Heatmap: Cluster_21 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	-N	2.5M NaCl,0.5h	2.5M NaCl,1h	2.5M NaCl,2h	CCAP 19/18,4.5M NaCl	CCAP 19/18,5M Glycerol	CCAP 19/3	CCAP 19/3,Log	CCAP 19/3,Log,3M NaCl,1h	CCAP 19/3,Log,3M NaCl,6h	Log	Mid-log,Low light	Mid-log,Medium light	Mid-log,High light	Mid-log,White light	Mid-log,Red light	Mid-log,Blue light	Strain 435	Strain 435,H2O2	Strain 435,NaCl	Strain 435,Sorbitol
Dusal.0001s00040.1 (33198798)	0.39	0.5	0.5	0.48	0.15	0.16	0.39	0.7	0.61	0.69	1.0	0.46	0.4	0.57	0.3	0.28	0.33	0.41	0.42	0.43	0.43
Dusal.0003s00026.1 (33187489)	0.17	0.44	0.46	0.46	0.21	0.23	0.39	0.94	0.82	1.0	0.72	0.36	0.32	0.43	0.23	0.26	0.34	0.51	0.5	0.53	0.54
Dusal.0006s00020.1 (33186124)	1.0	0.61	0.6	0.56	0.39	0.38	0.34	0.49	0.47	0.64	0.43	0.44	0.44	0.4	0.52	0.69	0.96	0.67	0.62	0.63	0.75
Dusal.0013s00032.1 (33200934)	1.0	0.72	0.76	0.69	0.33	0.34	0.47	0.83	0.72	0.74	0.42	0.52	0.54	0.66	0.38	0.39	0.47	0.6	0.58	0.68	0.6
Dusal.0017s00026.1 (33200512)	0.27	0.94	1.0	0.95	0.29	0.3	0.52	0.49	0.41	0.5	0.96	0.34	0.33	0.36	0.24	0.3	0.35	0.69	0.66	0.88	0.81
Dusal.0023s00045.1 (33198034)	1.0	0.23	0.3	0.61	0.54	0.44	0.44	0.28	0.26	0.5	0.23	0.23	0.32	0.05	0.26	0.46	0.51	0.44	0.59	0.59	0.65
Dusal.0024s00015.1 (33202210)	0.8	0.73	0.77	0.74	0.36	0.37	0.4	1.0	0.81	0.96	0.67	0.44	0.36	0.53	0.41	0.34	0.44	0.82	0.74	0.84	0.82
Dusal.0024s00020.1 (33202211)	0.86	0.75	0.77	0.7	0.29	0.31	1.0	0.35	0.28	0.33	0.95	0.65	0.56	0.8	0.5	0.44	0.59	0.66	0.62	0.62	0.66
Dusal.0029s00015.1 (33203771)	0.38	0.72	0.75	0.71	0.39	0.41	0.37	0.82	0.77	0.91	1.0	0.5	0.4	0.55	0.41	0.39	0.48	0.66	0.62	0.67	0.66
Dusal.0029s00017.1 (33203768)	1.0	0.32	0.33	0.3	0.21	0.22	0.23	0.42	0.36	0.42	0.6	0.3	0.26	0.35	0.27	0.25	0.34	0.23	0.24	0.28	0.28
Dusal.0029s00041.1 (33203765)	0.62	1.0	0.99	0.9	0.3	0.32	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.72	0.62	0.83	0.49	0.5	0.59	0.81	0.73	0.85	0.85
Dusal.0041s00032.1 (33194551)	0.35	0.98	1.0	0.86	0.3	0.32	0.49	0.0	0.0	0.0	0.2	0.44	0.39	0.37	0.33	0.36	0.55	0.45	0.44	0.48	0.49
Dusal.0049s00020.1 (33200338)	0.23	0.98	1.0	0.76	0.39	0.4	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.59	0.46	0.57	0.41	0.53	0.78	0.78	0.91	0.75
Dusal.0062s00002.1 (33200785)	0.23	0.56	0.44	0.92	0.23	0.16	0.07	0.98	0.88	0.91	1.0	0.09	0.21	0.05	0.11	0.12	0.12	0.11	0.07	0.14	0.11
Dusal.0067s00003.1 (33194677)	0.8	0.82	0.84	0.83	0.3	0.33	0.49	0.63	0.56	0.67	1.0	0.44	0.41	0.48	0.32	0.35	0.46	0.68	0.69	0.66	0.67
Dusal.0088s00017.1 (33203549)	0.75	0.66	0.68	0.65	0.26	0.26	0.67	0.97	0.84	1.0	0.98	0.61	0.5	0.59	0.47	0.5	0.62	0.39	0.41	0.47	0.5
Dusal.0093s00008.1 (33185336)	0.4	0.65	0.69	0.66	0.35	0.37	0.52	0.82	0.73	0.92	1.0	0.37	0.33	0.36	0.34	0.41	0.52	0.76	0.74	0.82	0.85
Dusal.0101s00022.1 (33199178)	0.25	0.98	1.0	0.97	0.32	0.35	0.68	0.38	0.32	0.36	0.27	0.71	0.63	0.88	0.45	0.41	0.51	0.84	0.81	0.84	0.8
Dusal.0117s00014.1 (33191086)	0.82	0.96	1.0	0.94	0.4	0.41	0.71	0.24	0.18	0.22	0.21	0.72	0.61	0.8	0.5	0.43	0.6	0.75	0.78	0.8	0.83
Dusal.0120s00018.1 (33194381)	0.1	0.57	0.65	0.8	0.09	0.05	1.0	0.46	0.47	0.49	0.81	0.02	0.05	0.01	0.03	0.09	0.08	0.56	0.49	0.43	0.57
Dusal.0152s00012.1 (33186214)	0.27	0.49	0.51	0.49	0.27	0.28	0.47	0.48	0.44	0.49	1.0	0.5	0.41	0.5	0.37	0.33	0.41	0.55	0.53	0.58	0.58
Dusal.0155s00009.1 (33194778)	0.55	0.74	0.76	0.72	0.29	0.32	0.73	0.22	0.19	0.24	0.17	0.43	0.38	0.43	0.33	0.34	0.44	0.9	0.85	1.0	0.97
Dusal.0160s00007.1 (33188333)	0.19	0.34	0.35	0.37	0.2	0.21	0.65	0.75	0.68	0.79	1.0	0.25	0.22	0.25	0.18	0.22	0.25	0.49	0.51	0.49	0.51
Dusal.0160s00027.1 (33188334)	1.0	0.48	0.48	0.44	0.26	0.26	0.43	0.5	0.46	0.51	0.69	0.38	0.32	0.43	0.29	0.32	0.43	0.38	0.39	0.4	0.43
Dusal.0166s00002.1 (33188742)	1.0	0.42	0.45	0.57	0.22	0.22	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.42	0.55	0.3	0.28	0.29	0.24	0.28	0.35	0.37
Dusal.0190s00012.1 (33189449)	0.07	0.69	0.73	0.7	0.19	0.21	0.65	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.5	0.68	0.44	0.35	0.4	0.95	0.87	1.0	1.0
Dusal.0199s00011.1 (33199094)	0.54	0.68	0.63	0.78	0.38	0.35	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.49	0.45	0.67	1.0	0.49	0.69	0.35	0.33	0.3	0.35
Dusal.0222s00006.1 (33201854)	0.25	0.46	0.57	0.67	0.04	0.04	1.0	0.14	0.09	0.06	0.75	0.07	0.17	0.07	0.06	0.29	0.25	0.41	0.51	0.41	0.48
Dusal.0238s00023.1 (33193670)	0.43	0.73	0.76	0.71	0.21	0.22	1.0	0.9	0.73	0.95	0.9	0.73	0.62	0.79	0.59	0.42	0.53	0.46	0.42	0.5	0.48
Dusal.0241s00008.1 (33190252)	1.0	0.38	0.4	0.37	0.25	0.25	0.18	0.31	0.29	0.3	0.6	0.28	0.24	0.33	0.21	0.2	0.3	0.35	0.37	0.51	0.48
Dusal.0242s00016.1 (33196725)	1.0	0.73	0.78	0.73	0.38	0.38	0.64	0.68	0.65	0.64	0.79	0.27	0.27	0.23	0.24	0.32	0.46	0.64	0.68	0.82	0.82
Dusal.0251s00001.1 (33190197)	1.0	0.19	0.21	0.16	0.08	0.06	0.63	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.41	0.26	0.5	0.62	0.82	0.78	0.8	0.7	0.84
Dusal.0264s00012.1 (33193090)	0.05	0.54	0.49	0.65	0.03	0.03	0.07	1.0	0.71	0.7	0.51	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.16	0.25	0.19	0.23
Dusal.0268s00002.1 (33190613)	0.78	0.54	0.56	0.52	0.25	0.25	1.0	0.36	0.33	0.38	0.69	0.39	0.4	0.53	0.38	0.32	0.45	0.46	0.45	0.51	0.5
Dusal.0276s00013.1 (33203073)	0.29	0.29	0.3	0.29	0.22	0.23	0.5	0.56	0.5	0.61	1.0	0.24	0.18	0.24	0.22	0.24	0.3	0.23	0.21	0.25	0.25
Dusal.0293s00005.1 (33190176)	0.4	0.95	1.0	0.84	0.27	0.27	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.39	0.53	0.33	0.36	0.42	0.56	0.51	0.6	0.57
Dusal.0308s00002.1 (33194619)	0.78	0.41	0.42	0.41	0.27	0.29	0.45	0.96	0.84	0.99	1.0	0.4	0.39	0.52	0.23	0.33	0.38	0.74	0.67	0.75	0.78
Dusal.0318s00002.1 (33185638)	0.21	0.73	0.75	0.68	0.18	0.18	0.42	0.5	0.45	0.52	1.0	0.46	0.41	0.52	0.34	0.29	0.43	0.35	0.33	0.39	0.38
Dusal.0375s00002.1 (33193949)	0.63	0.43	0.45	0.41	0.3	0.3	0.43	0.7	0.65	0.72	1.0	0.29	0.25	0.27	0.25	0.31	0.41	0.47	0.44	0.49	0.51
Dusal.0376s00011.1 (33188044)	0.9	0.54	0.52	1.0	0.67	0.65	0.56	0.3	0.28	0.94	0.37	0.38	0.56	0.25	0.45	0.84	0.82	0.55	0.6	0.61	0.68
Dusal.0391s00002.1 (33187356)	0.76	0.89	0.91	0.87	0.3	0.31	0.64	0.53	0.51	0.53	1.0	0.51	0.41	0.56	0.39	0.45	0.55	0.58	0.54	0.61	0.62
Dusal.0430s00019.1 (33200652)	0.36	0.68	0.71	0.69	0.22	0.23	0.43	0.85	0.75	0.86	1.0	0.48	0.42	0.53	0.33	0.3	0.37	0.65	0.65	0.71	0.68
Dusal.0446s00012.1 (33201126)	0.77	0.94	1.0	0.91	0.38	0.39	0.53	0.2	0.18	0.22	0.34	0.64	0.53	0.72	0.47	0.44	0.66	0.82	0.82	0.93	0.93
Dusal.0453s00002.1 (33187614)	0.66	0.66	0.68	0.62	0.21	0.22	0.36	0.63	0.58	0.61	1.0	0.32	0.26	0.38	0.19	0.23	0.3	0.37	0.35	0.4	0.39
Dusal.0494s00007.1 (33193763)	0.7	0.71	0.73	0.73	0.36	0.37	0.98	0.7	0.61	0.73	0.84	0.25	0.25	0.19	0.24	0.32	0.3	1.0	0.87	0.67	0.83
Dusal.0504s00002.1 (33188688)	0.84	0.47	0.48	0.52	0.59	0.53	0.45	0.26	0.27	0.47	0.25	0.38	0.42	0.2	0.37	0.88	1.0	0.55	0.6	0.67	0.76
Dusal.0521s00005.1 (33197389)	0.45	0.64	0.66	0.66	0.0	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.33	0.5	0.36	0.31	0.42	0.86	0.84	0.94	1.0
Dusal.0521s00006.1 (33197395)	0.45	0.85	0.89	0.86	0.43	0.44	0.51	0.8	0.7	0.79	1.0	0.61	0.57	0.77	0.54	0.52	0.6	0.59	0.6	0.7	0.69
Dusal.0524s00007.1 (33201137)	0.61	0.96	1.0	0.86	0.28	0.3	0.56	0.47	0.38	0.45	0.57	0.58	0.55	0.57	0.29	0.42	0.56	0.55	0.58	0.59	0.59
Dusal.0543s00007.1 (33190902)	0.0	0.47	0.49	0.56	0.22	0.25	0.67	0.0	0.0	0.0	0.0	0.51	0.45	0.39	0.73	0.42	0.37	0.89	0.87	0.95	1.0
Dusal.0610s00002.1 (33191023)	1.0	0.94	0.97	0.88	0.47	0.5	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.81	0.67	0.91	0.67	0.53	0.74	0.7	0.65	0.7	0.74
Dusal.0652s00006.1 (33198110)	0.18	0.19	0.17	0.22	0.41	0.38	0.4	0.68	0.72	0.69	1.0	0.5	0.51	0.48	0.33	0.17	0.27	0.2	0.24	0.47	0.32
Dusal.0690s00005.1 (33188589)	0.75	0.18	0.22	0.71	0.31	0.28	0.46	0.63	0.56	0.93	1.0	0.48	0.55	0.44	0.33	0.38	0.43	0.28	0.31	0.56	0.32
Dusal.0705s00006.1 (33186300)	1.0	0.82	0.85	0.82	0.38	0.4	0.51	0.41	0.34	0.43	0.39	0.56	0.57	0.74	0.38	0.39	0.46	0.59	0.56	0.64	0.61
Dusal.0723s00004.1 (33203597)	0.46	0.95	1.0	0.92	0.19	0.2	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	0.6	0.9	0.47	0.37	0.49	0.55	0.54	0.6	0.56
Dusal.0757s00001.1 (33202066)	0.3	0.96	0.99	0.89	0.3	0.33	0.72	0.0	0.0	0.0	0.0	0.79	0.58	1.0	0.67	0.47	0.65	0.35	0.31	0.39	0.41
Dusal.0778s00006.1 (33199653)	0.53	0.67	0.69	0.67	0.43	0.46	1.0	0.01	0.01	0.01	0.65	0.5	0.47	0.61	0.34	0.39	0.49	0.51	0.49	0.51	0.57
Dusal.0808s00008.1 (33188936)	0.4	0.43	0.45	0.43	0.26	0.27	1.0	0.43	0.36	0.43	0.56	0.36	0.31	0.5	0.19	0.2	0.24	0.3	0.29	0.33	0.35
Dusal.0883s00005.1 (33201955)	0.3	0.97	1.0	0.86	0.3	0.32	0.42	0.32	0.29	0.32	0.34	0.55	0.44	0.69	0.51	0.36	0.5	0.35	0.35	0.42	0.4
Dusal.0931s00005.1 (33189912)	0.19	0.52	0.54	0.52	0.23	0.24	0.66	0.38	0.34	0.41	1.0	0.53	0.46	0.65	0.43	0.37	0.45	0.46	0.48	0.51	0.49
Dusal.0936s00001.1 (33189602)	0.2	0.56	0.58	0.6	0.27	0.29	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.51	0.48	0.7	0.35	0.3	0.36	0.96	0.93	0.99	1.0
Dusal.1082s00002.1 (33193928)	0.42	0.8	0.8	0.88	0.43	0.43	0.45	0.0	0.0	0.0	0.0	0.6	0.58	0.6	0.69	0.27	0.44	0.98	1.0	0.78	0.89
Dusal.1371s00001.1 (33191881)	0.58	0.98	1.0	0.96	0.5	0.51	0.76	0.57	0.52	0.61	0.8	0.57	0.47	0.65	0.47	0.41	0.54	0.82	0.81	0.88	0.95
Dusal.1405s00001.1 (33194454)	0.41	0.95	1.0	0.95	0.5	0.53	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.62	0.57	0.73	0.45	0.48	0.59	0.92	0.89	0.95	0.95
Dusal.1916s00002.1 (33187807)	0.18	0.65	0.68	0.65	0.21	0.22	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.54	0.57	0.27	0.32	0.4	0.88	0.85	1.0	0.87
Dusal.2019s00002.1 (33200838)	1.0	0.31	0.51	0.74	0.88	0.6	0.46	0.26	0.37	0.46	0.25	0.52	0.68	0.22	0.41	0.7	0.71	0.37	0.5	0.46	0.51
Dusal.2138s00001.1 (33185794)	1.0	0.69	0.71	0.67	0.3	0.32	0.41	0.6	0.49	0.63	0.44	0.44	0.4	0.48	0.3	0.32	0.41	0.71	0.69	0.76	0.75
Dusal.3410s00001.1 (33201679)	1.0	0.21	0.22	0.22	0.15	0.16	0.27	0.26	0.25	0.27	0.22	0.32	0.29	0.32	0.2	0.27	0.34	0.34	0.32	0.32	0.33

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)