Heatmap: Cluster_162 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000093.18 (tig00000093_g3455.t1)
0.05 0.03 0.02 0.03 0.01 0.0 0.03 0.02 0.01 0.02 0.02 0.03 0.06 0.07 0.06 0.14 0.04 0.13 0.07 0.04 1.0 0.31 0.45 0.12 0.11 0.12
Cpa|evm.model.tig00000093.19 (tig00000093_g3456.t1)
0.16 0.08 0.07 0.07 0.04 0.03 0.03 0.04 0.04 0.07 0.07 0.12 0.21 0.15 0.22 0.24 0.11 0.19 0.14 0.11 1.0 0.28 0.61 0.16 0.22 0.13
Cpa|evm.model.tig00000144.15 (tig00000144_g9004.t1)
0.32 0.27 0.19 0.21 0.26 0.29 0.33 0.37 0.45 0.39 0.41 0.4 0.36 0.21 0.3 0.24 0.24 0.41 0.35 0.21 0.99 0.23 1.0 0.39 0.27 0.14
Cpa|evm.model.tig00000342.26 (tig00000342_g24211.t1)
0.3 0.27 0.29 0.33 0.33 0.23 0.35 0.34 0.31 0.36 0.32 0.24 0.19 0.27 0.22 0.26 0.24 0.43 0.37 0.28 1.0 0.2 0.54 0.36 0.47 0.45
Cpa|evm.model.tig00000342.27 (tig00000342_g24212.t1)
0.25 0.3 0.27 0.29 0.3 0.28 0.27 0.34 0.25 0.29 0.27 0.23 0.18 0.19 0.2 0.2 0.17 0.36 0.32 0.22 1.0 0.17 0.54 0.21 0.42 0.46
Cpa|evm.model.tig00000405.52 (tig00000405_g484.t1)
0.22 0.1 0.11 0.18 0.19 0.15 0.26 0.29 0.19 0.24 0.22 0.14 0.16 0.21 0.08 0.12 0.06 0.14 0.12 0.16 1.0 0.09 0.68 0.17 0.25 0.21
Cpa|evm.model.tig00000459.102 (tig00021179_g19248.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.81 0.18 0.02 0.04
Cpa|evm.model.tig00000523.6 (tig00000523_g1826.t1)
0.14 0.1 0.12 0.14 0.16 0.18 0.16 0.16 0.17 0.15 0.15 0.19 0.12 0.11 0.08 0.11 0.1 0.12 0.11 0.08 1.0 0.21 0.55 0.37 0.14 0.13
Cpa|evm.model.tig00000600.22 (tig00000600_g2282.t1)
0.11 0.17 0.11 0.21 0.19 0.15 0.17 0.17 0.2 0.26 0.29 0.32 0.1 0.34 0.21 0.24 0.17 0.23 0.24 0.14 1.0 0.08 0.62 0.46 0.38 0.37
Cpa|evm.model.tig00000600.5 (tig00000600_g2263.t1)
0.02 0.06 0.1 0.12 0.12 0.09 0.11 0.12 0.12 0.13 0.15 0.16 0.03 0.16 0.13 0.15 0.09 0.1 0.11 0.08 1.0 0.25 0.39 0.45 0.29 0.31
0.01 0.01 0.03 0.02 0.03 0.01 0.01 0.02 0.03 0.02 0.01 0.01 0.0 0.03 0.04 0.06 0.02 0.09 0.07 0.02 1.0 0.1 0.73 0.07 0.05 0.05
Cpa|evm.model.tig00000655.42 (tig00000655_g2867.t1)
0.13 0.05 0.02 0.04 0.07 0.17 0.23 0.19 0.24 0.28 0.3 0.25 0.08 0.09 0.14 0.05 0.09 0.23 0.25 0.12 1.0 0.06 0.69 0.25 0.05 0.08
Cpa|evm.model.tig00000718.9 (tig00000718_g3685.t1)
0.08 0.12 0.13 0.11 0.13 0.12 0.11 0.11 0.12 0.13 0.12 0.13 0.08 0.21 0.3 0.23 0.18 0.22 0.27 0.14 1.0 0.16 0.66 0.36 0.16 0.16
Cpa|evm.model.tig00000808.26 (tig00000808_g4415.t1)
0.31 0.13 0.09 0.07 0.08 0.08 0.11 0.12 0.13 0.1 0.12 0.13 0.31 0.1 0.22 0.16 0.14 0.24 0.2 0.14 1.0 0.08 0.55 0.21 0.26 0.09
Cpa|evm.model.tig00000857.21 (tig00000857_g4947.t1)
0.11 0.13 0.12 0.15 0.2 0.23 0.19 0.15 0.11 0.1 0.09 0.09 0.07 0.13 0.11 0.13 0.14 0.2 0.18 0.16 1.0 0.24 0.49 0.27 0.16 0.19
Cpa|evm.model.tig00000900.31 (tig00000900_g5387.t1)
0.07 0.13 0.08 0.07 0.03 0.02 0.13 0.11 0.11 0.06 0.11 0.11 0.01 0.12 0.07 0.07 0.02 0.09 0.11 0.02 1.0 0.08 0.47 0.18 0.3 0.24
Cpa|evm.model.tig00000903.44 (tig00000903_g5536.t1)
0.14 0.11 0.07 0.07 0.09 0.08 0.11 0.11 0.1 0.1 0.1 0.13 0.09 0.1 0.06 0.12 0.07 0.1 0.08 0.07 1.0 0.29 0.55 0.42 0.25 0.27
Cpa|evm.model.tig00000903.5 (tig00000903_g5503.t1)
0.06 0.08 0.09 0.16 0.26 0.35 0.36 0.27 0.2 0.11 0.1 0.07 0.06 0.06 0.08 0.12 0.09 0.16 0.18 0.15 1.0 0.2 0.64 0.26 0.22 0.14
Cpa|evm.model.tig00000912.36 (tig00000912_g5442.t1)
0.01 0.05 0.09 0.11 0.08 0.06 0.1 0.11 0.16 0.21 0.2 0.21 0.04 0.11 0.08 0.25 0.19 0.12 0.09 0.09 1.0 0.28 0.71 0.4 0.21 0.2
Cpa|evm.model.tig00000955.6 (tig00000955_g5779.t1)
0.09 0.09 0.13 0.14 0.14 0.13 0.14 0.14 0.13 0.14 0.14 0.15 0.12 0.25 0.17 0.21 0.14 0.16 0.14 0.12 1.0 0.26 0.56 0.38 0.32 0.32
0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.05 0.09 0.05 0.09 0.05 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.05 0.06 0.03 1.0 0.04 0.62 0.21 0.4 0.29
Cpa|evm.model.tig00001003.12 (tig00001003_g6269.t1)
0.07 0.14 0.16 0.19 0.21 0.27 0.17 0.2 0.25 0.19 0.2 0.22 0.09 0.22 0.17 0.1 0.15 0.24 0.23 0.13 1.0 0.2 0.76 0.5 0.23 0.24
Cpa|evm.model.tig00001027.23 (tig00001027_g6392.t1)
0.19 0.09 0.07 0.17 0.08 0.03 0.05 0.14 0.09 0.08 0.14 0.12 0.12 0.01 0.0 0.01 0.01 0.03 0.02 0.04 1.0 0.17 0.52 0.14 0.28 0.22
Cpa|evm.model.tig00001027.27 (tig00001027_g6399.t1)
0.0 0.0 0.02 0.03 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0 0.24 0.11 0.21 0.08 0.05 0.04 0.03 1.0 0.23 0.4 0.36 0.17 0.14
Cpa|evm.model.tig00001029.21 (tig00001029_g6420.t1)
0.03 0.08 0.22 0.32 0.41 0.48 0.47 0.4 0.39 0.37 0.35 0.33 0.02 0.44 0.27 0.35 0.36 0.38 0.28 0.22 1.0 0.33 0.9 0.49 0.49 0.32
Cpa|evm.model.tig00001086.30 (tig00001086_g6864.t1)
0.16 0.27 0.26 0.36 0.26 0.18 0.21 0.24 0.15 0.1 0.13 0.17 0.18 0.11 0.08 0.09 0.08 0.08 0.09 0.12 1.0 0.22 0.63 0.35 0.32 0.35
Cpa|evm.model.tig00001093.23 (tig00001093_g6900.t1)
0.05 0.1 0.09 0.14 0.16 0.22 0.21 0.18 0.25 0.23 0.25 0.27 0.06 0.03 0.05 0.03 0.08 0.1 0.08 0.1 1.0 0.06 0.62 0.52 0.07 0.08
Cpa|evm.model.tig00001095.1 (tig00001095_g7016.t1)
0.3 0.3 0.32 0.38 0.3 0.22 0.29 0.32 0.27 0.25 0.27 0.28 0.27 0.22 0.25 0.44 0.17 0.35 0.33 0.22 1.0 0.25 0.74 0.64 0.42 0.5
Cpa|evm.model.tig00001154.25 (tig00001154_g7289.t1)
0.41 0.21 0.17 0.19 0.19 0.26 0.35 0.33 0.33 0.31 0.31 0.31 0.34 0.22 0.26 0.27 0.23 0.45 0.33 0.26 1.0 0.1 1.0 0.45 0.26 0.21
Cpa|evm.model.tig00001249.10 (tig00001249_g7780.t1)
0.16 0.15 0.12 0.17 0.2 0.18 0.2 0.17 0.19 0.2 0.23 0.25 0.2 0.25 0.15 0.2 0.15 0.16 0.15 0.09 1.0 0.31 0.48 0.39 0.34 0.27
Cpa|evm.model.tig00020510.104 (tig00020510_g9888.t1)
0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.9 0.02 1.0 0.07 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020510.138 (tig00020510_g9926.t1)
0.17 0.18 0.23 0.25 0.22 0.22 0.21 0.24 0.23 0.23 0.27 0.28 0.14 0.36 0.15 0.33 0.18 0.25 0.2 0.22 1.0 0.18 0.62 0.43 0.36 0.45
Cpa|evm.model.tig00020537.54 (tig00020537_g10279.t1)
0.08 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.04 0.07 0.07 0.07 0.06 0.06 0.06 0.07 0.07 0.05 0.06 0.06 0.05 0.03 1.0 0.03 0.7 0.07 0.09 0.13
Cpa|evm.model.tig00020592.5 (tig00020592_g11635.t1)
0.06 0.14 0.15 0.32 0.32 0.25 0.22 0.24 0.22 0.16 0.16 0.14 0.07 0.09 0.06 0.08 0.07 0.09 0.07 0.11 1.0 0.12 0.37 0.11 0.26 0.18
Cpa|evm.model.tig00020685.10 (tig00020685_g12924.t1)
0.02 0.04 0.11 0.16 0.2 0.21 0.25 0.25 0.23 0.22 0.22 0.12 0.02 0.11 0.07 0.12 0.08 0.09 0.06 0.07 1.0 0.11 0.69 0.12 0.43 0.19
Cpa|evm.model.tig00020780.37 (tig00020780_g13786.t1)
0.09 0.04 0.03 0.05 0.03 0.02 0.04 0.06 0.03 0.05 0.06 0.05 0.06 0.1 0.17 0.08 0.09 0.25 0.16 0.09 1.0 0.12 0.63 0.15 0.31 0.35
Cpa|evm.model.tig00020830.121 (tig00020830_g14507.t1)
0.13 0.08 0.11 0.13 0.17 0.13 0.15 0.19 0.24 0.13 0.09 0.09 0.07 0.1 0.21 0.08 0.05 0.42 0.48 0.17 1.0 0.02 0.95 0.26 0.12 0.23
Cpa|evm.model.tig00020909.17 (tig00020909_g15337.t1)
0.04 0.07 0.04 0.1 0.08 0.15 0.07 0.05 0.17 0.12 0.11 0.14 0.01 0.06 0.15 0.21 0.02 0.26 0.4 0.08 1.0 0.04 0.68 0.13 0.03 0.12
Cpa|evm.model.tig00020911.39 (tig00020911_g15743.t1)
0.06 0.04 0.04 0.09 0.16 0.15 0.11 0.11 0.21 0.15 0.15 0.13 0.05 0.06 0.02 0.03 0.01 0.09 0.05 0.04 1.0 0.08 0.44 0.16 0.3 0.18
Cpa|evm.model.tig00020961.130 (tig00020961_g16749.t1)
0.12 0.08 0.08 0.11 0.12 0.11 0.09 0.11 0.16 0.15 0.19 0.2 0.1 0.1 0.1 0.09 0.11 0.12 0.13 0.1 1.0 0.13 0.84 0.63 0.16 0.17
Cpa|evm.model.tig00020961.144 (tig00020961_g16763.t1)
0.01 0.0 0.0 0.02 0.06 0.06 0.07 0.05 0.1 0.04 0.06 0.08 0.01 0.05 0.02 0.02 0.02 0.04 0.03 0.01 1.0 0.02 0.7 0.11 0.16 0.17
Cpa|evm.model.tig00020965.32 (tig00020965_g16847.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.04 0.7 0.1 0.04 0.06
Cpa|evm.model.tig00021070.109 (tig00021070_g17925.t1)
0.03 0.04 0.04 0.07 0.08 0.08 0.11 0.09 0.11 0.08 0.07 0.05 0.03 0.11 0.14 0.13 0.12 0.21 0.17 0.15 1.0 0.1 0.75 0.25 0.36 0.16
Cpa|evm.model.tig00021072.12 (tig00021072_g17969.t1)
0.09 0.11 0.06 0.07 0.06 0.03 0.03 0.05 0.05 0.1 0.11 0.09 0.06 0.03 0.01 0.02 0.01 0.07 0.03 0.03 1.0 0.04 0.81 0.04 0.03 0.06
Cpa|evm.model.tig00021123.32 (tig00021123_g18515.t2)
0.13 0.15 0.13 0.15 0.18 0.18 0.19 0.15 0.22 0.23 0.23 0.21 0.11 0.14 0.18 0.18 0.18 0.27 0.28 0.21 1.0 0.36 0.44 0.36 0.22 0.26
Cpa|evm.model.tig00021127.30 (tig00021127_g18707.t1)
0.03 0.07 0.17 0.25 0.29 0.32 0.31 0.26 0.27 0.27 0.19 0.17 0.04 0.24 0.28 0.28 0.24 0.38 0.29 0.34 1.0 0.34 0.73 0.34 0.7 0.48
Cpa|evm.model.tig00021339.34 (tig00021339_g20413.t1)
0.09 0.04 0.04 0.06 0.07 0.06 0.05 0.06 0.06 0.04 0.07 0.1 0.05 0.13 0.04 0.06 0.04 0.09 0.08 0.02 1.0 0.14 0.71 0.47 0.17 0.16
Cpa|evm.model.tig00021366.17 (tig00021366_g20851.t1)
0.09 0.08 0.06 0.08 0.1 0.09 0.1 0.08 0.08 0.08 0.09 0.1 0.12 0.07 0.08 0.08 0.06 0.17 0.15 0.09 1.0 0.08 0.88 0.23 0.48 0.12
Cpa|evm.model.tig00021374.36 (tig00021374_g21117.t1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 1.0 0.0 0.78 0.03 0.01 0.01
Cpa|evm.model.tig00021374.48 (tig00021374_g21131.t1)
0.19 0.11 0.08 0.07 0.08 0.14 0.17 0.21 0.22 0.23 0.24 0.26 0.17 0.04 0.07 0.06 0.11 0.17 0.14 0.14 0.8 0.09 1.0 0.38 0.12 0.08
Cpa|evm.model.tig00021462.32 (tig00021462_g21596.t1)
0.04 0.02 0.05 0.08 0.07 0.15 0.16 0.19 0.15 0.16 0.19 0.15 0.06 0.01 0.02 0.01 0.03 0.06 0.06 0.02 1.0 0.05 0.46 0.12 0.29 0.33
0.13 0.02 0.15 0.34 0.08 0.15 0.06 0.09 0.03 0.14 0.17 0.19 0.04 0.14 0.3 0.28 0.1 0.38 0.25 0.18 1.0 0.05 0.84 0.22 0.07 0.2

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)