1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_32 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000057.131 (tig00020851_g14720.t1)
 - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000057.50 (tig00000057_g69.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000093.56 (tig00000093_g3493.t1)
 - - - - 1.24 - - 1.56 - - - - - - 1.45 2.76 - - - - 0.55 1.15 2.49 - 0.93 -
Cpa|evm.model.tig00000093.90 (tig00000093_g3517.t1)
 - - - -2.48 - - - - 2.69 -2.53 - -1.33 -1.54 -3.03 -1.53 - -2.21 -0.3 -1.11 -2.52 -0.09 -1.76 1.09 - - 3.69
Cpa|evm.model.tig00000117.17 (tig00000733_g3769.t1)
 - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000123.35 (tig00000123_g6941.t1)
 - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000204.14 (tig00000741_g3830.t1)
 0.01 1.44 0.67 0.05 0.16 -0.38 -0.17 -1.35 0.23 -0.08 -1.43 -0.56 -0.22 -0.54 0.77 0.82 -1.43 0.88 0.98 -0.91 -1.84 -0.36 -2.49 0.11 -0.03 -1.85
Cpa|evm.model.tig00000215.136 (tig00021318_g20158.t1)
 2.12 - 1.42 - 0.89 - - - - - 1.2 - 2.61 - 0.94 - - - - - - - - - - 2.77
Cpa|evm.model.tig00000254.17 (tig00000254_g22466.t1)
 - - - 3.13 - - - 1.35 - - 1.39 - 2.94 - - - - 0.87 - 1.38 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000361.17 (tig00000361_g24367.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000430.30 (tig00020816_g14130.t1)
 - 2.91 4.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000430.58 (tig00001024_g6338.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.34 - - - - - - 3.99
Cpa|evm.model.tig00000441.38 (tig00000194_g14738.t1)
 1.66 - - - - - - - - - 2.91 - - - - 1.86 - - - - - - - - - 3.54
Cpa|evm.model.tig00000444.32 (tig00000850_g4793.t1)
 - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000444.43 (tig00000444_g833.t1)
 - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000448.69 (tig00000448_g908.t1)
 -0.61 1.71 - - - 0.34 - 2.25 - -1.76 - - 2.54 - - -0.73 - - 0.78 - 1.85 - - - - 2.01
Cpa|evm.model.tig00000448.72 (tig00000448_g907.t1)
 - - - 2.4 - - - 2.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.9
Cpa|evm.model.tig00000520.3 (tig00021319_g20263.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000555.13 (tig00000555_g2140.t1)
 - - - - - - - - - - - - 2.7 - 2.21 2.2 - - 1.95 1.93 1.37 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000581.30 (tig00000581_g2236.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.85 - 3.53 - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000654.23 (tig00000654_g2818.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000655.2 (tig00000655_g2834.t1)
 - - - - - - - - - - - - 4.2 - - - 1.84 - - - - - - - 1.99 -
Cpa|evm.model.tig00000681.81 (tig00000681_g3144.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000836.30 (tig00000836_g4709.t1)
 - - 1.85 0.69 0.8 - - 0.64 0.74 - 0.62 - - 0.45 2.11 0.6 - - 0.54 - - 0.36 -0.05 - 1.75 -
Cpa|evm.model.tig00000842.52 (tig00000842_g4873.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.29 - - - - - - - 4.02
Cpa|evm.model.tig00001208.14 (tig00021569_g22352.t1)
 - - 3.08 - 3.27 - - - - - - - 2.98 - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001362.1 (tig00001065_g6713.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
Cpa|evm.model.tig00020510.31 (tig00020510_g9814.t1)
 - - - 1.7 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.18 1.23 1.25 - 0.95 3.79
Cpa|evm.model.tig00020539.19 (tig00020539_g10408.t1)
 - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020553.217 (tig00021111_g18384.t2)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020572.71 (tig00020616_g12287.t1)
 - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020572.82 (tig00020725_g13550.t1)
 - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020572.91 (tig00020572_g11613.t1)
 - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020607.8 (tig00000114_g6048.t2)
 - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020611.11 (tig00020611_g12106.t1)
 2.93 - - - - - - 0.37 - - 0.28 1.44 2.22 - - - - -0.19 - - - - - - - 2.93
Cpa|evm.model.tig00020660.62 (tig00020660_g12571.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020675.114 (tig00020675_g12703.t1)
 - 1.6 3.2 - - - - - - - - - - - - 1.35 - 1.89 2.45 - 1.02 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020816.45 (tig00020816_g14135.t1)
 - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020816.52 (tig00020965_g16843.t1)
 - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020816.85 (tig00020816_g14174.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
Cpa|evm.model.tig00020824.16 (tig00020941_g16213.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020851.15 (tig00000850_g4793.t1)
 - - 3.84 - - - - - - - - - - - - - 2.0 - - - - - - - 2.94 -
Cpa|evm.model.tig00020852.2 (tig00021586_g22684.t1)
 - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
Cpa|evm.model.tig00020910.1 (tig00020910_g15698.t1)
 - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020911.23 (tig00020911_g15734.t1)
 - - 2.94 - - - 1.13 - - - - - 2.6 - 1.03 - - - - - 1.68 - - 1.73 - 0.62
Cpa|evm.model.tig00020921.13 (tig00001049_g6676.t1)
 - - 4.24 - 2.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021014.11 (tig00021014_g17094.t1)
 - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021017.49 (tig00021017_g17221.t2)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
Cpa|evm.model.tig00021037.1 (tig00021037_g17407.t1)
 - - 2.21 - - - - 2.19 - - 1.94 - - - 1.89 - - - 3.21 - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021038.101 (tig00021680_g23058.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 3.0 - - - - - - - - - - - 4.17
Cpa|evm.model.tig00021038.37 (tig00021038_g17528.t1)
 - - - - - - - - - - - 1.35 3.22 - - - - - - - - - - - - 3.82
Cpa|evm.model.tig00021043.16 (tig00021043_g17636.t1)
 - - - - - - - - - - - - 1.27 - - - 2.35 1.79 - - 0.93 - 1.0 - 1.76 2.95
Cpa|evm.model.tig00021126.29 (tig00021126_g18480.t1)
 - -1.89 - -1.77 1.06 1.44 0.99 0.01 0.38 - -2.92 - -0.26 -2.5 1.85 - 2.27 0.24 2.08 -3.23 - -0.92 - - -0.48 -
Cpa|evm.model.tig00021137.35 (tig00020936_g16182.t1)
 - 1.34 1.32 - - - - 1.11 1.22 1.99 2.06 - 0.99 - - - - - 1.74 - - - - - - 1.59
Cpa|evm.model.tig00021137.36 (tig00021137_g19006.t1)
 - - 2.65 - - - - - 1.69 2.57 1.58 1.76 2.08 - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021181.25 (tig00021181_g19330.t1)
 - - - - - - - - - - - - 3.82 - - - - - 3.57 - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021222.16 (tig00021222_g19372.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021251.1 (tig00000622_g2618.t1)
 - - - - - 1.3 - - 3.08 - 2.95 - 1.29 - - - - - - - - - - 2.3 - -
Cpa|evm.model.tig00021257.35 (tig00000382_g24596.t1)
 - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021257.41 (tig00020629_g12496.t1)
 - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021318.12 (tig00000411_g549.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021339.13 (tig00021339_g20391.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021339.15 (tig00021339_g20393.t1)
 - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021366.22 (tig00021319_g20263.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021373.1 (tig00000042_g15521.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021534.12 (tig00021534_g22254.t1)
 - - - - - - 0.36 - 2.16 - - - 2.14 - - - - 0.01 - - - - - 2.76 0.48 2.74
Cpa|evm.model.tig00021571.23 (tig00021571_g22367.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021572.11 (tig00021572_g22396.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
Cpa|evm.model.tig00021579.2 (tig00000842_g4873.t1)
 - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021612.3 (tig00021439_g21487.t1)
 2.72 - - - - 1.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.02
Cpa|evm.model.tig00021741.2 (tig00021741_g23276.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
Cpa|evm.model.tig00021745.19 (tig00021745_g23363.t1)
 - - 3.18 - - - - - 3.31 - - - - - - - - - - 2.81 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021758.1 (tig00021758_g23394.t1)
 - - - - 0.48 0.6 - 0.61 0.57 1.5 - 0.68 - - - 0.57 1.69 - - 0.26 -0.4 - - 1.19 - 2.75
Cpa|evm.model.tig00021762.15 (tig00021762_g23471.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7
Cpa|evm.model.tig00021762.4 (tig00021761_g23445.t1)
 2.9 - - - - - - - 3.33 - - - 3.09 - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00022080.1 (tig00020563_g11225.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00022104.8 (tig00022104_g23823.t1)
 -0.03 0.11 - -1.5 -1.14 -3.26 -1.71 - - -0.62 -1.2 - 0.73 0.35 1.5 0.93 1.06 0.33 - -2.48 -0.05 1.28 -2.54 -2.56 1.61 1.87

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.