Heatmap: Cluster_75 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
-N
2.5M NaCl,0.5h
2.5M NaCl,1h
2.5M NaCl,2h
CCAP 19/18,4.5M NaCl
CCAP 19/18,5M Glycerol
CCAP 19/3
CCAP 19/3,Log
CCAP 19/3,Log,3M NaCl,1h
CCAP 19/3,Log,3M NaCl,6h
Log
Mid-log,Low light
Mid-log,Medium light
Mid-log,High light
Mid-log,White light
Mid-log,Red light
Mid-log,Blue light
Strain 435
Strain 435,H2O2
Strain 435,NaCl
Strain 435,Sorbitol
Dusal.0001s00015.1 (33198790)
- - - - 3.1 3.64 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0002s00003.1 (33187965)
- - - - 3.78 2.86 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0004s00019.1 (33201046)
- - - - 3.68 3.03 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0005s00004.1 (33196928)
- - - - 3.1 3.64 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0006s00008.1 (33186157)
- - - - 3.3 3.48 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0015s00003.1 (33190944)
- - - - 4.39 - - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0016s00016.1 (33193061)
- - - - 3.4 3.39 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0034s00037.1 (33197153)
- - - - 3.66 3.06 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0045s00022.1 (33191657)
- - - - 3.45 1.72 - - - - - - - - 2.76 - - - - - -
Dusal.0052s00031.1 (33199549)
- - - - 3.69 3.02 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0062s00023.1 (33200773)
- - - - 3.82 2.78 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0078s00017.1 (33203790)
- - - - 3.81 2.8 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0086s00009.1 (33192753)
- - - - 2.69 3.21 - - - - - - - 2.4 - - - - - - -
Dusal.0151s00003.1 (33191981)
- -2.07 - -1.87 3.18 2.85 - - - - - - - - 0.75 -1.52 -1.62 0.23 -1.13 - -2.14
Dusal.0177s00021.1 (33189763)
- - - - 3.72 2.96 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0181s00026.1 (33189280)
- - - - 3.87 2.67 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0197s00009.1 (33188528)
- - - - 3.98 2.38 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0198s00002.1 (33192666)
- - - - 3.65 3.07 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0226s00020.1 (33193539)
- - - - 3.76 2.89 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0248s00007.1 (33189801)
2.39 -1.18 - - 3.55 1.86 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0271s00014.1 (33193291)
- - - - 3.41 3.37 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0280s00001.1 (33203396)
- - - - 3.61 3.13 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0281s00011.1 (33190360)
- - - - 3.0 3.7 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0284s00005.1 (33187022)
1.47 - - - 3.53 2.74 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0356s00003.1 (33193312)
- - - - 3.51 3.26 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0396s00014.1 (33198516)
- - - - 3.47 3.31 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0403s00009.1 (33192108)
- - - - 3.91 2.58 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0404s00014.1 (33186408)
- - - - 3.85 2.71 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0436s00001.1 (33203568)
- - - - 3.06 3.66 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0445s00002.1 (33198002)
- - - - 3.98 2.38 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0445s00010.1 (33198003)
- - - - 3.27 3.5 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0448s00004.1 (33185731)
- - - - 3.41 3.37 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0467s00016.1 (33194483)
- - - - 3.21 3.56 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0479s00010.1 (33193186)
- - - - 3.81 2.8 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0485s00004.1 (33190587)
- - - - 3.41 3.37 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0502s00005.1 (33199154)
- - - - 3.0 3.7 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0552s00004.1 (33196630)
- - - - 3.56 3.2 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0554s00007.1 (33189010)
- - - - 3.22 3.55 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0578s00006.1 (33185487)
- - - - 3.07 3.66 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0595s00010.1 (33191196)
- - - - 4.05 2.16 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0622s00004.1 (33200103)
- - - - 3.0 3.7 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0659s00005.1 (33197118)
- - - - 3.54 3.22 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0722s00006.1 (33198675)
- - - - 2.84 3.79 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0779s00004.1 (33187347)
- - - - 3.78 2.85 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0781s00012.1 (33186560)
- - - - 3.29 3.49 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0866s00004.1 (33187686)
- - - - 4.39 - - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0866s00005.1 (33187684)
- - - - 3.41 3.37 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0943s00004.1 (33203024)
- - - - 3.91 2.57 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.0972s00003.1 (33195738)
- - - - 3.41 3.37 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.1108s00004.1 (33185838)
- - - - 3.41 3.37 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.1234s00001.1 (33196303)
- - - - 3.4 3.39 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.1274s00002.1 (33202783)
- - - - 4.03 2.22 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.1337s00004.1 (33191722)
- - - - 3.7 3.0 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.1409s00001.1 (33191942)
- - - - 3.82 2.78 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.1444s00001.1 (33196889)
- - - - 3.74 2.93 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.1471s00001.1 (33196849)
- - - - 3.75 2.92 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.2077s00001.1 (33203293)
- - - - 3.29 3.48 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.2247s00003.1 (33199825)
- - - - 3.71 2.98 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.2524s00002.1 (33187824)
- - - - 3.31 3.47 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.4040s00001.1 (33189702)
- - - - 3.14 3.61 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.4342s00001.1 (33195747)
- - 2.94 - 2.75 2.72 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.4403s00001.1 (33190983)
- - - - 3.76 2.9 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.4496s00001.1 (33199157)
- - - - 3.98 2.37 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.4567s00001.1 (33186167)
- - - - 3.11 3.63 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.4584s00001.1 (33185371)
- - - - 3.58 3.18 - - - - - - - - - - - - - - -
Dusal.4913s00001.1 (33192819)
- - - - 3.32 3.21 - - - - - -0.51 -0.89 - -1.75 -2.0 - - - - -
Dusal.4935s00001.1 (33190219)
- - - - 3.09 3.64 - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.