Heatmap: Cluster_55 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
-N
2.5M NaCl,0.5h
2.5M NaCl,1h
2.5M NaCl,2h
CCAP 19/18,4.5M NaCl
CCAP 19/18,5M Glycerol
CCAP 19/3
CCAP 19/3,Log
CCAP 19/3,Log,3M NaCl,1h
CCAP 19/3,Log,3M NaCl,6h
Log
Mid-log,Low light
Mid-log,Medium light
Mid-log,High light
Mid-log,White light
Mid-log,Red light
Mid-log,Blue light
Strain 435
Strain 435,H2O2
Strain 435,NaCl
Strain 435,Sorbitol
Dusal.0002s00076.1 (33187983)
0.04 0.1 0.09 0.07 1.0 0.87 0.0 0.12 0.08 0.1 0.02 0.19 0.22 0.09 0.12 0.2 0.14 0.29 0.42 0.19 0.31
Dusal.0008s00032.1 (33198873)
0.22 0.11 0.12 0.18 1.0 0.82 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.17 0.09 0.13 0.19 0.19 0.16 0.22 0.19 0.22
Dusal.0015s00013.1 (33190947)
0.05 0.13 0.09 0.17 1.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.19 0.1 0.18 0.45 0.45 0.08 0.11 0.15 0.11
Dusal.0024s00004.1 (33202209)
0.08 0.12 0.15 0.09 1.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.13 0.05 0.13 0.13 0.09 0.34 0.29 0.22 0.36
Dusal.0025s00035.1 (33200725)
0.23 0.21 0.25 0.11 1.0 0.66 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.1 0.03 0.41 0.71 0.42 0.08 0.07 0.11 0.12
Dusal.0028s00026.1 (33198469)
0.28 0.15 0.09 0.05 1.0 0.87 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.17 0.14 0.05 0.15 0.16 0.19 0.31 0.1 0.15
Dusal.0030s00033.1 (33195322)
0.26 0.15 0.13 0.19 0.99 1.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.19 0.43 0.29 0.18 0.18 0.13 0.17 0.17 0.11
Dusal.0042s00002.1 (33189887)
0.22 0.1 0.07 0.07 0.88 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.17 0.12 0.2 0.19 0.19 0.25 0.24 0.22 0.25
Dusal.0056s00003.1 (33188785)
0.13 0.09 0.1 0.04 1.0 0.72 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.1 0.03 0.16 0.37 0.37 0.06 0.1 0.04 0.07
Dusal.0061s00008.1 (33190659)
0.31 0.14 0.12 0.12 1.0 0.91 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.17 0.15 0.19 0.24 0.23 0.18 0.22 0.11 0.19
Dusal.0062s00027.1 (33200762)
0.12 0.15 0.18 0.18 0.92 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.11 0.18 0.62 0.25 0.38 0.14 0.24 0.12 0.13
Dusal.0062s00028.1 (33200781)
0.12 0.15 0.21 0.2 1.0 0.91 0.15 0.0 0.01 0.02 0.05 0.11 0.1 0.06 0.18 0.19 0.24 0.22 0.25 0.23 0.24
Dusal.0069s00003.1 (33202964)
0.17 0.02 0.07 0.07 1.0 0.98 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.07 0.03 0.24 0.15 0.11 0.09 0.08 0.12 0.11
Dusal.0071s00008.1 (33185700)
0.25 0.17 0.17 0.1 1.0 0.97 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.22 0.18 0.16 0.19 0.2 0.18 0.26 0.18 0.19
Dusal.0073s00005.1 (33194590)
0.23 0.11 0.06 0.2 1.0 0.79 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.36 0.1 0.33 0.32 0.42 0.11 0.13 0.26 0.2
Dusal.0082s00020.1 (33189236)
0.12 0.1 0.09 0.09 1.0 0.77 0.12 0.01 0.0 0.01 0.01 0.07 0.15 0.08 0.1 0.13 0.15 0.11 0.15 0.08 0.12
Dusal.0084s00036.1 (33201453)
0.4 0.05 0.07 0.15 1.0 0.96 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.25 0.15 0.23 0.18 0.32 0.14 0.16 0.2 0.22
Dusal.0089s00001.1 (33198306)
0.45 0.16 0.16 0.37 0.95 1.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.13 0.13 0.31 0.19 0.21 0.24 0.31 0.36 0.33
Dusal.0096s00022.1 (33195828)
0.04 0.17 0.15 0.05 1.0 0.9 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.16 0.14 0.05 0.07 0.14 0.19 0.07 0.16
Dusal.0105s00006.1 (33200187)
0.36 0.21 0.18 0.18 0.96 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.1 0.07 0.31 0.27 0.17 0.23 0.25 0.2 0.23
Dusal.0110s00014.1 (33194375)
0.18 0.08 0.09 0.06 1.0 0.84 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.15 0.08 0.07 0.17 0.15 0.12 0.13 0.12 0.15
Dusal.0122s00003.1 (33203036)
0.21 0.08 0.07 0.1 1.0 0.96 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.21 0.11 0.15 0.07 0.13 0.13 0.12 0.07 0.12
Dusal.0127s00001.1 (33200025)
0.23 0.24 0.2 0.15 1.0 1.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.18 0.2 0.4 0.25 0.28 0.24 0.21 0.13 0.13
Dusal.0155s00018.1 (33194781)
0.31 0.08 0.09 0.25 0.94 1.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.17 0.13 0.17 0.15 0.22 0.18 0.22 0.3 0.26
Dusal.0175s00006.1 (33199717)
0.17 0.06 0.14 0.22 0.94 1.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.09 0.09 0.14 0.17 0.19 0.12 0.13 0.19 0.18
Dusal.0175s00010.1 (33199715)
0.57 0.13 0.14 0.18 1.0 0.92 0.15 0.09 0.09 0.14 0.15 0.2 0.38 0.28 0.73 0.31 0.31 0.31 0.34 0.21 0.22
Dusal.0178s00019.1 (33194020)
0.4 0.11 0.1 0.14 1.0 0.84 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.09 0.06 0.32 0.14 0.14 0.29 0.26 0.17 0.3
Dusal.0188s00006.1 (33189664)
0.08 0.11 0.11 0.15 1.0 0.89 0.08 0.01 0.0 0.01 0.01 0.09 0.12 0.04 0.17 0.15 0.16 0.25 0.24 0.19 0.26
Dusal.0210s00009.1 (33187440)
0.17 0.09 0.12 0.09 1.0 0.97 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.08 0.11 0.09 0.28 0.16 0.21 0.28 0.24 0.16 0.26
Dusal.0211s00001.1 (33198605)
0.53 0.15 0.15 0.18 1.0 0.86 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.18 0.1 0.44 0.61 0.44 0.13 0.16 0.1 0.14
Dusal.0237s00005.1 (33197975)
0.12 0.08 0.07 0.1 1.0 0.94 0.07 0.1 0.12 0.11 0.16 0.16 0.2 0.11 0.13 0.08 0.09 0.24 0.31 0.3 0.24
Dusal.0238s00004.1 (33193655)
0.27 0.21 0.16 0.1 0.93 1.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.19 0.27 0.33 0.2 0.18 0.33 0.33 0.17 0.27
Dusal.0280s00007.1 (33203399)
0.64 0.13 0.14 0.16 1.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.34 0.14 0.54 0.48 0.46 0.11 0.11 0.4 0.24
Dusal.0288s00017.1 (33188438)
0.7 0.17 0.15 0.08 1.0 0.92 0.18 0.05 0.07 0.0 0.02 0.29 0.34 0.29 0.73 0.27 0.46 0.3 0.31 0.08 0.14
Dusal.0305s00008.1 (33191335)
0.26 0.11 0.15 0.17 1.0 0.9 0.24 0.07 0.08 0.07 0.04 0.37 0.32 0.34 0.73 0.42 0.48 0.3 0.37 0.16 0.34
Dusal.0349s00011.1 (33189936)
0.19 0.12 0.12 0.23 1.0 0.88 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.16 0.11 0.17 0.21 0.23 0.2 0.2 0.28 0.27
Dusal.0376s00003.1 (33188043)
0.03 0.12 0.09 0.07 1.0 0.89 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.06 0.03 0.07 0.18 0.13 0.14 0.18 0.05 0.12
Dusal.0389s00015.1 (33193626)
0.2 0.04 0.04 0.04 1.0 0.83 0.16 0.08 0.06 0.11 0.08 0.07 0.06 0.02 0.42 0.49 0.21 0.13 0.11 0.04 0.11
Dusal.0399s00002.1 (33191739)
0.24 0.29 0.25 0.14 1.0 0.97 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.22 0.1 0.08 0.09 0.19 0.26 0.27 0.16 0.16
Dusal.0445s00011.1 (33198004)
0.03 0.04 0.04 0.11 1.0 0.91 0.07 0.01 0.0 0.01 0.03 0.08 0.08 0.03 0.07 0.12 0.13 0.15 0.09 0.12 0.15
Dusal.0536s00005.1 (33200136)
0.0 0.11 0.12 0.11 1.0 0.91 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.07 0.08 0.13 0.14 0.17 0.11 0.16 0.12 0.15
Dusal.0575s00001.1 (33197402)
0.16 0.1 0.11 0.1 1.0 0.8 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.17 0.04 0.35 0.52 0.31 0.09 0.11 0.04 0.08
Dusal.0588s00001.1 (33195780)
0.4 0.18 0.22 0.23 1.0 0.88 0.06 0.02 0.02 0.01 0.0 0.19 0.22 0.1 0.22 0.56 0.45 0.07 0.1 0.09 0.1
Dusal.0661s00003.1 (33199742)
0.2 0.12 0.12 0.14 1.0 0.9 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.12 0.07 0.28 0.18 0.15 0.19 0.19 0.18 0.18
Dusal.0694s00007.1 (33185244)
0.26 0.31 0.17 0.11 0.97 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.18 0.14 0.25 0.2 0.3 0.26 0.35 0.13 0.21
Dusal.0719s00002.1 (33201744)
0.39 0.15 0.1 0.08 1.0 0.84 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.18 0.18 0.2 0.2 0.18 0.21 0.25 0.27 0.08 0.22
Dusal.0722s00002.1 (33198674)
0.28 0.1 0.12 0.05 1.0 0.9 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.09 0.06 0.05 0.16 0.15 0.08 0.08 0.04 0.08
Dusal.0758s00009.1 (33198758)
0.22 0.17 0.16 0.1 1.0 0.79 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.09 0.09 0.04 0.27 0.48 0.42 0.14 0.13 0.03 0.06
Dusal.0762s00004.1 (33191775)
0.1 0.11 0.11 0.1 1.0 0.84 0.15 0.01 0.02 0.04 0.03 0.08 0.09 0.06 0.13 0.15 0.12 0.15 0.2 0.17 0.18
Dusal.0773s00003.1 (33197934)
0.06 0.11 0.16 0.16 1.0 0.79 0.06 0.01 0.01 0.0 0.0 0.15 0.3 0.16 0.21 0.1 0.14 0.19 0.22 0.17 0.15
Dusal.0797s00002.1 (33192322)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.34 0.19 0.12 0.12 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0835s00005.1 (33202841)
0.24 0.14 0.12 0.05 1.0 0.96 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.11 0.12 0.21 0.19 0.2 0.22 0.22 0.12 0.2
Dusal.0853s00002.1 (33198945)
0.14 0.05 0.07 0.1 1.0 0.99 0.08 0.02 0.02 0.0 0.02 0.25 0.35 0.2 0.14 0.29 0.33 0.14 0.21 0.23 0.18
Dusal.1007s00003.1 (33187007)
0.44 0.16 0.15 0.24 1.0 0.81 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.28 0.11 0.72 0.38 0.32 0.24 0.32 0.26 0.32
Dusal.1053s00002.1 (33199991)
0.13 0.15 0.15 0.17 1.0 0.77 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.16 0.07 0.1 0.2 0.22 0.07 0.08 0.13 0.12
Dusal.1066s00003.1 (33203822)
0.24 0.11 0.14 0.15 0.98 1.0 0.11 0.08 0.09 0.12 0.13 0.14 0.15 0.13 0.22 0.27 0.23 0.3 0.3 0.27 0.27
Dusal.1225s00002.1 (33202324)
0.44 0.25 0.23 0.2 0.96 1.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.3 0.25 0.19 0.24 0.34 0.22 0.23 0.15 0.18
Dusal.1327s00001.1 (33196449)
0.07 0.15 0.11 0.09 1.0 0.92 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.16 0.09 0.12 0.22 0.13 0.12 0.12 0.08 0.14
Dusal.1335s00001.1 (33200989)
0.2 0.19 0.14 0.19 1.0 0.87 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.24 0.16 0.47 0.4 0.47 0.2 0.19 0.16 0.18
Dusal.1367s00002.1 (33197623)
0.22 0.22 0.17 0.08 1.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.31 0.16 0.16 0.5 0.38 0.15 0.22 0.24 0.21
Dusal.1490s00001.1 (33185973)
0.07 0.12 0.14 0.11 1.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.25 0.22 0.16 0.14 0.21 0.24 0.19 0.2 0.25
Dusal.3388s00001.1 (33196595)
0.18 0.12 0.11 0.12 1.0 0.95 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.2 0.15 0.27 0.33 0.22 0.23 0.25 0.21 0.27

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)