1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_87 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000025.43 (tig00000025_g7947.t1)
 - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000057.59 (tig00000057_g80.t1)
 - - - 3.11 - 3.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.06 - -
Cpa|evm.model.tig00000144.89 (tig00000144_g9082.t1)
 -0.54 -0.9 -1.62 0.04 -1.26 1.02 0.57 -0.2 -0.58 0.29 -0.63 -2.53 - 0.29 0.41 0.22 0.63 0.56 0.74 -0.08 -3.56 -0.94 0.69 -0.43 1.24 0.33
Cpa|evm.model.tig00000147.31 (tig00000147_g9470.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000158.1 (tig00000158_g10113.t1)
 - - - - - 2.81 1.42 - 3.32 1.16 1.22 - - - - - - - - 0.83 - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000158.39 (tig00000158_g10151.t1)
 2.78 1.23 - - - 1.66 - 1.67 1.77 - - - 2.81 - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000204.6 (tig00021257_g19770.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000342.69 (tig00021248_g19635.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 3.91 - - - - - - - - - - 3.46 -
Cpa|evm.model.tig00000396.48 (tig00000396_g24919.t1)
 - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000459.68 (tig00020604_g11845.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000473.29 (tig00021137_g19017.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000492.61 (tig00000492_g1450.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000507.16 (tig00000215_g18613.t1)
 0.75 -1.12 -3.14 0.42 -1.89 2.33 -0.47 0.46 -0.77 -1.48 -1.8 -0.95 -0.83 -0.36 -0.5 0.4 0.37 0.47 0.24 -0.04 -0.9 -1.39 0.07 -0.47 -0.31 0.63
Cpa|evm.model.tig00000551.31 (tig00020734_g13561.t1)
 - - - - - - - - - 3.74 - - - 3.66 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000607.7 (tig00000607_g2518.t1)
 - - 1.86 - - - - 1.75 - - - - - 3.69 2.61 - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000658.38 (tig00020951_g16460.t1)
 - - - - - 3.53 - - - - - - - 2.93 - - - 2.77 - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000704.9 (tig00021123_g18502.t2)
 3.76 - - - - 3.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000760.26 (tig00000760_g3947.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 3.57 - - - 3.58 - - - - - - 1.12 -
Cpa|evm.model.tig00000940.10 (tig00000940_g5548.t1)
 - - - - - 3.44 - - - - 2.44 - - - - - - - - - 2.49 2.03 - - - -
- - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020542.11 (tig00021590_g22781.t1)
 - - - 3.15 - 2.31 - 1.95 2.19 - - - - 1.9 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020545.14 (tig00021137_g19017.t1)
 - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020553.211 (tig00020553_g10701.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020554.120 (tig00020554_g10898.t1)
 -1.6 -0.1 1.12 -0.28 -1.4 0.46 0.93 0.78 1.7 0.21 0.78 1.19 - 0.31 - 0.27 - -1.84 -0.65 0.98 - - -0.96 0.3 -1.91 -0.72
Cpa|evm.model.tig00020567.6 (tig00000443_g767.t1)
 - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020567.9 (tig00020567_g11516.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020614.125 (tig00020554_g10795.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020629.58 (tig00020629_g12373.t1)
 1.28 - 1.65 - 0.13 2.76 0.43 - 2.05 - - 0.52 0.86 0.77 - - - 1.09 - - - - - - - -
- - - - - 2.81 3.25 - - - - - - - - - - 2.05 - - - 2.41 - - - -
Cpa|evm.model.tig00020685.56 (tig00020685_g12974.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020816.144 (tig00020816_g14224.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020921.7 (tig00020921_g15924.t1)
 - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020934.26 (tig00020934_g16093.t1)
 -0.88 -1.6 -0.9 -1.51 -0.47 1.88 -0.22 0.39 -0.97 -0.72 -2.85 -2.7 -3.41 -0.08 0.21 -0.34 0.33 1.4 1.42 0.75 -3.75 -1.82 -0.28 -1.39 1.14 0.32
Cpa|evm.model.tig00020996.54 (tig00020996_g16960.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021038.4 (tig00021038_g17493.t1)
 - 3.22 - 3.04 - - - - - - - - - - - - - - 3.08 - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021070.128 (tig00021070_g17943.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021111.7 (tig00021111_g18388.t1)
 - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021126.28 (tig00021126_g18479.t1)
 - - 1.6 - - 1.62 - 1.49 1.73 - 1.53 - - 2.76 1.35 - - - - - 0.62 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021244.14 (tig00021244_g19571.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021246.1 (tig00021246_g19602.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021326.32 (tig00021591_g22790.t1)
 1.07 1.24 - -0.74 - 2.49 0.77 - -0.78 - - 0.27 0.57 2.5 - - - 2.23 - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021338.4 (tig00021338_g20368.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 3.65 - - - - 3.75 - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021365.1 (tig00021365_g20814.t1)
 - - - - - - - - - - - 3.82 - 3.57 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021373.14 (tig00021373_g21082.t1)
 - - - - - 3.75 - - - - - - - - 3.65 - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021374.56 (tig00000137_g8141.t1)
 - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021572.34 (tig00021572_g22416.t1)
 - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021586.4 (tig00020936_g16182.t1)
 - 2.51 - 2.33 - 2.38 - - - - 2.3 - - - - - - - 2.36 - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021603.17 (tig00000194_g14735.t1)
 - - - - 1.03 - - - - - - - - 4.48 0.74 - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.