Heatmap: Cluster_71 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
-N
2.5M NaCl,0.5h
2.5M NaCl,1h
2.5M NaCl,2h
CCAP 19/18,4.5M NaCl
CCAP 19/18,5M Glycerol
CCAP 19/3
CCAP 19/3,Log
CCAP 19/3,Log,3M NaCl,1h
CCAP 19/3,Log,3M NaCl,6h
Log
Mid-log,Low light
Mid-log,Medium light
Mid-log,High light
Mid-log,White light
Mid-log,Red light
Mid-log,Blue light
Strain 435
Strain 435,H2O2
Strain 435,NaCl
Strain 435,Sorbitol
Dusal.0002s00063.1 (33187979)
1.0 0.21 0.24 0.22 0.42 0.42 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.37 0.34 0.78 0.36 0.52 0.29 0.35 0.44 0.58
Dusal.0002s00064.1 (33187976)
0.8 0.35 0.32 0.31 0.56 0.42 0.37 0.07 0.08 0.09 0.05 0.48 0.77 0.23 1.0 0.62 0.96 0.44 0.57 0.5 0.74
Dusal.0011s00004.1 (33192142)
1.0 0.13 0.13 0.06 0.37 0.33 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.28 0.15 0.25 0.51 0.62 0.19 0.28 0.21 0.28
Dusal.0027s00013.1 (33191559)
0.77 0.23 0.28 0.48 0.69 0.56 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 1.0 0.37 0.61 0.89 0.93 0.51 0.65 0.73 0.8
Dusal.0033s00031.1 (33202488)
0.51 0.41 0.34 0.5 0.6 0.59 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.5 0.33 0.93 0.96 1.0 0.64 0.61 0.49 0.7
Dusal.0041s00018.1 (33194529)
1.0 0.21 0.26 0.45 0.67 0.68 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.61 0.33 0.84 0.58 0.66 0.53 0.56 0.68 0.64
Dusal.0042s00023.1 (33189875)
1.0 0.38 0.48 0.33 0.44 0.51 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.3 0.48 0.66 0.5 0.63 0.44 0.47 0.31 0.65
Dusal.0044s00008.1 (33194929)
0.56 0.16 0.13 0.06 0.61 0.58 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.4 0.38 0.6 0.67 1.0 0.31 0.41 0.31 0.4
Dusal.0046s00003.1 (33197235)
1.0 0.26 0.32 0.67 0.83 0.81 0.44 0.1 0.08 0.05 0.05 0.68 0.7 0.39 0.69 0.86 0.96 0.59 0.56 0.8 0.65
Dusal.0054s00028.1 (33201661)
1.0 0.28 0.25 0.29 0.54 0.54 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.42 0.32 0.57 0.46 0.66 0.45 0.43 0.48 0.5
Dusal.0062s00013.1 (33200772)
0.48 0.14 0.1 0.1 0.84 0.57 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.41 0.08 0.21 0.73 1.0 0.35 0.44 0.19 0.41
Dusal.0091s00007.1 (33193985)
0.14 0.4 0.37 0.47 0.63 0.6 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 1.0 0.99 0.55 0.62 0.75 0.53 0.57 0.62 0.56
Dusal.0098s00006.1 (33203630)
0.32 0.15 0.2 0.23 0.63 0.6 0.19 0.0 0.0 0.01 0.0 0.55 0.51 0.33 0.62 0.71 1.0 0.53 0.56 0.48 0.48
Dusal.0127s00003.1 (33199995)
1.0 0.2 0.18 0.24 0.61 0.62 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.47 0.4 0.76 0.62 0.81 0.5 0.57 0.56 0.54
Dusal.0134s00001.1 (33191003)
0.52 0.37 0.35 0.33 0.52 0.53 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 1.0 0.62 0.76 0.72 0.66 0.39 0.42 0.24 0.28
Dusal.0172s00015.1 (33188488)
0.39 0.13 0.15 0.17 0.72 0.66 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.54 0.48 0.68 0.87 1.0 0.39 0.46 0.42 0.47
Dusal.0173s00021.1 (33191842)
0.17 0.29 0.29 0.36 0.67 0.61 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.43 0.22 0.9 1.0 0.81 0.57 0.65 0.53 0.71
Dusal.0177s00016.1 (33189757)
0.29 0.16 0.16 0.43 0.7 0.67 0.23 0.06 0.07 0.06 0.05 0.71 0.56 0.4 0.77 0.67 1.0 0.33 0.34 0.7 0.46
Dusal.0189s00010.1 (33201896)
0.47 0.23 0.2 0.2 0.5 0.46 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.38 0.22 0.65 0.67 1.0 0.5 0.49 0.24 0.43
Dusal.0210s00001.1 (33187433)
0.25 0.36 0.32 0.54 0.94 0.97 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 1.0 0.75 0.5 0.46 0.46 0.4 0.4 0.57 0.41
Dusal.0217s00004.1 (33197558)
0.64 0.23 0.23 0.17 0.4 0.35 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.47 0.32 0.27 0.49 1.0 0.18 0.19 0.23 0.16
Dusal.0226s00018.1 (33193538)
1.0 0.29 0.29 0.23 0.53 0.52 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.64 0.43 0.36 0.56 0.82 0.51 0.61 0.46 0.57
Dusal.0229s00002.1 (33187459)
0.36 0.25 0.23 0.22 0.82 0.7 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.4 0.34 0.32 1.0 0.91 0.36 0.43 0.58 0.58
Dusal.0255s00017.1 (33188958)
1.0 0.23 0.22 0.22 0.42 0.37 0.26 0.1 0.1 0.12 0.05 0.33 0.31 0.21 0.55 0.58 0.62 0.26 0.28 0.28 0.28
Dusal.0262s00019.1 (33195653)
0.3 0.22 0.2 0.42 0.71 0.64 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.65 0.42 0.54 1.0 0.96 0.37 0.4 0.68 0.63
Dusal.0279s00012.1 (33195857)
1.0 0.28 0.25 0.25 0.46 0.38 0.18 0.01 0.0 0.0 0.0 0.3 0.52 0.08 0.38 0.68 0.98 0.14 0.24 0.23 0.2
Dusal.0284s00001.1 (33187011)
1.0 0.09 0.09 0.04 0.53 0.42 0.24 0.1 0.1 0.12 0.14 0.33 0.3 0.17 0.27 0.5 0.68 0.2 0.24 0.36 0.28
Dusal.0303s00019.1 (33185548)
1.0 0.27 0.24 0.5 0.42 0.4 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.77 0.32 0.37 0.69 0.92 0.46 0.61 0.65 0.64
Dusal.0308s00010.1 (33194625)
1.0 0.12 0.11 0.08 0.36 0.36 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.22 0.16 0.73 0.53 0.67 0.07 0.07 0.03 0.05
Dusal.0322s00014.1 (33197818)
0.82 0.2 0.24 0.37 0.71 0.62 0.42 0.08 0.07 0.11 0.23 0.52 0.69 0.32 0.45 0.97 1.0 0.3 0.36 0.41 0.4
Dusal.0326s00016.1 (33186770)
0.41 0.34 0.31 0.52 0.58 0.67 0.38 0.0 0.0 0.01 0.0 0.83 0.86 0.63 1.0 0.99 0.97 0.42 0.38 0.45 0.47
Dusal.0349s00004.1 (33189930)
1.0 0.22 0.2 0.24 0.6 0.53 0.44 0.05 0.06 0.09 0.08 0.27 0.26 0.2 0.73 0.84 0.99 0.36 0.4 0.22 0.36
Dusal.0367s00001.1 (33189397)
0.33 0.06 0.07 0.07 0.82 0.67 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.57 0.29 0.4 0.86 1.0 0.16 0.17 0.33 0.22
Dusal.0368s00003.1 (33194812)
0.56 0.37 0.45 0.33 0.73 0.65 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.45 0.24 0.52 0.88 1.0 0.72 0.9 0.58 0.72
Dusal.0378s00007.1 (33199212)
0.92 0.27 0.25 0.12 0.66 0.51 0.44 0.05 0.07 0.04 0.04 0.63 0.6 0.31 0.5 0.82 1.0 0.23 0.28 0.34 0.35
Dusal.0383s00011.1 (33199475)
1.0 0.18 0.19 0.22 0.58 0.57 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.34 0.4 0.98 0.5 0.91 0.43 0.5 0.35 0.44
Dusal.0404s00004.1 (33186401)
1.0 0.39 0.48 0.86 0.97 0.89 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.76 0.44 0.71 0.84 0.93 0.78 0.89 0.92 0.9
Dusal.0423s00012.1 (33192029)
1.0 0.34 0.39 0.39 0.68 0.63 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.92 0.5 0.64 0.78 0.79 0.3 0.37 0.31 0.3
Dusal.0423s00018.1 (33192035)
0.47 0.39 0.37 0.43 0.8 0.82 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.69 0.34 0.58 1.0 0.99 0.53 0.61 0.54 0.74
Dusal.0450s00011.1 (33185510)
0.92 0.63 0.63 0.66 1.0 0.99 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.83 0.96 0.67 0.51 0.52 0.55 0.6 0.74 0.69
Dusal.0476s00003.1 (33198125)
0.43 0.21 0.16 0.52 0.83 0.72 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.65 0.76 1.0 0.86 0.89 0.29 0.37 0.6 0.49
Dusal.0479s00011.1 (33193187)
0.57 0.39 0.4 0.67 0.72 0.68 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.84 0.45 0.75 0.73 0.88 0.73 0.81 1.0 0.98
Dusal.0494s00012.1 (33193760)
0.66 0.33 0.32 0.13 0.61 0.45 0.26 0.0 0.0 0.01 0.01 0.75 1.0 0.58 0.61 0.54 0.54 0.17 0.21 0.14 0.22
Dusal.0521s00009.1 (33197400)
0.9 0.19 0.19 0.25 0.84 0.71 0.4 0.04 0.03 0.06 0.01 0.87 0.91 0.4 0.43 0.72 0.79 0.79 0.84 0.6 1.0
Dusal.0527s00006.1 (33187735)
0.71 0.14 0.09 0.02 0.69 0.59 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.51 0.31 0.33 1.0 0.87 0.25 0.3 0.41 0.42
Dusal.0541s00005.1 (33201782)
0.58 0.43 0.38 0.43 0.76 0.68 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.88 0.6 0.88 0.94 1.0 0.5 0.53 0.56 0.59
Dusal.0554s00004.1 (33189011)
1.0 0.13 0.15 0.16 0.41 0.34 0.23 0.11 0.12 0.13 0.09 0.25 0.42 0.18 0.32 0.41 0.81 0.16 0.18 0.23 0.22
Dusal.0558s00007.1 (33191353)
0.91 0.21 0.23 0.19 0.76 0.7 0.55 0.03 0.02 0.05 0.02 0.35 0.4 0.33 0.63 0.87 1.0 0.46 0.49 0.27 0.43
Dusal.0674s00005.1 (33191313)
0.05 0.22 0.31 0.25 0.99 1.0 0.3 0.06 0.02 0.0 0.02 0.52 0.75 0.27 0.33 0.53 0.48 0.35 0.4 0.33 0.44
Dusal.0681s00003.1 (33191868)
0.86 0.2 0.18 0.2 0.6 0.58 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.51 0.29 0.7 0.93 1.0 0.41 0.45 0.31 0.36
Dusal.0704s00002.1 (33199617)
0.93 0.44 0.44 0.37 0.77 0.72 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.7 0.5 1.0 0.7 0.88 0.72 0.71 0.53 0.8
Dusal.0809s00007.1 (33193198)
0.43 0.22 0.29 0.18 0.57 0.49 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.56 0.23 0.39 0.75 1.0 0.56 0.6 0.45 0.47
Dusal.0820s00003.1 (33201397)
1.0 0.22 0.31 0.25 0.84 0.68 0.34 0.0 0.0 0.01 0.02 0.46 0.55 0.45 0.88 0.74 0.84 0.59 0.61 0.64 0.6
Dusal.0886s00004.1 (33195359)
0.61 0.38 0.37 0.3 0.6 0.53 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.49 0.37 0.82 0.76 1.0 0.38 0.43 0.54 0.52
Dusal.0924s00001.1 (33203267)
0.78 0.35 0.34 0.17 0.86 0.7 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.85 0.39 0.57 0.89 1.0 0.39 0.61 0.31 0.49
Dusal.0999s00001.1 (33191583)
0.35 0.23 0.22 0.43 0.67 0.65 0.47 0.11 0.11 0.14 0.06 0.56 0.59 0.3 0.74 1.0 0.96 0.46 0.47 0.57 0.59
Dusal.1014s00001.1 (33200028)
0.89 0.36 0.32 0.38 0.71 0.63 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 1.0 0.63 0.7 0.98 0.99 0.54 0.62 0.52 0.62
Dusal.1215s00002.1 (33202230)
0.54 0.35 0.37 0.49 0.63 0.58 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.51 0.25 1.0 0.66 0.96 0.45 0.48 0.45 0.56
Dusal.1480s00001.1 (33187688)
0.85 0.44 0.46 0.49 0.7 0.67 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.55 0.5 0.77 1.0 0.9 0.68 0.72 0.81 0.67

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)