Heatmap: Cluster_15 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	-N	2.5M NaCl,0.5h	2.5M NaCl,1h	2.5M NaCl,2h	CCAP 19/18,4.5M NaCl	CCAP 19/18,5M Glycerol	CCAP 19/3	CCAP 19/3,Log	CCAP 19/3,Log,3M NaCl,1h	CCAP 19/3,Log,3M NaCl,6h	Log	Mid-log,Low light	Mid-log,Medium light	Mid-log,High light	Mid-log,White light	Mid-log,Red light	Mid-log,Blue light	Strain 435	Strain 435,H2O2	Strain 435,NaCl	Strain 435,Sorbitol
Dusal.0004s00026.1 (33201083)	0.74	0.22	0.23	0.56	0.99	0.89	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.7	1.0	0.49	0.35	0.64	0.51	0.2	0.2	0.4	0.31
Dusal.0023s00016.1 (33198011)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.93	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.78	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0023s00018.1 (33198037)	0.4	0.33	0.31	0.21	0.97	1.0	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.41	0.33	0.35	0.43	0.34	0.27	0.23	0.12	0.14
Dusal.0023s00034.1 (33198031)	0.51	0.26	0.21	0.5	1.0	0.93	0.26	0.19	0.14	0.22	0.13	0.57	0.65	0.45	0.34	0.34	0.5	0.37	0.44	0.48	0.41
Dusal.0025s00015.1 (33200681)	0.06	0.08	0.07	0.18	1.0	0.79	0.03	0.0	0.0	0.01	0.01	0.25	0.45	0.15	0.03	0.04	0.09	0.04	0.07	0.1	0.06
Dusal.0035s00005.1 (33196661)	0.55	0.04	0.02	0.05	1.0	0.79	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.6	0.66	0.3	0.26	0.52	0.68	0.25	0.17	0.33	0.32
Dusal.0058s00007.1 (33199370)	0.24	0.12	0.15	0.22	1.0	0.75	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.49	0.08	0.02	0.21	0.19	0.14	0.14	0.22	0.21
Dusal.0094s00031.1 (33187396)	0.14	0.2	0.2	0.35	0.95	1.0	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.8	0.56	0.38	0.31	0.39	0.36	0.23	0.35	0.39
Dusal.0100s00013.1 (33202471)	0.39	0.27	0.21	0.09	0.92	1.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.22	0.26	0.2	0.21	0.25	0.4	0.53	0.19	0.26
Dusal.0105s00003.1 (33200177)	0.29	0.34	0.41	0.58	1.0	0.97	0.21	0.04	0.09	0.07	0.22	0.55	0.56	0.41	0.26	0.22	0.26	0.33	0.41	0.49	0.41
Dusal.0105s00016.1 (33200196)	0.6	0.12	0.15	0.3	1.0	0.84	0.19	0.01	0.01	0.0	0.12	0.68	0.93	0.37	0.29	0.48	0.69	0.3	0.31	0.38	0.34
Dusal.0110s00022.1 (33194356)	0.35	0.34	0.29	0.08	1.0	1.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.67	0.39	0.2	0.3	0.4	0.44	0.44	0.08	0.27
Dusal.0111s00023.1 (33199798)	0.4	0.14	0.15	0.15	1.0	0.93	0.18	0.07	0.07	0.05	0.03	0.29	0.47	0.35	0.13	0.25	0.28	0.3	0.28	0.28	0.3
Dusal.0129s00011.1 (33194510)	0.7	0.34	0.28	0.41	1.0	0.93	0.59	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	0.93	0.54	0.39	0.43	0.43	0.22	0.28	0.4	0.37
Dusal.0160s00005.1 (33188345)	0.45	0.34	0.38	0.11	1.0	0.95	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.53	0.23	0.4	0.67	0.41	0.32	0.35	0.1	0.15
Dusal.0161s00017.1 (33201261)	0.26	0.16	0.19	0.36	1.0	0.85	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.86	0.42	0.12	0.51	0.42	0.23	0.28	0.35	0.29
Dusal.0181s00017.1 (33189278)	0.55	0.24	0.32	0.5	1.0	0.87	0.37	0.08	0.07	0.06	0.07	0.41	0.9	0.4	0.11	0.44	0.27	0.29	0.31	0.48	0.41
Dusal.0193s00004.1 (33196099)	0.53	0.11	0.13	0.21	1.0	0.94	0.15	0.06	0.07	0.11	0.12	0.63	0.84	0.4	0.37	0.51	0.56	0.24	0.26	0.51	0.39
Dusal.0227s00005.1 (33197607)	0.48	0.14	0.19	0.19	1.0	0.96	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.41	0.36	0.35	0.16	0.25	0.15	0.22	0.16	0.22
Dusal.0228s00019.1 (33187327)	1.0	0.21	0.25	0.29	0.98	0.86	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0	0.62	0.74	0.75	0.66	0.39	0.45	0.27	0.27	0.28	0.23
Dusal.0240s00020.1 (33202728)	0.23	0.15	0.16	0.25	1.0	0.82	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.47	0.25	0.13	0.2	0.27	0.09	0.1	0.21	0.18
Dusal.0263s00002.1 (33192431)	0.76	0.47	0.42	0.3	0.93	0.96	0.75	0.0	0.0	0.0	0.0	0.87	1.0	0.65	0.46	0.56	0.68	0.23	0.32	0.38	0.21
Dusal.0263s00016.1 (33192427)	0.56	0.18	0.18	0.29	1.0	0.9	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.41	0.34	0.3	0.14	0.19	0.26	0.28	0.27	0.31
Dusal.0300s00017.1 (33188054)	0.33	0.08	0.11	0.14	1.0	0.82	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.59	0.15	0.03	0.08	0.09	0.12	0.13	0.17	0.12
Dusal.0311s00013.1 (33186235)	0.34	0.24	0.28	0.22	1.0	0.88	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.44	0.33	0.21	0.22	0.24	0.27	0.3	0.1	0.24
Dusal.0362s00007.1 (33189269)	0.68	0.2	0.24	0.12	0.99	0.97	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	1.0	0.44	0.31	0.36	0.52	0.27	0.36	0.31	0.35
Dusal.0392s00004.1 (33187247)	0.4	0.19	0.23	0.22	1.0	0.91	0.29	0.05	0.01	0.02	0.01	0.57	0.85	0.33	0.34	0.63	0.68	0.26	0.35	0.3	0.32
Dusal.0399s00014.1 (33191732)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.92	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.83	0.13	0.18	0.13	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0402s00015.1 (33196852)	0.65	0.16	0.19	0.09	1.0	0.81	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.8	0.34	0.33	0.38	0.4	0.32	0.4	0.11	0.28
Dusal.0407s00006.1 (33197900)	0.89	0.25	0.29	0.56	1.0	0.86	0.56	0.16	0.15	0.19	0.17	0.58	0.85	0.33	0.37	0.66	0.53	0.22	0.28	0.35	0.29
Dusal.0411s00005.1 (33201249)	0.23	0.24	0.2	0.1	0.73	0.73	0.45	0.0	0.0	0.0	0.0	0.7	1.0	0.65	0.39	0.22	0.29	0.25	0.28	0.17	0.25
Dusal.0420s00005.1 (33194852)	0.2	0.27	0.24	0.09	0.98	1.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.78	0.47	0.22	0.23	0.26	0.39	0.41	0.12	0.2
Dusal.0447s00004.1 (33186877)	0.5	0.28	0.34	0.23	1.0	0.82	0.46	0.01	0.0	0.0	0.03	0.5	0.94	0.44	0.33	0.33	0.43	0.34	0.35	0.2	0.38
Dusal.0447s00010.1 (33186880)	0.08	0.14	0.15	0.25	1.0	0.82	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.67	0.95	0.3	0.07	0.57	0.47	0.14	0.16	0.21	0.2
Dusal.0487s00004.1 (33203260)	0.31	0.07	0.07	0.09	1.0	0.91	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.67	0.36	0.09	0.15	0.14	0.17	0.12	0.23	0.19
Dusal.0533s00006.1 (33189077)	0.32	0.16	0.15	0.4	0.92	1.0	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0	0.52	0.91	0.52	0.34	0.36	0.41	0.23	0.27	0.58	0.41
Dusal.0539s00008.1 (33194239)	0.17	0.07	0.13	0.26	1.0	0.97	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.51	0.94	0.32	0.06	0.29	0.17	0.21	0.33	0.24	0.28
Dusal.0546s00009.1 (33194090)	0.46	0.23	0.27	0.21	1.0	1.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.35	0.16	0.27	0.34	0.25	0.23	0.18	0.12	0.14
Dusal.0587s00004.1 (33188428)	0.45	0.25	0.28	0.24	0.88	0.88	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	1.0	0.57	0.34	0.57	0.43	0.3	0.25	0.27	0.25
Dusal.0607s00002.1 (33187793)	0.31	0.4	0.36	0.18	1.0	0.98	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.37	0.27	0.42	0.61	0.51	0.38	0.38	0.13	0.18
Dusal.0698s00009.1 (33202033)	0.55	0.39	0.42	0.22	0.89	1.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.41	0.28	0.51	0.32	0.4	0.27	0.3	0.15	0.2
Dusal.0708s00006.1 (33201672)	0.1	0.28	0.29	0.13	0.97	1.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.29	0.23	0.32	0.45	0.41	0.31	0.33	0.1	0.22
Dusal.0742s00004.1 (33189897)	0.25	0.25	0.25	0.33	1.0	0.9	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.78	0.24	0.2	0.43	0.32	0.49	0.5	0.47	0.45
Dusal.0759s00008.1 (33194759)	0.52	0.2	0.22	0.34	1.0	0.93	0.24	0.0	0.0	0.01	0.0	0.47	0.75	0.22	0.21	0.46	0.57	0.3	0.39	0.44	0.3
Dusal.0810s00005.1 (33198562)	0.46	0.17	0.16	0.13	1.0	0.78	0.2	0.04	0.01	0.03	0.06	0.28	0.57	0.16	0.14	0.25	0.25	0.22	0.21	0.26	0.33
Dusal.0823s00003.1 (33201516)	0.53	0.19	0.19	0.28	1.0	0.93	0.22	0.23	0.24	0.34	0.18	0.35	0.62	0.36	0.42	0.4	0.48	0.43	0.51	0.34	0.46
Dusal.0833s00002.1 (33193591)	1.0	0.25	0.24	0.12	0.76	0.74	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.81	0.55	0.23	0.55	0.55	0.24	0.21	0.16	0.35
Dusal.0883s00006.1 (33201952)	0.11	0.03	0.02	0.04	1.0	0.87	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.86	0.29	0.0	0.0	0.0	0.05	0.08	0.08	0.06
Dusal.1095s00001.1 (33197946)	0.56	0.26	0.27	0.17	1.0	0.87	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.51	1.0	0.55	0.14	0.24	0.43	0.26	0.23	0.23	0.36
Dusal.1242s00001.1 (33195130)	0.12	0.22	0.19	0.11	0.95	1.0	0.32	0.01	0.01	0.01	0.01	0.32	0.44	0.34	0.43	0.27	0.33	0.1	0.16	0.24	0.12

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)