Heatmap: Cluster_179 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000017.2 (tig00000017_g2.t1)	0.36	0.23	0.26	0.49	0.38	0.24	0.38	0.49	0.49	0.49	0.58	0.48	0.38	0.5	0.33	0.5	0.22	0.42	0.26	0.24	0.32	0.74	1.0	0.65	1.0	0.65
Cpa\|evm.model.tig00000025.39 (tig00000025_g7945.t1)	0.53	0.36	0.39	0.5	0.44	0.33	0.58	0.56	0.77	0.81	0.88	0.75	0.46	0.54	0.51	0.72	0.55	0.5	0.42	0.48	0.55	0.95	0.9	0.82	1.0	0.92
Cpa\|evm.model.tig00000093.120 (tig00000093_g3551.t1)	0.39	0.24	0.25	0.32	0.29	0.22	0.31	0.32	0.25	0.31	0.44	0.47	0.45	0.7	0.44	0.55	0.29	0.35	0.33	0.23	0.34	0.93	0.62	0.64	1.0	0.66
Cpa\|evm.model.tig00000123.21 (tig00000123_g6927.t1)	0.3	0.24	0.21	0.27	0.36	0.38	0.53	0.44	0.53	0.45	0.41	0.38	0.31	0.67	0.46	0.49	0.39	0.51	0.47	0.4	0.15	1.0	0.94	0.6	0.93	0.73
Cpa\|evm.model.tig00000133.1 (tig00000133_g7660.t1)	0.52	0.43	0.38	0.54	0.6	0.55	0.61	0.61	0.69	0.66	0.73	0.77	0.58	0.5	0.43	0.47	0.32	0.36	0.5	0.24	0.51	0.91	1.0	0.82	0.89	0.75
Cpa\|evm.model.tig00000189.21 (tig00000189_g14323.t1)	0.48	0.35	0.2	0.23	0.25	0.23	0.28	0.31	0.31	0.32	0.42	0.6	0.56	0.34	0.21	0.23	0.16	0.44	0.31	0.23	0.14	0.82	0.51	0.65	1.0	0.47
Cpa\|evm.model.tig00000202.11 (tig00000202_g16618.t1)	0.48	0.36	0.27	0.38	0.34	0.29	0.31	0.29	0.42	0.38	0.49	0.51	0.36	0.27	0.94	0.24	0.23	0.39	0.22	0.19	0.25	0.81	0.76	0.65	1.0	0.71
Cpa\|evm.model.tig00000204.67 (tig00000204_g17734.t1)	0.54	0.48	0.4	0.55	0.54	0.42	0.56	0.59	0.58	0.71	0.8	0.76	0.62	0.76	0.53	0.7	0.46	0.54	0.5	0.32	0.44	0.91	1.0	0.76	0.93	0.7
Cpa\|evm.model.tig00000227.42 (tig00000227_g19834.t1)	0.46	0.2	0.14	0.18	0.21	0.2	0.2	0.19	0.24	0.26	0.34	0.45	0.46	0.62	0.26	0.46	0.22	0.33	0.27	0.17	0.59	1.0	0.31	0.59	0.9	0.94
Cpa\|evm.model.tig00000241.184 (tig00000241_g21055.t1)	0.47	0.29	0.31	0.34	0.2	0.17	0.23	0.34	0.31	0.28	0.45	0.44	0.33	0.27	0.27	0.2	0.25	0.32	0.27	0.18	0.05	0.98	0.51	0.54	1.0	0.46
Cpa\|evm.model.tig00000293.27 (tig00020951_g16425.t1)	0.28	0.22	0.19	0.18	0.19	0.21	0.22	0.21	0.18	0.13	0.1	0.1	0.2	0.37	0.29	0.24	0.2	0.36	0.34	0.26	0.25	1.0	0.25	0.38	0.77	0.86
Cpa\|evm.model.tig00000310.76 (tig00000310_g24001.t1)	0.31	0.24	0.26	0.41	0.37	0.27	0.36	0.41	0.38	0.43	0.51	0.43	0.32	0.28	0.24	0.26	0.21	0.31	0.19	0.16	0.49	0.71	1.0	0.59	0.78	0.56
Cpa\|evm.model.tig00000383.82 (tig00000383_g24693.t1)	0.34	0.33	0.37	0.34	0.29	0.28	0.33	0.28	0.42	0.39	0.42	0.49	0.34	0.67	0.51	0.6	0.36	0.45	0.37	0.35	0.19	1.0	0.74	0.5	0.69	0.76
Cpa\|evm.model.tig00000475.4 (tig00000475_g1229.t1)	0.42	0.33	0.37	0.37	0.39	0.3	0.3	0.34	0.31	0.39	0.36	0.36	0.33	0.56	0.37	0.5	0.36	0.38	0.32	0.33	0.17	1.0	0.51	0.54	0.8	0.73
Cpa\|evm.model.tig00000492.76 (tig00000492_g1467.t1)	0.18	0.21	0.17	0.16	0.25	0.38	0.44	0.36	0.45	0.36	0.37	0.29	0.19	0.57	0.62	0.39	0.41	0.76	0.67	0.33	0.15	0.95	0.41	1.0	0.98	0.87
Cpa\|evm.model.tig00000630.3 (tig00000630_g2682.t1)	0.4	0.3	0.17	0.28	0.18	0.19	0.29	0.32	0.04	0.02	0.02	0.02	0.18	0.77	0.58	0.84	0.33	0.34	0.37	0.34	0.26	1.0	0.11	0.12	0.48	0.63
Cpa\|evm.model.tig00000655.40 (tig00000655_g2865.t1)	0.22	0.18	0.28	0.32	0.29	0.23	0.35	0.34	0.31	0.28	0.25	0.26	0.18	0.61	0.61	0.69	0.49	0.73	0.58	0.46	0.31	0.93	0.49	0.54	1.0	0.87
Cpa\|evm.model.tig00000692.61 (tig00000692_g3259.t1)	0.32	0.16	0.13	0.14	0.18	0.2	0.34	0.26	0.3	0.27	0.3	0.24	0.27	0.33	0.19	0.51	0.18	0.13	0.12	0.08	0.08	1.0	0.85	0.34	0.72	0.73
Cpa\|evm.model.tig00000821.59 (tig00000821_g4519.t1)	0.6	0.53	0.41	0.35	0.29	0.23	0.23	0.25	0.23	0.3	0.35	0.44	0.45	0.23	0.24	0.23	0.29	0.33	0.29	0.33	0.38	1.0	0.18	0.59	0.59	0.48
Cpa\|evm.model.tig00000850.4 (tig00000850_g4792.t1)	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.01	0.03	0.28	0.34	0.38	0.1	0.29	0.31	0.18	0.38	0.94	0.16	0.16	1.0	0.94
Cpa\|evm.model.tig00000949.38 (tig00000949_g5751.t1)	0.52	0.33	0.35	0.44	0.41	0.26	0.39	0.44	0.35	0.36	0.41	0.44	0.56	0.74	0.57	0.76	0.4	0.63	0.41	0.3	0.48	1.0	0.63	0.5	0.85	0.81
Cpa\|evm.model.tig00000981.16 (tig00000981_g5871.t1)	0.57	0.54	0.39	0.53	0.41	0.29	0.29	0.4	0.33	0.48	0.55	0.67	0.63	0.76	0.46	0.57	0.3	0.44	0.46	0.27	0.22	0.97	0.94	0.63	0.88	1.0
Cpa\|evm.model.tig00001030.7 (tig00001030_g6449.t1)	0.28	0.34	0.38	0.42	0.44	0.29	0.3	0.32	0.31	0.36	0.37	0.35	0.28	0.41	0.31	0.58	0.47	0.41	0.44	0.24	0.37	1.0	0.08	0.38	0.6	0.7
Cpa\|evm.model.tig00001042.30 (tig00001042_g6602.t1)	0.29	0.3	0.23	0.4	0.39	0.29	0.44	0.47	0.47	0.59	0.61	0.7	0.3	0.55	0.34	0.51	0.35	0.47	0.35	0.3	0.47	0.74	1.0	0.74	0.79	0.75
Cpa\|evm.model.tig00001215.7 (tig00001215_g7570.t1)	0.02	0.02	0.02	0.04	0.05	0.04	0.04	0.05	0.05	0.05	0.06	0.04	0.01	0.55	0.36	0.37	0.36	0.51	0.51	0.28	0.17	1.0	0.44	0.58	0.91	0.73
Cpa\|evm.model.tig00001215.9 (tig00001215_g7574.t1)	0.27	0.15	0.2	0.19	0.23	0.3	0.33	0.35	0.27	0.25	0.27	0.27	0.31	0.52	0.49	0.56	0.45	0.43	0.44	0.42	0.23	1.0	0.51	0.52	0.76	0.6
Cpa\|evm.model.tig00001249.8 (tig00001249_g7778.t1)	0.46	0.33	0.29	0.43	0.37	0.31	0.38	0.4	0.41	0.37	0.57	0.54	0.53	0.39	0.21	0.43	0.21	0.26	0.18	0.16	0.33	0.77	1.0	0.6	0.63	0.57
Cpa\|evm.model.tig00001299.17 (tig00001299_g8076.t1)	0.41	0.27	0.24	0.45	0.38	0.26	0.51	0.43	0.53	0.55	0.62	0.62	0.39	0.54	0.28	0.43	0.22	0.38	0.24	0.24	0.28	0.99	1.0	0.65	0.92	0.7
Cpa\|evm.model.tig00001487.17 (tig00001487_g8947.t1)	0.33	0.29	0.09	0.29	0.36	0.09	0.43	0.41	0.44	0.45	0.53	0.27	0.39	0.44	0.12	0.3	0.12	0.2	0.25	0.02	0.13	1.0	0.66	0.43	0.95	0.77
Cpa\|evm.model.tig00001493.1 (tig00001493_g8976.t1)	0.32	0.46	0.44	0.46	0.49	0.44	0.35	0.28	0.4	0.46	0.52	0.61	0.31	0.74	0.42	0.55	0.34	0.44	0.43	0.42	0.09	0.82	0.73	0.63	1.0	0.99
Cpa\|evm.model.tig00001542.3 (tig00001542_g9310.t1)	0.4	0.18	0.11	0.17	0.04	0.09	0.18	0.17	0.11	0.14	0.36	0.42	0.26	0.3	0.12	0.31	0.02	0.17	0.18	0.08	0.19	0.85	1.0	0.28	0.45	0.58
Cpa\|evm.model.tig00001590.3 (tig00001590_g9375.t1)	0.51	0.33	0.31	0.5	0.49	0.48	0.56	0.63	0.5	0.45	0.52	0.54	0.49	0.45	0.37	0.47	0.4	0.49	0.39	0.37	0.37	1.0	0.69	0.6	0.57	0.63
Cpa\|evm.model.tig00020553.59 (tig00020553_g10549.t1)	0.42	0.26	0.27	0.26	0.22	0.26	0.54	0.68	0.55	0.66	0.8	0.98	0.61	0.57	0.49	0.56	0.4	0.67	0.41	0.37	0.68	1.0	0.76	0.74	0.85	0.67
Cpa\|evm.model.tig00020563.92 (tig00020563_g11279.t1)	0.43	0.26	0.22	0.38	0.34	0.26	0.38	0.43	0.39	0.45	0.6	0.59	0.39	0.44	0.23	0.54	0.2	0.23	0.19	0.14	0.37	0.64	1.0	0.55	0.76	0.53
Cpa\|evm.model.tig00020675.21 (tig00020675_g12604.t1)	0.41	0.29	0.38	0.44	0.52	0.42	0.63	0.61	0.76	0.71	0.68	0.88	0.49	0.81	0.42	0.65	0.38	0.6	0.4	0.31	0.44	0.98	0.98	0.69	1.0	0.97
Cpa\|evm.model.tig00020685.14 (tig00020685_g12929.t1)	0.56	0.52	0.51	0.6	0.47	0.32	0.31	0.41	0.45	0.38	0.43	0.48	0.52	0.36	0.24	0.48	0.36	0.34	0.35	0.57	0.41	1.0	0.42	0.86	0.78	0.85
Cpa\|evm.model.tig00020704.4 (tig00020704_g13144.t1)	0.46	0.21	0.21	0.31	0.33	0.19	0.33	0.39	0.42	0.37	0.53	0.7	0.72	0.43	0.36	0.53	0.33	0.3	0.27	0.18	0.28	1.0	0.62	0.58	0.89	0.65
Cpa\|evm.model.tig00020710.27 (tig00020710_g13259.t1)	0.39	0.31	0.35	0.37	0.36	0.36	0.47	0.52	0.55	0.6	0.62	0.7	0.49	0.78	0.47	0.75	0.55	0.55	0.47	0.41	0.6	1.0	0.87	0.62	0.5	0.71
Cpa\|evm.model.tig00020710.58 (tig00020710_g13309.t1)	0.35	0.29	0.25	0.35	0.33	0.21	0.3	0.31	0.32	0.3	0.32	0.34	0.28	0.29	0.3	0.69	0.27	0.36	0.32	0.24	0.11	1.0	0.81	0.38	0.71	0.61
Cpa\|evm.model.tig00020723.97 (tig00020723_g13506.t2)	0.76	0.52	0.5	0.57	0.46	0.34	0.49	0.64	0.62	0.76	0.94	0.97	0.89	0.59	0.52	0.66	0.45	0.65	0.63	0.35	0.65	0.88	0.78	0.65	1.0	0.64
Cpa\|evm.model.tig00020908.3 (tig00020938_g16152.t1)	0.18	0.11	0.15	0.13	0.1	0.13	0.12	0.13	0.11	0.07	0.06	0.06	0.13	0.65	0.44	0.61	0.29	0.34	0.39	0.36	0.18	1.0	0.07	0.26	0.5	0.65
Cpa\|evm.model.tig00020909.13 (tig00020909_g15333.t1)	0.2	0.13	0.13	0.36	0.61	0.42	0.19	0.11	0.07	0.06	0.12	0.16	0.28	0.43	0.16	0.45	0.13	0.18	0.15	0.07	0.28	1.0	0.6	0.21	0.75	0.47
Cpa\|evm.model.tig00020934.19 (tig00020934_g16086.t1)	0.33	0.21	0.22	0.32	0.36	0.27	0.36	0.31	0.34	0.37	0.43	0.45	0.38	0.36	0.26	0.36	0.17	0.26	0.18	0.13	0.32	1.0	0.77	0.64	0.69	0.48
Cpa\|evm.model.tig00021015.25 (tig00021015_g17173.t1)	0.52	0.32	0.28	0.24	0.18	0.13	0.16	0.21	0.09	0.13	0.15	0.17	0.57	0.22	0.19	0.18	0.16	0.3	0.26	0.15	0.34	1.0	0.14	0.31	0.55	0.49
Cpa\|evm.model.tig00021036.55 (tig00021036_g17330.t1)	0.46	0.3	0.26	0.42	0.44	0.27	0.36	0.4	0.39	0.45	0.52	0.51	0.57	0.42	0.25	0.35	0.24	0.3	0.19	0.18	0.4	0.93	1.0	0.66	0.79	0.72
Cpa\|evm.model.tig00021254.3 (tig00021254_g19678.t2)	0.29	0.28	0.21	0.23	0.26	0.24	0.32	0.35	0.39	0.35	0.35	0.32	0.32	0.47	0.37	0.29	0.38	0.53	0.41	0.38	0.17	1.0	0.3	0.46	0.76	0.66
Cpa\|evm.model.tig00021428.10 (tig00021428_g21152.t2)	0.01	0.03	0.08	0.25	0.46	0.37	0.33	0.3	0.08	0.05	0.03	0.01	0.03	0.38	0.23	0.28	0.37	0.23	0.19	0.17	0.11	1.0	0.44	0.07	0.96	0.74
Cpa\|evm.model.tig00021432.22 (tig00021432_g21214.t1)	0.47	0.31	0.33	0.38	0.4	0.37	0.54	0.5	0.58	0.61	0.61	0.69	0.65	0.68	0.5	0.63	0.46	0.6	0.44	0.39	0.53	1.0	0.67	0.56	0.83	0.65
Cpa\|evm.model.tig00021435.32 (tig00021435_g21411.t1)	0.58	0.45	0.42	0.52	0.57	0.49	0.49	0.46	0.48	0.47	0.43	0.5	0.55	0.47	0.36	0.59	0.48	0.52	0.63	0.47	0.56	1.0	0.31	0.71	0.99	0.96
Cpa\|evm.model.tig00021489.39 (tig00021489_g21691.t1)	0.35	0.37	0.27	0.27	0.32	0.33	0.34	0.4	0.43	0.41	0.43	0.39	0.35	0.35	0.34	0.29	0.31	0.53	0.32	0.3	0.29	1.0	0.34	0.44	0.73	0.72
Cpa\|evm.model.tig00021493.25 (tig00021493_g21870.t1)	0.62	0.51	0.55	0.62	0.59	0.47	0.63	0.67	0.54	0.56	0.62	0.58	0.62	0.57	0.85	0.56	0.46	0.59	0.44	0.43	0.36	0.96	0.83	0.69	1.0	0.79
Cpa\|evm.model.tig00021517.25 (tig00021517_g22014.t1)	0.25	0.27	0.28	0.34	0.33	0.24	0.29	0.26	0.16	0.23	0.25	0.24	0.33	0.58	0.37	0.43	0.27	0.35	0.33	0.2	0.3	0.83	0.51	0.51	1.0	0.8
Cpa\|evm.model.tig00021537.60 (tig00021537_g22311.t1)	0.22	0.18	0.19	0.23	0.21	0.19	0.28	0.27	0.24	0.2	0.19	0.18	0.17	0.28	0.28	0.31	0.18	0.37	0.25	0.19	0.04	1.0	0.22	0.33	0.7	0.42
Cpa\|evm.model.tig00021795.16 (tig00021795_g23534.t1)	0.43	0.4	0.45	0.5	0.53	0.43	0.4	0.42	0.37	0.43	0.4	0.42	0.4	0.64	0.5	0.66	0.43	0.49	0.36	0.46	0.34	1.0	0.71	0.39	0.98	0.93

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)