Heatmap: Cluster_117 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
-N
2.5M NaCl,0.5h
2.5M NaCl,1h
2.5M NaCl,2h
CCAP 19/18,4.5M NaCl
CCAP 19/18,5M Glycerol
CCAP 19/3
CCAP 19/3,Log
CCAP 19/3,Log,3M NaCl,1h
CCAP 19/3,Log,3M NaCl,6h
Log
Mid-log,Low light
Mid-log,Medium light
Mid-log,High light
Mid-log,White light
Mid-log,Red light
Mid-log,Blue light
Strain 435
Strain 435,H2O2
Strain 435,NaCl
Strain 435,Sorbitol
Dusal.0004s00060.1 (33201030)
0.71 0.0 0.0 0.0 1.0 0.93 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.21 0.38 0.24 0.2 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0008s00022.1 (33198915)
0.38 0.0 0.0 0.0 1.0 0.9 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.17 0.09 0.24 0.14 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0009s00024.1 (33190482)
0.3 0.01 0.01 0.01 0.96 1.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.66 0.56 0.18 0.19 0.19 0.0 0.01 0.0 0.0
Dusal.0014s00020.1 (33202881)
0.14 0.0 0.0 0.0 1.0 0.99 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.16 0.15 0.12 0.19 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0015s00044.1 (33190954)
0.42 0.0 0.0 0.0 1.0 0.88 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.28 0.21 0.3 0.2 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0040s00022.1 (33197268)
0.35 0.02 0.03 0.02 1.0 0.95 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.28 0.8 0.41 0.27 0.34 0.09 0.11 0.16 0.12
Dusal.0044s00003.1 (33194918)
0.31 0.05 0.06 0.1 1.0 0.94 0.2 0.07 0.02 0.03 0.0 0.21 0.23 0.29 0.2 0.22 0.35 0.02 0.01 0.03 0.03
Dusal.0050s00031.1 (33193829)
0.62 0.0 0.0 0.0 0.97 1.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.25 0.27 0.09 0.08 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0065s00031.1 (33185852)
0.07 0.0 0.0 0.0 0.89 1.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.22 0.2 0.13 0.25 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0066s00012.1 (33195443)
0.55 0.04 0.05 0.01 1.0 0.94 0.25 0.02 0.04 0.01 0.01 0.47 0.29 0.59 0.49 0.17 0.4 0.1 0.16 0.06 0.14
Dusal.0081s00010.1 (33198243)
0.69 0.0 0.0 0.0 1.0 0.95 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.37 0.24 0.33 0.28 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0103s00017.1 (33186332)
0.33 0.0 0.0 0.0 1.0 0.97 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.26 0.2 0.58 0.21 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0125s00018.1 (33191817)
0.11 0.0 0.0 0.01 1.0 0.92 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.2 0.13 0.18 0.16 0.12 0.02 0.01 0.01 0.01
Dusal.0134s00003.1 (33191017)
0.41 0.0 0.0 0.0 1.0 0.97 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.19 0.14 0.44 0.17 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0155s00001.1 (33194762)
0.48 0.0 0.0 0.0 0.98 1.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.21 0.07 0.14 0.12 0.13 0.0 0.0 0.01 0.0
Dusal.0164s00014.1 (33198401)
0.18 0.0 0.0 0.0 0.96 1.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.25 0.19 0.21 0.21 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0173s00006.1 (33191844)
1.0 0.0 0.0 0.0 0.97 1.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.44 0.56 0.34 0.23 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0183s00014.1 (33202613)
0.18 0.08 0.09 0.07 1.0 0.98 0.26 0.04 0.05 0.04 0.0 0.31 0.25 0.32 0.27 0.29 0.26 0.08 0.1 0.05 0.05
Dusal.0185s00020.1 (33185826)
0.42 0.0 0.0 0.0 0.92 1.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.35 0.15 0.19 0.19 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0188s00002.1 (33189666)
0.67 0.0 0.0 0.0 1.0 0.76 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.31 0.07 0.15 0.24 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0197s00004.1 (33188535)
0.33 0.06 0.06 0.13 1.0 0.97 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.26 0.16 0.2 0.18 0.27 0.01 0.01 0.01 0.0
Dusal.0211s00014.1 (33198601)
0.5 0.06 0.06 0.15 1.0 0.85 0.27 0.02 0.02 0.1 0.03 0.41 0.32 0.34 0.13 0.26 0.38 0.05 0.05 0.1 0.05
Dusal.0218s00003.1 (33202708)
0.43 0.0 0.0 0.0 1.0 0.94 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.68 0.29 0.14 0.12 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0241s00006.1 (33190236)
0.1 0.0 0.0 0.0 0.99 1.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.15 0.12 0.23 0.2 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0265s00020.1 (33188540)
0.17 0.0 0.0 0.0 1.0 0.9 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.33 0.07 0.08 0.14 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0285s00024.1 (33192900)
1.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.97 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.51 0.69 0.48 0.4 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0320s00006.1 (33189566)
0.5 0.0 0.0 0.0 1.0 0.98 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.27 0.22 0.19 0.14 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0334s00013.1 (33189137)
0.43 0.0 0.0 0.0 1.0 0.87 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.43 0.16 0.13 0.19 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0349s00002.1 (33189922)
0.46 0.0 0.0 0.0 1.0 0.91 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.38 0.25 0.09 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0355s00006.1 (33196333)
0.09 0.0 0.0 0.0 0.98 1.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.23 0.25 0.24 0.21 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0364s00005.1 (33192089)
0.2 0.03 0.04 0.04 1.0 1.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.28 0.29 0.29 0.21 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0382s00012.1 (33189212)
0.05 0.01 0.02 0.05 0.99 1.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.21 0.15 0.1 0.16 0.16 0.0 0.0 0.01 0.0
Dusal.0464s00002.1 (33187029)
0.26 0.01 0.01 0.02 1.0 0.89 0.4 0.07 0.03 0.01 0.03 0.11 0.18 0.24 0.17 0.13 0.19 0.01 0.0 0.01 0.01
Dusal.0488s00012.1 (33201770)
0.31 0.02 0.0 0.02 1.0 0.95 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.69 0.36 0.02 0.05 0.09 0.01 0.0 0.01 0.01
Dusal.0488s00013.1 (33201769)
0.38 0.0 0.0 0.0 1.0 0.88 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.29 0.08 0.1 0.18 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0519s00003.1 (33200377)
0.1 0.04 0.04 0.11 1.0 0.89 0.22 0.15 0.08 0.09 0.06 0.2 0.55 0.11 0.07 0.12 0.14 0.01 0.01 0.01 0.02
Dusal.0521s00001.1 (33197384)
0.81 0.0 0.0 0.0 1.0 0.86 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.47 0.57 0.41 0.34 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0528s00007.1 (33190446)
0.36 0.04 0.03 0.02 1.0 1.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.12 0.12 0.14 0.17 0.17 0.11 0.09 0.07 0.09
Dusal.0574s00001.1 (33187462)
1.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.92 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.39 0.22 0.37 0.18 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0576s00003.1 (33196156)
0.5 0.01 0.01 0.01 1.0 0.92 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.24 0.12 0.68 0.12 0.1 0.02 0.03 0.01 0.01
Dusal.0576s00004.1 (33196159)
0.1 0.01 0.01 0.02 1.0 0.89 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.02 0.13 0.04 0.02 0.04 0.07 0.06 0.05
Dusal.0608s00009.1 (33188259)
0.53 0.0 0.0 0.0 0.98 1.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.25 0.15 0.12 0.27 0.22 0.0 0.01 0.0 0.0
Dusal.0617s00002.1 (33190789)
0.89 0.0 0.0 0.0 0.96 1.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0639s00002.1 (33195766)
0.87 0.0 0.0 0.0 1.0 0.85 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.23 0.42 0.1 0.21 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0693s00003.1 (33196183)
0.44 0.03 0.03 0.04 1.0 0.89 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.24 0.42 0.26 0.25 0.31 0.03 0.06 0.03 0.04
Dusal.0819s00005.1 (33201331)
0.31 0.0 0.0 0.0 1.0 0.97 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.27 0.25 0.15 0.15 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0852s00002.1 (33185425)
0.5 0.02 0.02 0.08 0.96 1.0 0.24 0.05 0.09 0.12 0.19 0.42 0.49 0.29 0.37 0.27 0.48 0.1 0.11 0.14 0.17
Dusal.0853s00001.1 (33198950)
0.26 0.01 0.01 0.03 1.0 0.92 0.24 0.01 0.0 0.0 0.0 0.26 0.38 0.21 0.23 0.15 0.25 0.02 0.02 0.03 0.03
Dusal.0895s00006.1 (33191715)
0.23 0.05 0.03 0.04 1.0 0.89 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.16 0.27 0.26 0.13 0.26 0.01 0.01 0.01 0.01
Dusal.1000s00001.1 (33186984)
0.09 0.05 0.05 0.05 1.0 0.79 0.23 0.21 0.07 0.11 0.04 0.18 0.14 0.16 0.13 0.17 0.2 0.06 0.08 0.06 0.06
Dusal.1039s00003.1 (33190034)
0.22 0.0 0.0 0.0 1.0 0.95 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.1305s00001.1 (33186703)
0.09 0.06 0.04 0.06 1.0 0.83 0.23 0.1 0.06 0.11 0.09 0.17 0.17 0.18 0.35 0.23 0.24 0.06 0.07 0.09 0.08
Dusal.1529s00001.1 (33196515)
0.45 0.0 0.0 0.0 1.0 0.95 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.23 0.33 0.14 0.28 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.1722s00001.1 (33202325)
0.17 0.0 0.0 0.0 1.0 0.86 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.49 0.19 0.25 0.18 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.3272s00001.1 (33190773)
0.83 0.0 0.0 0.01 1.0 1.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.08 0.04 0.11 0.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)