1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_33 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000073.61 (tig00000073_g1744.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000133.33 (tig00000133_g7693.t1)
 - 2.44 - 2.38 - - - - - - - - - - 1.21 - - - - - - - - - 3.71 -
Cpa|evm.model.tig00000157.57 (tig00000157_g9645.t2)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.45 - 3.91 -
Cpa|evm.model.tig00000158.41 (tig00000158_g10154.t1)
 2.3 - - - - - - - - 2.2 - - - 1.73 - - 2.51 - - 1.93 1.87 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000158.85 (tig00000158_g10190.t1)
 - - 2.18 0.56 - -1.61 - - - - - -0.42 - - - - - - - - -0.92 -0.91 - - 3.31 2.99
Cpa|evm.model.tig00000178.98 (tig00000178_g12820.t1)
 - - - - - - 1.34 1.02 2.15 1.09 - - - - 1.04 - 1.11 0.99 - 1.76 1.97 - - - 0.46 -
Cpa|evm.model.tig00000180.6 (tig00000180_g13616.t1)
 1.27 - - - - 2.09 1.14 1.02 1.18 - - - - - - - 1.36 0.98 - 2.34 1.69 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000190.51 (tig00001041_g6558.t1)
 - - 0.78 - 0.25 0.8 - 0.44 - - - - - - 0.46 - 2.78 1.81 - 0.17 0.58 - 2.49 - - -
Cpa|evm.model.tig00000215.90 (tig00000215_g18626.t1)
 1.94 - - - - - - - - - - 2.33 - 1.66 - - - - 2.23 - - - - - 2.57 1.74
Cpa|evm.model.tig00000227.16 (tig00000227_g19810.t1)
 - - - - - 2.34 - - - - 3.34 - - - - 2.31 2.56 - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000241.64 (tig00000241_g20922.t1)
 - - - -0.97 -1.02 -0.91 0.53 1.0 -0.93 1.0 -0.99 0.19 - 1.52 -0.09 -0.78 0.87 -1.67 0.61 1.62 1.12 - 1.32 - -0.6 -1.42
Cpa|evm.model.tig00000270.7 (tig00000270_g23911.t1)
 - - - - 1.99 - - - - - 2.29 - - - - - 4.1 - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000361.13 (tig00020904_g15213.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.95 0.19 - - - 1.21 - -1.62 - - -2.17 - - - -2.18 - - - -1.84 1.58 0.6 3.25 1.86
-0.9 - -0.89 - - - - -1.0 - - 0.66 - - - - - - - -0.96 -1.21 - 0.3 2.7 2.03 2.91 1.37
Cpa|evm.model.tig00000388.67 (tig00000388_g24830.t1)
 -1.44 - -1.2 -0.35 0.99 0.21 1.4 0.04 0.59 1.3 0.89 0.66 - - - -1.54 - - - -0.63 - 1.83 -1.81 - 2.43 -
Cpa|evm.model.tig00000448.47 (tig00021070_g17848.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 3.17 - - - - - - - - - - 4.09 -
Cpa|evm.model.tig00000459.78 (tig00000459_g1145.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000492.18 (tig00000492_g1405.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000492.65 (tig00000492_g1455.t1)
 0.02 -2.87 -0.94 1.05 -1.23 0.6 -2.8 -0.31 -2.01 -3.09 -1.04 -0.91 -0.44 0.35 -0.28 - -1.22 -2.59 -0.11 - - -2.4 -1.88 0.46 3.1 1.68
Cpa|evm.model.tig00000605.49 (tig00000605_g2514.t1)
 0.97 1.63 0.84 - 1.32 0.63 - - - 0.59 2.13 0.84 - - -0.52 - 1.75 -1.08 - - -0.3 - -1.59 - -2.29 0.61
Cpa|evm.model.tig00000630.34 (tig00000630_g2722.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 3.63 - - - - - - 3.77 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000658.20 (tig00000658_g2911.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000826.4 (tig00000826_g4569.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 3.93 3.43 - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00000923.14 (tig00020509_g9741.t1)
 - - 0.33 - 0.23 - - - 0.37 1.81 0.26 0.44 0.76 - - - - - - - -0.11 0.93 2.22 0.93 1.24 1.47
Cpa|evm.model.tig00000939.17 (tig00021127_g18818.t1)
 -0.48 - -1.17 -1.1 - 0.47 - 0.71 -1.05 -1.22 - - 0.66 -1.34 - 1.45 3.63 - - 1.1 -1.62 - - - -1.79 -0.75
Cpa|evm.model.tig00000983.8 (tig00021589_g22744.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00001017.7 (tig00001017_g6253.t1)
 - - - - 0.36 0.9 - 2.13 - - - - - 3.13 0.4 - 0.88 - - - 1.8 - - - 1.01 0.15
Cpa|evm.model.tig00001038.29 (tig00001038_g6542.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
Cpa|evm.model.tig00001177.7 (tig00001177_g7360.t1)
 - - - 1.32 - - - - - - - - - 3.78 - - - 2.88 - - - - - 1.27 - -
Cpa|evm.model.tig00001327.4 (tig00021326_g20297.t1)
 0.82 -0.76 -0.22 0.85 0.67 0.64 -1.33 1.09 - - -1.38 -0.23 - 0.52 -0.43 0.33 2.8 0.34 -1.69 -0.72 - -0.66 - -0.74 -1.96 -
Cpa|evm.model.tig00001333.15 (tig00001333_g8187.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.84 - 3.54 -
Cpa|evm.model.tig00020510.12 (tig00020510_g9798.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.62 2.36 - 4.15 -
Cpa|evm.model.tig00020516.6 (tig00020516_g9957.t1)
 -2.74 -0.44 0.32 -1.21 -1.35 -2.63 1.26 0.68 -0.28 0.05 -0.59 -1.79 0.53 0.47 -0.52 0.05 -2.91 -0.02 -0.64 -3.25 -2.23 -0.22 0.19 - 2.07 1.69
Cpa|evm.model.tig00020531.60 (tig00000829_g4676.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020531.63 (tig00021374_g21140.t1)
 - -0.72 - - - - - - - - - - - - - - 4.39 2.12 - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020553.9 (tig00020553_g10500.t1)
 - - - - - 2.76 - - - - - - - - 2.67 - 2.98 - - - 2.31 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020603.57 (tig00021589_g22719.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.9 - 3.92 1.77
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
Cpa|evm.model.tig00020629.150 (tig00020629_g12481.t1)
 - -2.21 -0.02 0.49 0.34 -0.21 0.83 0.79 -1.33 -1.39 -0.76 -0.25 - -0.36 - -0.07 - -0.16 0.86 -0.5 1.0 -1.6 -1.13 - 2.51 0.94
Cpa|evm.model.tig00020629.151 (tig00020912_g15785.t1)
 -0.14 -0.56 -1.48 0.88 0.76 1.04 0.26 2.2 -1.46 -1.56 -1.53 -0.79 -2.04 -0.56 -2.73 -0.43 - -0.52 - -0.51 -0.38 -0.51 -2.85 - 2.41 -0.16
Cpa|evm.model.tig00020629.163 (tig00020629_g12496.t1)
 - - - - - - - - - - 3.49 - - - - - - - - - - - - - 3.88 -
Cpa|evm.model.tig00020675.109 (tig00020675_g12692.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020675.74 (tig00000334_g24100.t1)
 - - - - - - - - - - - - 1.71 - - - 4.51 - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020681.2 (tig00020681_g12832.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020681.5 (tig00020681_g12835.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
Cpa|evm.model.tig00020689.1 (tig00020921_g15923.t1)
 - - - - - 2.39 - - - - - - - - - - 3.54 1.09 1.23 0.92 - 1.25 - - - -1.66
Cpa|evm.model.tig00020734.55 (tig00021572_g22389.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020816.142 (tig00020816_g14221.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020824.38 (tig00020961_g16767.t1)
 - - - - 0.75 - - - - - - - - - - - 4.6 - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020855.4 (tig00000411_g549.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020875.5 (tig00020875_g14883.t1)
 - - - - - - - - - - 3.04 - - 2.94 - - 3.34 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
Cpa|evm.model.tig00020930.17 (tig00020930_g16027.t1)
 1.19 - -0.09 - -0.19 - - - -0.05 - - - 0.34 1.84 - - - 1.92 - - -0.53 1.51 - - 2.23 2.02
Cpa|evm.model.tig00020934.16 (tig00020934_g16084.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020951.5 (tig00020951_g16401.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020964.37 (tig00020964_g16817.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00020996.43 (tig00020996_g16955.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
0.89 - - 1.28 - - - - - - - - - 2.61 - 1.09 1.43 1.05 0.84 1.82 1.76 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021012.48 (tig00000269_g23700.t2)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
Cpa|evm.model.tig00021070.74 (tig00021070_g17879.t1)
 - 1.06 - -0.93 -0.99 - -0.44 -1.0 - - -0.96 - -0.45 - -0.98 - -0.92 - 1.34 - 0.71 -1.28 2.7 1.1 2.53 -1.47
Cpa|evm.model.tig00021070.75 (tig00021070_g17881.t1)
 0.22 0.55 -0.94 -0.72 -0.8 -2.32 -1.06 -1.98 -1.56 -1.63 -2.03 -1.15 0.23 -1.53 -2.12 -1.52 -0.97 -0.55 0.01 -0.78 0.32 -3.96 1.6 1.33 2.54 0.86
Cpa|evm.model.tig00021072.25 (tig00021072_g17980.t1)
 - 2.9 - - - - - - - 2.65 - - - - - - 2.97 - - - - - - - 2.15 -
- -0.68 - - - - - - - - - -0.17 - - - - 0.71 0.7 0.66 -0.59 -0.2 0.34 1.53 - 2.65 2.95
Cpa|evm.model.tig00021073.71 (tig00021073_g18073.t1)
 -0.29 - -1.28 -0.26 - - - -1.07 - -1.4 - - - 0.69 0.16 1.09 0.45 - -0.35 -0.6 1.81 1.36 -0.66 0.91 1.88 1.66
Cpa|evm.model.tig00021105.15 (tig00021105_g18228.t1)
 - - 1.11 - 0.81 1.36 - - - - - - - 1.46 1.02 1.09 2.93 - - - - - 2.32 - - -
Cpa|evm.model.tig00021105.67 (tig00021105_g18276.t1)
 - - - 1.47 - - - - 1.98 2.33 1.35 0.48 - 1.8 - - - 0.85 1.03 1.01 -0.05 - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021106.2 (tig00021105_g18282.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 3.23 - - 4.05 - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021122.21 (tig00000388_g24795.t1)
 - - 2.34 - - - 1.55 - - - - - - - - 1.49 1.31 - - - - - - - 3.67 -
Cpa|evm.model.tig00021126.30 (tig00021126_g18480.t1)
 -0.57 - - - - - 1.53 - - - - - 1.22 2.84 2.86 - 2.52 - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021135.7 (tig00001307_g8117.t1)
 - 0.66 1.29 1.05 - -0.28 -0.52 -0.51 - -0.58 - - 1.33 1.08 - - - - -0.54 - 0.47 - 0.5 - 1.8 2.44
Cpa|evm.model.tig00021137.37 (tig00021137_g19007.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021167.8 (tig00021167_g19065.t1)
 - 1.77 - 2.27 - - - - - - - - 2.63 - - - - - - - - - - - 3.53 -
Cpa|evm.model.tig00021168.58 (tig00021579_g22426.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021276.14 (tig00021276_g19899.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
Cpa|evm.model.tig00021289.4 (tig00021289_g19955.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
Cpa|evm.model.tig00021332.19 (tig00020629_g12329.t1)
 - - - - - - - - - - - - 3.39 3.37 - - - - - - - - - - - 2.38
Cpa|evm.model.tig00021338.2 (tig00020734_g13588.t1)
 - - - - - 2.48 - - - - 2.54 - - 2.99 - 2.72 - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021374.51 (tig00021374_g21134.t1)
 - - - 2.78 - - - - - 0.62 - - - - - - 0.97 - - - - - - - 3.97 -
Cpa|evm.model.tig00021439.7 (tig00021439_g21485.t1)
 - - - - - - - - - - - - 1.75 0.76 - - - 0.76 1.0 - - - 1.97 - 3.28 1.85
Cpa|evm.model.tig00021504.3 (tig00021504_g21966.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021583.10 (tig00021583_g22651.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.73 0.17 - - 1.32 0.37 - 1.37 3.44 2.58
Cpa|evm.model.tig00021586.10 (tig00021137_g19012.t1)
 - - - - - - - - - - - - - 4.38 2.39 - - - - - - - - - - -
Cpa|evm.model.tig00021590.26 (tig00021590_g22783.t1)
 - - - - - - - 3.34 - - - - - 2.69 - - - 1.74 - - - - - - 2.6 -
Cpa|evm.model.tig00021591.19 (tig00021591_g22806.t1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.83 1.57 2.83 3.14 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.