Heatmap: Cluster_203 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000025.57	0.2	0.27	0.29	0.34	0.43	0.29	0.32	0.24	0.3	0.37	0.34	0.34	0.12	0.24	0.18	0.33	0.31	0.39	0.37	0.5	0.13	0.49	0.55	1.0	0.33	0.51
Cpa\|evm.model.tig00000042.63 (tig00000042_g15458.t1)	0.17	0.35	0.74	0.8	0.83	1.0	0.79	0.75	0.84	0.97	0.91	0.95	0.12	0.42	0.57	0.71	0.77	0.76	0.82	0.71	0.07	0.17	0.59	0.41	0.9	0.75
Cpa\|evm.model.tig00000042.67 (tig00000042_g15462.t1)	0.82	0.74	0.53	0.61	0.78	0.51	0.58	0.63	0.75	0.58	0.56	0.51	0.46	0.49	0.58	0.7	0.56	1.0	0.93	0.59	0.08	0.33	0.84	0.76	0.71	0.59
Cpa\|evm.model.tig00000057.14 (tig00000057_g29.t1)	0.46	0.64	0.66	0.75	0.79	0.79	0.84	0.9	0.74	0.85	0.86	0.82	0.55	0.5	0.59	0.52	0.78	1.0	0.79	0.75	0.08	0.47	0.74	0.74	0.99	0.97
Cpa\|evm.model.tig00000076.63 (tig00000076_g2364.t1)	0.62	0.76	0.86	1.0	0.89	0.69	0.81	0.78	0.65	0.75	0.77	0.71	0.72	0.9	0.56	0.74	0.7	0.94	0.72	0.59	0.18	0.27	0.65	0.64	0.9	0.78
Cpa\|evm.model.tig00000147.47 (tig00000147_g9487.t1)	0.57	0.5	0.59	0.57	0.69	0.64	0.61	0.64	0.51	0.71	0.79	0.66	0.46	0.56	0.3	0.48	0.4	0.37	0.49	0.58	0.09	0.34	1.0	0.74	0.91	0.79
Cpa\|evm.model.tig00000157.35 (tig00000157_g9625.t1)	0.75	0.78	0.63	0.59	0.64	0.75	0.83	0.8	0.79	0.65	0.58	0.6	0.73	0.39	0.63	0.59	0.58	1.0	0.86	0.69	0.21	0.55	0.81	0.65	0.74	0.6
Cpa\|evm.model.tig00000190.60 (tig00000190_g13877.t1)	0.31	0.46	0.74	0.71	0.84	1.0	0.84	0.88	0.82	0.62	0.57	0.43	0.26	0.65	0.75	0.82	0.92	0.94	0.98	0.85	0.08	0.7	0.93	0.77	0.83	0.83
Cpa\|evm.model.tig00000219.25 (tig00000219_g19464.t1)	0.28	0.61	0.74	0.89	1.0	0.88	0.81	0.75	0.69	0.76	0.8	0.87	0.19	0.85	0.76	0.79	0.72	0.82	0.74	0.75	0.09	0.13	0.95	0.72	0.98	0.95
Cpa\|evm.model.tig00000219.73 (tig00000219_g19509.t1)	0.54	0.6	0.69	0.81	0.86	0.57	0.89	0.79	0.55	0.66	0.61	0.7	0.72	0.71	0.54	0.76	0.73	0.67	0.53	0.61	0.04	0.24	0.48	0.3	1.0	0.63
Cpa\|evm.model.tig00000241.183 (tig00000241_g21054.t1)	0.06	0.34	0.51	0.55	0.55	0.5	0.37	0.4	0.61	0.59	0.6	0.68	0.02	0.18	0.34	0.13	0.47	0.6	0.57	0.85	0.04	0.3	0.65	1.0	0.71	0.77
Cpa\|evm.model.tig00000241.190 (tig00000241_g21058.t1)	0.07	0.13	0.19	0.4	0.36	0.33	0.53	0.45	0.61	0.68	0.85	0.8	0.15	0.58	0.13	0.23	0.23	0.2	0.16	0.42	0.03	0.04	0.29	0.29	1.0	0.69
Cpa\|evm.model.tig00000269.67 (tig00000269_g23728.t1)	0.37	0.7	0.68	0.65	0.76	0.94	0.78	0.68	0.68	0.56	0.48	0.44	0.39	0.69	0.58	0.83	0.68	1.0	0.84	0.75	0.22	0.45	0.73	0.55	0.66	0.78
Cpa\|evm.model.tig00000293.16 (tig00000293_g23884.t1)	0.35	0.53	0.59	0.72	0.71	0.7	0.6	0.61	0.5	0.67	0.81	0.87	0.4	0.28	0.54	0.24	0.43	0.72	0.56	0.56	0.05	0.72	0.81	0.9	1.0	0.8
Cpa\|evm.model.tig00000350.47 (tig00000350_g24344.t1)	0.65	0.5	0.39	0.41	0.68	0.85	0.99	0.89	1.0	0.83	0.76	0.59	0.62	0.47	0.45	0.44	0.56	0.6	0.62	0.53	0.06	0.18	0.69	0.47	0.98	0.51
Cpa\|evm.model.tig00000402.68 (tig00000402_g246.t1)	0.36	0.54	0.54	0.69	0.79	0.74	0.82	0.71	0.53	0.58	0.54	0.48	0.48	0.69	0.56	0.72	0.66	0.75	0.77	0.63	0.07	0.29	0.47	0.37	1.0	0.71
Cpa\|evm.model.tig00000523.43 (tig00000523_g1864.t1)	0.64	0.73	0.76	0.71	0.73	0.76	0.88	0.78	0.78	0.74	0.62	0.56	0.67	0.57	0.72	0.72	0.71	1.0	0.71	0.83	0.13	0.59	0.78	0.59	0.75	0.71
Cpa\|evm.model.tig00000525.10 (tig00000525_g1953.t1)	0.61	0.36	0.31	0.39	0.53	0.68	1.0	0.98	0.88	0.87	0.79	0.64	0.63	0.43	0.33	0.28	0.51	1.0	0.69	0.6	0.11	0.6	0.75	0.5	0.92	0.85
Cpa\|evm.model.tig00000525.17 (tig00000525_g1962.t1)	0.33	0.57	0.46	0.64	0.94	0.72	0.86	0.78	0.94	0.88	0.77	0.62	0.26	0.47	0.6	0.53	0.59	0.77	0.89	0.73	0.29	0.47	1.0	0.68	0.68	0.69
Cpa\|evm.model.tig00000553.31 (tig00000553_g2104.t1)	0.07	0.41	0.34	0.47	0.61	0.88	1.0	0.79	0.93	0.61	0.47	0.41	0.07	0.37	0.49	0.32	0.52	0.82	0.72	0.77	0.17	0.23	0.51	0.18	0.58	0.42
Cpa\|evm.model.tig00000605.5 (tig00000605_g2470.t1)	0.36	0.56	0.49	0.55	0.67	0.71	0.67	0.65	0.59	0.61	0.56	0.49	0.29	0.25	0.51	0.27	0.51	0.88	1.0	0.67	0.2	0.57	0.55	0.43	0.53	0.4
Cpa\|evm.model.tig00000692.69 (tig00000692_g3268.t1)	0.55	0.47	0.34	0.34	0.35	0.48	0.58	0.64	0.61	0.57	0.44	0.36	0.39	0.26	0.46	0.47	0.44	1.0	0.67	0.64	0.15	0.17	0.69	0.43	0.7	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000704.49 (tig00000704_g3336.t1)	0.54	0.66	0.6	0.57	0.53	0.51	0.65	0.66	0.64	0.65	0.53	0.51	0.48	0.5	0.63	0.77	0.62	1.0	0.88	0.8	0.17	0.2	0.62	0.65	0.78	0.72
Cpa\|evm.model.tig00000802.21 (tig00000802_g4272.t1)	0.43	0.8	0.69	0.78	0.94	1.0	0.91	0.8	0.86	0.8	0.75	0.63	0.35	0.59	0.66	0.56	0.74	0.93	0.92	0.81	0.07	0.59	0.66	0.38	0.86	0.73
Cpa\|evm.model.tig00000802.44 (tig00000802_g4293.t1)	0.28	0.31	0.38	0.47	0.67	0.76	0.7	0.61	0.59	0.46	0.51	0.47	0.28	0.3	0.33	0.45	0.32	0.31	0.35	0.29	0.15	0.25	1.0	0.47	0.94	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000880.24 (tig00000880_g5182.t1)	0.22	0.55	0.56	0.67	0.8	0.89	0.78	0.71	0.77	0.73	0.64	0.59	0.18	0.42	0.46	0.4	0.54	1.0	0.84	0.73	0.06	0.7	0.47	0.49	0.73	0.66
Cpa\|evm.model.tig00001003.23 (tig00001003_g6280.t1)	0.37	0.48	0.49	0.46	0.63	0.56	0.67	0.64	0.61	0.54	0.43	0.44	0.3	0.5	0.58	0.59	0.59	1.0	0.85	0.71	0.05	0.26	0.64	0.5	0.72	0.65
Cpa\|evm.model.tig00001065.43 (tig00001065_g6742.t1)	0.22	0.44	0.73	0.78	0.6	0.41	0.55	0.67	0.81	0.92	0.86	0.79	0.29	0.17	0.21	0.1	0.7	0.89	0.61	1.0	0.04	0.43	0.54	0.91	0.87	0.88
Cpa\|evm.model.tig00001130.8 (tig00001130_g7237.t1)	0.16	0.39	0.34	0.63	0.77	0.64	0.62	0.78	0.72	0.62	0.7	0.45	0.25	0.28	0.29	0.27	0.27	0.5	0.46	0.46	0.06	0.1	0.96	0.52	1.0	0.6
Cpa\|evm.model.tig00001155.4 (tig00001155_g7312.t1)	0.67	0.82	0.69	0.66	0.83	0.98	0.84	0.77	0.69	0.71	0.68	0.63	0.58	0.53	0.51	0.47	0.64	1.0	0.87	0.68	0.35	0.3	0.78	0.65	0.57	0.49
Cpa\|evm.model.tig00001493.2 (tig00001493_g8977.t1)	0.4	0.68	0.84	0.89	0.98	0.96	1.0	0.83	0.79	0.87	0.8	0.84	0.41	0.71	0.49	0.82	0.4	0.72	0.62	0.68	0.02	0.28	0.45	0.4	0.64	0.95
Cpa\|evm.model.tig00001623.2 (tig00001623_g9415.t1)	0.58	0.58	0.57	0.62	0.77	0.82	0.95	1.0	0.92	0.87	0.83	0.8	0.47	0.56	0.54	0.54	0.61	0.85	0.8	0.64	0.05	0.43	0.77	0.72	0.88	0.85
Cpa\|evm.model.tig00020553.73 (tig00020553_g10563.t1)	0.48	0.56	0.61	0.63	0.86	0.83	0.87	0.74	1.0	0.76	0.75	0.72	0.47	0.56	0.78	0.67	0.7	0.74	0.77	0.7	0.12	0.25	0.73	0.64	0.86	0.6
Cpa\|evm.model.tig00020563.105 (tig00020614_g12181.t1)	0.39	0.64	0.47	0.65	0.7	0.74	0.88	0.89	0.9	0.84	0.66	0.54	0.31	0.44	0.64	0.41	0.49	1.0	0.86	0.73	0.08	0.37	0.84	0.46	0.83	0.54
Cpa\|evm.model.tig00020563.118 (tig00020563_g11310.t1)	0.25	0.84	0.88	1.0	0.93	0.78	0.75	0.72	0.85	0.76	0.87	0.76	0.17	0.33	0.37	0.57	0.4	0.66	0.61	0.46	0.02	0.26	0.36	0.4	0.7	0.67
Cpa\|evm.model.tig00020563.174	0.33	0.56	0.59	0.56	0.44	0.33	0.62	0.66	0.69	0.75	0.86	0.84	0.43	0.15	0.12	0.2	0.41	1.0	0.47	0.69	0.03	0.42	0.48	0.75	0.8	0.78
Cpa\|evm.model.tig00020703.26 (tig00020703_g13128.t1)	0.18	0.47	0.53	0.61	0.64	0.62	0.61	0.61	0.7	0.73	0.77	0.62	0.24	0.23	0.33	0.35	0.47	0.66	0.66	0.59	0.02	0.42	0.88	0.7	1.0	0.49
Cpa\|evm.model.tig00020710.119 (tig00020710_g13383.t1)	0.31	0.49	0.33	0.49	0.64	0.53	0.55	0.63	0.49	0.52	0.44	0.5	0.26	0.57	0.48	0.65	0.37	0.77	0.53	0.38	0.03	0.2	0.4	0.43	1.0	0.62
Cpa\|evm.model.tig00020710.37 (tig00020710_g13270.t1)	0.67	0.51	0.59	0.56	0.53	0.56	0.67	1.0	0.75	0.62	0.57	0.55	0.46	0.21	0.24	0.18	0.36	0.67	0.51	0.56	0.16	0.14	0.42	0.54	0.69	0.78
Cpa\|evm.model.tig00020710.41 (tig00020710_g13275.t1)	0.65	0.66	0.71	0.87	0.86	0.88	0.92	1.0	0.89	0.72	0.67	0.61	0.69	0.65	0.44	0.53	0.49	0.73	0.58	0.77	0.12	0.39	0.26	0.44	0.84	0.84
Cpa\|evm.model.tig00020734.38 (tig00020734_g13590.t1)	0.5	0.48	0.76	0.49	0.8	0.85	0.7	0.46	0.51	0.33	0.42	0.21	0.47	0.31	0.37	0.44	0.44	1.0	0.82	0.51	0.16	0.61	0.83	0.35	0.46	0.43
Cpa\|evm.model.tig00020800.27 (tig00020800_g13745.t1)	0.1	0.5	0.53	0.58	0.45	0.42	0.49	0.91	0.9	0.86	0.87	0.67	0.06	0.56	0.48	0.59	0.6	0.91	0.8	0.76	0.06	0.1	0.42	0.4	1.0	0.71
Cpa\|evm.model.tig00020902.57 (tig00020902_g15012.t1)	0.41	0.63	0.52	0.61	0.48	0.42	0.45	0.38	0.5	0.61	0.71	0.53	0.28	0.46	0.54	0.33	0.47	0.88	0.95	1.0	0.08	0.22	0.66	0.81	0.79	0.87
Cpa\|evm.model.tig00020943.72 (tig00020943_g16312.t1)	0.49	0.69	0.59	0.58	0.61	0.57	0.66	0.65	0.76	0.8	0.77	0.52	0.39	0.35	0.51	0.39	0.51	1.0	0.87	0.86	0.11	0.19	0.55	0.79	0.62	0.59
Cpa\|evm.model.tig00020960.82 (tig00020960_g16609.t1)	0.27	0.47	0.52	0.8	0.58	0.43	0.48	0.61	0.61	0.77	0.89	0.82	0.17	0.14	0.24	0.17	0.75	0.63	0.46	0.45	0.01	0.45	0.52	0.76	1.0	0.5
Cpa\|evm.model.tig00020961.32 (tig00020961_g16652.t1)	0.3	0.17	0.32	0.68	0.82	0.63	0.76	0.57	0.58	0.96	1.0	0.94	0.46	0.78	0.27	0.53	0.16	0.2	0.25	0.46	0.09	0.24	0.12	0.28	0.9	0.89
Cpa\|evm.model.tig00021042.11 (tig00021042_g17602.t1)	0.43	0.45	0.53	0.71	0.89	0.94	1.0	0.83	0.77	0.62	0.51	0.39	0.26	0.44	0.5	0.5	0.76	0.78	0.78	0.75	0.05	0.2	0.89	0.61	0.84	0.63
Cpa\|evm.model.tig00021122.10 (tig00021122_g18441.t1)	0.76	0.57	0.46	0.86	0.95	0.76	0.89	0.8	0.64	0.64	0.75	0.46	0.33	0.26	0.34	0.24	0.51	0.78	0.74	0.69	0.14	0.84	0.68	0.61	1.0	0.67
Cpa\|evm.model.tig00021127.119 (tig00021127_g18799.t1)	0.35	0.48	0.41	0.39	0.36	0.33	0.47	0.55	0.62	0.76	0.67	0.67	0.45	0.34	0.54	0.41	0.52	1.0	0.73	0.57	0.02	0.51	0.53	0.41	0.61	0.37
Cpa\|evm.model.tig00021221.3 (tig00021221_g19343.t1)	0.7	0.64	0.63	0.84	1.0	0.86	0.88	0.77	0.78	0.86	0.76	0.67	0.62	0.55	0.38	0.46	0.57	0.72	0.5	0.62	0.1	0.25	0.39	0.57	0.82	0.86
Cpa\|evm.model.tig00021244.15 (tig00021244_g19572.t1)	0.57	0.6	0.43	0.55	0.62	0.53	0.92	0.94	0.92	0.75	0.67	0.61	0.37	0.31	0.36	0.21	0.51	0.79	0.61	0.52	0.05	0.55	0.73	0.49	1.0	0.76
Cpa\|evm.model.tig00021244.21 (tig00021244_g19577.t1)	0.53	0.51	0.49	0.51	0.65	0.74	0.87	0.93	0.87	0.79	0.71	0.61	0.33	0.44	0.45	0.25	0.4	0.69	0.61	0.51	0.13	0.33	0.59	0.64	1.0	0.96
Cpa\|evm.model.tig00021275.9 (tig00021275_g19872.t1)	0.25	0.55	0.71	0.81	0.81	0.9	1.0	0.89	0.88	0.61	0.58	0.42	0.17	0.59	0.63	0.64	0.64	0.99	0.88	0.75	0.22	0.37	0.91	0.45	0.88	0.69
Cpa\|evm.model.tig00021290.16 (tig00021290_g19980.t1)	0.36	0.47	0.62	0.72	0.89	0.63	0.58	0.56	0.5	0.73	0.7	0.77	0.51	0.82	0.5	0.75	0.29	0.56	0.4	0.59	0.0	0.15	0.3	0.27	1.0	0.72
Cpa\|evm.model.tig00021318.23 (tig00021318_g20143.t1)	0.66	0.82	0.73	0.93	0.84	0.85	0.99	0.87	0.87	1.0	0.83	0.84	0.59	0.78	0.76	0.7	0.76	0.95	0.8	0.84	0.14	0.32	0.73	0.81	0.96	0.78
Cpa\|evm.model.tig00021350.22 (tig00021350_g20639.t1)	0.66	0.7	0.7	0.87	0.88	0.68	0.88	0.74	0.73	0.75	0.76	0.55	0.3	0.35	0.5	0.51	0.45	0.78	0.78	0.52	0.1	0.23	0.93	1.0	0.85	0.76
Cpa\|evm.model.tig00021464.51 (tig00021464_g21755.t1)	0.58	0.65	0.68	0.72	0.74	0.68	0.73	0.71	0.63	0.67	0.7	0.62	0.5	0.45	0.46	0.39	0.53	0.85	0.7	0.64	0.12	0.27	0.57	0.63	0.84	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021521.10 (tig00021521_g22066.t1)	0.59	0.59	0.53	0.57	0.51	0.33	0.3	0.32	0.34	0.38	0.54	0.57	0.3	0.22	0.41	0.2	0.71	0.64	0.62	0.93	0.1	0.12	0.85	1.0	0.33	0.72
Cpa\|evm.model.tig00021521.11 (tig00021521_g22066.t1)	0.53	0.54	0.54	0.57	0.52	0.38	0.3	0.3	0.29	0.35	0.53	0.55	0.3	0.18	0.37	0.15	0.69	0.62	0.7	0.84	0.18	0.15	0.69	1.0	0.4	0.79

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)