Heatmap: Cluster_170 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
-N
2.5M NaCl,0.5h
2.5M NaCl,1h
2.5M NaCl,2h
CCAP 19/18,4.5M NaCl
CCAP 19/18,5M Glycerol
CCAP 19/3
CCAP 19/3,Log
CCAP 19/3,Log,3M NaCl,1h
CCAP 19/3,Log,3M NaCl,6h
Log
Mid-log,Low light
Mid-log,Medium light
Mid-log,High light
Mid-log,White light
Mid-log,Red light
Mid-log,Blue light
Strain 435
Strain 435,H2O2
Strain 435,NaCl
Strain 435,Sorbitol
Dusal.0006s00032.1 (33186145)
1.0 0.52 0.44 0.49 0.76 0.8 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.43 0.81 0.87 0.52 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0007s00016.1 (33201178)
1.0 0.3 0.25 0.48 0.58 0.48 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.76 0.84 0.76 0.62 0.85 0.2 0.16 0.25 0.16
Dusal.0021s00006.1 (33197783)
0.5 0.4 0.39 0.36 0.65 0.59 0.76 0.18 0.29 0.12 0.21 1.0 0.89 0.79 0.78 0.72 0.88 0.7 0.75 0.78 0.83
Dusal.0024s00024.1 (33202208)
0.88 0.52 0.48 0.51 0.77 0.73 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 1.0 0.69 0.63 0.83 0.97 0.82 0.74 0.89 0.93
Dusal.0027s00014.1 (33191537)
0.41 0.2 0.23 0.36 0.54 0.53 1.0 0.24 0.18 0.55 0.28 0.67 0.84 0.53 0.64 0.69 0.68 0.41 0.42 0.56 0.59
Dusal.0031s00033.1 (33192239)
0.15 0.47 0.48 0.36 0.21 0.22 0.11 0.1 0.09 0.08 0.03 0.48 0.36 0.19 0.65 1.0 0.88 0.33 0.25 0.19 0.26
Dusal.0038s00007.1 (33192342)
0.52 0.35 0.33 0.36 0.62 0.62 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.76 1.0 0.93 0.57 0.66 0.77 0.86 0.65 0.64
Dusal.0043s00018.1 (33199633)
0.2 1.0 0.83 0.68 0.92 0.79 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.64 0.39 0.6 0.7 0.79 0.18 0.21 0.26 0.3
Dusal.0045s00031.1 (33191656)
0.13 0.18 0.2 0.36 0.46 0.44 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 1.0 0.4 0.28 0.38 0.43 0.47 0.6 0.76 0.54
Dusal.0046s00027.1 (33197243)
0.97 0.08 0.04 0.1 0.56 0.55 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.59 1.0 0.45 0.47 0.61 0.2 0.18 0.17 0.15
Dusal.0048s00020.1 (33189473)
1.0 0.15 0.13 0.29 0.48 0.55 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.55 0.59 0.62 0.32 0.49 0.25 0.24 0.25 0.23
Dusal.0049s00005.1 (33200327)
0.32 0.48 0.33 0.3 0.55 0.62 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.53 0.89 1.0 0.31 0.29 0.27 0.2 0.1 0.13
Dusal.0054s00027.1 (33201640)
0.51 0.34 0.3 0.47 0.59 0.64 0.82 0.4 0.27 0.44 0.13 0.73 0.75 0.74 0.87 0.66 0.77 0.89 1.0 1.0 1.0
Dusal.0066s00001.1 (33195467)
0.18 0.22 0.22 0.36 0.24 0.27 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.7 0.52 1.0 0.46 0.47 0.05 0.04 0.04 0.06
Dusal.0084s00005.1 (33201462)
0.54 0.72 0.77 0.84 0.52 0.52 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.98 0.94 1.0 0.74 0.7 0.6 0.51 0.46 0.45
Dusal.0084s00018.1 (33201461)
0.44 0.48 0.51 0.65 0.45 0.45 0.87 0.3 0.25 0.47 0.23 0.79 1.0 0.45 0.58 0.73 0.6 0.61 0.62 0.71 0.62
Dusal.0119s00020.1 (33195187)
0.55 0.44 0.33 0.15 0.49 0.54 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.44 0.63 1.0 0.66 0.74 0.67 0.71 0.18 0.44
Dusal.0131s00011.1 (33186824)
0.67 0.37 0.28 0.42 0.38 0.33 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.95 0.27 0.47 0.94 1.0 0.6 0.65 0.42 0.77
Dusal.0149s00003.1 (33186642)
0.62 0.29 0.24 0.28 0.55 0.64 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.83 0.93 0.77 0.56 0.84 0.51 0.45 0.47 0.53
Dusal.0149s00024.1 (33186624)
0.34 0.63 0.64 0.5 0.56 0.55 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.96 0.83 0.83 0.66 0.7 0.67 0.69 0.44 0.6
Dusal.0149s00025.1 (33186623)
0.73 0.61 0.6 0.98 0.54 0.6 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.88 0.88 1.0 0.8 0.53 0.0 0.0 0.0 0.01
Dusal.0156s00020.1 (33189017)
0.36 0.45 0.51 0.69 0.36 0.35 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.57 0.78 1.0 0.49 0.59 0.43 0.45 0.47 0.52
Dusal.0193s00019.1 (33196110)
0.38 0.49 0.46 0.72 0.61 0.58 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.8 0.84 0.71 0.74 0.86 0.8 0.81 1.0 0.74
Dusal.0199s00015.1 (33199099)
0.48 0.54 0.52 0.52 0.81 0.9 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.79 0.67 0.82 0.78 0.98 0.83 0.89 0.73 0.83
Dusal.0200s00006.1 (33197056)
0.6 0.48 0.45 0.26 0.39 0.42 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.52 0.45 1.0 0.71 0.75 0.58 0.64 0.29 0.29
Dusal.0211s00009.1 (33198604)
0.62 0.11 0.15 0.34 0.47 0.42 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.74 0.69 0.28 0.26 0.42 0.25 0.31 0.48 0.39
Dusal.0234s00021.1 (33190802)
0.67 0.33 0.46 0.46 0.46 0.42 0.93 0.37 0.35 0.42 0.28 0.83 1.0 0.6 0.65 0.83 0.76 0.41 0.41 0.39 0.45
Dusal.0312s00001.1 (33200985)
0.8 0.71 0.85 1.0 1.0 0.92 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.44 0.39 0.86 0.8 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0315s00001.1 (33192601)
0.23 0.25 0.23 0.23 0.62 0.54 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 1.0 0.42 0.15 0.33 0.23 0.28 0.27 0.23 0.29
Dusal.0323s00005.1 (33192403)
0.79 0.23 0.26 0.6 0.53 0.61 0.78 0.13 0.12 0.44 0.09 0.84 1.0 0.77 0.89 0.78 0.73 0.55 0.53 0.57 0.5
Dusal.0358s00013.1 (33203380)
0.96 0.15 0.11 0.02 0.56 0.6 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.51 1.0 0.75 0.58 0.7 0.32 0.33 0.32 0.36
Dusal.0363s00010.1 (33186894)
0.74 0.34 0.26 0.57 0.7 0.7 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.72 0.65 0.85 0.96 0.96 0.51 0.52 1.0 0.64
Dusal.0365s00001.1 (33194908)
0.0 0.39 0.4 0.59 0.16 0.17 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.78 0.85 1.0 0.23 0.35 0.24 0.2 0.56 0.39
Dusal.0371s00016.1 (33186929)
0.3 0.17 0.22 0.44 0.13 0.11 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.7 0.3 0.35 0.52 0.65 0.35 0.43 1.0 0.76
Dusal.0399s00005.1 (33191733)
0.39 0.53 0.52 0.42 0.33 0.33 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 1.0 0.63 0.71 0.62 0.56 0.16 0.15 0.25 0.16
Dusal.0462s00005.1 (33197494)
0.6 0.09 0.07 0.19 0.32 0.3 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 1.0 0.47 0.43 0.66 0.6 0.24 0.24 0.59 0.35
Dusal.0467s00013.1 (33194478)
0.91 0.62 0.57 0.63 0.6 0.63 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.71 0.27 0.39 0.68 0.5 0.51 0.62 0.47 0.53
Dusal.0470s00003.1 (33196989)
0.43 0.49 0.4 0.33 0.35 0.35 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.74 0.64 1.0 0.79 0.56 0.39 0.3 0.2 0.3
Dusal.0481s00003.1 (33201479)
0.16 0.5 0.46 0.38 0.27 0.28 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.55 0.59 1.0 0.54 0.67 0.24 0.24 0.16 0.19
Dusal.0486s00011.1 (33199404)
0.46 0.42 0.45 0.56 0.47 0.45 0.83 0.02 0.0 0.0 0.03 0.82 1.0 0.64 0.62 0.65 0.83 0.36 0.4 0.58 0.44
Dusal.0514s00009.1 (33192278)
0.29 0.48 0.5 0.45 0.66 0.74 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 1.0 0.86 0.58 0.71 0.93 0.46 0.5 0.4 0.45
Dusal.0566s00004.1 (33194244)
0.47 0.18 0.16 0.09 0.47 0.5 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 1.0 0.53 0.44 0.52 0.56 0.21 0.25 0.18 0.22
Dusal.0628s00007.1 (33195401)
0.82 0.29 0.24 0.41 0.52 0.5 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.98 0.89 0.72 0.56 0.68 0.18 0.16 0.2 0.14
Dusal.0663s00008.1 (33186083)
0.6 0.15 0.17 0.2 0.48 0.51 0.96 0.09 0.09 0.14 0.33 0.6 1.0 0.49 0.4 0.32 0.33 0.37 0.4 0.44 0.43
Dusal.0701s00003.1 (33185976)
0.36 0.22 0.3 0.48 0.69 0.65 0.8 0.07 0.06 0.17 0.35 0.8 1.0 0.51 0.56 0.55 0.64 0.42 0.52 0.38 0.43
Dusal.0731s00001.1 (33195672)
0.3 0.54 0.47 0.37 0.36 0.39 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.53 0.4 1.0 0.79 0.51 0.41 0.39 0.26 0.31
Dusal.0867s00001.1 (33191468)
0.3 0.34 0.5 0.63 0.52 0.56 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 1.0 1.0 0.91 0.54 0.53 0.71 0.6 0.29 0.39
Dusal.0910s00005.1 (33197652)
0.96 0.35 0.42 0.41 0.78 0.65 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 1.0 0.5 0.4 0.53 0.87 0.46 0.64 0.53 0.58
Dusal.0942s00005.1 (33197485)
0.96 0.46 0.49 0.58 0.69 0.62 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.96 0.65 0.55 0.82 0.95 0.76 0.84 0.67 0.76
Dusal.1185s00001.1 (33192682)
0.45 0.47 0.4 0.47 0.43 0.47 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.51 0.52 1.0 0.6 0.42 0.47 0.54 0.33 0.39
Dusal.1430s00002.1 (33193070)
0.19 0.31 0.35 1.0 0.62 0.65 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.41 0.84 0.91 0.29 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.1747s00001.1 (33203463)
0.1 0.45 0.43 0.54 0.4 0.45 0.28 0.0 0.0 0.0 0.23 0.44 0.61 0.44 1.0 0.35 0.28 0.48 0.47 0.48 0.51
Dusal.1968s00001.1 (33192580)
0.37 0.21 0.29 0.56 0.19 0.2 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.49 0.39 1.0 0.73 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.1970s00001.1 (33187299)
0.35 0.55 0.43 0.29 0.49 0.53 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.66 0.64 0.82 0.58 0.87 0.48 0.55 0.46 0.5
Dusal.2165s00001.1 (33196590)
0.1 0.45 0.43 0.54 0.4 0.45 0.28 0.0 0.0 0.0 0.23 0.44 0.61 0.44 1.0 0.35 0.28 0.48 0.47 0.48 0.51
Dusal.2166s00001.1 (33189919)
0.31 0.34 0.39 0.42 0.32 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.44 0.34 0.81 0.72 1.0 0.24 0.25 0.17 0.18
Dusal.4071s00001.1 (33202092)
0.38 0.25 0.37 0.77 0.32 0.27 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 1.0 0.49 0.49 0.79 0.8 0.6 0.62 0.9 0.59

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)