Heatmap: Cluster_13 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	-N	2.5M NaCl,0.5h	2.5M NaCl,1h	2.5M NaCl,2h	CCAP 19/18,4.5M NaCl	CCAP 19/18,5M Glycerol	CCAP 19/3	CCAP 19/3,Log	CCAP 19/3,Log,3M NaCl,1h	CCAP 19/3,Log,3M NaCl,6h	Log	Mid-log,Low light	Mid-log,Medium light	Mid-log,High light	Mid-log,White light	Mid-log,Red light	Mid-log,Blue light	Strain 435	Strain 435,H2O2	Strain 435,NaCl	Strain 435,Sorbitol
Dusal.0004s00020.1 (33201038)	1.0	0.28	0.26	0.48	0.17	0.15	0.22	0.13	0.13	0.04	0.02	0.48	0.81	0.3	0.11	0.16	0.26	0.17	0.17	0.29	0.16
Dusal.0018s00044.1 (33187084)	0.81	0.8	0.67	0.49	0.5	0.48	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.7	0.57	0.67	0.89	1.0	0.43	0.43	0.25	0.31
Dusal.0025s00045.1 (33200718)	0.43	0.43	0.39	0.78	0.64	0.55	0.99	0.0	0.0	0.0	0.09	0.94	1.0	0.54	0.55	0.71	0.95	0.45	0.49	0.51	0.61
Dusal.0026s00013.1 (33185403)	0.47	0.35	0.39	0.98	0.62	0.63	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.82	0.75	0.69	1.0	1.0	0.68	0.07	0.07	0.2	0.14
Dusal.0032s00003.1 (33186672)	0.3	0.75	0.62	0.63	0.64	0.58	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.87	0.51	0.63	0.75	1.0	0.62	0.58	0.5	0.54
Dusal.0041s00019.1 (33194538)	0.39	0.31	0.28	0.28	0.29	0.23	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.65	0.67	0.56	1.0	0.7	0.67	0.01	0.0	0.0	0.0
Dusal.0044s00020.1 (33194932)	0.09	0.0	0.01	0.04	0.0	0.0	0.22	0.01	0.0	0.01	0.01	0.23	1.0	0.97	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.42	0.12
Dusal.0049s00015.1 (33200336)	0.29	0.57	0.55	0.17	0.58	0.51	0.42	0.0	0.0	0.0	0.01	0.76	0.87	0.26	0.31	0.87	0.84	0.61	1.0	0.39	0.73
Dusal.0056s00001.1 (33188758)	0.48	0.4	0.47	0.67	0.59	0.59	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.82	0.67	0.8	0.63	0.79	0.38	0.28	0.24	0.33
Dusal.0068s00006.1 (33187230)	0.41	0.13	0.35	0.6	0.72	0.64	0.44	0.0	0.01	0.0	0.02	0.62	1.0	0.47	0.31	0.64	0.74	0.19	0.2	0.36	0.21
Dusal.0071s00019.1 (33185717)	0.67	0.45	0.54	0.82	0.98	0.96	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.89	0.73	0.8	1.0	0.82	0.83	0.3	0.3	0.47	0.38
Dusal.0078s00013.1 (33203811)	0.59	0.0	0.0	0.0	0.08	0.1	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.74	0.82	1.0	0.2	0.54	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0081s00007.1 (33198263)	0.13	0.64	0.54	0.33	0.33	0.36	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.26	0.16	1.0	0.61	0.37	0.49	0.38	0.21	0.29
Dusal.0091s00018.1 (33193962)	0.32	0.82	0.72	0.51	0.89	0.89	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.31	0.15	1.0	0.57	0.46	0.43	0.36	0.27	0.31
Dusal.0096s00031.1 (33195837)	0.01	0.04	0.03	0.0	0.02	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	1.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.06	0.07	0.03	0.06
Dusal.0102s00014.1 (33190546)	0.4	0.2	0.31	0.58	0.39	0.38	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.69	0.77	0.66	0.46	0.67	0.18	0.21	0.43	0.2
Dusal.0103s00012.1 (33186324)	0.68	0.57	0.56	0.49	0.94	0.85	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.91	1.0	0.79	0.33	0.61	0.82	0.23	0.26	0.45	0.38
Dusal.0109s00010.1 (33202383)	0.34	0.58	0.51	0.44	0.57	0.55	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.75	0.65	0.55	0.96	0.95	1.0	0.21	0.19	0.14	0.14
Dusal.0110s00028.1 (33194367)	0.45	0.17	0.22	0.59	0.25	0.27	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.91	0.92	1.0	0.54	0.44	0.67	0.05	0.04	0.07	0.02
Dusal.0114s00008.1 (33202237)	0.0	0.57	0.68	0.14	0.71	0.78	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.83	1.0	0.51	0.22	0.62	0.76	0.74	0.73	0.47	0.56
Dusal.0138s00008.1 (33197030)	0.17	0.0	0.0	0.0	0.04	0.02	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.75	1.0	0.02	0.01	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0147s00014.1 (33195555)	0.42	0.73	0.71	0.61	0.44	0.43	0.36	0.07	0.1	0.1	0.08	0.34	0.27	0.11	0.94	1.0	0.63	0.69	0.7	0.35	0.54
Dusal.0160s00026.1 (33188347)	0.76	0.3	0.23	0.27	0.23	0.23	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.76	0.67	0.78	1.0	0.56	0.67	0.04	0.02	0.05	0.05
Dusal.0161s00006.1 (33201288)	0.41	0.04	0.14	0.76	1.0	0.92	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.84	0.57	0.1	0.08	0.09	0.09	0.08	0.22	0.06
Dusal.0199s00010.1 (33199104)	0.45	1.0	0.99	0.98	0.5	0.45	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.38	0.17	0.85	0.73	0.66	0.45	0.6	0.34	0.48
Dusal.0224s00018.1 (33186477)	0.47	0.51	0.59	0.5	0.78	0.71	0.42	0.0	0.01	0.0	0.0	1.0	0.88	0.72	0.63	0.57	0.75	0.23	0.31	0.56	0.46
Dusal.0244s00014.1 (33186519)	0.44	0.27	0.28	0.42	0.79	0.88	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.29	0.28	1.0	0.65	0.51	0.33	0.23	0.43	0.23
Dusal.0246s00017.1 (33197694)	0.65	0.21	0.23	0.52	0.39	0.39	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.67	0.72	0.91	0.5	0.8	0.16	0.14	0.2	0.11
Dusal.0247s00007.1 (33200437)	0.42	0.38	0.3	0.17	0.57	0.49	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.51	0.48	0.57	1.0	0.62	0.71	0.35	0.29	0.13	0.17
Dusal.0248s00016.1 (33189807)	0.3	0.38	0.51	0.3	0.75	1.0	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.27	0.17	0.52	0.32	0.33	0.11	0.16	0.38	0.2
Dusal.0250s00016.1 (33198098)	0.23	0.09	0.29	1.0	0.58	0.5	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.37	0.76	0.12	0.04	0.09	0.04	0.04	0.64	0.13
Dusal.0263s00015.1 (33192442)	0.0	0.06	0.09	1.0	0.14	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.51	0.48	0.08	0.19	0.23	0.02	0.01	0.17	0.09
Dusal.0299s00005.1 (33185792)	0.66	0.27	0.46	0.98	0.68	0.66	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.71	1.0	0.6	0.97	0.69	0.69	0.36	0.33	0.67	0.39
Dusal.0307s00002.1 (33188316)	0.33	0.56	0.49	0.7	0.78	0.77	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.58	0.51	0.45	1.0	0.77	0.84	0.29	0.33	0.34	0.39
Dusal.0313s00005.1 (33202814)	0.32	0.36	0.33	0.21	0.54	0.51	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.66	0.54	0.85	1.0	0.54	0.31	0.28	0.13	0.18
Dusal.0317s00019.1 (33192306)	0.06	0.25	0.54	1.0	0.37	0.4	0.11	0.0	0.0	0.0	0.01	0.62	0.17	0.84	0.22	0.16	0.25	0.17	0.24	0.3	0.28
Dusal.0326s00001.1 (33186775)	0.27	0.63	0.67	1.0	0.58	0.51	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.67	0.77	0.94	0.26	0.24	0.38	0.07	0.07	0.16	0.05
Dusal.0349s00008.1 (33189938)	0.7	0.27	0.31	0.94	0.54	0.5	0.51	0.0	0.0	0.0	0.0	0.75	1.0	0.8	0.7	0.56	0.55	0.23	0.19	0.43	0.23
Dusal.0354s00001.1 (33201406)	0.18	0.04	0.13	0.42	0.16	0.11	0.15	0.02	0.02	0.04	0.25	0.12	0.79	1.0	0.0	0.01	0.0	0.25	0.27	0.45	0.2
Dusal.0366s00013.1 (33199961)	0.47	0.77	0.77	0.56	0.76	0.74	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.43	0.26	1.0	0.65	0.36	0.26	0.21	0.26	0.18
Dusal.0374s00009.1 (33192008)	0.15	0.07	0.22	1.0	0.21	0.17	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.79	0.75	0.16	0.17	0.16	0.14	0.13	0.45	0.1
Dusal.0384s00014.1 (33195991)	0.58	0.31	0.42	0.56	0.82	0.84	0.41	0.23	0.2	0.18	0.14	0.32	0.33	0.29	1.0	0.74	0.53	0.44	0.41	0.5	0.49
Dusal.0422s00010.1 (33186840)	0.36	0.56	0.52	0.61	0.76	0.78	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.69	0.51	0.47	1.0	0.98	0.68	0.23	0.27	0.14	0.22
Dusal.0425s00008.1 (33201227)	1.0	0.56	0.5	0.46	0.5	0.45	0.6	0.28	0.26	0.3	0.14	0.59	0.7	0.4	0.73	0.75	0.82	0.45	0.49	0.33	0.38
Dusal.0438s00007.1 (33186966)	1.0	0.33	0.49	0.88	0.32	0.27	0.41	0.02	0.02	0.03	0.04	0.5	0.68	0.39	0.22	0.67	0.47	0.11	0.11	0.16	0.12
Dusal.0511s00009.1 (33195057)	0.47	0.26	0.32	0.94	0.45	0.44	0.86	0.0	0.0	0.0	0.18	0.84	1.0	0.64	0.62	0.68	0.61	0.32	0.34	0.71	0.38
Dusal.0513s00016.1 (33186377)	0.06	0.37	0.39	0.21	0.23	0.24	0.34	0.07	0.07	0.07	0.02	0.17	0.27	0.15	0.57	1.0	0.64	0.46	0.43	0.23	0.32
Dusal.0545s00007.1 (33199355)	0.47	0.0	0.0	0.0	0.13	0.12	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.55	1.0	0.44	0.24	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0546s00001.1 (33194089)	1.0	0.61	0.55	0.3	0.53	0.51	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.51	0.5	0.35	0.67	0.64	0.58	0.47	0.42	0.21	0.33
Dusal.0547s00005.1 (33188671)	0.46	0.16	0.18	0.54	0.58	0.54	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.6	0.54	0.46	0.77	0.55	1.0	0.23	0.21	0.46	0.25
Dusal.0556s00001.1 (33195346)	0.26	0.18	0.38	0.89	0.81	0.68	0.88	0.0	0.0	0.0	0.0	0.99	1.0	0.94	0.32	0.58	0.49	0.29	0.27	0.46	0.38
Dusal.0573s00004.1 (33189044)	0.53	0.5	0.41	1.0	0.24	0.23	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.55	0.91	0.56	0.29	0.43	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0
Dusal.0706s00005.1 (33190571)	0.54	0.57	0.54	0.73	0.77	0.68	0.66	0.0	0.0	0.0	0.0	0.87	0.94	0.78	0.86	0.92	1.0	0.28	0.24	0.29	0.24
Dusal.0715s00008.1 (33200890)	0.11	0.03	0.62	1.0	0.98	0.72	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.13	0.18	0.01	0.02	0.03	0.04	0.04	0.18	0.04
Dusal.0735s00002.1 (33198588)	0.7	0.27	0.31	1.0	0.38	0.47	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.83	0.53	0.84	0.91	0.62	0.74	0.11	0.15	0.61	0.17
Dusal.0741s00001.1 (33191034)	1.0	0.25	0.17	0.1	0.38	0.28	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.78	0.47	0.51	0.98	0.65	0.67	0.09	0.09	0.11	0.14
Dusal.0757s00005.1 (33202070)	1.0	0.06	0.16	0.93	0.31	0.22	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.51	0.34	0.3	0.39	0.34	0.08	0.1	0.11	0.1
Dusal.0766s00004.1 (33188361)	0.24	0.31	0.34	0.52	0.67	0.64	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.33	0.22	1.0	0.57	0.59	0.3	0.35	0.25	0.31
Dusal.0895s00001.1 (33191714)	0.44	0.18	0.24	0.84	0.49	0.57	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.75	0.74	0.66	1.0	0.74	0.9	0.13	0.11	0.41	0.17
Dusal.1048s00003.1 (33194744)	0.21	0.95	0.91	0.75	0.4	0.43	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.44	0.21	0.8	1.0	0.62	0.69	0.51	0.37	0.46
Dusal.1091s00001.1 (33201713)	0.57	0.95	0.86	0.51	0.71	0.64	0.61	0.0	0.0	0.01	0.0	0.73	0.97	0.65	0.55	1.0	0.88	0.79	0.95	0.45	0.54
Dusal.1098s00003.1 (33201898)	1.0	0.25	0.28	0.55	0.36	0.32	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.61	0.46	0.37	0.27	0.4	0.57	0.09	0.1	0.14	0.09
Dusal.1155s00001.1 (33197627)	0.54	0.11	0.08	0.41	0.3	0.25	0.68	0.31	0.28	0.3	0.33	0.27	1.0	0.45	0.04	0.17	0.19	0.06	0.08	0.19	0.05
Dusal.2537s00001.1 (33193777)	0.33	0.55	0.42	0.31	0.74	0.67	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.82	1.0	0.32	0.54	0.67	0.93	0.5	0.49	0.32	0.45
Dusal.3971s00001.1 (33198839)	0.12	0.34	0.31	0.2	0.17	0.16	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.14	0.05	0.52	1.0	0.37	0.44	0.37	0.12	0.18

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)