Heatmap: Cluster_52 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000074.1 (tig00000074_g1192.t1)	0.47	0.57	0.47	0.46	0.48	0.32	0.7	0.63	0.64	0.75	0.83	0.63	0.52	0.66	1.0	0.49	0.44	0.82	0.43	0.53	0.15	0.66	0.35	0.4	0.52	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000128.12 (tig00000128_g7216.t1)	0.07	0.03	0.05	0.03	0.01	0.0	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	1.0	0.02	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.04	0.07
Cpa\|evm.model.tig00000128.4 (tig00000128_g7204.t1)	0.19	0.12	0.18	0.21	0.12	0.1	0.1	0.16	0.05	0.01	0.01	0.01	0.15	0.21	1.0	0.05	0.06	0.09	0.09	0.11	0.06	0.0	0.01	0.0	0.25	0.12
Cpa\|evm.model.tig00000133.3 (tig00000133_g7662.t1)	0.12	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.06	0.06	0.07	0.07	0.09	0.11	0.13	0.08	1.0	0.06	0.06	0.06	0.06	0.05	0.02	0.09	0.13	0.08	0.09	0.08
Cpa\|evm.model.tig00000157.31 (tig00000157_g9621.t1)	0.26	0.27	0.26	0.15	0.12	0.08	0.19	0.19	0.3	0.36	0.5	0.48	0.25	0.18	1.0	0.14	0.18	0.25	0.18	0.25	0.03	0.6	0.42	0.64	0.38	0.33
Cpa\|evm.model.tig00000202.10 (tig00000202_g16618.t1)	0.49	0.36	0.3	0.45	0.36	0.25	0.28	0.31	0.39	0.41	0.59	0.47	0.46	0.2	1.0	0.24	0.21	0.27	0.19	0.19	0.16	0.67	0.72	0.49	0.75	0.48
Cpa\|evm.model.tig00000204.45 (tig00000204_g17713.t1)	0.03	0.05	0.06	0.1	0.25	0.29	0.26	0.21	0.1	0.08	0.07	0.04	0.02	0.01	1.0	0.02	0.05	0.07	0.09	0.1	0.0	0.01	0.05	0.02	0.06	0.05
Cpa\|evm.model.tig00000254.104 (tig00000254_g22560.t1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.04	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cpa\|evm.model.tig00000254.105 (tig00000254_g22561.t1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.04	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cpa\|evm.model.tig00000254.33 (tig00000254_g22483.t1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.02	0.02	0.0	0.05	1.0	0.46	0.03	0.05	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01
Cpa\|evm.model.tig00000254.81 (tig00000254_g22538.t1)	0.02	0.0	0.01	0.02	0.08	0.16	0.23	0.14	0.22	0.22	0.17	0.11	0.04	0.11	1.0	0.1	0.12	0.19	0.14	0.12	0.01	0.04	0.22	0.16	0.05	0.03
Cpa\|evm.model.tig00000269.108 (tig00000269_g23770.t1)	0.01	0.04	0.02	0.03	0.06	0.13	0.19	0.13	0.24	0.21	0.11	0.06	0.02	0.18	1.0	0.18	0.1	0.25	0.17	0.13	0.01	0.04	0.13	0.11	0.16	0.1
Cpa\|evm.model.tig00000269.66 (tig00000269_g23727.t1)	0.48	0.28	0.21	0.24	0.17	0.15	0.25	0.3	0.18	0.22	0.28	0.23	0.36	0.2	1.0	0.19	0.18	0.21	0.2	0.16	0.05	0.56	0.15	0.19	0.46	0.27
Cpa\|evm.model.tig00000367.40 (tig00000367_g24476.t1)	0.12	0.23	0.43	0.47	0.29	0.24	0.35	0.44	0.54	0.65	0.72	0.68	0.21	0.39	1.0	0.29	0.3	0.46	0.34	0.4	0.06	0.54	0.3	0.38	0.53	0.41
Cpa\|evm.model.tig00000404.8 (tig00000404_g373.t1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cpa\|evm.model.tig00000404.9 (tig00000404_g373.t1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Cpa\|evm.model.tig00000545.39 (tig00000545_g2013.t1)	0.03	0.03	0.03	0.07	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	1.0	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.08	0.08	0.07
Cpa\|evm.model.tig00000615.35 (tig00000615_g2563.t1)	0.1	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.06	0.09	0.12	0.12	0.07	0.06	0.04	1.0	0.12	0.02	0.02	0.02	0.03	0.0	0.0	0.09	0.07	0.02	0.04
Cpa\|evm.model.tig00000615.36 (tig00000615_g2564.t1)	0.04	0.11	0.09	0.1	0.16	0.22	0.26	0.21	0.17	0.21	0.14	0.08	0.03	0.03	1.0	0.03	0.03	0.04	0.06	0.13	0.0	0.0	0.16	0.08	0.06	0.07
Cpa\|evm.model.tig00000733.8 (tig00000733_g3773.t1)	0.04	0.07	0.08	0.09	0.11	0.12	0.15	0.16	0.15	0.14	0.12	0.09	0.03	0.25	1.0	0.16	0.11	0.12	0.1	0.11	0.0	0.2	0.07	0.04	0.11	0.07
Cpa\|evm.model.tig00000769.37 (tig00000769_g4034.t1)	0.74	0.71	0.76	0.91	0.49	0.21	0.32	0.4	0.34	0.47	0.62	0.69	0.69	0.32	1.0	0.35	0.49	0.56	0.37	0.56	0.17	0.74	0.57	0.55	0.57	0.72
Cpa\|evm.model.tig00000836.2 (tig00000836_g4686.t1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0
Cpa\|evm.model.tig00000857.15 (tig00000857_g4937.t1)	0.11	0.1	0.09	0.12	0.16	0.12	0.09	0.14	0.14	0.11	0.19	0.16	0.16	0.17	1.0	0.09	0.06	0.07	0.06	0.03	0.14	0.35	0.39	0.29	0.38	0.25
Cpa\|evm.model.tig00001030.15 (tig00001030_g6454.t1)	0.05	0.03	0.03	0.07	0.23	0.39	0.53	0.38	0.67	0.69	0.5	0.25	0.08	0.28	1.0	0.18	0.17	0.14	0.12	0.2	0.09	0.13	0.58	0.35	0.27	0.26
Cpa\|evm.model.tig00001042.27 (tig00001042_g6599.t1)	0.41	0.49	0.53	0.43	0.24	0.19	0.22	0.25	0.3	0.35	0.43	0.51	0.42	0.34	1.0	0.24	0.34	0.34	0.22	0.3	0.06	0.52	0.12	0.22	0.35	0.42
Cpa\|evm.model.tig00001128.1 (tig00001128_g7166.t1)	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.05	0.05	0.05	0.03	0.03	0.03	0.03	0.3	1.0	0.17	0.12	0.08	0.08	0.05	0.09	0.09	0.3	0.08	0.17	0.12
Cpa\|evm.model.tig00001128.11 (tig00001128_g7176.t1)	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.04	0.04	0.03	0.02	0.02	0.03	0.31	1.0	0.18	0.14	0.09	0.07	0.05	0.08	0.07	0.29	0.08	0.15	0.12
Cpa\|evm.model.tig00001304.5 (tig00001304_g8107.t1)	0.49	0.34	0.26	0.29	0.23	0.19	0.28	0.29	0.31	0.34	0.37	0.36	0.36	0.66	1.0	0.52	0.24	0.29	0.21	0.19	0.2	0.92	0.23	0.39	0.36	0.38
Cpa\|evm.model.tig00001336.6 (tig00001336_g8224.t1)	0.17	0.16	0.15	0.13	0.12	0.11	0.18	0.16	0.17	0.21	0.17	0.14	0.13	0.21	1.0	0.2	0.19	0.28	0.15	0.19	0.05	0.2	0.22	0.19	0.19	0.27
Cpa\|evm.model.tig00001336.7 (tig00001336_g8224.t1)	0.34	0.27	0.23	0.24	0.26	0.26	0.31	0.36	0.38	0.35	0.41	0.36	0.3	0.22	1.0	0.18	0.17	0.18	0.16	0.17	0.05	0.36	0.4	0.32	0.31	0.33
Cpa\|evm.model.tig00001496.1 (tig00001496_g9199.t1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	1.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03	0.0	0.01	0.0
Cpa\|evm.model.tig00001496.2 (tig00000147_g9513.t1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	1.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01
Cpa\|evm.model.tig00020564.35 (tig00020564_g11435.t1)	0.33	0.25	0.2	0.2	0.19	0.18	0.24	0.25	0.25	0.23	0.23	0.22	0.25	0.12	1.0	0.11	0.12	0.25	0.24	0.13	0.0	0.05	0.07	0.11	0.15	0.11
Cpa\|evm.model.tig00020601.8 (tig00020601_g11715.t1)	0.02	0.01	0.02	0.04	0.04	0.06	0.09	0.1	0.12	0.28	0.26	0.15	0.06	0.04	1.0	0.01	0.13	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.09	0.06	0.05	0.05
Cpa\|evm.model.tig00020614.89 (tig00020614_g12204.t1)	0.44	0.53	0.45	0.42	0.46	0.45	0.49	0.55	0.6	0.53	0.56	0.68	0.57	0.61	1.0	0.6	0.36	0.48	0.46	0.38	0.2	0.72	0.36	0.36	0.35	0.37
Cpa\|evm.model.tig00020725.6 (tig00020725_g13532.t1)	0.0	0.01	0.03	0.05	0.07	0.07	0.09	0.08	0.14	0.12	0.13	0.11	0.0	0.04	1.0	0.05	0.05	0.04	0.03	0.03	0.01	0.02	0.22	0.13	0.1	0.1
Cpa\|evm.model.tig00020805.15 (tig00020805_g14013.t1)	0.08	0.09	0.08	0.11	0.13	0.17	0.21	0.18	0.39	0.35	0.34	0.22	0.08	0.07	1.0	0.06	0.08	0.1	0.12	0.1	0.0	0.09	0.64	0.12	0.14	0.11
Cpa\|evm.model.tig00020828.2 (tig00020828_g14361.t1)	0.05	0.08	0.08	0.11	0.12	0.13	0.16	0.17	0.16	0.14	0.12	0.1	0.03	0.16	1.0	0.11	0.09	0.11	0.09	0.08	0.01	0.1	0.09	0.07	0.12	0.08
Cpa\|evm.model.tig00020848.48 (tig00020848_g14578.t1)	0.03	0.04	0.04	0.05	0.06	0.11	0.2	0.15	0.15	0.07	0.04	0.02	0.04	0.27	1.0	0.26	0.17	0.17	0.16	0.09	0.01	0.06	0.03	0.02	0.11	0.05
Cpa\|evm.model.tig00020851.13 (tig00020851_g14713.t1)	0.21	0.17	0.14	0.15	0.17	0.16	0.14	0.15	0.11	0.14	0.15	0.15	0.2	0.27	1.0	0.23	0.13	0.09	0.08	0.09	0.05	0.27	0.21	0.14	0.26	0.22
Cpa\|evm.model.tig00020902.78 (tig00020902_g15033.t1)	0.11	0.05	0.05	0.09	0.13	0.13	0.15	0.17	0.21	0.22	0.29	0.3	0.11	0.06	1.0	0.23	0.11	0.2	0.14	0.22	0.18	0.02	0.43	0.48	0.06	0.11
Cpa\|evm.model.tig00020911.38 (tig00020911_g15742.t1)	0.23	0.11	0.08	0.05	0.02	0.03	0.11	0.17	0.14	0.15	0.16	0.13	0.19	0.12	1.0	0.09	0.08	0.11	0.11	0.08	0.01	0.03	0.07	0.07	0.15	0.13
Cpa\|evm.model.tig00020943.24 (tig00020943_g16266.t1)	0.18	0.11	0.12	0.14	0.17	0.21	0.18	0.16	0.12	0.16	0.16	0.15	0.18	0.28	1.0	0.25	0.14	0.17	0.12	0.14	0.03	0.15	0.12	0.11	0.15	0.18
Cpa\|evm.model.tig00020961.6 (tig00020961_g16627.t1)	0.03	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.0	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.02	0.02
Cpa\|evm.model.tig00020965.6 (tig00020965_g16827.t1)	0.05	0.05	0.05	0.02	0.03	0.05	0.02	0.01	0.03	0.04	0.05	0.06	0.03	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.08	0.15	0.36	0.06	0.06
Cpa\|evm.model.tig00020965.61 (tig00020965_g16874.t1)	0.1	0.07	0.05	0.06	0.06	0.1	0.13	0.12	0.07	0.06	0.04	0.03	0.08	0.25	1.0	0.18	0.04	0.09	0.08	0.05	0.21	0.08	0.22	0.08	0.18	0.17
Cpa\|evm.model.tig00021015.8 (tig00000093_g3662.t1)	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.02	0.06	0.01	0.01	0.0	0.04	0.03	0.01	0.02	0.02	0.11
Cpa\|evm.model.tig00021035.28 (tig00021035_g17262.t1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.04	0.04	0.04	0.05	0.03	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.03	0.01	0.02	0.0	0.0
Cpa\|evm.model.tig00021070.13 (tig00021070_g17822.t1)	0.15	0.26	0.23	0.21	0.14	0.06	0.15	0.25	0.27	0.29	0.38	0.33	0.12	0.09	1.0	0.12	0.12	0.23	0.15	0.12	0.02	0.08	0.38	0.41	0.45	0.22
Cpa\|evm.model.tig00021070.14 (tig00021070_g17822.t1)	0.17	0.29	0.16	0.18	0.14	0.12	0.18	0.24	0.2	0.23	0.31	0.35	0.12	0.08	1.0	0.12	0.17	0.33	0.19	0.19	0.01	0.17	0.61	0.62	0.63	0.27
Cpa\|evm.model.tig00021070.82 (tig00021070_g17891.t1)	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.01
Cpa\|evm.model.tig00021070.86 (tig00021070_g17896.t1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	1.0	0.0	0.04	0.13	0.0	0.01	0.01	0.01	0.11	0.0	0.0	0.0
Cpa\|evm.model.tig00021179.18 (tig00021179_g19233.t1)	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.05	0.05	0.04	0.04	0.03	0.02	0.01	0.15	1.0	0.06	0.04	0.03	0.03	0.01	0.0	0.0	0.03	0.01	0.01	0.01
Cpa\|evm.model.tig00021234.31 (tig00021234_g19405.t1)	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.06	0.04	0.04	0.02	0.0	0.08	1.0	0.05	0.02	0.03	0.03	0.02	0.0	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02
Cpa\|evm.model.tig00021352.21 (tig00021352_g20690.t2)	0.13	0.19	0.21	0.18	0.15	0.09	0.09	0.09	0.05	0.09	0.1	0.12	0.14	0.3	1.0	0.25	0.25	0.17	0.15	0.13	0.02	0.13	0.07	0.11	0.2	0.18
Cpa\|evm.model.tig00021373.13 (tig00021373_g21081.t1)	0.03	0.06	0.14	0.18	0.25	0.2	0.22	0.28	0.34	0.39	0.38	0.28	0.05	0.25	1.0	0.3	0.2	0.34	0.27	0.2	0.19	0.29	0.56	0.31	0.2	0.29
Cpa\|evm.model.tig00021374.39 (tig00021374_g21121.t1)	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.04	0.03	0.03	0.02	0.02	0.04	0.04	1.0	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03
Cpa\|evm.model.tig00021428.34 (tig00021428_g21177.t1)	0.06	0.03	0.08	0.28	0.1	0.02	0.01	0.06	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.05	0.15
Cpa\|evm.model.tig00021489.12 (tig00021489_g21659.t1)	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.02	0.01	1.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03
Cpa\|evm.model.tig00021621.30 (tig00021621_g22986.t1)	0.15	0.21	0.2	0.25	0.3	0.31	0.32	0.33	0.35	0.35	0.35	0.38	0.17	0.12	1.0	0.1	0.12	0.27	0.21	0.12	0.03	0.26	0.36	0.23	0.35	0.24
Cpa\|evm.model.tig00021621.31 (tig00021621_g22987.t1)	0.05	0.03	0.02	0.04	0.06	0.08	0.09	0.08	0.07	0.06	0.06	0.05	0.06	0.03	1.0	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.0	0.02	0.05	0.02	0.03	0.03
Cpa\|evm.model.tig00021742.19 (tig00021742_g23331.t1)	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.03	0.05	0.07	0.05	0.03	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.33	0.04	0.02	0.14	0.11
Cpa\|evm.model.tig00022075.103 (tig00020610_g11947.t1)	0.41	0.55	0.42	0.36	0.32	0.35	0.51	0.62	0.64	0.68	0.54	0.44	0.35	0.58	1.0	0.43	0.47	0.62	0.41	0.43	0.11	0.42	0.31	0.41	0.34	0.33

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)