Heatmap: Cluster_79 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
-N
2.5M NaCl,0.5h
2.5M NaCl,1h
2.5M NaCl,2h
CCAP 19/18,4.5M NaCl
CCAP 19/18,5M Glycerol
CCAP 19/3
CCAP 19/3,Log
CCAP 19/3,Log,3M NaCl,1h
CCAP 19/3,Log,3M NaCl,6h
Log
Mid-log,Low light
Mid-log,Medium light
Mid-log,High light
Mid-log,White light
Mid-log,Red light
Mid-log,Blue light
Strain 435
Strain 435,H2O2
Strain 435,NaCl
Strain 435,Sorbitol
Dusal.0009s00036.1 (33190497)
1.44 0.0 0.0 0.0 7.27 5.03 0.16 2.38 2.34 1.55 0.9 0.78 1.08 1.38 1.46 0.24 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0010s00047.1 (33196817)
1.03 0.16 0.15 0.65 6.26 4.52 0.24 1.73 1.27 0.75 0.71 0.24 0.43 0.2 0.26 0.67 0.7 0.16 0.15 0.35 0.29
Dusal.0037s00019.1 (33185936)
1.0 0.36 0.48 0.71 6.76 5.95 2.63 2.31 2.85 1.78 1.67 1.08 0.81 0.91 0.71 1.04 1.23 1.07 1.22 1.04 1.02
Dusal.0037s00021.1 (33185965)
1.08 0.19 0.35 0.69 6.63 4.43 0.11 2.01 1.45 2.1 0.77 0.35 0.72 0.17 0.44 0.86 1.03 0.04 0.09 0.3 0.12
Dusal.0045s00028.1 (33191640)
0.0 0.05 0.14 0.12 4.52 3.3 0.18 4.03 3.82 2.47 1.13 0.19 0.39 0.06 0.16 0.31 0.29 0.23 0.3 0.38 0.18
Dusal.0046s00024.1 (33197254)
0.58 0.39 0.41 0.4 4.05 2.76 0.39 0.83 0.87 1.0 0.56 0.18 0.24 0.07 0.29 0.42 0.43 0.17 0.2 0.2 0.18
Dusal.0049s00039.1 (33200359)
293.92 72.74 72.88 100.97 906.17 837.09 52.89 364.29 393.36 235.39 1.65 138.27 198.47 245.45 205.01 167.6 198.39 31.66 34.63 95.92 55.78
Dusal.0057s00026.1 (33192927)
0.73 0.0 0.0 0.0 6.3 5.14 1.17 1.61 1.28 0.68 1.07 0.18 0.33 0.09 0.2 0.62 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0070s00029.1 (33189327)
15.57 10.95 10.24 10.15 33.78 33.21 3.67 12.44 9.42 14.05 2.93 8.64 6.69 8.57 12.32 10.14 8.68 11.14 10.85 9.51 11.05
Dusal.0081s00029.1 (33198230)
0.22 2.69 1.65 1.29 16.14 15.86 1.54 12.57 8.47 7.7 2.98 0.19 0.08 0.05 0.28 0.16 0.06 2.05 2.39 1.24 2.11
Dusal.0088s00010.1 (33203535)
0.71 0.61 0.48 0.66 3.92 3.2 0.53 1.28 1.01 1.25 0.89 0.37 0.42 0.29 0.49 0.48 0.62 0.39 0.44 0.58 0.37
Dusal.0092s00006.1 (33200078)
0.6 0.22 0.14 0.09 6.02 4.67 0.56 2.37 2.99 2.56 1.12 0.18 0.32 0.18 0.37 0.79 0.54 0.32 0.43 0.48 0.24
Dusal.0092s00024.1 (33200080)
2.34 2.48 2.78 3.52 23.77 28.47 2.63 17.66 11.4 9.59 1.91 3.13 0.68 0.0 0.54 0.52 1.92 1.52 0.0 0.76 0.82
Dusal.0098s00024.1 (33203611)
3.07 1.34 1.46 5.84 14.67 14.15 1.9 8.04 6.98 8.95 3.21 4.36 5.88 1.91 5.36 7.76 12.66 3.19 3.08 5.78 5.57
Dusal.0098s00029.1 (33203606)
7.32 0.0 0.0 0.0 22.3 21.55 0.0 9.71 6.36 5.91 7.77 8.6 7.43 10.39 8.22 9.41 8.27 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0101s00028.1 (33199196)
0.18 2.45 2.22 2.04 10.17 8.41 0.16 5.29 3.13 4.05 1.7 2.49 4.32 0.81 2.58 2.86 5.41 0.32 0.44 0.6 0.49
Dusal.0106s00005.1 (33193489)
0.0 0.07 0.09 0.13 6.84 5.25 1.76 1.14 1.09 2.09 0.78 0.17 0.22 0.08 0.2 0.31 0.29 0.02 0.03 0.03 0.01
Dusal.0107s00003.1 (33192134)
1.3 0.53 0.41 0.42 4.68 3.92 1.34 1.98 1.85 1.51 1.27 2.69 2.61 2.0 2.18 2.54 3.13 0.29 0.27 0.12 0.22
Dusal.0116s00022.1 (33196021)
0.27 0.02 0.02 0.03 6.55 5.03 0.11 1.19 0.92 1.07 1.12 0.01 0.06 0.0 0.0 0.02 0.05 0.01 0.01 0.0 0.02
Dusal.0118s00022.1 (33199932)
2.96 0.61 0.71 1.11 8.56 7.54 1.03 3.26 3.96 3.49 1.61 1.99 3.4 0.96 2.12 3.23 3.99 0.65 0.6 0.83 0.73
Dusal.0124s00018.1 (33193126)
0.8 0.06 0.11 0.06 7.51 6.27 3.18 1.45 0.92 2.9 0.99 0.56 0.94 0.58 1.01 2.63 2.78 0.11 0.05 0.05 0.13
Dusal.0128s00005.1 (33185286)
0.41 0.22 0.13 0.15 4.91 3.91 0.45 1.27 1.38 0.92 0.94 0.52 1.1 0.24 0.9 1.47 1.38 0.32 0.44 0.45 0.47
Dusal.0134s00010.1 (33191008)
0.62 0.42 0.49 0.41 2.84 1.87 0.46 1.03 1.09 1.02 0.36 0.29 0.6 0.16 0.48 1.02 0.77 0.03 0.06 0.06 0.07
Dusal.0148s00004.1 (33200404)
0.24 0.69 0.6 0.43 3.64 3.27 0.34 2.15 2.39 1.34 0.77 0.05 0.14 0.0 0.14 0.36 0.32 1.39 1.19 0.59 1.18
Dusal.0150s00023.1 (33196067)
1.2 0.1 0.1 0.15 4.42 3.1 0.18 3.58 2.31 1.01 0.23 0.48 0.28 0.37 0.13 0.86 1.01 0.12 0.02 0.02 0.12
Dusal.0154s00016.1 (33199324)
2.89 1.43 1.61 2.83 8.21 7.47 1.92 6.82 5.53 7.56 3.03 3.1 3.2 1.46 1.01 3.51 3.69 0.9 0.95 0.51 0.85
Dusal.0159s00009.1 (33191931)
0.45 0.12 0.05 0.25 3.33 3.18 1.07 1.55 1.32 2.63 0.83 1.1 1.36 0.86 0.92 0.67 1.14 0.28 0.35 0.21 0.2
Dusal.0177s00018.1 (33189769)
0.25 0.18 0.22 0.44 2.56 2.14 0.14 1.86 1.38 2.03 1.53 0.27 0.42 0.25 0.48 0.71 0.47 0.33 0.57 0.61 0.45
Dusal.0178s00008.1 (33194011)
2.39 7.93 8.41 9.72 37.28 34.68 1.12 12.87 10.36 16.34 11.53 11.62 11.45 6.84 12.98 10.22 11.92 5.75 6.22 5.95 7.53
Dusal.0180s00005.1 (33191153)
42.82 0.05 0.23 0.1 215.81 200.3 74.16 99.79 84.93 85.83 86.01 29.75 34.48 20.4 43.08 60.28 53.4 0.09 0.04 0.05 0.0
Dusal.0189s00017.1 (33201891)
0.68 0.04 0.16 0.26 11.34 10.36 0.52 2.32 1.89 2.62 2.24 3.81 2.61 1.69 3.49 4.05 4.17 0.15 0.04 0.15 0.34
Dusal.0213s00009.1 (33189197)
1.03 0.13 0.16 0.17 6.65 5.7 2.42 2.51 2.78 3.17 1.88 1.04 1.17 0.38 0.84 1.42 1.58 0.26 0.36 0.54 0.29
Dusal.0225s00012.1 (33185186)
2.16 1.0 1.9 2.69 13.56 11.87 1.1 4.92 2.8 5.2 3.95 6.15 6.81 1.77 6.89 10.1 7.6 0.68 0.87 0.93 0.8
Dusal.0226s00011.1 (33193550)
1.59 0.01 0.06 0.09 10.95 9.03 0.61 1.84 1.85 1.1 1.08 0.88 1.69 0.39 0.7 1.52 1.66 0.22 0.26 0.13 0.14
Dusal.0241s00014.1 (33190249)
0.07 0.0 0.0 0.0 4.43 2.78 0.18 0.82 0.83 0.85 0.35 0.49 0.74 0.2 0.33 0.83 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0241s00016.1 (33190245)
3.39 0.03 0.24 0.27 5.4 4.89 1.0 3.7 2.92 2.3 0.92 1.12 1.76 0.81 0.97 1.69 1.6 0.05 0.16 0.17 0.21
Dusal.0268s00020.1 (33190618)
1.2 0.59 0.51 0.96 5.68 3.89 0.38 2.15 1.51 1.91 0.32 1.38 2.78 0.61 1.46 3.35 3.21 0.22 0.23 0.2 0.14
Dusal.0282s00007.1 (33199293)
3.41 0.56 0.91 2.02 19.51 14.13 0.1 7.52 3.98 6.74 0.69 7.72 8.08 2.82 2.6 10.42 6.82 0.97 0.99 1.55 1.21
Dusal.0311s00002.1 (33186245)
0.53 0.42 0.37 0.31 6.14 4.78 0.86 2.69 2.98 2.35 1.58 0.29 0.35 0.08 0.28 0.49 0.48 0.13 0.14 0.05 0.09
Dusal.0332s00008.1 (33188705)
0.58 0.0 0.0 0.15 4.84 3.86 0.0 3.18 3.83 2.22 1.07 0.46 0.53 0.15 0.31 0.84 1.23 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0348s00009.1 (33203498)
3.68 0.0 0.0 0.07 6.02 3.91 0.6 2.16 1.21 1.21 0.7 0.8 1.99 0.23 0.44 1.61 1.17 0.0 0.03 0.0 0.0
Dusal.0351s00018.1 (33194418)
0.28 0.22 0.25 0.1 1.71 1.35 0.46 0.29 0.56 0.65 0.73 0.33 0.47 0.29 0.33 0.51 0.5 0.27 0.31 0.17 0.35
Dusal.0361s00002.1 (33202643)
1.04 0.64 0.68 1.23 7.39 5.6 1.18 6.3 6.77 5.1 3.14 0.54 1.24 0.32 0.5 1.23 1.24 0.56 0.75 0.95 0.75
Dusal.0365s00015.1 (33194907)
0.53 0.17 0.05 0.13 5.02 3.76 0.3 1.99 1.84 1.31 0.69 0.28 0.62 0.1 0.22 0.55 0.65 0.11 0.13 0.11 0.17
Dusal.0371s00010.1 (33186918)
0.26 0.6 0.4 1.08 7.64 6.33 0.8 4.68 2.35 0.81 0.24 1.05 1.53 0.99 0.57 2.09 1.31 0.17 0.17 0.54 0.48
Dusal.0379s00005.1 (33191215)
37.99 0.0 0.04 0.01 132.87 122.47 7.85 55.68 50.37 45.64 43.71 23.89 43.39 72.32 15.06 32.97 29.18 0.19 0.31 0.15 0.15
Dusal.0379s00006.1 (33191219)
0.0 0.0 0.0 0.0 137.57 113.7 0.0 90.4 75.65 49.5 27.1 0.12 0.0 0.13 0.0 0.0 0.24 0.0 0.09 0.0 0.0
Dusal.0382s00016.1 (33189217)
0.3 0.04 0.06 0.1 2.93 2.36 0.76 0.76 0.59 0.69 1.0 0.39 0.48 0.32 0.36 0.67 0.55 0.04 0.01 0.01 0.1
Dusal.0383s00005.1 (33199486)
1.42 0.28 0.29 0.23 6.83 5.48 1.55 0.67 0.46 1.05 2.39 2.98 3.52 1.24 1.46 3.59 3.88 0.6 0.37 0.7 0.74
Dusal.0385s00012.1 (33191752)
12.28 0.0 0.0 0.0 29.3 31.43 4.91 7.47 6.55 8.11 9.34 5.05 6.4 3.4 10.31 15.11 9.49 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0393s00001.1 (33191264)
0.13 0.1 0.04 0.11 2.97 2.35 0.21 1.38 1.33 2.91 0.07 0.21 0.23 0.19 0.27 0.3 0.19 0.09 0.13 0.22 0.14
Dusal.0400s00001.1 (33188089)
0.46 0.31 0.26 0.16 2.7 2.22 0.44 0.57 0.54 0.62 1.3 0.41 0.72 0.3 0.33 0.95 0.7 0.34 0.48 0.19 0.29
Dusal.0407s00005.1 (33197893)
5.74 2.22 2.21 1.79 8.9 7.84 2.0 7.88 7.15 5.33 2.56 3.86 4.07 3.42 2.96 3.83 2.84 1.56 2.13 1.53 1.68
Dusal.0414s00007.1 (33185364)
0.58 0.0 0.0 0.0 6.31 4.94 0.23 0.91 1.05 0.9 0.39 0.54 0.72 0.17 0.29 1.1 0.85 0.0 0.02 0.0 0.02
Dusal.0421s00006.1 (33198736)
1.13 0.32 0.22 0.51 5.77 4.66 0.14 4.53 5.53 3.1 1.01 0.36 0.44 0.1 0.55 0.77 1.06 0.34 0.29 0.1 0.09
Dusal.0437s00012.1 (33198272)
22.13 0.0 0.05 0.0 97.95 104.05 15.27 29.11 27.63 31.72 25.83 38.46 35.71 26.28 32.94 31.03 33.72 0.04 0.0 0.05 0.09
Dusal.0454s00012.1 (33185671)
1.59 0.0 0.0 0.01 7.21 5.37 0.02 4.44 4.66 5.39 1.22 0.3 0.35 0.07 0.24 0.84 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0455s00003.1 (33198934)
0.68 0.29 0.35 0.29 4.28 3.05 0.4 1.34 1.05 0.79 0.79 0.3 0.74 0.18 0.27 0.77 0.68 0.18 0.22 0.2 0.21
Dusal.0460s00009.1 (33188216)
1.42 0.04 0.0 0.0 16.96 15.91 0.46 2.55 2.72 1.96 4.15 0.05 0.29 0.06 0.11 0.42 0.39 0.0 0.02 0.02 0.02
Dusal.0476s00008.1 (33198121)
1.51 0.15 0.28 0.62 7.31 5.84 0.47 3.45 3.45 2.92 2.21 2.84 3.71 2.32 2.83 3.93 4.37 0.45 0.46 0.84 0.74
Dusal.0504s00014.1 (33188690)
2.66 0.0 0.0 0.0 3.86 3.14 0.61 1.57 1.5 1.87 1.5 0.39 0.74 0.35 1.17 1.57 2.05 0.0 0.01 0.0 0.0
Dusal.0515s00011.1 (33186737)
3.58 1.0 1.19 2.2 9.05 7.53 1.48 3.14 2.16 7.27 1.56 2.98 3.62 1.64 2.25 4.49 5.58 1.2 1.53 1.62 1.18
Dusal.0517s00006.1 (33199342)
1.71 0.0 0.05 0.05 14.41 13.84 0.0 6.03 4.65 4.06 3.52 2.93 2.97 3.26 5.3 4.26 3.45 0.0 0.08 0.0 0.0
Dusal.0517s00010.1 (33199340)
0.91 0.31 0.26 0.07 8.15 6.16 1.74 2.27 2.95 3.53 2.22 0.72 1.46 0.78 0.66 1.67 1.2 0.2 0.38 0.19 0.36
Dusal.0521s00004.1 (33197391)
2.65 0.84 0.43 1.04 5.73 4.76 1.01 3.7 3.53 3.8 1.97 1.2 1.76 0.68 0.88 2.77 2.33 0.5 0.72 0.93 0.52
Dusal.0545s00009.1 (33199362)
7.32 3.33 3.42 3.4 19.21 16.6 7.38 4.3 4.03 9.99 2.49 4.84 5.68 3.86 3.41 4.02 5.21 3.35 3.64 2.11 3.53
Dusal.0582s00002.1 (33188162)
0.89 0.09 0.13 0.3 4.95 3.9 0.54 1.95 1.89 1.02 1.2 0.93 1.64 0.37 1.33 2.65 2.77 0.14 0.16 0.21 0.18
Dusal.0654s00005.1 (33186757)
3.17 0.0 0.0 0.0 42.69 37.01 0.0 12.87 13.31 9.0 9.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0655s00006.1 (33199838)
0.7 0.17 0.15 0.21 8.11 7.25 0.89 6.66 5.89 7.12 3.43 1.0 1.58 0.78 1.13 2.03 1.9 0.11 0.02 0.07 0.11
Dusal.0661s00005.1 (33199737)
1.71 0.24 0.19 0.38 6.72 5.69 0.48 1.96 1.7 2.03 0.48 1.51 1.42 1.44 1.15 1.59 1.76 1.34 1.51 2.22 1.72
Dusal.0674s00003.1 (33191314)
1.09 0.19 0.1 0.41 6.33 5.57 0.46 3.1 2.51 5.1 1.87 0.9 1.38 0.73 0.56 1.46 1.71 0.23 0.2 0.68 0.34
Dusal.0680s00006.1 (33198150)
0.21 0.05 0.07 0.13 2.1 1.52 0.28 0.7 0.77 0.81 0.89 0.13 0.16 0.06 0.41 0.25 0.32 0.13 0.16 0.17 0.23
Dusal.0737s00003.1 (33190747)
2.55 0.04 0.1 0.0 12.91 10.13 0.45 2.51 2.83 5.3 3.47 4.85 5.82 3.43 2.19 4.43 7.3 0.03 0.0 0.0 0.03
Dusal.0780s00002.1 (33202420)
1.08 0.3 0.19 0.06 6.34 4.82 0.4 2.14 1.38 1.57 1.26 1.85 2.49 1.07 2.05 2.84 4.05 0.18 0.16 0.18 0.29
Dusal.0799s00008.1 (33202119)
0.58 0.37 0.35 0.21 6.48 5.8 0.72 3.08 3.67 1.35 1.55 0.7 1.42 0.28 1.04 1.16 1.04 0.45 0.32 0.23 0.33
Dusal.0844s00001.1 (33192064)
0.73 0.33 0.25 0.28 2.76 2.68 1.12 0.77 0.65 1.23 0.83 0.25 0.64 0.35 0.32 0.68 0.53 0.22 0.24 0.22 0.32
Dusal.0938s00002.1 (33192805)
2.75 0.7 0.36 1.18 8.31 6.27 2.2 2.19 2.76 4.47 2.87 1.79 3.35 0.7 1.62 3.76 5.16 0.06 0.0 0.0 0.0
Dusal.0958s00001.1 (33202833)
0.4 0.52 0.55 0.93 2.7 2.23 0.43 1.95 1.3 1.32 1.05 0.17 0.3 0.17 0.42 0.44 0.43 0.89 0.8 1.02 0.91
Dusal.1085s00004.1 (33187575)
0.17 0.1 0.16 0.03 6.76 5.37 0.74 1.69 1.45 1.05 1.4 0.14 0.18 0.09 0.21 0.26 0.18 0.01 0.03 0.02 0.03
Dusal.1128s00001.1 (33188667)
1.56 0.68 0.75 1.44 5.46 4.52 1.13 0.77 0.68 0.37 2.44 0.89 1.4 0.63 1.34 2.29 1.89 0.42 0.45 0.6 0.71
Dusal.1152s00001.1 (33195166)
1.26 0.06 0.17 0.11 6.02 4.79 1.43 0.58 0.42 0.4 2.49 3.01 3.88 1.76 2.07 3.41 3.26 0.04 0.03 0.17 0.14
Dusal.1659s00001.1 (33199787)
2.63 0.15 0.33 0.67 355.36 321.11 8.78 139.75 80.5 77.75 117.12 9.95 11.92 15.71 10.89 25.56 18.08 0.0 0.71 0.66 0.48
Dusal.1963s00001.1 (33202134)
0.92 0.02 0.0 0.0 9.38 8.56 0.16 3.71 7.14 0.76 0.87 0.0 0.27 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)