Heatmap: Cluster_208 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000113.5 (tig00000113_g5572.t1)	0.24	0.2	0.15	0.27	0.42	0.32	0.43	0.39	0.49	0.57	0.54	0.43	0.29	0.42	0.32	0.44	0.22	0.4	0.45	0.26	0.36	0.38	0.85	1.0	0.77	0.68
Cpa\|evm.model.tig00000204.16 (tig00000204_g17685.t1)	0.24	0.37	0.2	0.13	0.09	0.08	0.21	0.32	0.31	0.46	0.51	0.4	0.22	0.28	0.22	0.18	0.32	0.43	0.41	0.3	0.04	0.21	1.0	0.8	0.47	0.35
Cpa\|evm.model.tig00000204.64 (tig00000204_g17731.t1)	0.3	0.43	0.49	0.58	0.62	0.48	0.67	0.66	0.87	0.89	0.87	0.72	0.39	0.95	0.52	0.71	0.68	0.73	0.53	0.61	0.22	0.59	0.99	1.0	0.97	0.96
Cpa\|evm.model.tig00000388.63 (tig00000388_g24825.t1)	0.26	0.16	0.19	0.31	0.26	0.29	0.27	0.26	0.36	0.37	0.43	0.48	0.3	0.38	0.44	0.32	0.24	0.37	0.35	0.25	0.27	0.68	1.0	0.85	0.8	0.64
Cpa\|evm.model.tig00000403.103 (tig00000403_g365.t1)	0.23	0.2	0.35	0.43	0.34	0.29	0.32	0.34	0.31	0.31	0.27	0.33	0.14	0.15	0.12	0.15	0.19	0.27	0.26	0.29	0.54	0.41	1.0	0.41	0.31	0.48
Cpa\|evm.model.tig00000431.17 (tig00000431_g679.t1)	0.12	0.09	0.13	0.33	0.3	0.25	0.34	0.34	0.49	0.43	0.69	0.5	0.06	0.53	0.3	0.41	0.22	0.29	0.42	0.29	0.27	0.49	0.54	1.0	0.62	0.8
Cpa\|evm.model.tig00000459.64 (tig00000459_g1131.t1)	0.23	0.06	0.06	0.26	0.21	0.17	0.23	0.24	0.4	0.31	0.55	0.35	0.18	0.26	0.16	0.16	0.12	0.23	0.37	0.14	0.18	0.32	0.75	1.0	0.49	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000498.49 (tig00000498_g1626.t1)	0.06	0.05	0.16	0.39	0.5	0.48	0.58	0.47	0.69	0.69	0.75	0.52	0.02	0.78	0.52	0.49	0.31	0.58	0.56	0.49	0.4	0.49	0.64	0.62	1.0	0.78
Cpa\|evm.model.tig00000498.71 (tig00000498_g1648.t1)	0.06	0.07	0.08	0.2	0.2	0.13	0.14	0.1	0.15	0.21	0.26	0.29	0.08	0.14	0.05	0.1	0.09	0.13	0.12	0.06	0.52	0.07	1.0	0.96	0.71	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000523.37 (tig00000523_g1857.t1)	0.04	0.0	0.01	0.03	0.09	0.13	0.24	0.17	0.23	0.34	0.35	0.27	0.06	0.35	0.47	0.36	0.13	0.11	0.12	0.12	0.11	0.18	1.0	0.62	0.49	0.46
Cpa\|evm.model.tig00000786.10 (tig00000786_g4058.t1)	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.3	0.13	0.53	0.83	0.81	0.56	0.0	1.0	0.63	0.14	0.14	0.33	0.47	0.18	0.21	0.03	0.37	0.98	0.14	0.48
Cpa\|evm.model.tig00000842.27 (tig00000842_g4846.t1)	0.53	0.54	0.56	0.69	0.64	0.6	0.8	0.86	0.88	0.88	0.89	0.71	0.56	0.86	0.73	0.89	0.65	0.81	0.79	0.58	0.52	0.7	0.91	0.92	1.0	0.87
Cpa\|evm.model.tig00000851.38 (tig00000851_g4922.t1)	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.18	0.18	0.19	0.34	0.31	0.23	0.1	0.26	0.09	0.14	0.1	0.21	0.13	0.14	0.28	0.02	1.0	0.6	0.47	0.68
Cpa\|evm.model.tig00000863.56 (tig00000863_g5010.t1)	0.29	0.29	0.31	0.25	0.15	0.13	0.28	0.37	0.48	0.58	0.68	0.71	0.39	0.45	0.3	0.34	0.34	0.44	0.46	0.46	0.07	0.58	1.0	0.78	0.79	0.64
Cpa\|evm.model.tig00001057.13 (tig00001057_g6694.t1)	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.19	0.18	0.22	0.15	0.25	0.25	0.07	0.16	0.27	0.16	0.18	0.04	0.03	0.07	0.04	0.04	1.0	0.14	0.15	0.1
Cpa\|evm.model.tig00001057.19 (tig00001057_g6694.t1)	0.07	0.05	0.0	0.0	0.0	0.03	0.18	0.2	0.08	0.28	0.26	0.17	0.05	0.09	0.16	0.11	0.14	0.07	0.0	0.04	0.01	0.04	1.0	0.04	0.17	0.11
Cpa\|evm.model.tig00001057.21 (tig00001057_g6695.t1)	0.13	0.08	0.04	0.02	0.02	0.08	0.27	0.31	0.35	0.5	0.46	0.38	0.15	0.28	0.34	0.17	0.26	0.04	0.12	0.08	0.04	0.06	1.0	0.24	0.19	0.18
Cpa\|evm.model.tig00001086.20 (tig00001086_g6854.t1)	0.14	0.23	0.22	0.07	0.02	0.02	0.09	0.29	0.31	0.44	0.58	0.47	0.08	0.44	0.55	0.31	0.29	0.36	0.33	0.22	0.08	0.15	1.0	0.55	0.64	0.62
Cpa\|evm.model.tig00001095.33 (tig00001095_g7049.t1)	0.2	0.2	0.33	0.32	0.31	0.46	0.56	0.55	0.66	0.46	0.53	0.36	0.17	0.99	0.86	0.61	0.51	0.51	0.38	0.37	0.19	0.54	0.61	0.71	0.84	1.0
Cpa\|evm.model.tig00001214.12 (tig00001214_g7554.t1)	0.35	0.26	0.31	0.32	0.36	0.44	0.45	0.45	0.53	0.54	0.58	0.62	0.41	0.48	0.56	0.68	0.5	0.29	0.44	0.46	0.13	0.37	1.0	0.71	0.54	0.41
Cpa\|evm.model.tig00001222.11 (tig00001222_g7607.t1)	0.4	0.28	0.2	0.34	0.38	0.33	0.33	0.33	0.43	0.43	0.53	0.33	0.35	0.37	0.11	0.23	0.22	0.3	0.33	0.21	0.23	0.6	0.59	1.0	0.37	0.63
Cpa\|evm.model.tig00001222.4 (tig00001222_g7600.t1)	0.37	0.25	0.3	0.37	0.34	0.3	0.33	0.38	0.42	0.44	0.53	0.44	0.32	0.41	0.37	0.47	0.27	0.4	0.35	0.29	0.2	0.37	1.0	0.97	0.73	0.63
Cpa\|evm.model.tig00001222.6 (tig00001222_g7600.t1)	0.29	0.31	0.19	0.25	0.34	0.28	0.33	0.33	0.41	0.4	0.39	0.38	0.23	0.28	0.32	0.3	0.2	0.44	0.39	0.29	0.13	0.31	1.0	0.75	0.57	0.46
Cpa\|evm.model.tig00001532.1	0.09	0.05	0.06	0.17	0.21	0.22	0.39	0.32	0.38	0.27	0.29	0.24	0.09	0.25	0.19	0.34	0.13	0.19	0.27	0.12	0.29	0.32	1.0	0.7	0.57	0.5
Cpa\|evm.model.tig00001590.8 (tig00001590_g9380.t1)	0.56	0.4	0.38	0.43	0.52	0.49	0.61	0.66	0.62	0.72	0.67	0.57	0.49	0.87	0.74	0.68	0.51	0.75	0.74	0.37	0.49	1.0	0.83	0.88	0.88	0.77
Cpa\|evm.model.tig00020537.33 (tig00020537_g10256.t1)	0.12	0.1	0.16	0.28	0.32	0.35	0.4	0.38	0.47	0.5	0.48	0.39	0.11	0.3	0.35	0.63	0.36	0.57	0.51	0.35	0.37	0.33	1.0	0.76	0.8	0.6
Cpa\|evm.model.tig00020553.174 (tig00020553_g10666.t1)	0.04	0.12	0.18	0.19	0.2	0.3	0.31	0.31	0.42	0.4	0.38	0.43	0.05	0.33	0.32	0.33	0.29	0.48	0.39	0.3	0.23	0.35	1.0	0.7	0.62	0.58
Cpa\|evm.model.tig00020553.44 (tig00020553_g10531.t1)	0.36	0.25	0.15	0.23	0.16	0.26	0.24	0.26	0.3	0.34	0.36	0.31	0.2	0.4	0.26	0.38	0.26	0.22	0.42	0.32	0.33	0.22	1.0	0.43	0.59	0.61
Cpa\|evm.model.tig00020564.37 (tig00020564_g11437.t1)	0.24	0.16	0.14	0.17	0.17	0.2	0.32	0.35	0.4	0.42	0.44	0.56	0.19	0.28	0.15	0.2	0.17	0.4	0.3	0.21	0.05	0.28	1.0	0.76	0.65	0.33
Cpa\|evm.model.tig00020592.18 (tig00020592_g11651.t1)	0.09	0.06	0.07	0.1	0.1	0.11	0.18	0.19	0.22	0.34	0.35	0.25	0.11	0.42	0.29	0.32	0.39	0.35	0.29	0.23	0.27	0.33	1.0	0.61	0.58	0.65
Cpa\|evm.model.tig00020660.10 (tig00020660_g12507.t1)	0.03	0.06	0.13	0.22	0.19	0.26	0.44	0.44	0.55	0.66	0.61	0.44	0.02	0.78	0.44	0.46	0.2	0.29	0.25	0.22	0.37	0.4	0.7	0.55	0.81	1.0
Cpa\|evm.model.tig00020660.8 (tig00020660_g12507.t1)	0.03	0.02	0.04	0.06	0.1	0.06	0.16	0.12	0.26	0.34	0.31	0.17	0.01	0.38	0.2	0.29	0.15	0.14	0.11	0.05	0.33	0.31	0.48	0.6	1.0	0.61
Cpa\|evm.model.tig00020693.38 (tig00020693_g13049.t1)	0.33	0.32	0.25	0.21	0.27	0.24	0.25	0.21	0.22	0.33	0.38	0.38	0.26	0.49	0.27	0.34	0.32	0.31	0.44	0.31	0.4	0.09	1.0	0.91	0.45	0.6
Cpa\|evm.model.tig00020704.63 (tig00020704_g13209.t1)	0.3	0.12	0.18	0.23	0.26	0.11	0.26	0.37	0.46	0.36	0.49	0.57	0.24	0.11	0.08	0.12	0.1	0.19	0.13	0.14	0.07	0.38	1.0	0.41	0.32	0.5
Cpa\|evm.model.tig00020812.5 (tig00020812_g14080.t1)	0.32	0.22	0.18	0.26	0.32	0.27	0.32	0.41	0.43	0.43	0.53	0.57	0.25	0.34	0.23	0.26	0.2	0.33	0.38	0.22	0.11	0.23	1.0	0.73	0.39	0.56
Cpa\|evm.model.tig00020902.54 (tig00020902_g15007.t1)	0.12	0.01	0.02	0.09	0.25	0.31	0.56	0.38	0.46	0.72	0.64	0.51	0.15	1.0	0.42	0.6	0.3	0.31	0.31	0.31	0.14	0.44	1.0	0.74	0.79	0.68
Cpa\|evm.model.tig00020902.63 (tig00020902_g15019.t1)	0.23	0.15	0.14	0.19	0.26	0.37	0.37	0.36	0.4	0.5	0.59	0.57	0.31	0.66	0.38	0.55	0.29	0.36	0.29	0.24	0.11	0.18	1.0	0.74	0.54	0.61
Cpa\|evm.model.tig00020909.20 (tig00020909_g15342.t1)	0.43	0.32	0.25	0.28	0.31	0.23	0.33	0.32	0.27	0.4	0.56	0.58	0.3	0.27	0.22	0.26	0.13	0.22	0.15	0.22	0.17	0.05	1.0	0.56	0.48	0.66
Cpa\|evm.model.tig00020927.66 (tig00020927_g15999.t1)	0.08	0.15	0.27	0.33	0.25	0.25	0.31	0.37	0.43	0.45	0.52	0.4	0.11	0.83	0.42	0.74	0.52	0.45	0.43	0.35	0.07	0.49	1.0	0.74	0.99	0.69
Cpa\|evm.model.tig00021070.101 (tig00021070_g17917.t1)	0.59	0.43	0.36	0.31	0.32	0.19	0.29	0.36	0.38	0.5	0.55	0.53	0.51	0.21	0.23	0.17	0.16	0.25	0.16	0.17	0.06	0.08	1.0	0.83	0.61	0.61
Cpa\|evm.model.tig00021070.59 (tig00021070_g17871.t1)	0.28	0.22	0.26	0.33	0.41	0.44	0.38	0.34	0.36	0.43	0.46	0.56	0.22	0.46	0.28	0.42	0.42	0.47	0.42	0.41	0.08	0.3	1.0	0.93	0.51	0.49
Cpa\|evm.model.tig00021098.29 (tig00021098_g18199.t1)	0.04	0.07	0.19	0.27	0.29	0.35	0.4	0.32	0.61	0.44	0.59	0.58	0.02	0.37	0.63	0.43	0.37	0.35	0.35	0.22	0.11	0.4	1.0	0.79	0.56	0.43
Cpa\|evm.model.tig00021127.105 (tig00021127_g18786.t1)	0.12	0.19	0.08	0.18	0.13	0.11	0.22	0.23	0.27	0.32	0.34	0.33	0.03	0.13	0.15	0.07	0.11	0.4	0.27	0.15	0.08	0.03	1.0	0.38	0.39	0.27
Cpa\|evm.model.tig00021179.62 (tig00021179_g19276.t1)	0.05	0.08	0.19	0.27	0.26	0.23	0.29	0.28	0.23	0.24	0.24	0.18	0.06	0.28	0.18	0.19	0.18	0.26	0.26	0.26	0.48	0.19	1.0	0.6	0.32	0.67
Cpa\|evm.model.tig00021257.17 (tig00021257_g19755.t1)	0.24	0.27	0.23	0.34	0.44	0.39	0.48	0.48	0.58	0.6	0.57	0.49	0.17	1.0	0.81	0.61	0.45	0.56	0.43	0.45	0.47	0.31	0.8	0.63	0.88	0.9
Cpa\|evm.model.tig00021357.50 (tig00021357_g20775.t1)	0.06	0.17	0.27	0.25	0.21	0.14	0.29	0.36	0.44	0.67	0.68	0.59	0.1	0.4	0.46	0.36	0.38	0.52	0.64	0.47	0.46	0.42	1.0	0.86	0.84	0.6
Cpa\|evm.model.tig00021432.45 (tig00021432_g21238.t1)	0.58	0.41	0.39	0.39	0.39	0.39	0.41	0.39	0.39	0.42	0.45	0.55	0.57	0.61	0.61	0.58	0.44	0.54	0.59	0.42	0.61	0.48	1.0	0.7	0.54	0.63
Cpa\|evm.model.tig00021494.1 (tig00021494_g21913.t1)	0.05	0.07	0.18	0.24	0.17	0.18	0.4	0.48	0.55	0.61	0.71	0.7	0.09	0.48	0.36	0.47	0.34	0.55	0.41	0.32	0.33	0.38	0.55	0.64	1.0	0.64
Cpa\|evm.model.tig00021522.11 (tig00021522_g22104.t1)	0.1	0.02	0.05	0.08	0.12	0.1	0.23	0.19	0.17	0.78	0.77	0.64	0.21	1.0	0.12	0.41	0.33	0.19	0.17	0.58	0.15	0.21	0.69	0.96	0.43	0.69
Cpa\|evm.model.tig00021612.60 (tig00021612_g22901.t1)	0.51	0.44	0.31	0.35	0.34	0.27	0.36	0.43	0.45	0.6	0.64	0.71	0.52	0.43	0.35	0.36	0.37	0.32	0.3	0.35	0.19	0.25	1.0	0.61	0.56	0.48

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)