Heatmap: Cluster_120 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000076.6	0.01	0.02	0.21	0.43	0.34	0.51	0.31	0.37	0.39	0.38	0.48	0.21	0.02	0.53	0.09	0.28	0.05	0.19	0.33	0.24	0.06	0.23	1.0	0.48	0.52	0.61
Cpa\|evm.model.tig00000076.75 (tig00000076_g2376.t1)	0.24	0.29	0.3	0.36	0.44	0.41	0.64	0.56	0.61	0.76	0.62	0.53	0.22	0.66	0.52	0.5	0.62	0.7	0.62	0.65	0.12	0.16	1.0	0.65	0.66	0.82
Cpa\|evm.model.tig00000144.12 (tig00000144_g9001.t1)	0.38	0.54	0.48	0.61	0.6	0.55	0.65	0.49	0.69	0.66	0.56	0.51	0.28	0.51	0.53	0.56	0.51	1.0	0.82	0.57	0.22	0.49	0.8	0.88	0.56	0.79
Cpa\|evm.model.tig00000145.51 (tig00000145_g8852.t1)	0.07	0.1	0.11	0.16	0.19	0.37	0.48	0.44	0.81	0.72	0.67	0.46	0.08	0.51	0.29	0.22	0.42	0.6	0.52	0.53	0.03	0.09	1.0	0.6	0.44	0.64
Cpa\|evm.model.tig00000215.36 (tig00000215_g18574.t1)	0.37	0.61	0.7	0.73	0.81	0.62	0.62	0.53	0.61	0.74	0.73	0.61	0.3	0.73	0.56	0.63	0.55	1.0	0.75	0.65	0.05	0.54	0.47	0.79	0.75	0.77
Cpa\|evm.model.tig00000215.37 (tig00000215_g18574.t1)	0.37	0.47	0.6	0.69	0.54	0.4	0.47	0.46	0.51	0.57	0.5	0.43	0.19	0.69	0.54	0.59	0.64	1.0	0.7	0.64	0.06	0.55	0.46	0.83	0.83	0.93
Cpa\|evm.model.tig00000248.36 (tig00000248_g21802.t1)	0.17	0.39	0.48	0.55	0.71	0.68	0.7	0.59	0.73	0.62	0.69	0.7	0.22	0.64	0.64	0.59	0.55	0.63	0.66	0.46	0.36	0.63	1.0	0.87	0.81	0.73
Cpa\|evm.model.tig00000248.68 (tig00000248_g21827.t1)	0.2	0.4	0.43	0.42	0.54	0.69	0.68	0.56	0.8	0.71	0.57	0.54	0.24	0.57	0.87	0.58	0.48	0.84	0.81	0.61	0.09	0.75	0.8	1.0	0.72	0.72
Cpa\|evm.model.tig00000430.40 (tig00000430_g627.t1)	0.26	0.37	0.48	0.39	0.45	0.4	0.44	0.43	0.85	0.96	0.75	0.74	0.3	0.28	0.34	0.36	0.63	0.86	0.63	0.96	0.1	0.44	1.0	0.69	0.76	0.66
Cpa\|evm.model.tig00000444.10 (tig00000444_g800.t1)	0.14	0.3	0.31	0.4	0.49	0.68	0.52	0.51	0.64	0.81	0.74	0.63	0.15	0.5	0.44	0.46	0.45	0.63	0.63	0.7	0.16	0.47	0.83	0.71	0.62	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000498.39 (tig00000498_g1615.t1)	0.14	0.18	0.45	0.47	0.62	0.65	0.73	0.61	0.67	0.67	0.57	0.48	0.19	0.48	0.31	0.45	0.42	0.59	0.5	0.45	0.3	0.45	0.98	0.64	1.0	0.56
Cpa\|evm.model.tig00000605.33 (tig00000605_g2499.t1)	0.18	0.22	0.22	0.27	0.58	0.88	0.84	0.65	1.0	0.61	0.48	0.33	0.05	0.38	0.69	0.49	0.58	0.63	0.66	0.54	0.13	0.4	0.93	0.72	0.47	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000630.40 (tig00000630_g2726.t1)	0.09	0.39	0.66	0.73	0.78	0.58	0.66	0.52	0.73	0.8	0.71	0.52	0.09	0.68	0.49	0.82	0.61	1.0	0.76	0.59	0.12	0.66	0.7	1.0	0.99	0.74
Cpa\|evm.model.tig00000655.63 (tig00000655_g2891.t1)	0.23	0.26	0.29	0.51	0.64	0.63	0.74	0.65	0.98	0.96	1.0	0.75	0.16	0.25	0.48	0.2	0.48	0.99	0.65	0.73	0.41	0.4	0.83	0.81	0.63	0.72
Cpa\|evm.model.tig00000718.4 (tig00000718_g3680.t1)	0.25	0.29	0.38	0.42	0.56	0.62	0.78	0.61	0.77	1.0	0.82	0.73	0.28	0.48	0.55	0.6	0.63	0.84	0.66	0.77	0.27	0.56	0.76	0.92	0.74	0.57
Cpa\|evm.model.tig00000733.6 (tig00000733_g3772.t1)	0.15	0.06	0.17	0.34	0.44	0.51	0.58	0.44	0.57	0.67	0.56	0.42	0.19	0.37	0.71	0.31	0.42	0.49	0.6	0.56	0.15	0.89	1.0	0.62	0.75	0.67
Cpa\|evm.model.tig00000733.7 (tig00000733_g3772.t1)	0.16	0.07	0.16	0.35	0.55	0.42	0.7	0.54	0.57	0.75	0.67	0.5	0.23	0.33	0.67	0.3	0.46	0.55	0.57	0.6	0.14	1.0	0.9	0.76	0.7	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000823.31 (tig00000823_g4557.t1)	0.07	0.28	0.3	0.36	0.4	0.56	0.59	0.53	0.57	0.68	0.57	0.66	0.06	0.49	0.68	0.55	0.61	0.85	0.98	0.59	0.1	0.43	1.0	0.94	0.53	0.68
Cpa\|evm.model.tig00000850.13 (tig00000850_g4802.t1)	0.23	0.33	0.44	0.46	0.58	0.58	0.57	0.54	0.69	0.79	0.64	0.6	0.21	0.57	0.65	0.54	0.49	0.79	0.69	0.52	0.07	0.61	0.84	1.0	0.8	0.86
Cpa\|evm.model.tig00000851.22 (tig00000851_g4908.t1)	0.03	0.02	0.17	0.46	0.53	0.67	0.63	0.39	0.86	0.6	0.51	0.51	0.14	0.46	0.84	0.51	0.64	0.92	0.58	0.52	0.15	0.94	1.0	0.74	0.73	0.72
Cpa\|evm.model.tig00000852.35 (tig00000852_g5047.t1)	0.26	0.48	0.54	0.62	0.5	0.42	0.69	0.68	0.64	0.65	0.64	0.51	0.24	0.47	0.58	0.52	0.45	1.0	0.63	0.7	0.02	0.34	0.57	0.78	0.9	0.76
Cpa\|evm.model.tig00000863.50 (tig00000863_g5004.t1)	0.02	0.06	0.07	0.18	0.36	0.55	0.73	0.32	0.6	0.45	0.4	0.2	0.03	0.41	0.62	0.35	0.39	0.57	0.52	0.3	0.1	0.27	1.0	0.92	0.67	0.26
Cpa\|evm.model.tig00001024.8 (tig00001024_g6318.t1)	0.19	0.32	0.27	0.42	0.51	0.53	0.65	0.59	0.85	0.73	0.56	0.44	0.21	0.69	0.52	0.73	0.43	0.54	0.59	0.43	0.12	0.74	0.78	0.74	1.0	0.76
Cpa\|evm.model.tig00001038.22 (tig00001038_g6531.t1)	0.05	0.42	0.34	0.54	0.71	0.54	0.68	0.68	0.59	0.48	0.53	0.4	0.05	0.27	0.45	0.38	0.43	1.0	0.83	0.52	0.02	0.28	0.38	0.75	0.58	0.53
Cpa\|evm.model.tig00001057.26 (tig00001057_g6700.t1)	0.32	0.59	0.54	0.47	0.46	0.38	0.63	0.5	0.6	0.52	0.51	0.56	0.31	0.61	0.51	0.6	0.49	1.0	0.78	0.5	0.1	0.4	0.65	0.81	0.81	0.63
Cpa\|evm.model.tig00001221.5 (tig00001221_g7591.t1)	0.23	0.21	0.16	0.2	0.24	0.39	0.44	0.41	0.56	0.56	0.48	0.41	0.18	0.31	0.43	0.3	0.42	0.58	0.61	0.51	0.14	0.1	1.0	0.57	0.46	0.43
Cpa\|evm.model.tig00001264.15 (tig00001264_g7871.t1)	0.03	0.08	0.18	0.27	0.49	0.71	0.62	0.46	0.86	0.7	0.55	0.44	0.02	0.37	1.0	0.38	0.5	0.69	0.49	0.58	0.17	0.18	0.92	0.71	0.44	0.61
Cpa\|evm.model.tig00001428.13 (tig00001428_g8733.t1)	0.09	0.16	0.2	0.22	0.33	0.39	0.47	0.4	0.5	0.5	0.47	0.45	0.09	0.29	0.23	0.26	0.42	0.59	0.53	0.41	0.28	0.32	1.0	0.94	0.68	0.56
Cpa\|evm.model.tig00001471.9 (tig00001471_g8871.t1)	0.12	0.2	0.23	0.26	0.31	0.37	0.44	0.47	0.68	0.62	0.66	0.41	0.08	0.34	0.5	0.37	0.38	0.54	0.38	0.37	0.13	0.62	1.0	0.89	0.48	0.46
Cpa\|evm.model.tig00001490.1 (tig00001490_g8964.t1)	0.02	0.04	0.1	0.09	0.1	0.11	0.23	0.18	0.34	0.42	0.41	0.37	0.04	0.32	0.31	0.24	0.19	0.21	0.15	0.23	0.1	0.2	1.0	0.12	0.63	0.39
Cpa\|evm.model.tig00001532.13 (tig00001532_g9279.t1)	0.23	0.37	0.5	0.6	0.64	0.67	0.71	0.64	0.71	0.65	0.61	0.65	0.27	0.56	0.55	0.49	0.41	0.59	0.45	0.46	0.29	0.54	1.0	0.6	0.84	0.79
Cpa\|evm.model.tig00020553.51 (tig00020553_g10539.t1)	0.03	0.05	0.05	0.13	0.29	0.37	0.46	0.43	0.51	0.46	0.41	0.25	0.03	0.22	0.24	0.17	0.35	0.55	0.48	0.37	0.06	0.47	1.0	0.76	0.63	0.49
Cpa\|evm.model.tig00020563.183 (tig00020563_g11384.t1)	0.3	0.23	0.25	0.35	0.49	0.59	0.69	0.64	0.73	0.64	0.62	0.53	0.26	0.33	0.25	0.24	0.34	0.59	0.45	0.4	0.18	0.35	1.0	0.98	0.58	0.55
Cpa\|evm.model.tig00020563.24 (tig00020563_g11207.t1)	0.01	0.23	0.34	0.52	0.52	0.54	0.53	0.46	0.5	0.43	0.45	0.31	0.03	0.27	0.45	0.34	0.4	1.0	0.62	0.51	0.08	0.46	0.38	0.49	0.84	0.34
Cpa\|evm.model.tig00020614.121 (tig00020614_g12237.t1)	0.09	0.11	0.15	0.28	0.4	0.36	0.5	0.5	0.53	0.45	0.49	0.36	0.07	0.21	0.24	0.26	0.38	0.59	0.51	0.33	0.11	0.32	1.0	0.64	0.59	0.43
Cpa\|evm.model.tig00020614.44 (tig00020614_g12157.t1)	0.1	0.18	0.31	0.4	0.54	0.6	0.47	0.38	0.69	0.53	0.43	0.34	0.08	0.43	0.7	0.48	0.53	0.55	0.42	0.39	0.1	0.46	1.0	0.73	0.67	0.85
Cpa\|evm.model.tig00020629.94 (tig00020629_g12415.t1)	0.09	0.08	0.18	0.18	0.24	0.27	0.37	0.38	1.0	0.89	0.91	0.65	0.07	0.22	0.17	0.17	0.33	0.83	0.34	0.42	0.31	0.15	0.67	0.73	0.33	0.46
Cpa\|evm.model.tig00020848.16 (tig00020848_g14543.t1)	0.02	0.07	0.2	0.31	0.48	0.65	0.57	0.48	0.68	0.73	0.61	0.53	0.01	0.39	0.49	0.35	0.52	0.73	0.64	0.53	0.14	0.21	1.0	0.7	0.65	0.68
Cpa\|evm.model.tig00020912.77 (tig00020912_g15847.t1)	0.05	0.07	0.2	0.2	0.24	0.24	0.48	0.46	0.66	0.72	0.72	0.51	0.06	0.22	0.41	0.21	0.35	0.69	0.46	0.4	0.05	0.37	1.0	1.0	0.61	0.61
Cpa\|evm.model.tig00020927.8 (tig00020927_g15937.t1)	0.29	0.19	0.14	0.18	0.36	0.49	0.61	0.45	0.51	0.57	0.42	0.38	0.23	0.33	0.41	0.3	0.54	0.67	0.67	0.56	0.12	0.15	0.85	1.0	0.42	0.45
Cpa\|evm.model.tig00020960.73 (tig00020960_g16602.t1)	0.22	0.38	0.62	0.63	0.54	0.6	0.72	0.74	0.91	0.99	0.81	0.66	0.2	0.97	0.4	0.74	0.62	0.72	0.59	0.75	0.17	0.29	0.95	0.58	0.94	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021070.81 (tig00021070_g17890.t1)	0.06	0.02	0.12	0.4	0.64	0.67	0.82	0.61	1.0	0.76	0.62	0.47	0.1	0.56	0.88	0.54	0.64	0.76	0.6	0.53	0.09	0.99	0.92	0.72	0.95	0.74
Cpa\|evm.model.tig00021127.159 (tig00021127_g18843.t1)	0.18	0.21	0.26	0.36	0.49	0.54	0.72	0.72	0.67	0.89	0.87	0.65	0.13	0.38	0.28	0.48	0.54	0.67	0.65	0.91	0.03	0.39	1.0	0.84	0.65	0.81
Cpa\|evm.model.tig00021127.35 (tig00021127_g18712.t1)	0.01	0.03	0.11	0.13	0.25	0.37	0.32	0.25	0.37	0.31	0.21	0.17	0.01	0.24	0.34	0.21	0.32	0.32	0.52	0.32	0.06	0.09	1.0	0.44	0.34	0.35
Cpa\|evm.model.tig00021167.3 (tig00021167_g19058.t1)	0.02	0.16	0.23	0.42	0.59	0.49	0.65	0.59	0.74	0.77	0.65	0.51	0.02	0.33	0.24	0.25	0.4	0.77	0.63	0.49	0.18	0.29	0.95	1.0	0.78	0.72
Cpa\|evm.model.tig00021357.31	0.12	0.14	0.27	0.48	0.34	0.36	0.85	0.77	0.61	0.48	0.24	0.24	0.08	0.25	0.33	0.55	0.41	1.0	0.6	0.53	0.14	0.41	0.41	0.58	0.72	0.51
Cpa\|evm.model.tig00021428.15 (tig00021428_g21157.t1)	0.07	0.06	0.19	0.35	0.37	0.5	0.61	0.62	0.9	0.88	0.71	0.75	0.14	0.5	1.0	0.41	0.62	0.71	0.62	0.7	0.31	0.38	0.69	0.77	0.46	0.59
Cpa\|evm.model.tig00021537.66 (tig00021537_g22318.t1)	0.1	0.19	0.21	0.18	0.24	0.48	0.62	0.69	0.66	0.8	0.76	0.63	0.16	0.42	0.34	0.53	0.76	0.76	0.68	0.74	0.14	0.12	0.68	1.0	0.41	0.51
Cpa\|evm.model.tig00021680.26 (tig00021680_g23047.t1)	0.01	0.02	0.15	0.26	0.33	0.47	0.66	0.5	1.0	0.89	0.63	0.45	0.02	0.39	0.39	0.25	0.64	0.96	0.58	0.91	0.09	0.34	0.91	0.6	0.48	0.85
Cpa\|evm.model.tig00021680.4 (tig00021680_g23024.t2)	0.06	0.05	0.18	0.23	0.42	0.68	0.73	0.59	0.93	0.8	0.67	0.56	0.08	0.53	0.3	0.41	0.41	0.47	0.49	0.56	0.07	0.53	1.0	0.65	0.96	0.75
Cpa\|evm.model.tig00021795.18 (tig00021795_g23536.t2)	0.04	0.17	0.27	0.4	0.45	0.42	0.45	0.37	0.58	0.54	0.48	0.46	0.06	0.47	0.33	0.27	0.28	0.33	0.27	0.29	0.12	0.22	1.0	0.34	0.5	0.48

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)