Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	-N	2.5M NaCl,0.5h	2.5M NaCl,1h	2.5M NaCl,2h	CCAP 19/18,4.5M NaCl	CCAP 19/18,5M Glycerol	CCAP 19/3	CCAP 19/3,Log	CCAP 19/3,Log,3M NaCl,1h	CCAP 19/3,Log,3M NaCl,6h	Log	Mid-log,Low light	Mid-log,Medium light	Mid-log,High light	Mid-log,White light	Mid-log,Red light	Mid-log,Blue light	Strain 435	Strain 435,H2O2	Strain 435,NaCl	Strain 435,Sorbitol
Dusal.0002s00016.1 (33187964)	0.16	0.03	0.04	0.13	0.9	1.0	0.1	0.02	0.02	0.05	0.04	0.14	0.11	0.17	0.25	0.19	0.15	0.04	0.04	0.08	0.06
Dusal.0007s00001.1 (33201158)	0.17	0.13	0.11	0.27	1.0	0.94	0.2	0.01	0.03	0.01	0.01	0.49	0.49	0.34	0.53	0.37	0.45	0.23	0.22	0.28	0.25
Dusal.0007s00030.1 (33201172)	0.08	0.1	0.12	0.18	0.99	1.0	0.14	0.08	0.11	0.08	0.08	0.32	0.33	0.33	0.28	0.24	0.23	0.27	0.27	0.19	0.3
Dusal.0010s00016.1 (33196832)	0.38	0.11	0.15	0.46	1.0	0.87	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.32	0.13	0.26	0.45	0.42	0.06	0.07	0.21	0.1
Dusal.0011s00021.1 (33192174)	0.02	0.04	0.04	0.1	0.89	1.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.27	0.29	0.35	0.15	0.21	0.15	0.14	0.2	0.15
Dusal.0016s00027.1 (33193057)	0.28	0.08	0.12	0.23	1.0	0.99	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.19	0.12	0.19	0.25	0.31	0.18	0.22	0.32	0.32
Dusal.0024s00053.1 (33202179)	0.25	0.13	0.07	0.1	1.0	0.93	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.11	0.07	0.09	0.1	0.11	0.15	0.13	0.12	0.14
Dusal.0032s00021.1 (33186657)	0.02	0.02	0.06	0.11	1.0	0.88	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.06	0.09	0.04	0.04	0.06	0.06	0.06	0.14	0.11
Dusal.0040s00028.1 (33197300)	0.13	0.03	0.04	0.06	1.0	0.95	0.13	0.12	0.09	0.1	0.01	0.32	0.45	0.21	0.3	0.35	0.3	0.06	0.09	0.11	0.12
Dusal.0045s00042.1 (33191653)	0.4	0.0	0.0	0.0	1.0	0.91	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.42	0.16	0.06	0.08	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0048s00010.1 (33189506)	0.1	0.1	0.11	0.1	1.0	0.94	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.1	0.05	0.04	0.09	0.1	0.18	0.17	0.12	0.17
Dusal.0052s00023.1 (33199545)	0.2	0.14	0.11	0.25	1.0	1.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.38	0.39	0.57	0.31	0.35	0.22	0.22	0.32	0.29
Dusal.0065s00018.1 (33185864)	0.16	0.08	0.06	0.14	0.9	1.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.19	0.12	0.35	0.23	0.24	0.12	0.12	0.14	0.16
Dusal.0070s00012.1 (33189325)	0.16	0.07	0.08	0.07	1.0	1.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.08	0.19	0.23	0.09	0.1	0.25	0.28	0.09	0.2
Dusal.0070s00036.1 (33189313)	0.23	0.11	0.13	0.26	1.0	0.86	0.12	0.13	0.05	0.06	0.07	0.35	0.38	0.33	0.31	0.34	0.39	0.13	0.1	0.16	0.16
Dusal.0092s00022.1 (33200079)	0.22	0.12	0.14	0.4	1.0	0.99	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.26	0.17	0.12	0.26	0.25	0.12	0.14	0.12	0.17
Dusal.0093s00009.1 (33185317)	0.31	0.05	0.1	0.29	1.0	0.99	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.24	0.16	0.52	0.28	0.5	0.27	0.29	0.32	0.32
Dusal.0095s00006.1 (33190271)	0.26	0.22	0.22	0.4	1.0	0.95	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.3	0.18	0.21	0.34	0.47	0.12	0.18	0.2	0.14
Dusal.0101s00005.1 (33199176)	0.11	0.08	0.08	0.1	1.0	0.99	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.47	0.29	0.33	0.33	0.33	0.16	0.18	0.1	0.14
Dusal.0114s00002.1 (33202251)	0.05	0.02	0.04	0.08	1.0	0.76	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.19	0.13	0.05	0.08	0.05	0.11	0.16	0.5	0.4
Dusal.0127s00017.1 (33200016)	0.16	0.05	0.07	0.06	1.0	0.9	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.16	0.2	0.18	0.12	0.16	0.15	0.13	0.13	0.1
Dusal.0144s00012.1 (33198199)	0.27	0.08	0.09	0.27	1.0	0.93	0.24	0.03	0.03	0.04	0.03	0.46	0.4	0.38	0.63	0.42	0.49	0.13	0.14	0.25	0.21
Dusal.0144s00018.1 (33198197)	0.21	0.07	0.08	0.19	1.0	0.94	0.17	0.01	0.01	0.0	0.01	0.18	0.24	0.17	0.38	0.29	0.32	0.25	0.31	0.35	0.36
Dusal.0149s00010.1 (33186630)	0.26	0.09	0.08	0.34	1.0	0.94	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.28	0.25	0.24	0.38	0.54	0.15	0.15	0.46	0.22
Dusal.0153s00005.1 (33203306)	0.14	0.07	0.12	0.32	1.0	0.94	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.36	0.28	0.34	0.38	0.36	0.13	0.18	0.18	0.15
Dusal.0153s00010.1 (33203320)	0.2	0.03	0.01	0.02	1.0	0.91	0.21	0.04	0.03	0.0	0.08	0.23	0.28	0.13	0.16	0.18	0.17	0.01	0.01	0.01	0.0
Dusal.0173s00013.1 (33191837)	0.17	0.06	0.08	0.28	1.0	0.93	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.37	0.21	0.31	0.27	0.37	0.07	0.06	0.15	0.09
Dusal.0174s00015.1 (33196283)	0.26	0.19	0.19	0.4	1.0	0.93	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.37	0.27	0.31	0.29	0.36	0.29	0.33	0.38	0.35
Dusal.0187s00014.1 (33194154)	0.33	0.05	0.03	0.02	1.0	0.99	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.15	0.3	0.47	0.21	0.27	0.15	0.14	0.14	0.17
Dusal.0217s00008.1 (33197554)	0.25	0.07	0.13	0.35	1.0	0.74	0.16	0.07	0.04	0.08	0.07	0.11	0.16	0.07	0.13	0.32	0.22	0.21	0.23	0.36	0.27
Dusal.0223s00020.1 (33201361)	0.37	0.18	0.19	0.28	1.0	0.88	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.28	0.29	0.39	0.3	0.36	0.26	0.28	0.19	0.29
Dusal.0238s00024.1 (33193663)	0.26	0.08	0.09	0.05	1.0	1.0	0.27	0.09	0.08	0.05	0.08	0.12	0.16	0.09	0.23	0.15	0.13	0.04	0.05	0.04	0.05
Dusal.0256s00020.1 (33203446)	0.19	0.04	0.06	0.15	1.0	0.97	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.58	0.31	0.61	0.42	0.45	0.36	0.19	0.15	0.21	0.21
Dusal.0263s00018.1 (33192434)	0.03	0.1	0.11	0.14	0.99	1.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.17	0.19	0.14	0.13	0.15	0.16	0.15	0.23	0.24
Dusal.0263s00020.1 (33192447)	0.1	0.17	0.29	0.41	1.0	0.85	0.14	0.01	0.0	0.12	0.2	0.11	0.17	0.08	0.21	0.11	0.19	0.12	0.14	0.21	0.25
Dusal.0265s00013.1 (33188546)	0.16	0.11	0.17	0.45	1.0	0.87	0.2	0.19	0.1	0.06	0.03	0.18	0.2	0.08	0.25	0.27	0.27	0.15	0.13	0.21	0.23
Dusal.0268s00014.1 (33190608)	0.17	0.07	0.05	0.1	1.0	0.92	0.19	0.0	0.0	0.0	0.01	0.43	0.4	0.24	0.28	0.52	0.49	0.17	0.19	0.22	0.21
Dusal.0281s00014.1 (33190358)	0.19	0.21	0.19	0.26	1.0	0.97	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.22	0.24	0.32	0.26	0.3	0.22	0.22	0.28	0.29
Dusal.0285s00002.1 (33192898)	0.25	0.03	0.06	0.07	1.0	0.98	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.35	0.2	0.14	0.15	0.23	0.06	0.04	0.06	0.07
Dusal.0328s00016.1 (33194972)	0.19	0.06	0.08	0.16	0.94	1.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.11	0.08	0.09	0.07	0.14	0.14	0.16	0.21	0.24
Dusal.0336s00016.1 (33190839)	0.55	0.03	0.04	0.13	0.96	1.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.52	0.27	0.46	0.74	0.45	0.42	0.09	0.14	0.16	0.13
Dusal.0361s00008.1 (33202657)	0.14	0.06	0.07	0.14	1.0	0.85	0.14	0.0	0.01	0.01	0.0	0.15	0.14	0.17	0.13	0.1	0.12	0.16	0.16	0.25	0.22
Dusal.0367s00016.1 (33189408)	0.22	0.0	0.0	0.0	0.98	1.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.25	0.24	0.21	0.15	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0369s00007.1 (33192259)	0.05	0.09	0.07	0.23	1.0	0.91	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.1	0.06	0.08	0.09	0.11	0.11	0.13	0.12	0.14
Dusal.0375s00014.1 (33193941)	0.22	0.12	0.07	0.16	1.0	0.95	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.44	0.46	0.51	0.31	0.33	0.16	0.16	0.23	0.15
Dusal.0411s00011.1 (33201259)	0.12	0.07	0.09	0.32	1.0	0.79	0.09	0.0	0.0	0.0	0.03	0.17	0.15	0.08	0.21	0.18	0.21	0.15	0.17	0.35	0.23
Dusal.0456s00004.1 (33199039)	0.22	0.06	0.11	0.27	1.0	0.84	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.36	0.22	0.16	0.19	0.33	0.07	0.05	0.18	0.14
Dusal.0472s00005.1 (33195973)	0.34	0.04	0.08	0.18	1.0	0.91	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.41	0.16	0.24	0.21	0.23	0.08	0.09	0.13	0.12
Dusal.0477s00001.1 (33196081)	0.77	0.11	0.08	0.3	1.0	0.97	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.31	0.21	0.29	0.36	0.43	0.06	0.05	0.13	0.09
Dusal.0508s00002.1 (33193141)	0.14	0.07	0.09	0.32	0.96	1.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.33	0.13	0.16	0.26	0.27	0.17	0.11	0.41	0.27
Dusal.0509s00009.1 (33198581)	0.22	0.0	0.0	0.0	1.0	0.97	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.13	0.08	0.24	0.18	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0535s00003.1 (33187724)	0.28	0.14	0.13	0.3	0.97	1.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.42	0.32	0.33	0.33	0.38	0.19	0.19	0.28	0.25
Dusal.0537s00003.1 (33195114)	0.16	0.07	0.07	0.37	1.0	0.88	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.28	0.14	0.14	0.29	0.28	0.08	0.06	0.42	0.26
Dusal.0546s00006.1 (33194088)	0.34	0.08	0.23	0.42	1.0	0.87	0.22	0.0	0.0	0.0	0.01	0.32	0.29	0.17	0.29	0.37	0.4	0.28	0.31	0.51	0.4
Dusal.0614s00006.1 (33202084)	0.12	0.07	0.11	0.35	1.0	0.91	0.17	0.0	0.0	0.03	0.02	0.16	0.18	0.16	0.17	0.11	0.15	0.17	0.15	0.21	0.21
Dusal.0637s00004.1 (33188917)	0.17	0.11	0.12	0.17	1.0	0.94	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.4	0.25	0.43	0.32	0.29	0.17	0.18	0.11	0.16
Dusal.0653s00003.1 (33194000)	0.16	0.15	0.15	0.42	1.0	0.92	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.23	0.12	0.18	0.21	0.3	0.14	0.1	0.18	0.18
Dusal.0665s00002.1 (33203206)	0.25	0.09	0.14	0.22	0.97	1.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.05	0.02	0.03	0.06	0.23	0.29	0.3	0.34
Dusal.0724s00002.1 (33190223)	0.35	0.08	0.08	0.17	1.0	0.98	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.14	0.15	0.09	0.06	0.09	0.22	0.22	0.34	0.38
Dusal.0743s00007.1 (33201749)	0.21	0.05	0.04	0.02	1.0	0.96	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.07	0.09	0.06	0.06	0.08	0.28	0.23	0.11	0.21
Dusal.0760s00003.1 (33190090)	0.1	0.1	0.16	0.28	1.0	0.92	0.13	0.0	0.0	0.0	0.01	0.16	0.24	0.09	0.19	0.27	0.23	0.15	0.15	0.17	0.13
Dusal.0882s00003.1 (33201831)	0.11	0.06	0.09	0.27	1.0	0.96	0.19	0.0	0.0	0.01	0.01	0.23	0.25	0.23	0.36	0.34	0.34	0.2	0.21	0.31	0.26
Dusal.0894s00002.1 (33187821)	0.38	0.19	0.22	0.47	1.0	0.92	0.2	0.08	0.07	0.12	0.03	0.35	0.43	0.24	0.31	0.46	0.44	0.18	0.2	0.27	0.23
Dusal.0895s00002.1 (33191711)	0.11	0.05	0.07	0.27	0.99	1.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.07	0.06	0.0	0.19	0.18	0.04	0.04	0.12	0.04
Dusal.0932s00002.1 (33201960)	0.26	0.11	0.14	0.21	1.0	0.91	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.06	0.06	0.03	0.09	0.12	0.16	0.22	0.22	0.18
Dusal.0939s00002.1 (33197537)	0.28	0.09	0.06	0.19	1.0	0.82	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.32	0.1	0.13	0.35	0.32	0.08	0.07	0.16	0.08
Dusal.0981s00002.1 (33196886)	0.19	0.12	0.13	0.15	0.96	1.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.3	0.29	0.54	0.27	0.25	0.1	0.13	0.14	0.18
Dusal.1021s00003.1 (33193159)	0.42	0.05	0.05	0.07	1.0	0.99	0.19	0.03	0.01	0.0	0.01	0.44	0.49	0.41	0.5	0.38	0.53	0.13	0.14	0.15	0.14
Dusal.1064s00001.1 (33196347)	0.18	0.06	0.06	0.16	0.97	1.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.3	0.33	0.36	0.29	0.34	0.2	0.21	0.28	0.15
Dusal.1403s00002.1 (33199971)	0.28	0.06	0.08	0.19	1.0	0.96	0.26	0.0	0.0	0.01	0.01	0.47	0.43	0.35	0.54	0.45	0.51	0.18	0.22	0.33	0.28
Dusal.2484s00001.1 (33185688)	0.17	0.11	0.1	0.11	1.0	0.99	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.18	0.16	0.25	0.14	0.15	0.26	0.26	0.24	0.25

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)