1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_46 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000076.142 (tig00000076_g2435.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000093.154 (tig00000093_g3582.t1)
 - - - - - 2.01 - - - 3.65 - - - - - - - - - - 2.71 - - - - 1.53
Cpa|evm.model.tig00000133.16 (tig00000133_g7677.t1)
 - - - - - - - - - 4.36 - - - - - - - - - - 2.45 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000137.2 (tig00000137_g8135.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 3.6 - - 2.11 - 2.53 1.91 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000137.6 (tig00000057_g42.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000142.31 (tig00020952_g16470.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000144.202 (tig00020951_g16420.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000178.89 (tig00020965_g16844.t1)
 - 0.93 1.58 - - - 1.8 - - - - - - 2.34 - 1.24 - - - 1.26 - 1.95 - 1.24 0.67 -
Cpa|evm.model.tig00000178.97 (tig00000178_g12823.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.11 - 3.13 - - -
Cpa|evm.model.tig00000215.50 (tig00021489_g21700.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000215.78 (tig00000215_g18614.t1)
 0.71 - - - - - - - - - - - - - 4.47 1.16 - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000219.96 (tig00000219_g19533.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000403.45 (tig00000403_g301.t1)
 - 0.4 - - - - - - 0.94 - - - - 2.16 3.2 - 1.79 - 1.74 0.44 -0.12 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000404.51 (tig00000404_g414.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000404.55 (tig00000404_g416.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 2.49 - - - 2.74 - 1.76 - 3.37 - - -
Cpa|evm.model.tig00000430.31 (tig00000430_g614.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000448.80 (tig00000473_g1214.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000471.2 (tig00020616_g12292.t1)
 - -1.06 - - 1.74 0.49 0.56 - - 0.28 - - -0.21 0.19 -0.89 0.83 0.57 -1.23 - - 1.86 - 2.59 -0.04 -0.32 -1.15
Cpa|evm.model.tig00000489.23 (tig00000381_g24536.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000492.115 (tig00000492_g1508.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 3.19 0.78 - 1.93 0.63 0.26 1.23 2.35 0.26 - - -
Cpa|evm.model.tig00000492.63 (tig00000492_g1452.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000523.12 (tig00000523_g1831.t3)
 - - - - 3.54 - - - - - - - - - - - - - - - 3.85 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000586.2 (tig00000217_g19140.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 3.74 - - - - 3.66 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000607.11 (tig00000607_g2523.t1)
 2.34 - - - - - - - - - - - - - 4.39 - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001033.19 (tig00001033_g6500.t1)
 -1.21 -0.42 -0.76 -0.83 -0.85 0.26 0.25 0.37 0.43 -2.14 0.35 -1.08 -0.39 0.14 -1.35 -0.27 -0.8 0.31 -0.09 -0.07 0.63 - 1.51 -0.45 1.49 0.48
Cpa|evm.model.tig00001066.2 (tig00001066_g6751.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001220.4 (tig00001220_g7619.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 4.16 - - - 3.02 - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001497.4 (tig00001497_g9210.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.88 - 3.49 - - -
Cpa|evm.model.tig00001542.5 (tig00001542_g9313.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020544.15 (tig00020544_g10495.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020562.14 (tig00020562_g11144.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 4.58 - 1.03 - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020562.15 (tig00020562_g11145.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020562.16 (tig00000826_g4598.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.51 - 3.87 - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020563.15 (tig00020563_g11196.t1)
 - - - - - - - - - 1.86 - - - - 3.24 - 2.1 - - - - - 3.11 - - -
Cpa|evm.model.tig00020571.20 (tig00000114_g6048.t1)
 - - 2.32 - - - - - - - - - - - 3.07 - - - 2.32 - - 2.93 - - - -
Cpa|evm.model.tig00020675.48 (tig00020675_g12632.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020675.50 (tig00020675_g12634.t1)
 0.82 1.37 - 1.2 1.31 1.02 - - 2.18 - - 1.21 - - - - - - - - 2.31 - 0.74 - 0.45 -
Cpa|evm.model.tig00020676.1 (tig00020676_g12827.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020689.2 (tig00000215_g18611.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 2.56 1.63 - - - - 2.85 3.29 - - - -
Cpa|evm.model.tig00020710.85 (tig00020710_g13340.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.67 3.35 - 3.24 - - -
Cpa|evm.model.tig00020770.6 (tig00021319_g20263.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020824.44 (tig00020824_g14275.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 4.26 0.54 2.21 -0.28 - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020825.2 (tig00020825_g14282.t1)
 - - - - - - - - - - - 2.41 - - 4.37 - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020876.6 (tig00020781_g13703.t2)
 - - 1.07 - - 2.32 - - - - - - - - 2.4 - - 0.32 - - - 1.67 - 2.67 - 1.49
Cpa|evm.model.tig00020878.13 (tig00000826_g4596.t1)
 - - - - - 2.18 - - - - - - - 1.58 1.92 - - - 2.16 - - 3.36 - - - -
Cpa|evm.model.tig00020908.20 (tig00000663_g2937.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020911.17 (tig00020911_g15728.t1)
 - - - 1.83 1.45 - - - - - - 1.86 - - 3.82 - - 1.0 - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020944.25 (tig00020944_g16371.t1)
 - - - - - - - 1.08 3.48 - - - - - - - - - - - 2.66 - 2.68 - - -
Cpa|evm.model.tig00021017.50 (tig00020693_g13054.t1)
 - - 3.15 - - - - - - 3.03 - - - - - - - - - - 3.16 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021038.102 (tig00021042_g17592.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021038.77 (tig00021038_g17567.t1)
 -0.32 -2.14 -5.41 -3.06 -5.51 -5.16 - - -3.79 -5.46 -3.43 -2.99 -0.87 -1.05 -4.5 - -3.69 -4.11 -3.85 -3.73 3.04 3.63 0.11 -1.81 -0.81 -0.8
- - - - - - - - - 2.84 - - - - - - - - - - 2.9 - 3.51 - - -
Cpa|evm.model.tig00021105.17 (tig00021105_g18221.t1)
 - - - - 1.54 - - - - - - 1.95 - 2.19 2.59 - 1.81 1.3 - - - 1.44 - - - -
Cpa|evm.model.tig00021145.1 (tig00000411_g553.t1)
 -0.67 -0.62 - - - - - - - -1.61 - - - -0.11 2.69 1.45 0.45 1.29 0.74 1.24 - 0.84 - 2.15 -2.19 -
Cpa|evm.model.tig00021168.39 (tig00021168_g19109.t1)
 -3.38 -3.5 - - -0.21 - - -2.19 -3.09 -0.57 -0.76 0.34 0.14 -0.81 2.63 0.53 -0.54 -3.67 -0.7 -0.34 2.23 1.37 -1.59 -0.97 0.81 -0.45
Cpa|evm.model.tig00021326.19 (tig00021326_g20286.t1)
 - 1.09 - 0.92 - - - - - - - - - 0.68 2.63 1.91 0.81 - - - 1.64 - 1.46 0.74 0.17 -
Cpa|evm.model.tig00021332.31 (tig00021332_g20349.t1)
 - - - - - - 1.58 - - 1.01 - - 1.52 2.74 2.87 - - - 1.05 1.04 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021357.4 (tig00021357_g20737.t1)
 - - - 0.82 2.21 - - - 0.79 - - - - - - - - 0.2 - 1.39 1.92 - 2.63 2.04 - -
Cpa|evm.model.tig00021358.4 (tig00021319_g20263.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021374.28 (tig00021374_g21107.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021518.13 (tig00021518_g22031.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 1.79 - 3.01 - - - 3.5 - 1.66 - - -
Cpa|evm.model.tig00021572.15 (tig00021572_g22399.t1)
 -0.16 -0.77 -0.78 - - 0.47 - -0.8 -0.89 - - -0.92 - 2.1 2.54 -1.03 1.16 0.11 1.62 1.04 0.13 - - -1.11 -1.63 -
Cpa|evm.model.tig00021687.16 (tig00021687_g23125.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021742.30 (tig00000140_g8485.t1)
 - 0.91 - - - 1.34 - - - - - - - - 3.07 - 2.88 - - 1.0 - 1.93 - - - -
Cpa|evm.model.tig00021746.4 (tig00021319_g20263.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.