Heatmap: Cluster_212 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000113.131 (tig00000113_g5711.t1)	0.79	0.57	0.61	0.8	0.8	0.57	0.68	0.79	0.55	0.72	0.78	0.99	1.0	0.91	0.47	0.69	0.41	0.49	0.48	0.36	0.46	0.9	0.4	0.39	0.66	0.63
Cpa\|evm.model.tig00000178.6	0.34	0.3	0.3	0.82	0.56	0.29	0.39	0.57	0.8	0.65	1.0	0.71	0.33	0.23	0.11	0.23	0.18	0.26	0.23	0.13	0.25	0.15	0.91	0.58	0.48	0.59
Cpa\|evm.model.tig00000204.46 (tig00000204_g17714.t1)	0.71	0.34	0.34	1.0	0.84	0.56	0.63	0.83	0.85	0.64	0.92	0.64	0.45	0.31	0.32	0.36	0.28	0.45	0.4	0.27	0.07	0.52	0.86	0.95	0.76	0.67
Cpa\|evm.model.tig00000204.68 (tig00000204_g17735.t1)	0.72	0.53	0.38	0.62	0.54	0.31	0.54	0.65	0.62	0.8	1.0	0.84	0.59	0.33	0.13	0.32	0.27	0.25	0.12	0.21	0.09	0.6	0.71	0.6	0.87	0.78
Cpa\|evm.model.tig00000229.4 (tig00000229_g20108.t1)	0.8	0.43	0.43	0.61	0.6	0.46	0.63	0.58	0.62	0.61	0.7	0.77	1.0	0.48	0.48	0.42	0.28	0.45	0.37	0.28	0.31	0.77	0.72	0.54	0.9	0.7
Cpa\|evm.model.tig00000246.18 (tig00000246_g21511.t1)	0.6	0.42	0.4	0.45	0.23	0.13	0.34	0.49	0.42	0.6	0.86	0.98	0.87	0.47	0.26	0.34	0.32	0.34	0.29	0.24	0.09	0.22	0.5	0.63	1.0	0.77
Cpa\|evm.model.tig00000369.2 (tig00000754_g3920.t1)	0.74	0.61	0.56	0.65	0.5	0.28	0.47	0.62	0.6	0.81	1.0	0.91	0.73	0.26	0.24	0.18	0.34	0.39	0.35	0.27	0.06	0.58	0.54	0.63	0.8	0.54
Cpa\|evm.model.tig00000383.49 (tig00000383_g24663.t1)	0.81	0.6	0.61	0.77	0.8	0.67	0.86	0.87	0.8	0.85	0.86	0.84	0.91	0.62	0.51	0.59	0.57	0.83	0.64	0.66	0.43	1.0	0.75	0.58	0.73	0.59
Cpa\|evm.model.tig00000403.7 (tig00000403_g262.t1)	0.75	0.42	0.35	0.63	0.63	0.41	0.63	0.68	0.68	0.77	0.85	0.78	0.91	0.44	0.32	0.49	0.24	0.32	0.29	0.21	0.21	0.68	0.6	0.43	1.0	0.73
Cpa\|evm.model.tig00000455.38 (tig00000455_g1028.t1)	0.75	0.54	0.53	0.68	0.57	0.57	0.6	0.64	0.51	0.46	0.51	0.62	1.0	0.61	0.31	0.56	0.31	0.32	0.29	0.29	0.1	0.29	0.43	0.31	0.44	0.53
Cpa\|evm.model.tig00000658.32 (tig00000658_g2922.t1)	0.77	0.59	0.69	0.82	0.68	0.53	0.77	0.88	0.62	0.71	0.86	0.83	0.98	1.0	0.44	0.96	0.6	0.44	0.36	0.42	0.26	0.92	0.29	0.43	0.87	0.72
Cpa\|evm.model.tig00000718.82 (tig00000718_g3754.t1)	0.73	0.27	0.17	0.38	0.43	0.44	0.68	1.0	0.7	0.61	0.77	0.45	0.75	0.22	0.04	0.06	0.08	0.25	0.19	0.07	0.08	0.22	0.2	0.76	0.67	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000806.34 (tig00000806_g4363.t1)	1.0	0.4	0.44	0.59	0.54	0.47	0.49	0.86	0.66	0.81	0.89	0.75	0.81	0.12	0.14	0.13	0.25	0.42	0.33	0.26	0.0	0.14	0.19	0.4	0.6	0.44
Cpa\|evm.model.tig00000821.18	0.47	0.12	0.13	0.74	0.51	0.15	0.3	0.41	0.47	0.5	0.69	0.45	0.3	0.26	0.11	0.27	0.13	0.21	0.23	0.12	0.07	0.71	0.67	1.0	0.7	0.5
Cpa\|evm.model.tig00000849.30 (tig00000849_g4770.t1)	0.52	0.47	0.55	0.88	0.98	0.66	0.74	0.85	0.78	0.93	1.0	0.92	0.73	0.75	0.62	0.84	0.65	0.78	0.55	0.49	0.46	0.84	0.55	0.56	1.0	0.67
Cpa\|evm.model.tig00000882.32 (tig00000882_g5275.t1)	1.0	0.56	0.47	0.72	0.56	0.4	0.43	0.63	0.58	0.65	0.91	0.89	0.91	0.77	0.52	0.58	0.45	0.28	0.39	0.28	0.31	0.61	0.87	0.68	0.97	0.79
Cpa\|evm.model.tig00001042.29 (tig00001042_g6601.t1)	0.68	0.24	0.17	0.16	0.16	0.19	0.34	0.34	0.26	0.39	0.49	0.56	1.0	0.28	0.33	0.25	0.21	0.13	0.11	0.14	0.05	0.44	0.19	0.19	0.22	0.19
Cpa\|evm.model.tig00001154.23 (tig00001154_g7286.t1)	0.45	0.62	0.51	0.5	0.25	0.25	0.47	0.66	0.63	0.7	0.94	1.0	0.73	0.17	0.13	0.21	0.36	0.14	0.19	0.17	0.05	0.4	0.5	0.4	0.56	0.36
Cpa\|evm.model.tig00001250.6 (tig00001250_g7795.t1)	0.53	0.28	0.27	0.37	0.46	0.5	0.72	0.77	0.75	0.97	1.0	0.87	0.92	0.73	0.38	0.37	0.34	0.39	0.3	0.27	0.34	0.54	0.8	0.78	0.82	0.49
Cpa\|evm.model.tig00001365.4 (tig00001365_g8357.t1)	0.89	0.82	0.6	0.78	0.65	0.4	0.62	0.76	0.9	0.97	0.96	0.98	0.98	0.24	0.21	0.25	0.3	0.5	0.33	0.41	0.08	0.97	1.0	0.91	0.97	0.63
Cpa\|evm.model.tig00001368.5 (tig00001368_g8405.t1)	0.86	0.61	0.73	0.82	0.67	0.5	0.74	0.8	0.6	0.71	0.87	0.9	1.0	0.87	0.53	0.84	0.51	0.47	0.47	0.41	0.19	0.61	0.66	0.63	0.78	0.86
Cpa\|evm.model.tig00001373.1 (tig00001373_g8440.t1)	0.61	0.49	0.37	0.64	0.52	0.64	0.67	0.76	0.92	0.9	0.97	1.0	0.77	0.5	0.24	0.39	0.19	0.3	0.26	0.27	0.16	0.97	0.64	0.98	0.92	0.85
Cpa\|evm.model.tig00001590.12 (tig00001590_g9384.t1)	0.94	0.44	0.49	0.59	0.52	0.36	0.57	0.81	0.67	0.69	0.86	0.9	1.0	0.27	0.36	0.3	0.33	0.44	0.52	0.38	0.07	0.41	0.47	0.66	0.68	0.54
Cpa\|evm.model.tig00001600.16 (tig00001600_g9401.t1)	0.82	0.48	0.37	0.71	0.59	0.49	0.58	0.74	0.54	0.56	0.66	0.84	0.66	0.52	0.35	0.43	0.2	0.38	0.27	0.25	0.39	0.51	1.0	0.41	0.72	0.77
Cpa\|evm.model.tig00020510.153 (tig00020510_g9938.t1)	0.6	0.82	0.75	0.87	0.88	0.7	0.94	0.95	0.88	0.97	1.0	0.93	0.61	0.53	0.62	0.71	0.4	0.7	0.72	0.55	0.21	0.67	0.62	0.84	0.56	0.51
Cpa\|evm.model.tig00020553.291 (tig00020553_g10775.t1)	0.75	0.77	0.78	0.87	0.85	0.81	0.93	1.0	0.98	0.93	0.9	0.88	0.86	0.66	0.67	0.72	0.57	0.59	0.54	0.63	0.37	0.71	0.52	0.57	0.63	0.63
Cpa\|evm.model.tig00020554.113 (tig00020554_g10889.t1)	0.68	0.4	0.56	0.7	0.39	0.18	0.34	0.62	0.58	0.56	0.72	0.87	0.7	0.64	0.4	0.43	0.29	0.31	0.33	0.27	0.16	0.46	0.55	0.53	1.0	0.88
Cpa\|evm.model.tig00020556.48 (tig00020556_g11019.t1)	0.72	0.61	0.5	0.61	0.53	0.37	0.5	0.61	0.75	0.87	1.0	0.86	0.66	0.41	0.31	0.44	0.31	0.46	0.39	0.44	0.22	0.74	0.51	0.85	0.65	0.47
Cpa\|evm.model.tig00020572.53 (tig00020572_g11570.t1)	0.54	0.36	0.27	0.66	0.48	0.35	0.53	0.51	0.55	0.48	0.68	0.61	0.69	0.24	0.14	0.24	0.18	0.27	0.19	0.22	0.17	0.63	1.0	0.27	0.74	0.71
Cpa\|evm.model.tig00020693.37 (tig00020693_g13048.t1)	0.76	0.46	0.31	0.66	0.66	0.42	0.49	0.48	0.56	0.65	1.0	0.93	0.75	0.22	0.17	0.17	0.11	0.28	0.2	0.14	0.23	0.54	0.68	0.99	0.74	0.71
Cpa\|evm.model.tig00020903.50 (tig00020903_g15119.t1)	0.66	0.35	0.34	0.35	0.32	0.28	0.47	0.55	0.57	0.76	0.96	1.0	0.78	0.53	0.29	0.41	0.31	0.33	0.25	0.28	0.19	0.87	0.43	0.72	0.57	0.59
Cpa\|evm.model.tig00020904.12 (tig00020904_g15145.t1)	0.89	0.44	0.33	0.42	0.47	0.42	0.46	0.5	0.59	0.69	0.77	0.85	0.79	0.7	0.49	0.62	0.29	0.36	0.34	0.25	0.1	0.85	0.67	0.5	1.0	0.81
Cpa\|evm.model.tig00020904.161 (tig00020904_g15279.t1)	0.6	0.46	0.44	0.36	0.26	0.23	0.5	0.55	0.56	0.69	0.75	0.76	1.0	0.28	0.13	0.3	0.09	0.14	0.08	0.22	0.03	0.45	0.19	0.45	0.31	0.42
Cpa\|evm.model.tig00020904.174 (tig00020904_g15294.t1)	1.0	0.54	0.39	0.61	0.78	0.71	0.76	0.78	0.68	0.64	0.65	0.53	0.87	0.16	0.14	0.16	0.19	0.33	0.27	0.21	0.03	0.47	0.33	0.33	0.58	0.23
Cpa\|evm.model.tig00020912.67 (tig00020912_g15841.t1)	0.81	0.6	0.44	0.74	0.56	0.22	0.5	0.68	0.85	0.74	1.0	0.91	0.73	0.28	0.23	0.27	0.13	0.45	0.38	0.21	0.04	0.47	0.72	0.67	0.65	0.54
Cpa\|evm.model.tig00020927.35 (tig00020927_g15964.t1)	1.0	0.49	0.46	0.7	0.6	0.34	0.57	0.74	0.6	0.68	0.99	0.95	0.95	0.57	0.3	0.5	0.25	0.25	0.26	0.24	0.12	0.48	0.53	0.74	0.76	0.56
Cpa\|evm.model.tig00020938.15 (tig00020938_g16139.t1)	0.56	0.25	0.24	0.17	0.17	0.32	0.62	0.85	0.69	0.96	1.0	0.85	0.93	0.35	0.12	0.22	0.21	0.45	0.3	0.11	0.18	0.75	0.69	0.83	0.98	0.62
Cpa\|evm.model.tig00020943.38 (tig00020943_g16280.t1)	0.71	0.42	0.2	0.56	0.68	0.29	0.39	0.7	0.6	0.45	0.72	0.71	0.63	0.33	0.36	0.24	0.26	0.36	0.32	0.24	0.01	0.13	0.56	0.51	1.0	0.38
Cpa\|evm.model.tig00020961.7 (tig00020961_g16628.t1)	0.51	0.18	0.29	0.54	0.48	0.27	0.4	0.44	0.4	0.67	1.0	1.0	0.68	0.31	0.17	0.3	0.14	0.13	0.14	0.15	0.1	0.38	0.47	0.55	0.72	0.64
Cpa\|evm.model.tig00020965.14 (tig00020965_g16834.t1)	0.48	0.51	0.5	0.58	0.51	0.51	0.67	0.65	0.55	0.59	0.57	0.54	0.51	0.68	0.39	0.59	0.33	0.76	0.4	0.51	0.48	1.0	0.65	0.45	0.64	0.55
Cpa\|evm.model.tig00020965.15 (tig00020965_g16834.t1)	0.85	0.77	0.73	0.91	0.96	0.85	0.96	1.0	0.92	0.93	0.98	0.92	0.98	0.78	0.46	0.65	0.36	0.67	0.47	0.51	0.41	0.85	0.64	0.44	0.57	0.55
Cpa\|evm.model.tig00020996.16 (tig00020996_g16933.t1)	0.66	0.54	0.37	0.56	0.44	0.34	0.46	0.43	0.55	0.53	0.84	0.78	0.35	0.2	0.14	0.28	0.17	0.41	0.21	0.24	0.01	0.22	0.6	1.0	0.85	0.54
Cpa\|evm.model.tig00021036.109 (tig00021036_g17395.t1)	1.0	0.52	0.37	0.74	0.71	0.51	0.86	0.92	0.76	0.74	0.92	0.69	0.85	0.25	0.3	0.26	0.27	0.44	0.44	0.34	0.0	0.13	0.34	0.39	0.78	0.37
Cpa\|evm.model.tig00021038.46 (tig00000545_g1987.t1)	0.96	0.61	0.53	0.58	0.51	0.38	0.67	0.66	0.59	0.7	0.88	0.95	1.0	0.75	0.46	0.93	0.71	0.59	0.33	0.45	0.15	0.53	0.61	0.77	0.73	0.6
Cpa\|evm.model.tig00021127.100 (tig00021127_g18780.t1)	0.77	0.47	0.41	0.61	0.65	0.69	0.75	0.91	0.67	0.64	0.69	0.69	1.0	0.57	0.33	0.56	0.28	0.38	0.33	0.38	0.15	0.58	0.6	0.42	0.58	0.45
Cpa\|evm.model.tig00021293.19 (tig00021293_g20011.t1)	1.0	0.51	0.5	0.8	0.75	0.54	0.87	0.91	0.79	0.81	0.93	0.69	0.88	0.35	0.32	0.3	0.42	0.61	0.55	0.47	0.03	0.05	0.29	0.31	0.95	0.61
Cpa\|evm.model.tig00021319.14 (tig00021319_g20209.t1)	0.88	0.71	0.79	1.0	0.83	0.73	0.9	0.88	0.76	0.81	0.99	0.97	0.9	0.77	0.49	0.76	0.43	0.42	0.43	0.43	0.25	0.68	0.57	0.63	0.66	0.71
Cpa\|evm.model.tig00021326.47 (tig00021326_g20312.t1)	0.59	0.2	0.16	0.48	0.38	0.34	0.4	0.47	0.24	0.33	0.4	0.37	0.7	0.78	0.27	1.0	0.14	0.19	0.12	0.13	0.21	0.1	0.61	0.27	0.79	0.48
Cpa\|evm.model.tig00021348.16 (tig00021348_g20519.t1)	0.66	0.16	0.22	0.31	0.39	0.4	0.49	0.55	0.58	0.55	0.84	1.0	0.87	0.77	0.21	0.42	0.18	0.29	0.31	0.2	0.16	0.59	0.74	0.67	0.68	0.57
Cpa\|evm.model.tig00021348.56 (tig00021348_g20559.t1)	1.0	0.4	0.3	0.55	0.8	0.68	0.7	0.88	0.55	0.65	0.79	0.57	0.7	0.12	0.23	0.16	0.31	0.45	0.56	0.34	0.07	0.2	0.25	0.56	0.67	0.35
Cpa\|evm.model.tig00021374.11 (tig00021374_g21094.t1)	0.54	0.24	0.27	0.55	0.55	0.43	0.66	0.63	0.56	0.53	0.36	0.36	0.5	0.36	0.09	0.12	0.24	0.24	0.17	0.22	0.28	0.46	1.0	0.48	0.79	0.61
Cpa\|evm.model.tig00021434.2 (tig00021434_g21298.t1)	0.99	0.41	0.46	0.74	0.34	0.39	0.39	0.56	0.6	0.69	0.99	1.0	0.99	0.52	0.42	0.3	0.16	0.42	0.34	0.18	0.11	0.48	0.92	0.67	0.98	0.46
Cpa\|evm.model.tig00021517.30 (tig00021517_g22018.t1)	0.66	0.47	0.58	1.0	0.68	0.6	0.77	0.77	0.69	0.71	0.72	0.75	0.93	0.92	0.57	0.87	0.45	0.65	0.39	0.43	0.42	0.62	0.48	0.51	0.94	0.85
Cpa\|evm.model.tig00021525.19 (tig00021525_g22135.t1)	0.66	0.28	0.33	0.52	0.49	0.36	0.59	0.67	0.59	0.62	0.69	0.77	0.84	0.45	0.3	0.47	0.35	0.34	0.25	0.27	0.13	0.51	0.48	0.57	1.0	0.87
Cpa\|evm.model.tig00021612.23 (tig00021612_g22869.t1)	0.7	0.41	0.41	0.43	0.38	0.24	0.41	0.5	0.52	0.75	1.0	0.96	0.94	0.16	0.12	0.12	0.21	0.2	0.21	0.24	0.03	0.3	0.31	0.49	0.64	0.44
Cpa\|evm.model.tig00021612.31 (tig00021612_g22875.t1)	0.98	0.37	0.31	0.56	0.57	0.41	0.64	0.77	0.67	0.67	0.97	0.91	1.0	0.14	0.14	0.13	0.15	0.28	0.22	0.18	0.36	0.69	0.58	0.67	0.79	0.61
Cpa\|evm.model.tig00021617.3 (tig00021617_g22929.t1)	0.63	0.56	0.75	0.79	0.85	0.75	0.64	0.71	0.61	0.87	0.97	0.95	0.9	1.0	0.49	0.69	0.41	0.44	0.35	0.5	0.24	0.63	0.38	0.27	0.81	0.93
Cpa\|evm.model.tig00021680.13 (tig00021680_g23034.t1)	0.7	0.41	0.39	0.6	0.62	0.66	0.65	0.75	0.8	0.85	1.0	0.92	0.67	0.2	0.13	0.16	0.17	0.25	0.24	0.29	0.07	0.4	0.16	0.37	0.58	0.54
Cpa\|evm.model.tig00021795.5 (tig00021795_g23523.t1)	0.96	0.48	0.42	0.46	0.45	0.45	0.49	0.59	0.73	0.78	1.0	0.99	0.91	0.24	0.21	0.22	0.3	0.2	0.4	0.34	0.09	0.3	0.33	0.62	0.59	0.68

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)