Heatmap: Cluster_74 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000057.133 (tig00000540_g1932.t1)	1.8	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.13	-	-	-	-	-	-	-	1.12	-	-	-	-	1.53
Cpa\|evm.model.tig00000093.217 (tig00000093_g3641.t1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000114.13 (tig00000114_g6027.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000123.4 (tig00000123_g6905.t1)	0.17	0.41	0.22	-	0.72	-	-	-1.15	0.26	-	1.77	-1.26	2.01	1.3	-	-	-	0.21	-	1.09	-	-1.76	0.05	-1.47	1.56	-0.23
Cpa\|evm.model.tig00000133.56 (tig00021013_g17080.t1)	-	-	-	-	1.7	1.91	-	-	-	2.13	0.24	-	2.25	-	-	-	0.2	-	-	-	-	-0.03	-	-	1.61	1.81
Cpa\|evm.model.tig00000144.134 (tig00000144_g9130.t1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000158.108 (tig00000158_g10210.t4)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000158.37 (tig00000158_g10146.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000178.46	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000215.76 (tig00020921_g15923.t1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000217.58 (tig00000217_g19184.t1)	-	-	-	-	-	2.69	-	4.29	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000248.79 (tig00000248_g21840.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000331.14 (tig00000492_g1481.t1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000404.57 (tig00000404_g420.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000441.34 (tig00000057_g148.t1)	-	-	-	-	2.67	-	-	-	2.52	2.36	-	-	0.92	1.32	-	-	-	-	2.13	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000507.5 (tig00021017_g17223.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000526.7 (tig00000526_g1902.t1)	-	-	-	-	-	-	-	3.44	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.87	-	-	2.97	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000545.5 (tig00000545_g1979.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000551.30 (tig00000551_g2051.t1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000654.27	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000663.6 (tig00000663_g2937.t1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000911.3 (tig00020688_g12997.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00000940.18 (tig00000940_g5552.t1)	1.99	-	-	-	-	2.38	-	-	1.28	-	-	1.38	2.73	0.7	-	-	-	-	0.94	-	-	-	-	-	-	0.71
Cpa\|evm.model.tig00020515.15 (tig00020629_g12329.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.82	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020528.15 (tig00020528_g9982.t1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020553.215 (tig00021111_g18383.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020553.85	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.94	-	3.42	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020567.15 (tig00020567_g11519.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020567.19 (tig00020567_g11524.t1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020675.47 (tig00020675_g12629.t1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020693.13 (tig00021012_g17010.t1)	1.67	-	1.53	-	-	-	-	-	-	3.03	-	-	-	1.88	-	-	-	-	-	-	-	-	0.87	-	0.92	2.11
Cpa\|evm.model.tig00020693.51 (tig00000194_g14727.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020816.120 (tig00020616_g12280.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020829.1 (tig00021531_g22181.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020851.20 (tig00021745_g23369.t1)	1.52	1.96	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	1.66	-	-	2.05	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020918.29 (tig00020918_g15906.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020930.4 (tig00020930_g16015.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020941.25 (tig00020941_g16218.t1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020941.7 (tig00020564_g11471.t1)	0.71	-	-	-	-	-	1.17	3.76	0.84	-	-	2.13	-	-	-	-	-	0.13	-	-	-	-	0.34	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00020961.148 (tig00020961_g16768.t1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.31	-	4.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021014.14 (tig00000254_g22487.t1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021017.47 (tig00021017_g17219.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021036.90 (tig00021761_g23440.t1)	-	-	-	-	-	-	2.71	4.08	-	-	-	-	-	-	1.35	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021108.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021108.76 (tig00021603_g22828.t1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021111.16 (tig00021111_g18397.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021116.15 (tig00000171_g10955.t1)	1.84	0.59	-	0.42	0.24	1.35	-	0.23	0.33	0.25	0.27	1.43	0.77	2.03	-	-	-	-0.2	-	-	-	-	-	-	-	0.76
Cpa\|evm.model.tig00021127.137 (tig00021127_g18817.t1)	-	-	-	-	-	-	-	3.98	-	-	-	-	3.35	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021137.39 (tig00021137_g19010.t1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021244.11 (tig00021244_g19569.t1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021247.11 (tig00021248_g19613.t1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.83	-	2.31	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.78	-
Cpa\|evm.model.tig00021275.21 (tig00021275_g19881.t1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021290.3 (tig00021289_g19955.t1)	-	-	-	-	-	-0.15	-	3.32	-	-0.21	-	0.93	2.6	-	-	-	-	0.25	-	-	1.22	-	-	1.45	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021312.35	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021319.20 (tig00021319_g20215.t1)	-0.01	-1.46	-1.7	0.92	0.49	0.31	0.3	-1.49	0.64	-0.79	0.59	-1.61	2.16	-1.06	-	-1.72	-1.47	-2.45	-1.78	-0.37	0.23	-1.03	-	-1.1	0.45	1.96
Cpa\|evm.model.tig00021332.39 (tig00000382_g24596.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021332.5 (tig00021332_g20322.t1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021434.38 (tig00021434_g21344.t1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021525.1 (tig00021525_g22116.t1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021532.2 (tig00021532_g22183.t1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021532.26 (tig00021532_g22204.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.58	-	1.05	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021603.15 (tig00021603_g22824.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021612.12 (tig00021612_g22859.t1)	0.7	0.37	0.52	0.89	0.78	-0.04	-0.38	0.22	-1.08	-1.24	0.04	-0.37	2.42	-1.36	-0.46	-1.94	-0.76	1.24	-1.92	0.68	-4.2	-5.62	-1.67	-1.89	-3.58	-2.54
Cpa\|evm.model.tig00021745.17 (tig00020936_g16182.t1)	1.22	-	2.2	-	-	-	1.09	1.11	1.13	-	-	-	3.11	-	-	-	-	-	-	1.0	-	-	-	0.98	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021761.6 (tig00020567_g11520.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021761.9 (tig00020936_g16176.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Cpa\|evm.model.tig00021762.7 (tig00021762_g23463.t1)	-	-	-	-	-	-	-	4.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.