Heatmap: Cluster_135 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	-N	2.5M NaCl,0.5h	2.5M NaCl,1h	2.5M NaCl,2h	CCAP 19/18,4.5M NaCl	CCAP 19/18,5M Glycerol	CCAP 19/3	CCAP 19/3,Log	CCAP 19/3,Log,3M NaCl,1h	CCAP 19/3,Log,3M NaCl,6h	Log	Mid-log,Low light	Mid-log,Medium light	Mid-log,High light	Mid-log,White light	Mid-log,Red light	Mid-log,Blue light	Strain 435	Strain 435,H2O2	Strain 435,NaCl	Strain 435,Sorbitol
Dusal.0006s00011.1 (33186109)	1.0	0.17	0.15	0.07	0.56	0.37	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.32	0.05	0.18	0.33	0.48	0.05	0.07	0.08	0.1
Dusal.0031s00031.1 (33192225)	1.0	0.72	0.78	0.64	0.04	0.03	0.36	0.45	0.46	0.38	0.12	0.23	0.34	0.12	0.42	0.98	0.71	0.62	0.65	0.41	0.54
Dusal.0037s00014.1 (33185933)	0.02	0.05	0.08	1.0	0.01	0.01	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.38	0.17
Dusal.0044s00014.1 (33194933)	0.66	0.4	0.53	1.0	0.22	0.23	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.13	0.02	0.15	0.3	0.33	0.24	0.19	0.53	0.37
Dusal.0044s00015.1 (33194917)	0.09	0.4	0.42	1.0	0.09	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.08	0.0	0.04	0.1	0.16	0.26	0.27	0.93	0.32
Dusal.0047s00021.1 (33194309)	0.98	0.42	0.72	1.0	0.27	0.17	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.16	0.04	0.02	0.27	0.18	0.29	0.25	0.55	0.52
Dusal.0047s00022.1 (33194323)	0.73	0.42	0.52	1.0	0.56	0.34	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.45	0.14	0.15	0.55	0.44	0.18	0.22	0.18	0.19
Dusal.0079s00010.1 (33199436)	0.09	1.0	0.9	0.68	0.34	0.37	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.21	0.11	0.59	0.57	0.31	0.1	0.07	0.05	0.06
Dusal.0081s00026.1 (33198251)	0.59	0.32	0.65	1.0	0.48	0.25	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.47	0.04	0.0	0.54	0.4	0.22	0.28	0.4	0.45
Dusal.0091s00021.1 (33193983)	0.0	0.55	0.38	0.66	0.43	0.38	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.91	1.0	0.67	0.63
Dusal.0111s00006.1 (33199803)	1.0	0.44	0.47	0.95	0.41	0.38	0.3	0.01	0.0	0.01	0.0	0.24	0.37	0.15	0.27	0.5	0.36	0.32	0.36	0.79	0.41
Dusal.0120s00015.1 (33194391)	0.44	0.17	0.2	0.62	0.94	0.81	0.61	0.05	0.04	0.05	0.05	0.78	0.95	0.52	0.46	0.49	0.71	0.33	0.35	1.0	0.71
Dusal.0123s00022.1 (33188375)	0.06	0.96	0.85	0.4	0.21	0.22	0.36	0.56	0.49	0.17	0.47	0.07	0.02	0.08	0.01	0.04	0.12	0.62	0.57	0.58	1.0
Dusal.0153s00029.1 (33203330)	0.05	0.55	0.5	0.26	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.02	0.09	0.02	0.1	0.15	0.63	0.51	0.62	1.0
Dusal.0157s00023.1 (33200049)	0.54	0.27	0.35	1.0	0.5	0.46	0.24	0.05	0.05	0.07	0.06	0.29	0.51	0.21	0.17	0.22	0.39	0.23	0.22	0.47	0.28
Dusal.0193s00011.1 (33196092)	0.09	0.61	0.57	1.0	0.19	0.16	0.61	0.3	0.21	0.22	0.24	0.1	0.16	0.07	0.09	0.12	0.13	0.43	0.39	0.59	0.56
Dusal.0204s00009.1 (33199785)	0.23	0.3	0.42	1.0	0.65	0.52	0.39	0.25	0.14	0.27	0.26	0.18	0.17	0.08	0.23	0.44	0.32	0.18	0.19	0.35	0.19
Dusal.0211s00012.1 (33198598)	0.69	1.0	0.97	0.92	0.28	0.25	0.49	0.31	0.34	0.3	0.12	0.32	0.35	0.12	0.41	0.87	0.84	0.16	0.2	0.37	0.27
Dusal.0230s00002.1 (33188647)	0.0	0.47	0.37	0.64	0.51	0.2	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.6	0.7	0.31
Dusal.0233s00010.1 (33196189)	0.37	0.29	0.39	1.0	0.35	0.28	0.38	0.1	0.11	0.09	0.05	0.18	0.32	0.11	0.15	0.5	0.42	0.26	0.27	0.51	0.31
Dusal.0235s00004.1 (33189620)	0.55	0.17	0.42	1.0	0.73	0.57	0.49	0.41	0.33	0.32	0.16	0.2	0.35	0.11	0.06	0.36	0.21	0.35	0.42	0.51	0.44
Dusal.0240s00017.1 (33202732)	0.0	0.64	0.59	1.0	0.23	0.2	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.24	0.06	0.0	0.01	0.01	0.51	0.45	0.88	0.62
Dusal.0252s00021.1 (33187322)	0.22	0.2	0.26	1.0	0.18	0.14	0.2	0.28	0.24	0.3	0.21	0.33	0.45	0.23	0.16	0.33	0.25	0.14	0.16	0.92	0.28
Dusal.0289s00012.1 (33195584)	0.27	0.31	0.41	1.0	0.57	0.49	0.35	0.4	0.3	0.18	0.05	0.13	0.16	0.07	0.06	0.29	0.22	0.19	0.19	0.45	0.3
Dusal.0308s00009.1 (33194641)	0.66	0.27	0.31	0.38	0.24	0.28	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.56	1.0	0.7
Dusal.0326s00014.1 (33186783)	1.0	0.34	0.36	0.82	0.9	0.71	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.39	0.1	0.22	0.49	0.74	0.11	0.12	0.15	0.14
Dusal.0370s00001.1 (33185655)	0.11	0.4	0.34	1.0	0.34	0.38	0.57	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.0	0.03	0.06	0.05	0.62	0.63	0.76	0.56
Dusal.0378s00002.1 (33199202)	0.66	0.56	0.42	0.93	1.0	0.83	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.36	0.16	0.22	0.37	0.43	0.1	0.13	0.28	0.15
Dusal.0405s00006.1 (33189132)	0.8	0.28	0.34	1.0	0.18	0.13	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.42	0.15	0.07	0.64	0.39	0.12	0.09	0.72	0.29
Dusal.0431s00002.1 (33195520)	0.39	0.94	0.75	0.33	0.12	0.08	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.43	0.17	0.39	0.86	1.0	0.66	0.7	0.4	0.57
Dusal.0447s00005.1 (33186886)	0.01	0.73	0.74	0.66	0.02	0.02	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.87	0.9	1.0	0.9
Dusal.0450s00004.1 (33185516)	0.46	1.0	0.74	1.0	0.01	0.02	0.55	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.3	0.24	0.31	0.7	0.62	0.55	0.6	0.82	0.81
Dusal.0480s00008.1 (33202059)	0.46	0.47	0.49	0.91	0.64	0.59	0.43	0.15	0.14	0.24	0.12	0.39	0.44	0.28	0.32	0.42	0.4	0.5	0.51	1.0	0.64
Dusal.0481s00008.1 (33201480)	0.15	0.42	0.37	1.0	0.27	0.27	0.43	0.02	0.03	0.0	0.0	0.4	0.84	0.2	0.35	0.37	0.38	0.21	0.22	0.75	0.36
Dusal.0498s00002.1 (33193566)	0.08	1.0	0.73	0.28	0.16	0.16	0.6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.02	0.1	0.08	0.11	0.18	0.54	0.46	0.29	0.56
Dusal.0498s00010.1 (33193561)	0.04	0.68	0.67	0.33	0.53	0.5	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.03	0.07	0.06	0.2	0.33	0.52	0.5	0.25	0.61
Dusal.0545s00011.1 (33199356)	0.21	0.43	0.53	1.0	0.36	0.27	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.15	0.02	0.13	0.49	0.4	0.29	0.35	0.4	0.36
Dusal.0547s00008.1 (33188676)	0.35	0.35	0.41	1.0	0.33	0.24	0.29	0.09	0.08	0.14	0.04	0.11	0.22	0.03	0.15	0.36	0.33	0.22	0.25	0.33	0.29
Dusal.0554s00012.1 (33189009)	0.34	1.0	0.87	0.41	0.05	0.04	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.2	0.11	0.04	0.02	0.04	0.51	0.51	0.37	0.41
Dusal.0584s00008.1 (33200152)	0.28	0.4	0.49	1.0	0.29	0.25	0.31	0.37	0.34	0.41	0.22	0.3	0.38	0.15	0.19	0.32	0.35	0.26	0.26	0.41	0.29
Dusal.0605s00001.1 (33202873)	0.07	0.69	0.5	0.08	0.07	0.06	0.24	0.01	0.0	0.0	0.0	0.1	0.04	0.1	0.05	0.07	0.31	1.0	0.85	0.38	0.84
Dusal.0659s00002.1 (33197117)	0.0	0.19	0.22	0.77	0.54	0.38	0.45	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.53	1.0	0.37
Dusal.0663s00005.1 (33186081)	0.48	0.55	0.6	1.0	0.39	0.32	0.28	0.41	0.28	0.49	0.42	0.33	0.45	0.25	0.33	0.4	0.36	0.21	0.24	0.88	0.37
Dusal.0683s00007.1 (33202288)	0.16	0.44	0.47	0.81	0.15	0.14	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.14	0.12	0.12	0.17	0.17	0.43	0.36	1.0	0.88
Dusal.0693s00005.1 (33196175)	0.51	0.2	0.18	0.4	0.77	0.65	0.51	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.73	0.53	0.42	0.38	0.46	0.42	0.31	1.0	0.61
Dusal.0787s00005.1 (33190015)	0.29	0.26	0.35	1.0	0.2	0.21	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.23	0.08	0.25	0.18	0.26	0.21	0.21	0.68	0.27
Dusal.0793s00001.1 (33186288)	1.0	0.24	0.31	0.88	0.49	0.28	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.18	0.02	0.1	0.43	0.28	0.03	0.03	0.2	0.1
Dusal.0796s00001.1 (33199756)	0.46	0.52	0.58	1.0	0.37	0.31	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.31	0.1	0.18	0.22	0.27	0.2	0.22	0.37	0.2
Dusal.0808s00001.1 (33188929)	0.08	0.13	0.24	1.0	0.2	0.22	0.14	0.0	0.02	0.05	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.01
Dusal.0819s00002.1 (33201329)	0.31	0.98	0.85	1.0	0.55	0.33	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.38	0.12	0.44	0.92	0.59	0.0	0.07	0.11	0.13
Dusal.0849s00001.1 (33190877)	0.11	0.85	0.9	0.9	0.12	0.13	0.71	0.0	0.0	0.0	0.19	0.3	0.25	0.33	0.14	0.15	0.19	0.85	1.0	0.92	0.89
Dusal.0855s00003.1 (33188663)	0.11	0.29	0.33	0.83	0.86	0.83	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.53	0.28	0.29	0.42	0.49	0.41	0.53	1.0	0.72
Dusal.0889s00005.1 (33194665)	0.24	0.63	0.56	0.7	0.22	0.25	0.73	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.04	0.15	0.09	0.1	0.09	0.93	0.63	1.0	1.0
Dusal.1625s00001.1 (33202406)	0.05	0.64	0.86	1.0	0.24	0.15	0.53	0.16	0.06	0.02	0.12	0.12	0.24	0.07	0.11	0.17	0.24	0.58	0.56	0.5	0.68
Dusal.2185s00001.1 (33200885)	0.39	0.54	0.7	1.0	0.11	0.12	0.52	0.36	0.42	0.19	0.26	0.13	0.35	0.13	0.45	0.53	0.58	0.3	0.37	0.56	0.41
Dusal.2577s00001.1 (33185795)	0.05	0.32	0.26	1.0	0.15	0.14	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.11	0.07	0.07	0.13	0.19	0.36	0.53	0.7	0.52
Dusal.2764s00001.1 (33186307)	1.0	0.5	0.32	0.28	0.26	0.18	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.3	0.18	0.2	0.74	0.86	0.43	0.49	0.52	0.55
Dusal.2919s00001.1 (33194611)	0.17	0.24	0.32	1.0	0.14	0.06	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.05	0.02	0.04	0.28	0.1	0.07	0.09	0.86	0.3
Dusal.4281s00001.1 (33196494)	0.0	0.6	0.71	0.4	0.16	0.12	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.02	0.03	0.03	0.87	0.79	1.0	0.88

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)