t1)	0.73	0.47	0.41	0.81	0.68	0.36	0.39	0.55	0.71	0.82	0.67	0.82	1.0	0.17	0.1	0.08	0.03	0.18	0.3	0.14	0.05	0.13	0.4	0.15	0.32	0.2
Cpa\|evm.model.tig00000269.69 (tig00000269_g23730.t1)	0.51	0.39	0.47	0.65	0.56	0.69	0.84	0.68	0.72	0.91	0.97	1.0	0.81	0.74	0.13	0.59	0.13	0.88	0.27	0.25	0.19	0.72	0.82	0.28	0.74	0.5
Cpa\|evm.model.tig00000369.5 (tig00000369_g24604.t1)	0.62	0.32	0.21	0.34	0.63	0.24	0.43	0.51	0.6	0.9	1.0	0.75	0.67	0.07	0.17	0.21	0.18	0.26	0.47	0.25	0.08	0.23	0.43	0.43	0.3	0.24
Cpa\|evm.model.tig00000382.37 (tig00000382_g24570.t1)	0.83	0.96	0.74	0.77	0.62	0.66	0.83	1.0	0.94	0.88	0.94	0.78	0.97	0.54	0.4	0.55	0.48	0.59	0.53	0.38	0.04	0.62	0.53	0.37	0.52	0.48
Cpa\|evm.model.tig00000492.71 (tig00000492_g1462.t2)	1.0	0.56	0.63	0.82	0.56	0.75	0.7	0.85	0.79	0.69	0.65	0.84	0.99	0.28	0.49	0.32	0.48	0.4	0.52	0.51	0.01	0.07	0.23	0.24	0.13	0.33
Cpa\|evm.model.tig00000492.73 (tig00000492_g1464.t1)	0.63	0.31	0.28	0.67	0.66	0.45	0.43	0.45	0.29	0.33	0.63	0.83	1.0	0.0	0.06	0.01	0.02	0.06	0.08	0.09	0.01	0.02	0.0	0.0	0.03	0.02
Cpa\|evm.model.tig00000551.15 (tig00000551_g2037.t1)	0.62	0.45	0.2	0.22	0.4	0.47	0.7	0.87	0.6	0.76	1.0	0.81	0.78	0.4	0.27	0.22	0.28	0.38	0.25	0.11	0.04	0.07	0.44	0.21	0.32	0.36
Cpa\|evm.model.tig00000663.17 (tig00000663_g2950.t1)	0.61	0.62	0.61	0.63	0.78	0.92	0.9	0.85	1.0	0.83	0.89	0.76	0.54	0.58	0.75	0.64	0.64	0.85	0.83	0.62	0.26	0.74	0.84	0.62	0.57	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000734.8 (tig00000734_g3762.t1)	0.81	0.64	0.81	0.75	0.63	1.0	0.91	0.96	0.99	0.68	0.8	0.79	0.76	0.52	0.51	0.62	0.44	0.17	0.39	0.41	0.17	0.32	0.21	0.29	0.28	0.43
Cpa\|evm.model.tig00000806.3 (tig00021179_g19300.t1)	1.0	0.35	0.66	0.77	0.33	0.82	0.39	0.71	0.47	0.31	0.36	0.37	0.83	0.07	0.01	0.01	0.06	0.0	0.02	0.01	0.03	0.0	0.0	0.01	0.02	0.04
Cpa\|evm.model.tig00000821.54 (tig00000821_g4514.t1)	0.45	0.43	0.5	0.78	0.78	0.92	1.0	0.93	0.99	0.87	0.75	0.85	0.65	0.06	0.13	0.08	0.19	0.42	0.26	0.34	0.05	0.49	0.35	0.53	0.28	0.23
Cpa\|evm.model.tig00000828.5 (tig00000828_g4605.t1)	0.32	0.28	0.45	0.71	0.71	0.84	0.81	0.67	1.0	0.86	0.81	0.97	0.3	0.35	0.16	0.24	0.13	0.21	0.27	0.11	0.22	0.35	0.41	0.34	0.64	0.15
Cpa\|evm.model.tig00000852.48 (tig00000852_g5054.t1)	0.43	0.45	0.74	0.82	0.71	1.0	0.78	0.88	0.99	0.55	0.57	0.47	0.4	0.44	0.39	0.41	0.36	0.4	0.5	0.36	0.08	0.19	0.52	0.18	0.35	0.36
Cpa\|evm.model.tig00000912.49 (tig00000912_g5453.t1)	0.64	0.51	0.55	0.57	0.62	0.75	0.67	0.75	0.96	0.77	0.92	1.0	0.79	0.35	0.32	0.35	0.27	0.33	0.34	0.43	0.11	0.33	0.44	0.35	0.29	0.41
Cpa\|evm.model.tig00001030.3 (tig00001030_g6446.t1)	0.58	0.39	0.53	0.61	0.64	0.61	0.8	0.79	0.88	0.87	1.0	0.92	0.76	0.79	0.54	0.7	0.51	0.53	0.46	0.41	0.12	0.48	0.48	0.49	0.43	0.41
Cpa\|evm.model.tig00001042.21 (tig00001042_g6593.t2)	0.66	0.59	0.53	0.56	0.64	1.0	0.9	0.87	0.93	0.74	0.68	0.79	0.61	0.35	0.31	0.43	0.34	0.38	0.5	0.41	0.06	0.2	0.69	0.44	0.43	0.41
Cpa\|evm.model.tig00001085.29 (tig00001085_g6967.t1)	0.76	0.49	0.22	0.31	0.39	0.52	0.98	1.0	0.69	0.87	0.97	0.81	0.94	0.49	0.18	0.27	0.3	0.36	0.3	0.26	0.1	0.18	0.95	0.51	0.67	0.36
Cpa\|evm.model.tig00020510.24	0.6	0.49	0.45	0.49	0.72	0.67	0.56	0.54	0.8	0.76	0.87	1.0	0.78	0.21	0.27	0.26	0.24	0.31	0.44	0.3	0.05	0.01	0.2	0.28	0.13	0.23
Cpa\|evm.model.tig00020553.244 (tig00020796_g13717.t2)	0.65	0.41	0.31	0.48	0.47	0.29	0.4	0.53	0.67	0.84	1.0	0.83	0.69	0.45	0.45	0.39	0.38	0.41	0.45	0.37	0.14	0.07	0.38	0.32	0.2	0.33
Cpa\|evm.model.tig00020556.88 (tig00020556_g11055.t1)	0.5	0.56	0.66	0.6	0.79	0.68	0.93	0.86	0.75	0.79	0.82	0.75	0.64	1.0	0.72	0.85	0.54	0.35	0.48	0.39	0.1	0.54	0.43	0.27	0.4	0.38
Cpa\|evm.model.tig00020563.135 (tig00020563_g11335.t1)	0.87	0.51	0.53	0.52	0.54	0.61	0.77	0.74	0.91	0.85	0.89	0.94	1.0	0.74	0.44	0.55	0.37	0.43	0.36	0.47	0.24	0.44	0.53	0.52	0.45	0.61
Cpa\|evm.model.tig00020563.162 (tig00020563_g11364.t1)	0.57	0.46	0.45	0.51	0.56	0.59	0.89	0.83	0.93	1.0	0.98	1.0	0.75	0.69	0.64	0.62	0.53	0.71	0.58	0.59	0.08	0.81	0.44	0.41	0.58	0.61
Cpa\|evm.model.tig00020563.8 (tig00020563_g11189.t1)	0.77	0.36	0.48	0.5	0.52	0.54	0.62	0.75	0.8	1.0	0.87	0.96	0.97	0.62	0.48	0.62	0.51	0.6	0.4	0.55	0.03	0.12	0.48	0.29	0.32	0.36
Cpa\|evm.model.tig00020614.65 (tig00020614_g12178.t1)	0.54	0.59	0.7	0.76	0.57	0.67	0.86	0.91	1.0	0.74	0.77	0.65	0.46	0.41	0.68	0.63	0.54	0.47	0.54	0.55	0.05	0.6	0.23	0.15	0.47	0.34
Cpa\|evm.model.tig00020675.78 (tig00020675_g12658.t1)	0.68	0.52	0.47	0.57	0.64	0.64	0.67	0.7	1.0	0.85	0.8	0.69	0.63	0.45	0.62	0.63	0.38	0.65	0.56	0.3	0.25	0.77	0.67	0.47	0.4	0.38
Cpa\|evm.model.tig00020675.79 (tig00020675_g12658.t1)	0.74	0.61	0.57	0.65	0.7	0.65	0.72	0.86	1.0	1.0	0.93	0.74	0.66	0.68	0.79	0.93	0.53	0.87	0.61	0.4	0.2	0.51	0.51	0.53	0.32	0.31
Cpa\|evm.model.tig00020710.13 (tig00020554_g10946.t1)	0.75	0.54	0.49	0.53	0.54	0.43	0.56	0.72	0.64	0.78	0.8	0.81	1.0	0.86	0.42	0.73	0.41	0.58	0.47	0.42	0.16	0.36	0.61	0.57	0.46	0.59
Cpa\|evm.model.tig00020780.50 (tig00020780_g13798.t1)	0.36	0.37	0.51	0.44	0.38	0.51	0.71	0.81	0.96	0.69	0.64	0.69	0.42	0.71	0.62	0.72	0.55	1.0	0.59	0.5	0.08	0.77	0.57	0.4	0.43	0.55
Cpa\|evm.model.tig00020816.18 (tig00020816_g14103.t1)	0.72	0.45	0.43	0.41	0.39	0.42	0.6	0.69	0.68	0.78	0.9	0.66	0.67	0.63	0.31	0.56	0.39	0.52	0.45	0.46	0.27	0.14	1.0	0.81	0.66	0.8
Cpa\|evm.model.tig00020830.93 (tig00020830_g14477.t1)	0.64	0.42	0.31	0.65	0.48	0.92	0.95	0.41	1.0	0.48	0.54	0.48	0.38	0.07	0.0	0.08	0.16	0.2	0.06	0.21	0.0	0.0	0.07	0.13	0.12	0.05
Cpa\|evm.model.tig00020908.5 (tig00021038_g17533.t1)	0.59	0.66	0.4	0.42	0.62	0.54	0.59	0.67	0.53	0.95	0.86	0.96	1.0	0.51	0.35	0.41	0.31	0.31	0.27	0.22	0.02	0.12	0.15	0.23	0.36	0.32
Cpa\|evm.model.tig00020912.41 (tig00020912_g15819.t1)	0.74	0.63	0.63	0.83	0.77	0.95	0.94	0.89	1.0	0.87	0.69	0.81	0.87	0.3	0.26	0.29	0.23	0.35	0.38	0.26	0.25	0.31	0.27	0.27	0.24	0.4
Cpa\|evm.model.tig00020918.11 (tig00020918_g15888.t1)	0.74	0.7	0.76	0.83	0.79	1.0	0.89	0.9	0.95	0.72	0.75	0.79	0.75	0.45	0.52	0.55	0.34	0.45	0.43	0.41	0.14	0.6	0.38	0.57	0.51	0.55
Cpa\|evm.model.tig00020943.8 (tig00020943_g16250.t1)	0.6	0.4	0.4	0.57	0.6	0.55	0.79	0.73	0.86	0.83	0.91	1.0	0.88	0.71	0.45	0.72	0.4	0.63	0.46	0.34	0.18	0.73	0.56	0.73	0.58	0.58
Cpa\|evm.model.tig00020952.45	0.32	0.45	0.52	0.55	0.86	1.0	0.82	0.71	0.88	0.89	0.95	0.83	0.43	0.59	0.52	0.48	0.4	0.53	0.43	0.53	0.05	0.8	0.56	0.57	0.6	0.73
Cpa\|evm.model.tig00020956.5 (tig00020956_g16513.t1)	0.77	0.44	0.54	0.51	0.43	0.42	0.54	0.64	0.82	0.76	0.94	1.0	0.86	0.34	0.36	0.39	0.26	0.36	0.41	0.29	0.05	0.03	0.21	0.26	0.16	0.22
Cpa\|evm.model.tig00021036.40 (tig00021036_g17314.t1)	0.36	0.4	0.44	0.48	0.5	0.41	0.53	0.66	0.54	0.91	1.0	0.8	0.54	0.54	0.58	0.28	0.17	0.64	0.25	0.45	0.0	0.09	0.03	0.18	0.62	0.38
Cpa\|evm.model.tig00021036.41 (tig00021036_g17314.t1)	0.33	0.35	0.36	0.42	0.47	0.28	0.42	0.54	0.36	0.77	0.8	0.64	0.39	0.7	0.63	0.34	0.27	1.0	0.34	0.6	0.0	0.11	0.03	0.14	0.81	0.44
Cpa\|evm.model.tig00021096.4 (tig00021096_g18127.t1)	0.44	0.52	0.33	1.0	0.75	0.31	0.52	0.65	0.42	0.68	0.69	0.51	0.87	0.0	0.02	0.0	0.05	0.2	0.04	0.05	0.0	0.0	0.09	0.0	0.01	0.0
Cpa\|evm.model.tig00021128.17 (tig00000025_g7959.t1)	0.74	0.58	0.64	0.74	0.79	1.0	0.84	0.83	0.78	0.68	0.72	0.86	0.82	0.47	0.48	0.73	0.39	0.4	0.37	0.49	0.18	0.51	0.4	0.36	0.33	0.4
Cpa\|evm.model.tig00021133.12 (tig00021133_g18910.t1)	0.59	0.56	0.65	0.8	0.91	1.0	0.88	0.7	0.95	0.91	0.85	0.86	0.6	0.62	0.43	0.7	0.46	0.86	0.41	0.55	0.42	0.91	0.59	0.56	0.51	0.6
Cpa\|evm.model.tig00021168.62 (tig00021168_g19127.t1)	0.52	0.54	0.54	0.51	0.54	0.63	0.6	0.59	0.59	0.68	0.8	1.0	0.63	0.32	0.23	0.17	0.23	0.37	0.27	0.39	0.02	0.09	0.24	0.21	0.24	0.29
Cpa\|evm.model.tig00021348.97 (tig00021348_g20605.t1)	0.4	0.33	0.39	0.41	0.53	0.63	0.79	0.77	0.79	1.0	0.9	0.85	0.6	0.72	0.27	0.36	0.54	0.54	0.53	0.69	0.27	0.2	0.54	0.58	0.55	0.74
Cpa\|evm.model.tig00021462.34 (tig00021462_g21598.t1)	0.36	0.57	0.49	0.52	0.79	0.76	0.78	0.39	1.0	0.6	0.58	0.84	0.3	0.43	0.04	0.23	0.21	0.04	0.08	0.04	0.02	0.0	0.23	0.13	0.0	0.17
Cpa\|evm.model.tig00021493.74 (tig00000983_g5898.t1)	0.18	0.26	0.2	0.22	0.89	0.29	0.35	0.42	0.25	0.66	0.72	0.81	0.53	0.14	0.09	0.11	0.1	0.68	0.08	0.12	0.25	1.0	0.58	0.21	0.77	0.71
Cpa\|evm.model.tig00021537.8 (tig00021537_g22264.t1)	0.44	0.39	0.4	0.47	0.57	0.66	0.71	0.69	0.9	1.0	0.85	0.91	0.63	0.71	0.54	0.64	0.47	0.46	0.39	0.57	0.16	0.31	0.44	0.5	0.56	0.58
Cpa\|evm.model.tig00022104.4 (tig00020564_g11447.t1)	0.43	0.13	0.21	0.3	0.47	0.53	0.8	0.88	0.63	0.99	1.0	0.8	0.46	0.34	0.04	0.01	0.16	0.07	0.03	0.42	0.04	0.11	0.21	0.36	0.38	0.5
Cpa\|evm.model.tig00022104.5 (tig00022104_g23820.t1)	0.39	0.14	0.25	0.29	0.38	0.58	0.8	0.79	0.7	0.96	1.0	0.7	0.54	0.27	0.03	0.02	0.11	0.06	0.05	0.35	0.02	0.1	0.13	0.31	0.24	0.42

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)